Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9385 cluster # 9385       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9385#0 length = 1311 sequences # 9  

consensusID : consensus_9385#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1311
fasta sequence
                              [TAAACAACTACCATCTGTTGTTACACCACCACCTCTGCTAGATGCCAATTATAACAATAATAATAATAGAAACTATCCTGTAATGAACCATCGTTATGTACAACCTCCAAGTAATAATCTATTAGGATCAGATTCAGTTTCTGGAAATAGTATGTCTAATGTGTTAATGCCGCCAGTGCCTGCATCACCACCAGCACAATCAGCCCAAATGATTACAAACTTTGGGCATAACATTGGTGGATCAATGCCTCCTAGTTTTCAATCATTAAACACTATGCCTTATGGTATGCCAACACCCACTCCCCAATTCAATGTTCAACAGCAGCAAGAACACAATCAACAACAAATGCGACCACTTCTACCGACATTACCACAAAAACAGCATCAATCATCAATGATGACACCAGGTTGGAATGATCCACCTATCTTAACAACTGATAAACCACGCCAAACAACCGTTTCACACAACCCTTATTATAATCCTATGGAATTTGTTAATTCACCTTTACCTCAACCGAATAATTCCGTATCACCGTCGAATTTTCCTCAACCAATGACGGAACTATACACAACTTCAAATCCTCCTTTACCACCAGGATATCCTGTTACTGGATTAAACGTATGTCAACCTGCACCACCACCACCACCACCAGTTCAAAATTCTATCCCACCTATAAATGCTGATATAATTCATCCTCAGCAGCCCTTGCCACCGTTGCCGACCCATGTTCAACAGCAATCATCATCATCACTCATGAGACCGCCAATTCAACAGCCATCGTATTCACAAGTACAAGGAGTGCCTCACCAACAAGAACAGTACCCAAATTATTTCCAGCCATCGGTTGAACAAACTTCTCAGTTTTCCAATATATCGTCATCACTACCACCTATGTCGTCAGTCGTTCCACCGAACCCTTACTCTCAATTTAATATTTGGCCTGCAGCTCAACCTTTGTCTAATACTGTAAAATCTGGGATTATCAATCAAACTATTGTTGAAAATGCCATATCATCAAATTCTTTCAGTTCTTCAAATAATGACCATAATGATGCACAGTCACTACATAATTTGGATTCTACAAGTTTAAACACCGATCCCAATAATATTAATAATTATTCATTGCCGACGGAATTCCAACCCATACAAAAAGTGTTATTTGACTTAATTCAAAATTGTCGTAAAGTTGGTGACACACATAATCGTCAAACATTAACGGATGATGAACATCGTCTGAATCAATTCTTTATGAATATATCTAATGGTCAATTACAATCAAATACTACATCAATGGAATATTTACATCACTG]

[+] EMBL CD160391             [TAAACAACTACCATCTGTTGTTACACCACCACCTCTGCTAGATGCCAATTATAACAATAATAATAATAGAAACTATCCTGTAATGAACCATCGTTATGTACAACCTCCAAGTAATAATCTATTAGGATCAGATTCAGTTTCTGGAAATAGTATGTCTAATGTGTTAATGCCGCCAGTGCCTGCATCACCACCAGCACAATCAGCCCAAATGATTACAAACTTTGGGCATAACATTGGTGGATCAATGCCTCCTAGTTTTCAATCATTAAACACTATGCCTTATGGTATGCCAACANCCACTCCCCAATTCAATGTTCAACAGCAGCAAGAACACAATCAACAACAAATGCGAACACTTCTACCGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD160102             [TAAACAACTACCATCTGTTGTTACACCACCACCTCTGCTAGATGCCAATTATAACAATAATAATAATAGAAACTATCCTGTAATGAACCATCGTTATGTACAACCTCCAAGTAATAATCTATTAGGATCAGATTCAGTTTCTGGAAATAGTATGTCTAATGTGTTAATGCCGCCAGTGCCTGCATCACCACCAGCACAATCAGCCCAAATGATTACAAACTTTGGGCATAACATTGGTGGATCAATGCCTCCTAGTTTTCAATCATTAAACACTATGCCTTATGGTATGCCAACANCCACTCCCCAATTCAATGTTCAACAGCAGCAAGAACACAATCAACAACAAATGCGACCACTTCTAACGACATTAGCACAAAAACAGCATCCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD114095             [                                                         TAATAATAATAGGGGCTATCCTGTAATGAACCATCGTTATGTACAACCTCCAAGTAATAATCTATTAGGATCAGATTCAGTTTCTGGAAATAGTATGTCTAATGTGTTAANGCCGCCAGTGCTTGCATCACCACCAGCACAATCAGCCCAAATGATTACAAACTTTGGGCATAACATTGGTGGATCAATGCCTCCTAGTTTTCAATCATTAAACACTATGCCTTATGGTATGCCAACACCCACTCCCCAATTCAATGTTCAACAGCAGCAAGAACACAATCAACAACAAATGCGACCACTTCTACCGACATTACCACAAAAACAGCATCAATCATCAATGATGACACCAGGTTGGAATGATCCACCTATCTTAACAACTGATAAACCACGCCAAACAACCGTTTCACACAACCCTTATTATAATCCTATGGAATTTGTTAATTCACATTTACCTCAACCGAATAATTCCGTATCACCGTCGAATTTTCCTCAACCAATGACGGAACTATACACAACTTCAAATCCTCCTTTACCACCAGGATATCCTGTTACTGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD133304             [                                                                                                                                                                                                  CACAATCAGCCCAAATGATTACAAACTTTGGGCATAACATTGGTGGATCAATGCCTCCTAGTTTTCAATCATTAAACACTATGCCTTATGGTATGCCAACACCCACTCCCCAATTCAATGTTCAACAGCAGCAAGAACACAATCAACAACAAATGCGACCACTTCTACCGACATTACCACAAAAACAGCATCAATCATCAATGATGACACCAGGTTGGAATGATCCACCTATCTTAACAACTGATAAACCACGCCAAACAACCGTTTCACACAACCCTTATTATAATCCTATGGAATTTGTTAATTCACCTTTACCTCAACCGAATAATTCCGTATCACCGTCGAATTTTCCTCAACCAATGACGGAACTATACACAACTTCAAATCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL AI976664             [                                                                                                                                                                                                                                          TGGTGGATCAATGCCTCCTAGTTTTCAATCATTAAACACTATGCCTTATGGTATGCCAACACCCACTCCCCAATTCAATGTTCAACAGCAGCAAGAACACAATCAACAACAAATGCGACCACTTCTACCGACATTACCACAAAAACAGCATCAATCATCAATGATGACACCAGGTTGGAATGATCCACCTATCTTAACAACTGATAAACCACGCCAAACAACCGTTTCACACAACCCTTATTATAATCCTATGGAATTTGTTAATTCACCTTTACCTCAACCGAATAATTCCGTATCACCGTCGAATTTTCCTCAACCAATGACGGAACTATACACAACTTCAAATCCTCCTTTACCACCAGGATATCCTGTTACTGGATTAAACGTATGTCAACCTGCACCACCACCACCACCACCAGTTCAAAATTCTATCCCACCTATAAATGCTGATATAATTCATCCTCAGCAGCCCTTGCCACCGTTGCCGACCCATGTTCAACAGCAATCATCATCATCACTCATGAGACCGCCAATTCAACAGCCATCGGATTCACAAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD147907             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAAATTCTATCCCACCTATAAATGCTGATATAATTCATCCTCAGCAGCCCTTGCCACCGTTGCCGACCCATGTTCAACAGCAATCATTATCATCACTCATGAGACCGCCAATTCAACAGCCATCGTATTCACAAGTACAAGGAGTGCCTCACCAACAAGAACAGTACCCAAATTATTTCCAGCCATCGGTTGAACAAACTTCTCAGTTTTCCAATATATCGTCATCACTACCACCTATGTCGTCAGTCGTTCCACCGAACCCTTACTCTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD193563             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAGCCCTTGCCACCGTTGCCGACCCATGTTCAACAGCAATCATCATCATCACTCATGAGACCGCCAATTCAACAGCCATCGTATTCACAAGTACAAGGAGTGCCTCACCAACAAGAACAGTACCCAAATTATCTCCAGCCATCGGTTGAACAAACTTCTCAGTTTTCCAATATATCGTCATCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD167072             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TCATCATCACTCATGAGACCGCCAATTCAACAGCCATCGTATTCACAAGTACAAGGAGTGCCTCACCAACAAGAACAGTACCCAAATTATTTCCAGCCATCGGTTGAACAAACTTCTCAGTTTTCCAATATATCGTCATCACTACCACCTATGTCGTCAGTCGTT CACCGAACCCTTACTCTCAATTTAATATTTGGCCTGCAGCTCAACCTTTGTCTAATACTGTAAAATCTGGGATTATCAATCAAACTATTGTTGAAAATGCCATATCATCAAATTCTTTCAGTTCTTCAAATAATGACCATAATGATGCACAGTCACTACATAATTTGGATTCTACAAGTTTAAACACCGATCCCAATAATATTAATAATTATTCATTGCCGACGGAATTCCAACCCATACAAAAAGTGTTATTTGACTTAATTCAAAATTGTCGTAAAGTTGGTG                                                                                                                      ]
[+] EMBL AI975429             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CAACCTTTGCATAATACTGTTAAATCTGGGATTATCAATCAAACTATTGTTGAAAATGCCATATCATCAAATTCTTTCAGCTCTTCAAATAATGACCATAATGATGCACACACACTACATAATTTGGATTCTACAAGTTTAAACACCGATCCCAATAATATTAATAATTATTCATTGCCGACGGAATCACAACCCATACAAAAAGTGTTATTTGACTCAATTCAAAATTGACGTAAAGCTGGTGACACACATAATCGTCAAACATTAACGGATGATGAACATCGTCTGAATCAATTCTTTATGAATATATCTAATGGTCAATTACAATCAAATACTACATCAATGGAATATTTACATCACTG]


>consensus_9385#0 TAAACAACTACCATCTGTTGTTACACCACCACCTCTGCTAGATGCCAATTATAACAATAA TAATAATAGAAACTATCCTGTAATGAACCATCGTTATGTACAACCTCCAAGTAATAATCT ATTAGGATCAGATTCAGTTTCTGGAAATAGTATGTCTAATGTGTTAATGCCGCCAGTGCC TGCATCACCACCAGCACAATCAGCCCAAATGATTACAAACTTTGGGCATAACATTGGTGG ATCAATGCCTCCTAGTTTTCAATCATTAAACACTATGCCTTATGGTATGCCAACACCCAC TCCCCAATTCAATGTTCAACAGCAGCAAGAACACAATCAACAACAAATGCGACCACTTCT ACCGACATTACCACAAAAACAGCATCAATCATCAATGATGACACCAGGTTGGAATGATCC ACCTATCTTAACAACTGATAAACCACGCCAAACAACCGTTTCACACAACCCTTATTATAA TCCTATGGAATTTGTTAATTCACCTTTACCTCAACCGAATAATTCCGTATCACCGTCGAA TTTTCCTCAACCAATGACGGAACTATACACAACTTCAAATCCTCCTTTACCACCAGGATA TCCTGTTACTGGATTAAACGTATGTCAACCTGCACCACCACCACCACCACCAGTTCAAAA TTCTATCCCACCTATAAATGCTGATATAATTCATCCTCAGCAGCCCTTGCCACCGTTGCC GACCCATGTTCAACAGCAATCATCATCATCACTCATGAGACCGCCAATTCAACAGCCATC GTATTCACAAGTACAAGGAGTGCCTCACCAACAAGAACAGTACCCAAATTATTTCCAGCC ATCGGTTGAACAAACTTCTCAGTTTTCCAATATATCGTCATCACTACCACCTATGTCGTC AGTCGTTCCACCGAACCCTTACTCTCAATTTAATATTTGGCCTGCAGCTCAACCTTTGTC TAATACTGTAAAATCTGGGATTATCAATCAAACTATTGTTGAAAATGCCATATCATCAAA TTCTTTCAGTTCTTCAAATAATGACCATAATGATGCACAGTCACTACATAATTTGGATTC TACAAGTTTAAACACCGATCCCAATAATATTAATAATTATTCATTGCCGACGGAATTCCA ACCCATACAAAAAGTGTTATTTGACTTAATTCAAAATTGTCGTAAAGTTGGTGACACACA TAATCGTCAAACATTAACGGATGATGAACATCGTCTGAATCAATTCTTTATGAATATATC TAATGGTCAATTACAATCAAATACTACATCAATGGAATATTTACATCACTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)