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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9294#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1573 fasta sequence
[TTCTTATGACTGAGTACAAGTTAGTTGTTGTTGGAGCTGGTGGAGTTGGCAAAAGTGCTCTTACTATCCAGCTCATTCAGAATCATTTTGTTGAGGAATATGACCCAACGATAGAGGACTCTTATAGAAAACAGATGGTCATTGATGGAGAAATATGCTTGTTAGATATCTTAGATACTGCTGGTCAAGAGGAATACAGTGCAATGCGCGATCAGTATATGCGTACTGGAGAGGGGTTTTTATGCGTATTTGCCGTAAACAACTCCAAGAGCTACGATGATATAAATCAATATCGAGAGCAGATCAAAAGAGTCAAAGATGCTGACGAAGTTCCTATGGTTCTTGTTGGAAACAAAGTTGATCTCACAAATCGCAGTGTTTGTACAGAGGAGGCAAAATCTTTAGCCCACTCGTATAATATCCCTTATGTTGAGACTTCCGCCAAGACCAGACAAGGTGTGGAAGATGCGTTTCATAAACTTGTCCGGGAGATCAGAAAATCTAAAGAGAAGAAGGGGAAAGATCGTAAAAAGCGCAAACGAAAATGTTGTATACAATGAATTAACCACTATATTATATTGGGCGCCAGTGGGCTTTATTAAAAAACTGGAATTTAATTTCAAAGCGTCTCAATGATGATTATAATAGCTGTATTTGTGAACTGGCCTTCGTCACTATCCGGTCTTCATAAACTTTTCATCTGATTTAGCATAATTCCACATCTGCTCTAGCAGTTTTACTAAAAAGTTACTTTGAATAATTGTTTTGTTCGTACATACGTATGCGAACATACGAATGTTTTAAAATTTAACTTGTTTGAACTTTTGTATGAGTTTTGTCTCCCTTTCGATTTATATATATGGTAAAACAATGCAATTTTAGATATCATTCTAGGTATGCTTTCTGCAACTTTTCCACTTTCTTTTCAAATTAATCGCGTTCTGTACATGTATTCATCGCGCGACTAATCTCCTTTTTTGTCAGCCTCCTATTTGTTTTGATTCAATCTGCTGTACACAATATGTAGTAAAAATAACAATGGCATTTTTGCACACGTACAAACTTTGTGACTTTATTGTTTCCGTTTACGGGTATTATTTTTATTGACACCAATATTGTTATGATTGTTTAATCTCTGAGTGTACATATATCGATTCTTTCTTTACTTTATTTGTCATCTTGTTTTATGCAATATATGATTATGGAAAATTGGATATAATGATTATTTTGAGCTATGTATTAGAAAAATATAAAACCGTTAGTTTGACAGGTTGAGATAGATTCAATCTGTCTTTTTTTGTCAAGGTCACCATCTTTATGTTCGTACAAATTGAATGGATATCGAGCCTGACAAAACATCAGTTGGACGTTTCTGTTTATCTGTCAATCAGTATTTCCATATTGTTTGTTTCTCAACCTGTCATCCTTAAATCCAAAATCGTATATATTTTCTTGAATTGAAAGTTGCACTAGTAAATATAAATTTGTCGGTTCGGTATAATAAATGCTTTTTATTGGTTTCATACACATGCTGATTGTATATTGTTAAATATAATAATTACAGTTAAAAAAA]
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[+] EMBL AI618821 [ TTCGTCACTATCCGGTCTTCATAAACTTTTCATCTGATTTAGCATAATTCCACATCTGCTCTAGCAGTTTTACTAAAAAGTTACTTTGAATAATTGTTTTGTTCGTACATACGTATGCGAACATACGAATGTTTTAAAATTTAACTTGTTTGAACTTTTGTATGAGTTTTGTCTCCCTTTCGATTTATATATATGGTAAAACAATGCAATTTTA ]
[+] EMBL CD137212 [ TCTGATTTAGCATAATTCCACATCTGCTCTAGCAGTTTTACTAAAAAGTTACTTTGAATAATTGTTTTGTTCGTACATACGTATGCGAACATACGAATGCTTTAAAATTTAACTTGTTTGAACTTTTGTATGAGTTTTGTCTCCCTTTCGATTTATATATATGGTAAAACAATGCAATTTTAGATATCATTCTAGGTATGCTTTCTGCAACTTTTCCACTTTCTTTTCAAATTAATCGCGTTCTGTACATGTATTCATCGCGCGACTAATCTCCTTTTTTGTCAGCCTCCTATTTGTTTTGATTCAATCTGCTGTACACAATATGTAGTAAAAATAACAATGGCATTTTTGCACACGTACAAACTTTGTGACTTTATTGTTTCCGTTTACGGGTATTATTTTTATTGACACCAATATTGTTATGATTGTTTAATCTCTGAGTGTACATATATCGATTCTTTCTTTACTTTATTTGNCATCTTGgt ]
[+] EMBL CD139983 [ GCATAATTCCACATCTGCTCTAGCAGTTTTACTAAAAAGTTACTTTGAATAATTGTTTTGTTCGTACATACGTATGCGAACATACGAATGTTTTAAAATTTAACTTGTTTGAACTTTTGTATGAGTTTTGTCACCCTTTCGATTTATATATATGGTAAAACAATGCAATTTTAGATATCATTCTAGGTATGCTTTCTGCAACTTTTCCACTTTCTTTTCAAA TAATCGCngtc ]
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[-] EMBL CD140048 [ TTTGTCAAGGTCACCATCTTTATGTTCGTACAAATTGAATGGATATCGAGCCTGACAAAACATCAGTTGGACGTTTCTGTTTATCTGTCAATCAGTATTTCCATATTGTTTGTTTCTCAACCTGTCATCCTTAAATCCAAAATCGTATATATT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||