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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9283#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1527 fasta sequence
[GGATGACCATTACCGTCTCGGAAGATATACTGATCAAACACATTATCGACCGTTTGCATGCTATTGGTATAACTAGTGAACCGACTGTATCTTCGGTCAGTGACGCGTCAAAGTTAGAGGAGGAAAATGCAAATAACTCAGTTGTTTCTTGTTCGCTAAGCGACTTTCACAGTAATCCCCAACCAGATAAACCAAATACAACCTCAACCGATCTTTTTGACCAGTCAAAACAAACTACTGAAGGAACAACGGGCAATTTAGCCTCATTACTCAAAGGACGTTTATGCCTGAAGGATACGAGAGGGCATGATTGGTTAGCTGAATCAGAAAATACTTTAATATCTCTCCCTTGTTCTGACGCTTATAGTATCATTTTGGACTGTCAAAGTTTAGAAATACGACGTAGACTCAATGACATTCGAAGTCACATACAACAACATCCTGTTACGCGACTTAATGAAACCCTAAAACTTTCAGATTGTTTCGAACGTTTTACTGATATAGAACAATTAGGTTCAAGAGATCTGTGGTACTGTAGTCGCTGCAAAGCGGAAAAACCAGCTACAAAAAAATTTGATTTATGGAAGCTTCCTGATGTTCTTGTAGTACAATTAAAGCGTTTCCGATCTCACTTACGATTTCATGATAAGATCGATACTTTACTGGAATTCCCACTAACTGGCTTAAATTTGACTTCACGTGTACTTGAAAAGAAACCAGACGAGAAATTTATCTATGACTTAGTAGCTGTAAGCAATCATATGGGATATTTGGGTGGAGGTCATTATACAGCATTTGCTTTAAACGCTCACACTAATCGATGGTACTTTTTCGATGATTCTTCAACACGAGAATGTGATCCTTCCAAAATTGTAACTAGTGCAGCATATGTGTTAGTTTATGTACGCCGCANAGTTGGTTCTACGCANATATGCAACACGATCAACAGTGATGATGAACAAGAAGATTCTTCGTCTGAAACAGATGANNATAGTCTTTCANATGGTGCTTTATCTTCGCATTATATAACTGAAGGTTGTGTGCAAAATGGTCGGACTGGCAACGCGAACTCATCTTTCAATCTTCAGGATCAAGATCTAATGGATATTGAATAGACGTCTTTGTCTTTTCTTTTTATAGTTTCACTTCCTTTCAACTTAACCACATCGCTTCGACTTATGCAGTCACTCATTTTTTTATGAGTTTATGCATGATTACAGTGTTTGTTAACTTGTTCATTCTCGGTGAATCAAGTGAAGTAATGACATTTAGACGTTTTTTCCGAACAATATCCCTGCCCCTTATCTTATTCTTGTTCTTCAGCTAACATATAATTCTCTATCTCTCCAGTTACTTCAGTTTTAATTTTGGTCACAAAGAGAATTGTTTACTATGCAGTTTGCTTTTTGTCCCAATGAATGTATATTCACACCGCAGTAAAATAAATTCAAATCCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGTA]
[+] EMBL CD082868 [GGATGACCATTACCGTCTCGGAAGATATACTGATCAAACACATTATCGACCGTTTGCATGCTATTGGTATAACTAGTGAACCGACTGTATCTTCGGTCAGTGACGCGTCAAAGTTAGAGGAGGAAAATGCAAATAACTCAGTTGTTTCTTGTTCGCTAAGCGACTTTCACAGTAATCCCCAACCAGATAAACCAAATACAACCTCAACCGATCTTTTTGACCAGTCAAAACAAACTACTGAAGGAACAACGGGCAATTTAGCCTCATTACTCAAAGGACGTTTATGCCTGAAGGATACGAGAGGGCATGATTGGTTAGCTGAATCAGAAAATACTTTAATATCTCTCCCTTGTTCTGACGCTTATAGTATCATTTTGGACTGTCAAAGTTTAGAAATACGACGTAGACTCAATGACATTCGAAGTCACATACAACAACATCCTGTTACGCGACTTAATGAAACCCTAAAACTTTCAGATTGTTTCGAACGTTTTACTGATATAGAACAATTAGGTTCAAGAGATCTGTGGTACTGTAGTCGCTGCANAGCGGAAAAACCAGCTACAAAAAAATTTGATTTATGGAAGCTTCCTGATGTTCTTGTAGTACAATTAAAGCGTTTCCGATCTCACTTACGATTTCATGANTAGATCGATACTTTACTGGAATTC ]
[+] EMBL CD201515 [ CGACTGTATCTTCGGTCAGTGACGCGTCAAAGTTAGAGGAGGAAAATGCAAATAACTCAGTTGTTTCTTGTTCGCTAAGCGACTTTCACAGTAATCCCCAACCAGATAAACCAAATACAACCTCAACCGATCTTTTTGACCAGTCAAAACAAACTACTGAAGGAACAACGGGCAATTTAGCCTCATTACTCAAAGGACGTTTATGCCTGAAGGATACGAGAGGGCATGATTGGTTAGCTGAATCAGAAAATACTTTAATATCTCTCCCTTGTTCTGACGCTTATAGTATCATTTTGGACTGTCAAAGTTTAGAAATACGACGTAGACCCAATGACATTCGAAGTCACATACAACAACATCCTGTTACGCGACTTAATGAAACCCTAAAACTTTCAGATTGTTTCGAACGTTTTACTGATATAGAACAATTAGGTTCAAGAGATCTGTGGTACTGTAGTCGCTGCAAAGCGGAAAAACCAGCTAC AAAAAATTTGATTTATGGAAGCTTCCTGATGTTCTTGTAGTACAATTAAAGCGTTTCCGATCTCACTTACGATTTCATG ]
[-] EMBL CD156430 [ ACTACTGAAGGAACAACGGGCAATTTAGCCTCATTACTCAAAGGACGTTTATGCCTGAAGGATACGAGAGGGCATGATTGGTTAGCTGAATCAGAAAATACTTTAATATCTCTCCCTTGTTCTGACGCTTATAGTATCATTTTGGACTGTCAAAGTTTAGAAATACGACGTAGACTCAATGACATTCGAAGTCACATACAACAACATCCTGTTACGCGACTTAATGAAACCCTAAAACTTTCAGATTGTTTCGAACGTTTTACTGATATAGAACAATTAGGTTCAAGAGATCTGTGGTACTGTAGTCGCTGCAAAGCGGAAAAACCAGCTACAAAAAAATTTGATTTATGGAAGCTTCCTGATGTTCTTGTAGTACAATTAAAGCGTTTCCGATCTCACTTACGATTTCATGATAAGATCGATACTTTACTGGAATTCCCACTAACTGGCTTAAATTTGACTTCACGTGTACTTGAAAAGAAACCAGACGAGAAATTTATCTATGACTTAGTAGCTGTAAGCAATCATATGG ]
[+] EMBL CD154034 [ CTTAATGAAACCCTAAAACTTTCAGATTGTTTCGAACGTTTTACTGATATAGAACAATTAGGTTCAAGAGATCTGTGGTACTGTAGTCGCTGCAAAGCGGAAAAACCAGCTACAAAAAAATTTGATTTATGGAAGCTTCCTGATGTTCTTGTAGTACAATTAAAGCGTTTCCGATCTCACTTACGATTTCATGATAAGATCGATACTTTACTGGAATTCCCACTAACTGGCTTAAATTTGACTTCACGTGTACTTGAAAAGAAACCAGACGAGAAATTTATCTATGACTTAGTAGCTGTAAGCAATCATATGGGATATTTGGGTGGAGGTCATTATACAGCATTTGCTTTAAACGCTCACACTAATCGATGGTACTTTTTCGATGATTCTTCAACACGAGAATGTGATCCTTCCAAAATTGTAACTAGTGCAGCATATGTGTTAGTTTATGTACGCCGCANAGTTGGTTCTACGCANATATGCAACACGATCAACAGTGATGATGAACAAGAAGATTCTTCGTCTGAAACAGATGANNATAGTCTTTCANATGGTGC ]
[-] EMBL CD122408 [ AACCCTAAAACTTTCAGATTGTTTCGAACGTTTTACTGATATAGAACAATTAGGTTCAAGAGATCTGTGGTACTGCAGTCGCTGCAAAGCGGAAAAACCAGCTACAAAAAAATTTGATTTATGGAAGCTTCCTGATGTTCTTGTAGTACAATTAAAGCGTTTCCGATCTCACTTACGATTTCATGATAAGATCGATACTTTACTGGAATTCCCACTAACTGGCTTAAATTTGACTTCACGTGTACTTGAAAAGAAACCCGACGAGAAATTTATCTATGACTTAGTAGCTGTAAGCAATCATATGGGATATTTGGGTGGAGGTCATTATACAGCATTTGCTTTAAACGCTCACACTAATCGATGGTACTTTTTCGATGATTCTTCAACACGA ]
[+] EMBL CD166355 [ ACCAGCTACAAAAAAATTTGATTTATGGAAGCTTCCTGATGTTCTTGTAGTACAATTAAAGCGTTTCCGATCTCACTTACGATTTCATGATAAGATCGATACTTTACTGGAATTCCCACTAACTGGCTTAAATTTGACTTCACGTGTACTTGAAAAGAAACCAGACGAGAAATTTATCTATGACTTAGTAGCTGTAAGCAATCATATGGGATATTTGGGTGGAGGTCATTATACAGCATTTGCTTTAAACGCTCACACTAATCGATGGTACTTTTTCGATGATTCTTCAACACGAGAATGTGAT ]
[-] EMBL CD126601 [ CCAGCTACAAAAAAATTTGATTTATGGAAGCTTCCTGATGTTCTTGTAGTACAATTAAAGCGTTTCCGATCTCACTTACGATTTCATGATAAGATCGATACTTTACTGGAATTCCCACTAACTGGCTTAAATTTGACTTCACGTGTACTTGAAAAGAAACCAGACGAGAAATTTATCTATGACTTAGTAGCTGTAAGCAATCATATGGGATATTTGGGTGGAGGTCATTATGCAGCATTTGCTTTAAACGCTCACACTAATCGATGGTACTTTTTCGATGATTCTTCAACACGAGAATGTGATCCT ]
[-] EMBL CD076454 [ CAACACGAGAATGTGATCCTTCCAAAATTGTAACTAGTGCAGCATATGTGTTAGTTTATGTACGCCGCAAAGTTGGTTCTACGCAAATATGCAACACGATCAACAGTGATGATGAACAAGAAGATTCTTCGTCTGAAACAGATGAAAATAGTCTTTCAAATGGTGCTTTATCTTCGCATTATATAACTGAAGGTTGTGTGCAAAATGGTCGGACTGGCAACGCGAACTCATCTTTCAATCTTCAGGATCAAGATCTAATGGATATTGAATAGACGTCTTTGTCTTTTCTTTTTATAGTTTCACTTCCTTTCAACTTAACCACATCGCTTCGACTTATGCAGTCACTCATTTTTTTATGAGTTTATGCATGATTACAGTGTTTGTTAACTTGTTCATTCTCGGTGAATCAAGTGAAGTAATGACATTTAGACGTTTTTTCCGAACAATATCCCTGCCCCTTATCTTATTCTTGTTCTTCAGCTAACATATAATTCTCTATCTCTCCAGTTACTTCAGTTTTAATTTTGGTCACAAAGAGAATTGTTTACTATGCAGTTTGCTTTTTGTCCCAATGAATGTATATTCACACCGCAGTAAAATAAATT ]
[-] EMBL AI977440 [ ATGGTCGGACTGGCAACGCGAACTCATCTTTCAATCTTCAGGATCAAGATCTAATGGATATTGAATAGACGTCTTTGTCTTTTCTTTTTATAGTTTCACTTCCTTTCAACTTAACCACATCGCTTCGACTTATGCAGTCACTCATTTTTTTATGAGTTTATGCATGATTACAGTGTTTGTTAACTTGTTCATTCTCGGTGAATCAAGTGAAGTAATGACATTTAGACGTTTTTTCCGAACAATATCCCTGCCCCTTATCTTATTCTTGTTCTTCAGCTAACATATAATTCTCTATCTCTCCAGTTACTTCAGTTTTAATTTTGGTCACAAAAAGAATTGTTTACTATGCAGTTTGCTTTTTGTCCCAATGAATGTATATTCACACCGCAGTAAAATAAATTCAAATCCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGTA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||