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Schistosoma mansoni
cluster # 9241 cluster # 9241       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9241#0 length = 875 sequences # 9  

consensusID : consensus_9241#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 875
fasta sequence
                              [AGTTACTTTCGTATATAGAATTAATAGAATTGACCAACACTACTAATACTACTAATGGCTACTCGTACACAAGATTTTGGAATTGATGTAGCAATTTCTAGAAAGTTGAATAGTAGATATGATCCAGATGCAGAACGTCAAGTTATGGGTTGGATACAACAATTAACTGGACAAAATATTCCACTTGGACGTGAAAATGTACAAAGAACATTAAAAAATGGTCAAATACTTGTTGAACTTATCAATGCTGTATATGAACGTACACCGAATTTACCACCAAAAGCTCAAACAATACGTAGACCAATAAAAGCAAATGCAGGAACTGCACCATTTAAACAAATGGAGAATATTCAACGATTTCTCGATTTATCCGAAGCTTATGGTGTACCACGTGAATGTTTATTTCAAACTGTTGATTTATTTGAAGCAAGAAATATGGCACAAGTATTAGCTACTCTATTACAATTAGGAACTGAATGTCAACGTAATGGATTTCAAGGTCCTGTCTGTGGACCAAAACCTACTTATTCACAACCACGTCAATGGACTGAAGAAAAA-TACGTGCTGGTGAGGGTATTATTGGTTTACAAGCGGGAACAAATAAATTAGCATCACAAAAAGGCATGTCATTTGGTGCTTAACGTCATATTGCAGA-TATTCGATGTGATGATATGACACCAGAAGGTGCTGCTGTAATAAGTTTACAAATGGGTACAAAT-AAATTTGCATCACAAAAAGGCATG-AGTTTTAGTAATCAACGTCATATTGCCGATATAAAATGTGATGATTTATCACAAGAAGGTAAATCTGTAATCAATTTACAAATGGGTACAAATCAATTCGCTTCACAAAAGGGTATGCGAATTGGTAGTAGT]

[+] EMBL CD133767             [AGTTACTTTCGTATATAGAATTAATAGAATTGACCAACACTACTAATACTACTAATGGCTACTCGTACACAAGATTTTGGAATTGATGTAGCAATTTCTAGAAAGTTGAATAGTAGATATGATCCAGATGCAGAACGTCAAGTTATGGGTTGGATACAACAATTAACTGGACAAAATATTCCACTTGGACGTGAAAATGTACAAAGAACATTAAAAAATGGTCAAATACTTGTTGAACTTATCAATGCTGTATATGAACGTACACCGAATTTACCACCAAAAGCTCAAACAATACGTAGACCAATAAAAGCAAATGCAGGAACTGCACCATTTAAACAAATGGAGAATATTCAACGATTTCTCGATTTATCCGAAGCTTATGGTGTACCACGTGAATGTTTATTTCAAACTGTTGATTTATTTGAAGCAAGAAATATGGCACAAGTATTAGCTACTCTATTACAATTAGGAACTGAATGTCAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD191555             [     CTTTCGTATATAGAATTAATAGAATTGACCAACACTACTAATTCTACTAATGGCTACTCGTACACAAGATTTTGGAATTGATGTAGCAATTTCTAGAAAGTTGAATAGTAGATATGATCCAGATGCAGAACGCCAAGTTATGGGTTGGATACAACAATTAACTGGACAAAATATTCCACTTGGACGTGAAAATGTACAAAGAACATTAAAAAATGGTCAAATACTTGTTGAACTTATCAATGCTGTATATGAACGTACACCGAATTTACCACCAAAAGCTCAAACAATACGTAGACCAATAAAAGCAAATGCAGGAACTGCACCATTTAAACAAATGGAGAATATTCAACGATTTCTCGATTTATCCGAAGCTTATGGTGTACCACGTGAATGTTTATTTCAAACTGTTGATTTATTTGAAGCAAGAAATATGGCACAAGTATTAGCTACTCTATTACAATTAGGAACTGAATGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD185253             [     CTTTCGTATATAGAATTAATAGAATTGACCAACACTACTAATACTACTAATGGCTACTCGTACACAAGATTTTGGAATTGATGTAGCAATTTCTAGAAAGTTGAATAGTAGATATGATCCAGATGCAGAACGTCAAGTTATGGGTTGGATACAACGATTAACTGGACAAAATATTCCACTTGGACGTGAAAATGTACAAAGAACATTAAAAAATGGTCAAATACTTGTTGAACTTATCAATGCTGTATATGAACGTACACCGAATTTACCACCAAAAGCTCAAACAATACGTAGACCAATAAAAGCAAATGCAGGAACTGCACCATTTAAACAAATGGAGAATATTCAACGATTTCTCGATTTATCCGAAGCTTATGGTGTACCACGTGAATGTTTATTTCAAACTGTTGATTTATTTGAAGCAAGAAATATGGCACAAGTATTAGCTACTCTATTACAATTAGGAACTGAATGTCAACGTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD191509             [     CTTTCGTATAT GAATTAATAGAATTGACCAACACTACTAATACTACTAATGGCTACTCGTACACAAGATTTTGGAATTGATGTAGCAATTTCTAGAAAGTTGAATAGTAGATATGATCCAGATGCAGAACGTCAAGTTATGGGTTGGATACAACAATTAACTGGACAAAATATTCCACTTGGACGTGAAAATGTACAAAGAACATTAAAAAATGGTCAAATACTTGTTGAACTTATCAATGCTGTATATGAACGTACACCGAATTTACCACCAAAAGCTCAAACAATACGTAGACCAATAAAAGCAAGTGCAGGAACTGCACCATTTAAACAAATGGAGAATATTCAACGACTTCTCGATTTATCCGAAGCTTATGGTGTACCACGTGAATGTTTATTTCAGACTGTTGATTTATTTGAAGCAAGAAATATGGCACAAGTATTAGCTACTCTATTACAATTAGGAACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AI977175             [      TTTCGTATATAGAATTAATAGAATTGACCAACACTACTAATACTACTAATGGCTACTCGTACACAAGATTTTGGAATTGATGTAGCAATTTCTAGAAAGTTGAATAGTAGATATGATCCAGATGCAGAACGTCAAGTTATGGGTTGGATACAACAATTAACTGGACAAAATATTCCACTTGGACGTGAAAATGTACAAAGAACATTAAAAAATGGTCAAATACTTGTTGAACTTATCAATGCTGTATATGAACGTACACCGAATTTACCACCAAAAGCTCAAACAATACGTAGACCAATAAAAGCAAATGCAGGAACTGCACCATTTAAACAAATGGAGAATATTCAACGATTTCTCGATTTATCCGAAGCTTATGGTGTACCACGTGAATGTTTATTTCAAACTGTTGATTTATTTGAAGCAAGAAATATGGCACAAGTATTAGCTACTCTATTACAATTAGGAACTGAATGTCAACGTAATGGATTTCAAGGTCCTGTCTGTGGACCAAAACCTACTTATTCACAACCACGTCAATGGACTGAAGAAAAA TACGTGCTGGTGAGGGTTTTATTGGTTTACAAGCGGGAACAAATAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD114681             [                                                                                                                      ATGATCCAGATGCAGAACGTCAAGTTATGGGTTGGATACAACAATTAACTGGACAAAATATTCCACTTGGACGTGAAAATGTACAAAGAACATTAAAAAATGGTCAAATACTTGTTGAACTTATCAATGCTGTATATGAACGTACACCGAATTTACCACCAAAAGCTCAAACAATACGTAGACCAATAAAAGCAAATGCAGGAACTGCACCATTTAAACAAATGGAGAATATTCAACGATTTCTCGATTTATCCGAAGCTTATGGTGTACCACGTGAATGTTTATTTCAAACTGTTGATTTATTCGAAGCAGGAAATATGGCACAAGTATTAGCTACTCTATTACAATTAGGAACTGAATGTCAACGTAATGGATTTCAAGGTCCTGTCTGTGGACCAAAACCTACTTATTCACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD114622             [                                                                                                                                          CAAGTTATGGGTTGGATACAACAATTAACTGGACAAAATATTCCACTTGGACGTGAAAATGTACAAAGAACATTAAAAAATGGTCAAATACTTGTTGAACTTATCAATGCTGTATATGAACGTACACCGAATTTACCACCAAAAGCTCAAACAATACGTAGACCAATAAAAGCAAATGCAGGAACTGCACCATTTAAACAAATGGAGAATATTCAACGATTTCTCGATTTATCCGAAGCTTATGGTGTACCACGTGAATGTTTATTTCAAACTGTTGATTTATTTGAAGCAAGAAATATGGCACAAGTATTAGCTACTCTATTACAATTAGGAACAGAATGTCAACGTAATGGATTTCAAGGTCCTGTCTGTGGACCAAAACCTACTTATTCACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD146898             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TATTTCAAACTGTTGATTTATTTGAAGCAAGAAATATGGCACAAGTATTAGCTACTCTATTACAATTAGGAACTGAATGTCAACGTAATGGATTTCAAGGTCCTGTCTGTGGACCAAAACCTACTTATTCACAACCACGTCAATGGACTGAAGAAAAATTACGTGCTGATGAGGGTATTATTGGTTTACAAGCGGGAACAAATAAATTAGCATCACAAAAAGGCATGTCATTTGGTGCTTAACGTCATATTGCAGA TATTCGATGTGATGATATGACACCAGAAGGTGCTGCTGTAATAAGTTTACAAATGGGTACAAAT AAATTTGCATCACAAAAAGGCATG AGTTTTAGTAATCAACGTCATATTGCCGATATAAAATGTGATGATTTATCACAAGAAGGTAAATCTGTAATCAATTTACAAATGGGTACAAATCAATTCGCTTCACAAAAGGGTATGCGAATTGGTAGTAGT]
[+] EMBL CD179857             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTGTGGACCAAAACCTACTTATTCACAACCACGTCAATGGACTGAAGAAAAATTACGTGCTGGTGAGGGTATTATTGGTTTACAAGCGGGAACAAATAAATTAGCATCACAAAAAGGCATGTCATTTGGTGCTCAACGTCATATTGCAGATTATTCGATGTGATGATATGACACCAGAAGGTGCTGCTGTAATAAGTTTACAAATGGGTACAAATAAAATTTGCATCACAAAAAGGTATGAAGTTTTAGTAATCAACGTCATAT                                                                                                             ]


>consensus_9241#0 AGTTACTTTCGTATATAGAATTAATAGAATTGACCAACACTACTAATACTACTAATGGCT ACTCGTACACAAGATTTTGGAATTGATGTAGCAATTTCTAGAAAGTTGAATAGTAGATAT GATCCAGATGCAGAACGTCAAGTTATGGGTTGGATACAACAATTAACTGGACAAAATATT CCACTTGGACGTGAAAATGTACAAAGAACATTAAAAAATGGTCAAATACTTGTTGAACTT ATCAATGCTGTATATGAACGTACACCGAATTTACCACCAAAAGCTCAAACAATACGTAGA CCAATAAAAGCAAATGCAGGAACTGCACCATTTAAACAAATGGAGAATATTCAACGATTT CTCGATTTATCCGAAGCTTATGGTGTACCACGTGAATGTTTATTTCAAACTGTTGATTTA TTTGAAGCAAGAAATATGGCACAAGTATTAGCTACTCTATTACAATTAGGAACTGAATGT CAACGTAATGGATTTCAAGGTCCTGTCTGTGGACCAAAACCTACTTATTCACAACCACGT CAATGGACTGAAGAAAAATACGTGCTGGTGAGGGTATTATTGGTTTACAAGCGGGAACAA ATAAATTAGCATCACAAAAAGGCATGTCATTTGGTGCTTAACGTCATATTGCAGATATTC GATGTGATGATATGACACCAGAAGGTGCTGCTGTAATAAGTTTACAAATGGGTACAAATA AATTTGCATCACAAAAAGGCATGAGTTTTAGTAATCAACGTCATATTGCCGATATAAAAT GTGATGATTTATCACAAGAAGGTAAATCTGTAATCAATTTACAAATGGGTACAAATCAAT TCGCTTCACAAAAGGGTATGCGAATTGGTAGTAGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)