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Schistosoma mansoni
cluster # 9262 cluster # 9262       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9262#0 length = 1148 sequences # 9  

consensusID : consensus_9262#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1148
fasta sequence
                              [GAATGTTTTGGTGGATAATGCCGATATTTGTTGCTTGTTCAACGTTTGGTGGTGCCAATGGAACTATATTAACTACATCAAGAATATTTGTTGTTGCTAGTCAGCTTAAGCAAATGCCAGCGTTTATCAGTTATTTGCACACGGATCGATTAACACCTATTCCGGCTGTTTTGTTCACTTGTATTGTATCAATTATTTACCTACTTGCTGGAGATATTTTCACCCTTATGAATTATATGGGTTTTGTTCAATGGTTAGCAGTTGGTCTTTGTGTTTTGATTGTAGTAATTTTCAGATTTACTCGTCGTAATATTCGACGTCCAGTTAAGGCTCCTATAATATTTGCCATTATCTACTTAGTGGTTACTACATCTCTGTTAATTTTCTCCTTTTATGGATCACCTCAAGAATCATTATATGGTATTTTGATCATTTTAACCGGTATACCGGTTTATATACTCGGTTGTGCATGGAGTCCTAAACCAAAATCATTTCAAGAATCAATGATAAACATCACAATTGGATTACAAAAACTTTTCCGTATTGTACCATCTAGTT-AAAAATAAAAGATAAAGTATTAG-AATGATTGTGTATTATTATTATTAT-GAACAATGTTAAACAATCATATTGTTGTGTTACACTAACACTTATTGTGCGAATTCACCATCTACACAAACCAATTCAATATCAAGCCAAGAATAACAACAACAGAAAAGCAACAACAACATTTCACCTATTTATTAGTTTTCTATTTGATCGCCTCTTTTTTTTAATTTTTAAATGCTACATTAATGAGGTGATAAACACAATGATTTTCAGTATCCAGGTGCTCTTTTCCGGTTGCAATATTTTTTTCTGTACATTTTGTCTAATTTTGATTGGTATTTTCCTGTTTTTTTCATTTGTATTCTTATATATATTTGCAAAAAACTATTTTCCCTACAATTTGACGATTCACTTAAAGAAGATTTTTAGTCATTTATGGTTAATATACTAAACAATGTGTATATGATTTGGATTCTGTATCTCACTTTCACTTTGTCTCTCTCTCACTCCTATTTTTTTCATGAGATTTAGGTAGAAATATTTGTAAATTGTATGGAAACAACAAATGCCCTTTTCTTATTAAATCTATAATAATATGATAT]

[+] EMBL CD078245             [GAATGTTTTGGTGGATAATGCCGATATTTGTTGCTTGTTCAACGTTTGGTGGTGCCAATGGAACTATATTAACTACATCAAGAATATTTGTTGTTGCTAGTCAGCTTAAGCAAATGCCAGCGTTTATCAGTTATTTGCACACGGATCGATTAACACCTATTCCGGCTGTTTTGTTCACTTGTATTGTATCAATTATTTACCTACTTGCTGGAGATATTTTCACCCTTATGAATTATATGGGTTTTGTTCAATGGTTAGCAGTTGGTCTTTGTGTTTTGATTGTAGTAATTTTCAGATTTACTCGTCGTAATATTCGACGTCCAGTTAAGGCTCCTATAATATTTGCCATTATCTACTTAGTGGTTACTACATCTCTGTTAATTTTCTCCTTTTATGGATCACCTCAAGAATCATTATATGGTATTTTGATCATTTTAACCGGTATACCGGTTTATATACTCGGTTGTGCATGGAGTCCTAAACCAAAATCATTTCAAGAATCAATGATAAACATCACAATTGGATTACAAAAACTTTTCCGTATTGTACCATCTAGTT AAAAATAAAAGATAAAGTATTAG AATGATTGTGTATTATTATTATTAT GAACAATGTTAAACAATCATATTGNTGTGTTACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD078325             [GAATGTTTTGGTGGATAATGCCGATATTTGTTGCTTGTTCAACGTTTGGTGGTGCCAATGGAACTATATTAACTACATCAAGAATATTTGTTGTTGCTAGTCAGCTTAAGCAAATGCCAGCGTTTATCAGTTATTTGCACACGGATCGATTAACACCTATTCCGGCTGTTTTGTTCACTTGTATTGTATCAATTATTTACCTACTTGCTGGAGATATTTTCACCCTTATGAATTATATGGGTTTTGTTCAATGGTTAGCAGTTGGTCTTTGTGTTTTGATTGTAGTAATTTTCAGATTTACTCGTCGTAATATTCGACGTCCAGTTAAGGCTCCTATAATATTTGCCATTATCTACTTAGNGGCTACTACATCTCTGTTAATTTTCTNNTTTTATGGATCACCTCAAGAATCATTATATGGTATTTTGATCATTTTAACCGGTATACCGGTTTATATACTCGGTTGTGNGNGGAGTCCTAAACCAAAATCATTTCAAGAATCAATGATAAACATCACAATTGGATTACAAAAACTTTTCCGTATTGTACCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD112574             [                                                               CTATATTAACTACATCAAGAATATTTGTTGTTGCTAGTCAGCTTAAGCAAATGCCAGCGTTTATCAGTTATTTGCACACGGATCGATTAACACCTATTCCGGCTGTTTTGTTCACTTGTATTGTATCAATTATTTACCTACTTGCTGGAGATATTTTCACCCTTATGAATTATATGGGTTTTGTTCAATGGTTAGCAGTTGGTCTTTGTGTTTTGATTGTAGTAATTTTCAGATTTACTCGTCGTAATATTCGACGTCCAGTTAAGGCTCCTATAATATTTGCCATTATCTACTTAGTGGTTACTACATCTCTGTTAATTTTCTCCTTTTATGGATCACCTCAAGAATCATTATATGGTATTTTGATCATTTTAACCGGTATACTGGTTTATATACTCGGTTGTGCATGGAGTCCTAAACCAAAATCATTTCAAGAATCAATGATAAACATCACAATTGGATTACAAAAACTTTTCCGTATTGTACCATCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD112120             [                                                               CTATATTAACTACATCAAGAATATTTGTTGTTGCTAGTCAGCTTAAGCAAATGCCAGCGTTTATCAGTTATTTGCACACGGATCGATTAACACCTATTCCGGCTGTTTTGTTCACTTGTATTGTATCAATTATTTACCTACTTGCTGGAGATATTTTCACCCTTATGAATTATATGGGTTTTGTTCAATGGTTAGCAGTTGGTCTTTGTGTTTTGATTGTAGTAATTTTCAGATTTACTCGTCGTAATATTCGACGTCCAGTTAAGGCTCCTGTAATATTTGCCATTATCTACTTAGTGGTTACTACATCTCTGTTAATTTTCTCCTTTTATGGATCACCTCAAGAATCATTATATGGTATTTTGATCATTTTAACCGGTATACTGGTTTATATACTCGGTTGTGCATGGAGTCCTAAACCAAAATCATTTCAAGAATCAATGATAAACATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD112336             [                                                               CTATATTAACTACATCAAGAATATTTGTTGTTGCTAGTCAGCTTAAGCAAATGCCAGCGTTTATCAGTTATTTGCACACGGATCGATTAACTCCTATTCCGGCTGTTTTGTTCACTTGTATTGTATCAATTATTTACCTACTTGCTGGAGATATTTTCACCCTTATGAATTATATGGGTTTTGTTCAATGGTTAGCAGTTGGTCTTTGTGTTTTGATTGTAGTAATTTTCAGATTTACTCGTCGTAATATTCGACGTCCAGTTAAGGCTCCTATAATATTTGCCATTATCTACTTAGTGGTTACTACATCTCTGTTAATTTTCTCCTTTTATGGATCACCTCAAGAATCATTATATGGTATTTTGATCATTTTAACCGGTATACTGGTTTATATACTCGGTTGTGCATGGAGTCCTAAACCAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BF936465             [                                                                                                                       GCGTTTATCAGTTATTTGCACACGGATCGATTAACACCTATTCCGGCTGTTTTGTTCACTTGTATTGTATCAATTATTTACCTACTTGCTGGAGATATTTTCACCCTTATGAATTATATGGGTTTTGTTCAATGGTTAGCAGTTGGTCTTTGTGTTTTGATTGTAGTAATTTTCAGATTTACTCGTCGTAATATTCGACGTCCAGTTAAGGCTCCTATAATATTTGCCATTATCTACTTAGTGGTTACTACATCTCTGTTAATTTTCTCCTTTTATGGATCACCTCAAGAATCATTATATGGTATTTTGATCATTTTAACCGGTATACCGGTTTATATACTCGGTTGTGCATGGAGTCCTAAACCAAAATCATTTCAAGAATCAATGATAAACATCACAATTGGATTACAAAAACTTTTCCGTATTGTACCATCTAGTT AAAAATAAAAGATAAAGTATTAGAAATGATTGTGTATTATTATTATTAT GAACAATGTTAAACAATCATATTGTTGTGTTACACTAACACTTATTGTGCGAATTCACCATCTACACAAACCAATTCAATAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD069428             [                                                                                                                                AGTTATTTGCACACGGATCGATTAATACCTATTCCGGCTGTTTTGTTCACTTGTATTGTATCAATTATTTACCTACTTGCTGGAGATATTTTCACCCTTATGAATTATATGGGTTTTGTTCAATGGTTAGCAGTTGGTCTTTGTGTTTTGATTGTAGTAATTTTCAGATTTACTCGTCGTAATATTCGACGTCCAGTTAAGGCTCCTATAATATTTGCCATTATCTACTTAGTGGTTACTACATCTCTGTTAATTTTCTCCTTTTATGGATCACCTCAAGAATCATTATATGGTATTTTGATCATTTTAACCGGTATACCGGTTTATATACTCGGTTGTGCATGGAGTCCTAAACCAAAATCATTTCAAGAATCAATGATAAACATCACAATTGGATTACAAAAACTTTTCCGTATTGTACCATCTAGTT AAAAATAAAAGATAAAGTATTAG AATGATTGTGTATTATTATTATTAT GAACAATGTTAAACAATCATATTGTTGTGTTACACTAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD084129             [                                                                                                                                                                                                      cgaggCTTGCTGGAGATATTTTCACCCTTATGAATTATATGGGTTTTGTTCAATGGTTAGCAGTTGGTCTTTGTGTTTTGATTGTAGTAATTTTCAGATTTACTCGTCGTAATATTCGACGTCCAGTTAAGGCTCCTATAATATTTGCCATTATCTACTTAGTGGTTACTACATCTCTGTTAATTTTCTCCTTTTATGGATCACCTCAAGAATCATTATATGGTATTTTGATCATTTTAACCGGTATACCGGTTTATATACTCGGTTGTGCATGGAGTCCTAAACCAAAATCATTTCAAGAATCAATGATAAACATCACAATTGGATTACAAAAACTTTTCCGTATTGTACCATCTAGTTCAAAATTACAAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD072883             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TATTATGGAACAATGTTAAACAATCATATTGTTGTGTTACACTAACACTTATTGTGCGAATTCACCATCTACACAAACCAATTCAATATCAAGCCAAGAATAACAACAACAGAAAAGCAACAACAACATTTCACCTATTTATTAGTTTTCTATTTGATCGCCTCTTTTTTTTAATTTTTAAATGCTACATTAATGAGGTGATAAACACAATGATTTTCAGTATCCAGGTGCTCTTTTCCGGTTGCAATATTTTTTTCTGTACATTTTGTCTAATTTTGATTGGTATTTTCCTGTTTTTTTCATTTGTATTCTTATATATATTTGCAAAAAACTATTTTCCCTACAATTTGACGATTCACTTAAAGAAGATTTTTAGTCATTTATGGTTAATATACTAAACAATGTGTATATGATTTGGATTCTGTATCTCACTTTCACTTTGTCTCTCTCTCACTCCTATTTTTTTCATGAGATTTAGGTAGAAATATTTGTAAATTGTATGGAAACAACAAATGCCCTTTTCTTATTAAATCTATAATAATATGATAT]


>consensus_9262#0 GAATGTTTTGGTGGATAATGCCGATATTTGTTGCTTGTTCAACGTTTGGTGGTGCCAATG GAACTATATTAACTACATCAAGAATATTTGTTGTTGCTAGTCAGCTTAAGCAAATGCCAG CGTTTATCAGTTATTTGCACACGGATCGATTAACACCTATTCCGGCTGTTTTGTTCACTT GTATTGTATCAATTATTTACCTACTTGCTGGAGATATTTTCACCCTTATGAATTATATGG GTTTTGTTCAATGGTTAGCAGTTGGTCTTTGTGTTTTGATTGTAGTAATTTTCAGATTTA CTCGTCGTAATATTCGACGTCCAGTTAAGGCTCCTATAATATTTGCCATTATCTACTTAG TGGTTACTACATCTCTGTTAATTTTCTCCTTTTATGGATCACCTCAAGAATCATTATATG GTATTTTGATCATTTTAACCGGTATACCGGTTTATATACTCGGTTGTGCATGGAGTCCTA AACCAAAATCATTTCAAGAATCAATGATAAACATCACAATTGGATTACAAAAACTTTTCC GTATTGTACCATCTAGTTAAAAATAAAAGATAAAGTATTAGAATGATTGTGTATTATTAT TATTATGAACAATGTTAAACAATCATATTGTTGTGTTACACTAACACTTATTGTGCGAAT TCACCATCTACACAAACCAATTCAATATCAAGCCAAGAATAACAACAACAGAAAAGCAAC AACAACATTTCACCTATTTATTAGTTTTCTATTTGATCGCCTCTTTTTTTTAATTTTTAA ATGCTACATTAATGAGGTGATAAACACAATGATTTTCAGTATCCAGGTGCTCTTTTCCGG TTGCAATATTTTTTTCTGTACATTTTGTCTAATTTTGATTGGTATTTTCCTGTTTTTTTC ATTTGTATTCTTATATATATTTGCAAAAAACTATTTTCCCTACAATTTGACGATTCACTT AAAGAAGATTTTTAGTCATTTATGGTTAATATACTAAACAATGTGTATATGATTTGGATT CTGTATCTCACTTTCACTTTGTCTCTCTCTCACTCCTATTTTTTTCATGAGATTTAGGTA GAAATATTTGTAAATTGTATGGAAACAACAAATGCCCTTTTCTTATTAAATCTATAATAA TATGATAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)