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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9449#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 833 fasta sequence
[ATAATGAGTGGTTCTACCCTTCAGTTTGCCGGGATTGGAGCTGTTCGTAATATGAAGAATCCTGTAAAGGTTGCAAGGCTTCTGTTACAGTCACAAATTGACCACCCTGTGGGTGAGTTAGGACGCGTTCCTCCATCTGTACTTGTTGGTGATGGTGCTCATGTGTGGGCTGCGTCAAAAGGATATTCTGTTGATAATAGTGATCTCGTCACAAAACATTCACGGGTTTCATGGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTTGATACTGTAGGTGCTGTTTGTATTGATATAGAAGGGAAGATTGCTGCAGCATCTTCTAGTGGTGGTATTGCAATGAAGTATGAAGGTCGTCTAGGTCAAGCGTGTACATATGGCTGTGGTTGTTGGGCAGAAGAACTCAGTTCA-TTTTCTAGTATTGGGGTTGTTACTTCAGGTACTGGTGAACAACTTATAAGAACTCAACTTGCTCAGCGTTCTGCAGAACGTTTTAATGGTGACTCTATTTCCGTTTCCGAAATAGTCCACTCATCTCTCACTGATGGGTTTTTAAATTCTAAGTATCTTTCCTGTGATATGGAG-AAATTTGCTGG-AG-TGCTGGAGTTTACGCTAATTTTGAACGAATTGACTTTCCTAATGTGGAGGTGTTTTTTTGGACACTCAACACGATCGATGAGTGTTGGCCACTACCTACCGAGTATTATGAAAAAGCCATCTGTCCATGCATCACGCAAGCAAATTGATAA]
[+] EMBL CD165039 [ATAATGAGTGGTTCTACCCTTCAGTTTGCCGGGATTGGAGCTGTTCGTAATATGAAGAATCCTGTAAAGGTTGCAAGGCTTCTGTTACAGTCACAAATTGACCACCCTGTGGGTGAGTTAGGACGCGTTCCTCCATCTGTACTTGTTGGTGATGGTGCTCATGTGTGGGCTGCGTCAAAAGGATATTCTGTTGATAATAGTGATCTCGTCACAAAACATTCACGGGTTTCATGGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTT ]
[+] EMBL CD146485 [ GATTGGAGCTGTTCGTAATATGAAGAATCCTGTAAAGGTTGCAAGGCTTCTGTTACAGTCACAAATTGACCACCCTGTGGGTGAGTTAGGACGCGTTCCTCCATCTGTACTTGTTGGTGATGGTGCTCATGTGTGGGCTGCGTCAAAAGGATATTCTGTTGATAATAGTGATCTCGTCACAAAACATTCACGGGTTTCATGGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTTGATACTGTAGGTGCTGTTTGTATTGATATAGAAGGGAAGATTGCTGCAGCATCTTCTAGTGGTGGTATTGCAATGAAGTATGAAGGTCGTCTAGGTCAAGCGTGTACATATGGCTGTGGTTGTTGGGCAGAAGAACTCAGTTCA TTNTCTAGTATTGGGGTTGTTACTTCAGGTACTGGTGAACAACTTATAAGAACTCAACTTGCTCAGCGTTCTGCAGAACGTTNTAATGGTGACTCTATTTTCGTTTCCGAAATAGTCCACTCATCTCTCACTGATGGGGTTTTAAATTCTAAGTATCTTTCCTGTGATATGGAGAAAATTTGCTGGNAG TGCTGNAGTTTACGCTAATTTTGGACGAATTGAC ]
[-] EMBL CD161602 [ ATTGGAGCTGTTCGTAATATGAAGAATCCTGTAAAGGCTGCAAGGCTTCTGTTACAGTCACAAATTGACCACCCTGTGGGTGAGTTAGGACGCGTTCCTCCATCTGTACTTGTTGGTGATGGTGCTCATGTGTGGGCTGCGTCAAAAGGATATTCTGTTGATAATAGTGATCTCGTCACAAAACATTCACGGGTTTCATGGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTTGATACTGTAGGTGCTGTTTGTATTGATATAGAAGGGAAGATTGCTGCAGCATCTTCTAGTGGTGGTATTGCAATGAAGTATGAAGGTCGTCTAGGTCAAGCGTGTACATAT ]
[-] EMBL CD161643 [ ATTGGAGCTGTTCGTAATATGAAGAATCCTGTAAAGGTTGCAAGGCTTCTGTTACAGTCACAAATTGACCACCCTGTGGGTGAGTTAGGACGCGTTCCTCCATCTGTACTTGTTGGTGATGGTGCTCATGTGTGGGCTGCGTCAAAAGGATATTCTGTTGATAATAGTGATCTCGTCACAAAACATTCACGGGTTTCATGGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTTGATACTGTAGGTGCTGTTTGTATTGATATAGAAGGGAAGATTGCTGCAGCATCTTCTAGTGGTGGTATTGCAATGAAGTATGAAGGTCGTCTAGGTCAAGCGTGTACATAT ]
[-] EMBL CD166247 [ AAGGCTTCTGTTACAGTCACAAATTGACCACCCTGTGGGTGAGTTAGGACGCGTTCCTCCATCTGTACTTGTTGGTGATGGTGCTCATGTGTGGGCTGCGTCAAAAGGATATTCTGTTGATAATAGTGATCTCGTCACAAAACATTCACGGGTTTCATGGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTTGATACTGTAGGTGCTGTTTGTATTGATATAGAAGGGAAGATTGCTGCAGCATCTTCTAGTGGTGGTATTGCAATGAAGTATGAAGGTCGTCTAGGTCAAGCGTGTACATATGGCTGTGGTTGTTGGGCAGAAGAACTCAGTTCATTTTTCTAGTATTGGGGTTGTTACTTCAGGTACTGGTGAACAACTTATAAGAACACAACTg ]
[-] EMBL CD166246 [ TGGGTGAGTTAGGACGCGTTCCTCCATCTGTACTTGTTGGTGATGGTGCTCATGTGTGGGCTGCGTCAAAAGGATATTCTGTTGATAATAGTGATCTCGTCACAAAACATTCACGGGTTTCATGGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTTGATACTGTAGGTGCTGTTTGTATTGATATAGAAGGGAAGATTGCTGCAGCATCTTCTAGTGGTGGTATTGCAATGAAGTATGAAGGTCGTCTAGGTCAAGCGTGTACATATGGCTGTGGTTGTTGGGCAGAAGAACTCAGTTCA TTTTCTAGTATTGGGGTTGTTACTTCAGGTACTGGTGAACAACTTA ]
[-] EMBL CD123259 [ GGGAAAAATACAAAAGTTGGTTATTTAATGGGAACGAAATGAATGCAACTACAAGGGATCCTCATTTTAATCATCATGAAAATGTTCCTGAGTTGAAAAGGTCTCGTGTCCATAGATTTGATACTGTAGGTGCTGTTTGTATTGATATAGAAGGGAAGATTGCTGCAGCATCTTCTAGTGGTGGTATTGC ]
[+] EMBL CD127815 [ CAAGCGTGTACATATGGCTGTGGTTGTTGGGCAGAAGAACTCAGTTCA TTTTCTAGTATTGGGGTTGTTACTTCAGGTACTGGTGAACAACTTATAAGAACTCAACTTGCTCAGCGTTCTGCAGAACGTTTTAATGGTGACTCTATTTCCGTTTCCGAAATAGTCCACTCATCTCTCACTGACGGGTTTTTAAATTCTAAGTATCTTTCCTGTGATATGGAG AAATTTGCTGG AGTTGCTGGAGTTTACGCTAATTTTGAACGAATTGACTTTCCTAATGTGGAGGTGTTTTTTTGGACACTCAACACGATCGATGAGTGTTGGCCACTACCTACCGAGTATTATGAAAAAGCCATCTGTCCATGCATCACGCAAGC ]
[-] EMBL CD137322 [ TGTTGGGCAGAAGAACTCAGTTCA TTTTCTAGTATTGGGGTTGTTACTTCAGGTACTGGTGAACAACTTATAAGAACTCAACTTGCTCAGCGTTCTGCAGAACGGTTTAATGGTGACTCTATTTCCGTTTCCGAAATAGTCCACTCATCTCTCACTGATGGGTTTTTAAATTCTAAGTATCTTTCCTGTGATATGGAG AAATTTGCTGG AGTTGCTGGAGTTTACGCTAATTTTGAACGAATTGACTTTCCTAATGTGGAGGTG TTTTTTGGACACTCAACACGATCGATGAGTGTTGGCCACTACCTACCGAGTATTATGAAAAAGCCATCTGTCCATGTATCACGCAAGCAAATTGATAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||