These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9280#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1316 fasta sequence [TTCAGTGCAAGCAAGATATGCCAACGGTTTCGCGAGATTATGAGACCAATGTAATACAGTTCGATTAGGCATACGTTTATCCAGTAAAACCATGCTATAGTAACCACCAGCCAAAACATATACATTACCAATCCACTTAGGTGGGGAATATGTGAGATGATCATTTGAATTCAATAAAA-ACGAGCGTTCTGAAG-TGTTGAACAGTT-GGTAAGCACTTGATGGTGCTATACGGGTGTCAAAAATTAGGATACGACGTGTGGTTGTCAGACACAATTCACCCGGATAACTTCCGAATCCTACACGTAACCAATGATAATTGGGATAATGCTGGTGTAGAAGATGTTTCCGTGATGTACGTGTACAATAAGATTCAATATCTGATTGAACCGGATCTTGTTTAGATGGCGATGATGCTATGCTCTTCAAGCACAATGAGTTTTCCTTTGTTATATTTTCCATATAATTGCCTAAATTTACGTGACCAGACCATATAGGCAGTTGAGTATCTTCTGAATTATACAACCGAATACTA-GCTTTACGATCCCTTTTTTCGTCCACATAATTACCGGCCATACACCATTCCCCTG-GAATCCATCG-ACTCATG-CATATAC-TAGTAACATAATTACTT-GATGAAATACGTAT-TAAAT-TAACGTTGTC-AATACATG-AGTTAGACATGTTCAGTTC-GTTTACCTT-AATTTGCATACGAACA-ATATTTGTCTTACTGCCCGATGTTGGCAATAAACGACCGACTATATCGATATTCTCACTTGATTCACTAAAACATGCATCAAGCTCACAAAATGATCTAGATGAAAGTTTTGTCAATGGAATGGGAAGAACTGAGAAACGATTTGGCTCATGAATATTAGTTTTCAACAGATTTGATGTTTTGCCAATACAGAAGGAATTTGTTTGAAGTGAATACCATAAGAGTATGTCAGACTGATTTGTAGACGACTGATAGTTATGTGTACTTACATTGCATAATAAACCATTCCCGAGATAATTCGGATTTACAATTCGACTTGCTAATCTGATAACTAATGGATCAAAGGATGCTAATAGCCTACTACAGTCGGATTCAAATGTTAAATTATCTGAACTACATAATGTTGTAGATGATGACGATATGGATGAGGACAATGATGAATGACCTGGATAGAGAAGTCTACCGATAGTACAAGGTAGTAACTGCTCTGATTTCCCAGATGCACTACTATCAACACCTTCACCAGTTTCGAAAGCGATAGCCTTTGTTGCTTTTGATGGCTTTGTTGTTAGCCGGAGTCGTTTTGTTGATGGCTGGTTGTTACCAA] [-] EMBL CD065169 [TTCAGTGCAAGCAAGATATGCCAACGGTTTCGCGAGATTATGAGACCAATGTAATACAGTTCGATTAGGCATACGTTTATCCAGTAAAACCATGCTATAGTAACCACCAGCCAAAACATATACATTACCAATCCACTTAGGTGGGGAATATGTGAGATGATCATTTGAATTCAATAAAA ACGAGCGTTCTGAAG TGTTGAACAGTT GGTAAGCACTTGATGGTGCTATACGGGTGTCAAAAATTAGGATACGACGTGTGGTTGTCAGACACAATTCACCCGGATAACTTCCGAATCCTACACGTAACCAATGATAATTGGGATAATGCTGGTGTAGAAGATGTTTCCGTGATGTACGTGTACAATAAGAT ] [-] EMBL CD118092 [ AATATGTGAGATGATCATTTGAATTCAATAAAANACGAGCGTTTTGAAGTTGTTGAACAGTTGGGTAAGCACTTGATGGTGCTATACGGGTGTCAAAAATTAGGATACGACGTGTGGTTGTCAGACACAATTCACCCGGATAACTTCCGAATCCTACACGTAACCAATGATAATTGGGATAATGCTGGTGTAGAAGATGTTTCCGTGATGTACGTGTACAATAAGATTCAATATCTGATTGAACCGGATCTTGTTTAGATGGCGATGATGCTATGCTCTTCAAGCACAATGAGTTTTCCTTTGTTATATTTTCCATATAATTGCCTAAATTTACGTGACCAGACCATATAGGCAGTTGAGTATCTTCTGAATTATACAACCGAATACTA GCTTTACGATCCCTTTTTTCGTCCACATAATTACCGGCCATACACCATTCCCGTG GAATCCATCG ACTCATG CATATAC TAGTAACAT ] [-] EMBL CD118140 [ ATATGTGAGATGATCATTTGAATCAAATACAA ACGAGCGTTCTGAAG TGTTGAACAGTT GGTAAGCACTTGATGGTGCTATACGGGTGTCAAAAATTAGGATACGACGTGTGGTTGTCAGACACAATTCACCCGGATAACTTCCGAATCCTACACGTAACCAATGATAATTGGGATAATGCTGGTGTAGAAGATGTTTCCGTGATGTACGTGTACAATAAGATTCAATATCTGATTGAACCGGATCTTGTTTAGATGGCGATGATGCTATGCTCTTCAAGCACAATGAGTTTTCCTTTGTTATATTTTCCATATAATTGCCTAAATTTACGTGACCAGACCATATAGGCAGTTGAGTATCTTCTGAATTATACAACCGAATACTA GCTTTACGATCCCTTTTTTCGTCCACATAATTACCGGCCATACACCATTCCCCTG GAATCCATCG ACTCATG CATATAC TAGTAACAT ] [-] EMBL CD118119 [ AAG TGTTAACCAGTT GGTAAGCACTTGATGGTGCTATACGGGTGTCAAAAATTAGGATACGACGTGTGGTTGTCAGACACAATTCACCCGGATAACTTCCGAATCCTACACGTAACCAATGATAATTGGGATAATGCTGGTGTAGAAGATGTTTCCGTGATGTACGTGTACAATAAGATTCAATATCTGATTGAACCGGATCTTGTTTAGATGGCGATGATGCTATGCTCTTCAAGCACAATGAGTTTTCCTTTGTTATATTTTCCATATAATTGCCTAAATTTACGTGACCAGACCATATAGGCAGTTGAGTATCTTCTGAATTATACAACCGAATACTA GCTTTACGATCCCTTTTTTCGTCCACATAATTACCGGCCATACACCATTCCCCTG GAATCCATCG ACTCATG CATATAC TAGTAACAT ] [-] EMBL CD118179 [ CAATAAGATTCAATATCTGATTGAACCGGATCTTGTTTAGATGGCGATGATGCTATGCTCTTCAAGCACAATGAGTTTTCCTTTGTTATATTTTCCATATAATTGCCTAAATTTACGTGACCAGACCATATAGGCAGTTGAGTATCTTCTGAATTATACAACCGAATACTA GCTTTACGATCCCTTTTTTCGTCCACATAATTACCGGCCATACACCATTCCCCTG GAATCCATCG ACTCATG CATATAC TAGTAACAT ] [+] EMBL CD147411 [ GGCAGTTGAGTATCTTCCGAATTATACAACCGAATACTA GCTTTACGATCCCTTTTTTCGTCCACATAATTACCGGCCATACACCATTCCCCTG GAATCCATCG ACTCATG CATATAC TAGTAACATAATTACTT GATGAAATACGTAT TAAAT TAACGTTGTC AATACATG AGTTAGACATGTTCAGTTC GTTTACCTT AATTTGCATACGAACA ATATTTGTCTTACTGCCCGATGTTGGCAATAAACGACCGACTATATCGATATTCTCACTTGATTCACTAAAACATGCATCAAGCTCACAAAATGATCTAGATGAAAGTTTTGTCAATGGAATGGGAAGAACTGAGAAACGATTTGGCTCATGAATATTAGTTTTCAACAGATTTGATGTTTTGCCAATACAGAAGGAATTTGTTTGAAGTGAATACCATAAGAGTATGTCAGACTGATTTGTAGACGACTGATAGTTATGTGT ] [+] EMBL CD147408 [ GGCAGTTGAGTATCTTCCGAATTATACAACCGAATACTAGGCTTTACGATCCCTTTTTTCGTCCACATAATTACCGGCCATACACCATTCCCCTGTGAATCCATCGCACTCATGTCATATACATAGTAACATAATTACTTGGATGAAATACGTATATAAATGTAACGTTGTCAAATACATGAAGTTAGACATGTTCAGTTCTGTTTACCTTCAATTTGCATACGAACACTTATTTGTCTTACTGCCCGATGTTGGCAATAAACGACCGACTATATCGATATTCTCACTTGATTCACTAAAACATGCATCAAGCTCACAAAATGATCTATATGAAAGTTTgg ] [+] EMBL CD147469 [ GGCAGTTGAGTATCTTCCGAATTATACAACCGAATACTA GCTTTACGATCCCTTTTTTCGTCCACATAATTACCGGCCATACACCATTCCCCTG GAATCCATCG ACTCATG CATATAC TAGTAACATAATTACTT GATGAAATACGTAT TAAAT TAACGTTGTC AATACATG AGTTAGACATGTTCAGTTC GTTTACCTT AATTTGCATACGAACA ATATTTGTCTTACTGCCCGATGTTGGCAATAAACGACCGACTATATCGATATTCTCACTTGATTCACTAAAACATGCATCAAGCTCACAAAATGATCTAGATGAAAGTTTTGTCAATGGAATGGGAAGAACTGAGAAACGATTTGGCTCATGAATATTAGTTTTCAACAGATTTGATGTTTTGCCCATACCGAAGGAA ] [-] EMBL CD137779 [ TTTCAACAGATTTGATGTTTCGCCAATACAGAAGGAATTTGTTTGAAGTGAATACCATAAGAGTATGTCAGACTGATTTGTAGACGACTGATAGTTATGTGTACTTACATTGCATAATAAACCATTCCCGAGATAATTCGGATTTACAATTCGACTTGCTAATCTGATAACTAATGGATCAAAGGATGCTAATAGCCTACTACAGTCGGATTCAAATGTTAAATTATCTGAACTACATAATGTTGTAGATGATGACGATATGGATGAGGACAATGATGAATGACCTGGATAGAGAAGTCTACCGATAGTACAAGGTAGTAACTGCTCTGATTTCCCAGATGCACTACTATCAACACCTTCACCAGTTTCGAAAGCGATAGCCTTTGTTGCTTTTGATGGCTTTGTTGTTAGCCGGAGTCGTTTTGTTGATGGCTGGTTGTTACCAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||