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Schistosoma mansoni
cluster # 9299 cluster # 9299       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9299#0 length = 596 sequences # 9  

consensusID : consensus_9299#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 596
fasta sequence
                              [TAAACTCTGAGGATTCCCCCCGAAATAGGAAGATTAGGGTAATACAGAGTAAAGATGTCTAGCTCAC-CAAGCCGTTCTTTGTGTGGTGAACACTGGAGTCCTGGAATTACAAGGGTATCTACTTTTTCAAGATATACTAGTCACCTTCCAATTTTGGGTGTCATTAAGTTTATGTATACTGTAGTGAACATATAAGTATCTTATTTGGTAAATGTCCGTCTTAAAGCCTATATTGTTGTAAAACCTTTAGCTGCTGCCACACTGTAGTGGGCTGTAGTCTTAAAATTATGATTCATTGTCGCCCCAGGATCATTGTGAGGCCGGACTGCAGGGACAGACTCTTCACCTATGCTGTACCTACTAACCTTTGTATCCCCAATGTGCAAGCAGACACACTTGGCTTTGCTGATAGACATTAGTCAGCGTCTGTAATTTAGTTTTGAGACTTCGTATTAACCTACAGAACTCTGGTTAAGTTCATAAAACAAGATATGCACTCAAAGTAACTAGTATCCATTTTATTTGTCTGTTTATTTTAACACAAACATTAGTACAAAAAGACAAAATATATATGCACCACACTTCATCGTTCGATT]

[+] EMBL CD086234             [TAAACTCTGAGGATTCCCCCCGAAATAGGAAGATTAGGGTAATACAGAGTAAAGATGTCTAGCTCAC CAAGCCGTTCTTTGTGTGGTGAACACTGGAGTCCTGGAATTACAAGGGTATCTACTTTTTCAAGATATACTAGTCACCTTCCAATTTTGGGTGTCATTAAGTTTATGTATACTGTAGTGAACATATAAGTATCTTATTTGGTAAATGTCCGTCTTAAAGCCTATATTGTTGTAAAACCTTTAGCTGCTGCCACACTGTAGTGGGCTGTAGTCTTAAAATTATGATTCATTGTCGCCCCAGGATCATTGTGAGGCCGGACTGCAGGGACAGACTCTTCACCTATGCTGTACCTACTAACCTTTGTATCCCCAATGTGCAAGCAGACACACTTGGCTTTGCTGATAGACATTAGTCAGCGTCTGTAATTTAGTTTTGAGACTTCGTATTAACCTACAGAACTCTGGTTAAGTTCATAAAACAAGATATGCACTCAAAGTAACTAGTATCCATTTTATTTGTCTGTTTATTTTAACACAAACATTAGTACAAAAAGACAAAATATATATGCACCACACTTCATCGTTCGAT ]
[+] EMBL CD085985             [TAAACTCTGAGGATTCCCCCCGAAATAGGAAGATTAGGGTAATACAGAGTAAAGATGTCTAGCTCAC CAAGCCGTTCTTTGTGTGGTGAACACTGGAGTCCTGGAATTACAAGGGTATCTACTTTTTCAAGATATACTAGTCACCTTCCAATTTTGGGTGTCATTAAGTTTATGTATACTGTAGTGAACATATAAGTATCTTATTTGGTAAATGTCCGTCTTAAAGCCTATATTGTTGTAAAACCTTTAGCTGCTGCCACACTGTAGTGGGCTGTAGTCTTAAAATTATGATTCATTGTCGCCCCAGGATCATTGTGAGGCCGGACTGCAGGGACAGACTCTTCACCTATGCTGTACCTACTAACCTTTGTATCCCCAATGTGCAAGCAGACACACTTGGCTTTGCTGATAGACATTAGTCAGCGTCTGTAATTTAGTTTTGAGACTTCGTATTAACCTACAGAACTCTGGTTAAGTTCATAAAACAAGATATGCACTCAAAGTAACTAGTATCCATTTTATTTGTCTGTTTATTTTAACACAAACATTAGTACAAAAAGACAAAATATATATGCACCACACTTCATCGTTCGAT ]
[+] EMBL CD086028             [TAAACTCTGAGGATTCCCCCCGAAATAGGAAGATTAGGGTAATACAGAGTAAAGATGTCTAGCTCAC CAAGCCGTTCTTTGTGTGGTGAACACTGGAGTCCTGGAATTGCAAGGGTATCTACTTTTTCAAGATATACTAGTCACCTTCCAATTTTGGGTGTCATTAAGTTTATGTATACTGTAGTGAACATATAAGTATCTTATTTGGTAAATGTCCGTCTTAAAGCCTATATTGTTGTAAAACCTTTAGCTGCTGCCATACTGTAGTGGGCTGTAGTCTTAAAATTATGATTCATTGTCGCCCCAGGATCATTGTGAGGCCGGACTGCAGGGACAGACTCTTCACCTATGCTGTACCTACTAACCTTTGTATCCCCAATGTGCAAGCAGACACACTTGGCTTTGCTGATAGACATTAGTCAGCGTCTGTAATTTAGTTTTGAGACTTCGTATTAACCTACAGAACTCTGGTTAAGTTCATAAAACAAGATATGCACTCAAAGTAACTAGTATCCATTTTATTTGTCTGTTTATTTTAACACAAACATTAGTACAAAAAGACAAAATATATATGCACCACACTTCATCGTTCGAT ]
[+] EMBL CD086085             [TAAACTCTGAGGATTCCCCCCGAAATAGGAAGATTAGGGTAATACAGAGTAAAGATGTCTAGCTCAC CAAGCCGTTCTTTGTGTGGTGAACACTGGAGTCCTGGAATTACAAGGGTATCTACTTTTTCAAGATATACTAGTCACCTTCCAATTTTGGGTGTCATTAAGTTTATGTATACTGTAGTGAACATATAAGTATCTTATTTGGTAAATGTCCGTCTTAAAGCCTATATTGTTGTAAAACCTTTAGCTGCTGCCACACTGTAGTGGGCTGTAGTCTTAAAATTATGATTCATTGTCGCCCCAGGATCATTGTGAGGCCGGACTGCAGGGACAGACTCTTCACCTATGCTGTACCTACTAACCTTTGTATCCCCAATGTGCAAGCAGACACACTTGGCTTTGCTGATAGACATTAGTCAGCGTCTGTAATTTAGTTTTGAGACTTCGTATTAACCTACAGAACTCTGGTTAAGTTCATAAAACAAGATATGCACTCAAAGTAACTAGTATCCATTTTATTTGTCTGTTTATTTTAACACAAACATTAGTACAAAAAGACAAAATATATATGCACCACACTTCATCGTTCGAT ]
[+] EMBL CD086170             [TAAACTCTGAGGATTCCCCCCGAAATAGGAAGATTAGGGTAATACAGAGTAAAGATGTCTAGCTCAC CAAGCCGTTCTTTGTGTGGTGAACACTGGAGTCCTGGAATTACAAGGGTATCTACTTTTTCAAGATATACTAGTCACCTTCCAATTTTGGGTGTCATTAAGTTTATGTATACTGTAGTGAACATATAAGTATCTTATTTGGTAAATGTCCGTCTTAAAGCCTATATTGTTGTAAAACCTTTAGCTGCTGCCACACTGTAGTGGGCTGTAGTCTTAAAATTATGATTCATTGTCGCCCCAGGATCATTGTGAGGCCGGACTGCAGGGACAGACTCTTCACCTATGCTGTACCTACTAACCTTTGTATCCCCAATGTGCAAGCAGACACACTTGGCTTTGCTGATAGACATTAGTCAGCGTCTGTAATTTAGTTTTGAGACTTCGTATTAACCTACAGAACTCTGGTTAAGTTCATAAAACAAGATATGCACTCAAAGTAACTAGTATCCATTTTATTTGTCTGTTTATTTTAACACAAACATTAGTACAAAAAGACAAAATATATATGCACCACACTTCATCGTTCGAT ]
[-] EMBL CD086260             [ AAACTCTGAAGATTCCCCCCGAAATAGGAAGATTAGGGTAATACAGAGTAAAGATGTCTAGCTCAC CAAGCCGTTCTTTGTGTGGTGAACACTGGAGTCCTGGAATTACAAGGGTATCTACTTTTTCAAGATATACTAGTCACCTTCCAATTTTGGGTGTCATTAAGTTTATGTATACTGTAGTGAACATATAAGTATCTTATTTGGTAAATGTCCGTCTTAAAGCCTATATTGTTGTAAAACCTTTAGCTGCTGCCACACTGTAGTGGGCTGTAGTCTTAAAATTATGATTCATTGTCGCCCCAGGATCATTGTGAGGCCGGACTGCAGGGACAGACTCTTCACCTATGCTGTACCTACTAACCTTTGTATCCCCAATGTGCAAGCAGACACACTTGGCTTTGCTGATAGACATTAGTCAGCGTCTGTAATTTAGTTTTGAGACTTCGTATTAACCTACAGAACTCTGGTTAAGTTCATAAAACAAGATATGCACTCAAAGTAACTAGTATCCATTTTATTTGTCTGTTTATTTTAACACAAACATTAGTACAAAAAGACAAAATATATATGCACCACACTTCATCGTTCGATT]
[-] EMBL CD085996             [ AAACTCTGAGGATTCCCCCCGAAATAGGAAGATTAGGGTAATACAGAGTAAAGATGTCTAGCTCAC CAAGCCGTTCTTTGTGTGGTGAACACTGGAGTCCTGGAATTACAAGGGTATCTACTTTTTCAAGATATACTAGTCACCTTCCAATTTTGGGTGTCATTAAGTTTATGTATACTGTAGTGAACATATAAGTATCTTATTTGGTAAATGTCCGTCTTAAAGCCTATATTGTTGTAAAACCTTTAGCTGCTGCCACACTGTAGTGGGCTGTAGTCTTAAAATTATGATTCATTGTCGCCCCAGGATCATTGTGAGGCCGGACTGCAGGGACAGACTCTTCACCTATGCTGTACCTACTAACCTTTGTATCCCCAATGTGCAAGCAGACACACTTGGCTTTGCTGATAGACATTAGTCAGCGTCTGTAATTTAGTTTTGAGACTTCGTATTAACCTACAGAACTCTGGTTAAGTTCATAAAACAAGATATGCACTCAAAGTAACTAGTATCCATTTTATTTGTCTGTTTATTTTAACACAAACATTAGTACAAAAAGACAAAATATATATGCACCACACTTCATCGTTCGATT]
[+] EMBL CD086109             [                      acATACGAAGATCACGGTAATACAGAGTAAATATGTCTAGCTCACACAAGCCGTTCTTTGTGTGGTGAACACTGGAGTCCTGGAATTACAAGGGTATCTACTTTTTCAAGATATACTAGTCACCTTCCAATTTTGGGTGTCATTAAGTTTATGTATACTGTAGTGAACATATAAGTATCTTATTTGGTAAATGTCCGTCTTAAAGCCTATATTGTTGTAAAACCTTTAGCTGCTGCCACACTGTAGTGGGCTGTAGTCTTAAAATTATGATTCATTGTCGCCCCAGGATCATTGTGAGGCCGGACTGCAGGGACAGACTCTTCACCTATGCTGTACCTACTAACCTTTGTATCCCCAATGTGCAAGCAGACACACTTGGCTTTGCTGATAGACATTAGTCAGCGTCTGTAATTTAGTTTTGAGACTTCGTATTAACCTACAGAACTCTGGTTAAGTTCATAAAACAAGATATGCACTCAAAGTAACTAGTATCCATTTTATTTGTCTGTTTATTTTAACACAAACATTAGTACAAAAAGACAAAATATATATGCACCACACTTCATCGTTCGAT ]
[-] EMBL CD086293             [                                                                                                                                                                                                                                   CCTATATTGTTGTAAAACCTTTAGCTGCTGCCACACTGTAGCGGGCTGTAGTCTTAAAATTATGATTCATTGTCGCCCCAGGATCATTGTGAGGCCGGACTGCAGGGACAGACTCTTCACCTATGCTGTACCTACTAACCTTTGTATCCCCAATGTGCAAGCAGACACACTTGGCTTTGCTGATAGACATTAGTCAGCGTCTGTAATTTAGTTTTGAGACTTCGTATTAACCTACAGAACTCTGGTTAAGTTCATAAAACAAGATATGCACTCAAAGTAACTAGTATCCATTTTATTTGTCTGTTTATTTTAACACAAACATTAGTACAAAAAGACAAAATATATATGCACCACACTTCATCGTTCGATT]


>consensus_9299#0 TAAACTCTGAGGATTCCCCCCGAAATAGGAAGATTAGGGTAATACAGAGTAAAGATGTCT AGCTCACCAAGCCGTTCTTTGTGTGGTGAACACTGGAGTCCTGGAATTACAAGGGTATCT ACTTTTTCAAGATATACTAGTCACCTTCCAATTTTGGGTGTCATTAAGTTTATGTATACT GTAGTGAACATATAAGTATCTTATTTGGTAAATGTCCGTCTTAAAGCCTATATTGTTGTA AAACCTTTAGCTGCTGCCACACTGTAGTGGGCTGTAGTCTTAAAATTATGATTCATTGTC GCCCCAGGATCATTGTGAGGCCGGACTGCAGGGACAGACTCTTCACCTATGCTGTACCTA CTAACCTTTGTATCCCCAATGTGCAAGCAGACACACTTGGCTTTGCTGATAGACATTAGT CAGCGTCTGTAATTTAGTTTTGAGACTTCGTATTAACCTACAGAACTCTGGTTAAGTTCA TAAAACAAGATATGCACTCAAAGTAACTAGTATCCATTTTATTTGTCTGTTTATTTTAAC ACAAACATTAGTACAAAAAGACAAAATATATATGCACCACACTTCATCGTTCGATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)