These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9304#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 256 fasta sequence [ATCCCCAACACTGTTTAGTGACTGGA-TGA-TAGAGTGGTTATTAAAACTTCCAGCACTGTTATTCACACCAGAATCCTCACAACCATTTGGGAGAGCTGAGAGAGTGGAATTAACTGCAGTTAAACTACCACGATTACCATTTAGTTGAATATTACTTGTGACAATGTTCATGGGACTTTTACCTAGTGGTACTTGTTGTGAATTTTGATGATGTTGTTGCTGTTGCTGCCAATGTGCCATCATTCGGTGTTGGGGA] [+] EMBL CD166489 [ATCCCCAACACTGTTTAGTGACTGGA TGA TAGAGTGGTTATTAAAACTTCCAGCACTGTTATTCACACCAGAATCCTCACAACCA TTGGGAGAGCTGAGAGAGTGGAATTAACTGCAGTTAAACTACCACGATTACCATTTAGTTGAATATTACTTGTGACAATGTTCATGGGACTTTTACCTAGTGGTACTTGTTGTGAATTTTGATGATGTTGTTGCTGTTGCTGCCAATGTGCC ] [+] EMBL CD126718 [ATCGCCAACACTG TTAGTGACTGGA TGA TAGAGTGGTTATTAAAACTTCCAGCACTGTTATTCACACCAGAATCCTCACAACCATTTGGGAGAGCTGAGAGAGTGGAATTAACTGCAGTTAAACTACCACGATTACCATTTAGTTGAATATTACTTGTGACAATGTTCATGGGACTTTTACCTAGTGGTACTTGTTGTGAATTTTGATGATGTTGTTGCTGTTGCTGCCAATGTG ] [+] EMBL CD166520 [ GTTTAGTGACTGGA TGA TAGAG GGTTATTAAAACTTCCAGCACTGTTA TCACACCAGAATCCTCACAACCA TTGGGAGAGCTGAGAGAGTGGAATTAACTGCAGTTAAACTACCACGATTACCATTTAGTTGAATATTACTTGTGACAATGTTCATGGGACTTTTACCTAGTGGTACTTGTTGTGAATTTTGATGATGTTGTTGCTGTTGCTGCCAATGTGCCATCATTCGGTGTT ] [-] EMBL CD166513 [ TAGTGACTGGA TGA TAGAGTGGTTATTAAAACTTCCAGCACTGTTATTCACACCAGAATCCTCACAACCATTTGGGAGAGCTGAGAGAGTGGAATTAACTGCAGTTAAACTACCACGATTACCATTTAGTTGAATATTACTTGTGAC ATGTTCATGGGACTTTTACCTAGTGGTACTTGTTGTG ATTTTGATGATG TGTTGCTGTgc ] [-] EMBL CD166473 [ AGTGACTGGA TGA TAGAATGGTTAATAAAACTTCCAGCACTGTTATTCACACCAGAATCCTCACCACCCTTTGGGAGAGCTGAGAGAGTGGGATTAACTGCAGTTAAACTACCACGATTACCCTTTAGTTGAATATTACTTGTGACCATGTTCATGGGACTTTTACCTAGTGGTACTTGTTGTG ATTTTGATGATGTTGTTGCTG TGCTGCatg ] [+] EMBL CD126680 [ ACTGGA TGACTAGAGTGGTTATTAAAACTTCCAGCACTGTTATTCACACCAGAATCCTCACAACCATTTGGGAGAGCTGAGAGAGTGGAATTAACTGCAGTTAAACTACCACGATTACCATTTAGTTGAATATTACTTGTGACAATGTTCATGGGACTTTTACCTAGTGGTACTTGTTGTGAATTTTGATGATGTTGTTGCTGTTGCTGCCAATGTGCCATCATTCGGTGTTG ] [-] EMBL CD126717 [ CTGGA TGA TAGAGTGGTTATTAAAACTTCCAGCACTGTTATTCACACCAGAATCCTCACAACCATTTGGGAGAGCTGAGAGAGTGGAATTAACTGCAGTTAAACTACCACGATTACCATTTAGTTGAATATTACTTGTGACAATGTTCATGGGACTTTTACCTAGTGGTACTTGTTGTGAATTTTGATGATGTTG TGCTGTTGCTGCC ATGTGCCATCATTC GTGTTGGGGA] [-] EMBL CD126713 [ CTGGA TGA TAGAGTGGTTATTAAAACTTCCAGCACTGTTATTCACACCAGAATCCTCACAACCATTTGGGAGAGCTGAGAGAGTGGAATTAACTGCAGTTAAACTACCACGATTACCATTTAGTTGAATATTACTTGTGACAATGTTCATGGGACTTTTACCTAGTGGTACTTGTTGTGAA TTTGATGATGTTGTTGCTGTTGCTGCCAATGTGCCATCATTCGGg ] [+] EMBL CD126698 [ acaTGGACTGACTAGAGTGGTTATTAAAACTTCCAGCACTGTTATTCACACCAGAATCCTCACAACCA TTGGGAGAGCTGAGAGAGTGGAATTAACTGCAGTTAAACTACCACGATTACCATTTAGTTGAATATTACTTGTGACAATGTTCATGGGACTTTTACCTAGTGGTACTTGTTGTGAATTTTGATGATGTTGTTGCTGTTGCTGCCAATGTG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||