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Schistosoma mansoni
cluster # 9375 cluster # 9375       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9375#0 length = 524 sequences # 9  

consensusID : consensus_9375#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 524
fasta sequence
                              [GCGCGACATCTATCTGGAATTCTCTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTA-TTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCTACGTTTTATTAAAAAAAAAATCGATCACTATATTCCATGCTCACATTTATATCTTGATTGTCTT-GGGGGGGGGAAAGAACAAACAAAATATTGGCATTCCATTATTGTTGATAAGTTGGAGCGTTATGGAAGCGTTTAATGTATGAGCATAGTAGAGAAACACTATTGACATTGTTATCTATTCTCTTTACATTCTATTATGAATCATATTGTTTCTTCTCTTTCATGTCAGTTATTATTTTA]

[+] EMBL CD185500             [GCGCGACATCTATCTGGAATTCTCTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTA TTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCT                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD131582             [GCGCGACATCTATCTGGAATTCTCTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGAAATTGTTA TTTTTTTTTCGTATGGCTGATCTCCTACATATTATGAGTACCACAACTATCACCACCTAGTACTAAAATGTTTCTATAAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCT                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD131658             [ CGCGACATCTATCTGGAATTCTCTTTCAATACATTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTA  TTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCGCTACGT                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD192715             [           ATCTGGAATTCTCTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTATTTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCTACGTTTTATTAAAAAAAAAATCGATCACTATATTCCATGCTCACATTTATATCTTGATTGTCTT GGGGGGGGGAAAGAACAAACAAAATATTGGCATTCCATTATTGTTGATAAGTTGGAGCGTTATGGAAGCGTTTAATGTATGAGCATAGTAGAGAAACACTATTGACATTGNTATCTATTCTCTTTACATTCTATTATGAATCATATTGTTTCTTCTCTTTCATGTCAGTTA        ]
[+] EMBL CD192374             [                   TTCTCTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTA TTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCTACGTTTTATT AAAAAAAAATCGATCACTATATTCCATGCTCACATTTATATCTTGATTGTCTT GGGGGGGGGAAAGAACAAACAAAATATTGGCATTCCATTATTGTTGATAAGTTGGAGCGTTATGGAAGCGTTTAATGTATGAGCATAGTAGAGAAACACTATTGACATTGTTATCTATTCTCTTTACATTCTATTATGAATCATATTGTTTCTTCTCTTTCATGTCAGTTA        ]
[+] EMBL CD134818             [                   TTCTCTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTA TTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCTACGTTTTATTAAAAAAAAAATCGATCACTATATTCCATGCTCACATTTATATCTTGATTGTCTTGGGGGGGGGGAAAGAACAAACAAAATATTGGCATTCCATTATTGTTGATAAGTTGGAGCGTTATGGAAGCGTTTAATGTATGAGCATAGTAGAGAAACACTATTGACATTGTTATCTATTCTCTTTACATTCTATTATGAATCATATTGTTTCTTCTCTTTCATGTCAGTTA        ]
[+] EMBL CD192468             [                   TTCTCTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTA TTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATCGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCTACGTTTTATTAAAAAAAAAATCGATCACTATATTCCATGCTCACATTTATATCTTGATTGTCTT GGGGGGGGGAAAGAACAAACAAAATATTGGCATTCCATTATTGTTGATAAGTTGGAGCGTTATGGAAGCGTTTAATGTATGAGCATAGTAGAGAAACACTATTGACATTGNTATCTATTCTCTNTACATTCTATTATGAATCATATTGTTTCTTCTCTTTCATGTCAGTTA        ]
[-] EMBL CD192298             [                    TCTTTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTATTTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCTACGTTTTATTAAAAAAAAAATCGATCACTATATTCCATGCTCACATTTATATCTTGATTGTCTT GGGGGGGGGAAAGAACAAACAAAATATTGGCATTCCATTATTGTTGATAAGTTGGAGCGTTATGGAAGCGTTTAATGTATGAGCATAGTAGAGAAACACTATTGACATTGTTATCTATTCTCTTTACATTCTATTATGAATCATATTGTTTCTTCTCTTTCATGTCAGTTATTATTTTA]
[+] EMBL CD156006             [                       CTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTA TTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCTACGTTTTATTAAAAAAAAAATCGATCACTATATTCCATGCTCACATTTATATCTTGATTGTCTT GGGGGGGGGAAAGAACAAACAAAATATTGGCATTCCATTATTGTTGATAAGGTGGAGCGTTATGGAAGCGTTTAATG                                                                                                      ]


>consensus_9375#0 GCGCGACATCTATCTGGAATTCTCTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACA TTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTATTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACAT ACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAAT CTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCG TCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCTACGTTTTATTAAAAAAAAA ATCGATCACTATATTCCATGCTCACATTTATATCTTGATTGTCTTGGGGGGGGGAAAGAA CAAACAAAATATTGGCATTCCATTATTGTTGATAAGTTGGAGCGTTATGGAAGCGTTTAA TGTATGAGCATAGTAGAGAAACACTATTGACATTGTTATCTATTCTCTTTACATTCTATT ATGAATCATATTGTTTCTTCTCTTTCATGTCAGTTATTATTTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)