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Schistosoma mansoni
cluster # 9450 cluster # 9450       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9450#0 length = 706 sequences # 9  

consensusID : consensus_9450#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 706
fasta sequence
                              [ATAGCGAAGCGAAACGAAATGACGCGCGATAGAGAAAGCAAGTGAATCAACTTAATTCATTCAGACATGAATCGACATTTA-TAGACAAACAAAAAGGTCAGGAATAATAAGCGAATAAGTGATAAGGTAAAAATGTGGCTTAAGAAGAATGAATAGATTGGTCTGTCCAGATGCTAGAATAACCCATATAGACTTGACATAATACCAGCCCCTACACTTTGTTCAATGCTTCAGATTACGTGAATCTCGATTACTGGATAAAAAAGTGGGAAATGATTTTAACATTTATGATTTTGCCGCTAACATTATTTCCCATGTAACAATAAATATAACAGTTTACCTATTCAAAAAATTCTGGGACGTGTTACAACATAGAAACTAAAACCATTATACTTTTATATAGGTTCGTGTTTATTTATTTATACAAATAAAAGATTTTATACATAATGTGTTAATTTAAAGATAAAAATAAACAGGAAAACATCTTCAGTTTCTGTTAAATGTTAGGATCCATCACCTTTACCGATATAGGTCTGCGTAAATGTCATGGGAAGCTTGGATAAG-ATACTCATGTAAGTTCGGCTGACATAAACAAAACTGATTTAGAATAGATTGCTTATGGNTATATATCAGCCTATCTCGGACCTATCNACAGGATGCACATGCATGTCAGTGTTGATGCTCNACATTGAGACTTG-ACCTAGTA]

[+] EMBL CD088799             [ATAGCGAAGCGAAACGAAATGACGCGCGATAGAGAAAGCAAGTGAATCAACTTAATTCATTCAGACATGAATCGACATTTA TAGACAAACAAAAAGGTCAGGAATAATAAGCGAATAAGTGATAAGGTAAAAACGTGGCTTAAGAAGAATGAATAGATTGGTCTGTCCAGATGCTAGAATAACCCATATAGACTTGACATAATACCAGCCCCTACACTTTGTTCAATGCTTCAGATTACGTGAATCTCGATTACTGGATAAAAAAGTGGGAAATGATTTTAACATTTATGATTTTGCCGCTAACATTATTTCCCATGTAACAATAAATATAACAGTTTACCTATTCAAAAAATTCTGGGACGTGTTACAACATAGAAACTAAAACCATTATACTTTTATATAGGTTCGTGTTTATTTATTTATACAAATAAAAGATTTTATACATAATGTGTTAATTTAAAGATAAAAATAAACAGGAAAACATCTTCAGTTTCTGTTAAATGTTAGGATCCATCACCTTTACCGATATAGGTCTGCGTANATGTCATGGGAAGCTCGGATAAG ATACTCATGTAAGTTCGGCTGACATANACAAAACTGATTTAGAATAGATTGCTTATGGNTATATATCAGCCTATCTCGGACCTATCNACAGGATGCACATGCATGTCAGTGTTGATGCTCNACATTGAGACTTG ACCTAGT ]
[+] EMBL CD088731             [ATAGCGAAGCGAAACGAAATGACGCGCGATAGAGAAAGCAAGTGAATCAACTTAATTCATTCAGACATGAATCGACATTTA TAGACAAACAAAAAGGTCAGGAATAATAAGCGAATAAGTGATAAGGTAAAAATGTGGCTTAAGAAGAATGAATAGATTGGTCTGTCCAGATGCTAGAATAACCCATATAGACTTGACATAATACCAGCCCCTACACTTTGTTCAATGCTTCAGATTACGTGAATCTCGATTACTGGATAAAAAAGTGGGAAATGATTTTAACATTTATGATTTTGCCGCTAACATTATTTCCCATGTAACAATAAATATAACAGTTTACCTATTCAAAAAATTCTGGGACGTGTTACAACATAGAAACTAAAACCATTATACTTTTATATAGGTTCGTGTTTATTTATTTATACAAATAAAAGATTTTATACATAATGTGTTAATTTAAAGATAAAAATAAACAGGAAAACATCTTCAGTTTCTGTTAAATGTTAGGATCCATCACCTTTACCGATATAGGTCTGCGTAAATGTCATGGGAAGCTTGGATAAG ATACTCATGTAAGTTCGGCTGACATAAACAAAA                                                                                                              ]
[+] EMBL CD088807             [ATAGCGAAGCGAAACGAAATGACGCGCGATAGAGAAAGCAAGTGAATCAACTTAATTCATTCAGACATGAATCGACATTTA TAGACAAACAAAAAGGTCAGGAATAATAAGCGAATAAGTGATAAGGTAAAAATGTGGCTTAAGATGAATGAATAGATTGGTCTGTCCAGATGCTAGAATAACCCATATAGACTTGACATAATACCAGCCCCTACACTTTGTTCAATGCTTCAGATTACGTGAATCTCGATTACTGGATAAAAAAGTGGGAAATGATTTTAACATTTATGATTTTGCCGCTAACATTATTTCCCATGTAACAATAAATATAACAGTTTACCTATTCAAAAAATTCTGGGACGTGTTACAACATAGAAACTAAAACCATTATACTTTTATATAGGTTCGTGTTTATTTATTTATACAAATAAAAGATTTTATACATAATGTGTTAATTTAAAGATAAAAATAAACAGGAAAACATCTTCAGTTTCTGTTAAATGTTAGGATCCATCACCTTTACCGATATAGGTCTGCGTANATGTCATGCGAAGCTTGGATAAG ATACTCATGTAAGTTCG                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD088741             [ATAGCGAAGCGAAACGAAATGACGCGCGATAGAGAAAGCAAGTGAATCAACTTAATTCATTCAGACATGAATCGACATTTA TAGACAAACAAAAAGGTCAGGAATAATAAGCGAATAAGTGATAAGGTAAAAATGTGGCTTAAGAAGAATGAATAGATTGGTCTGTCCAGATGCTAGAATAACCCATATAGACTTGACATAATACCAGCCCCTACACTTTGTTCAATGCTTCAGATTACGTGAATCTCGATTACTGGATAAAAAAGTGGGAAATGATTTTAACATTTATGGTTTTGCCGCTAACATTATTTCCCATGTAACAATAAATATAACAGTTTACCTATTCAAAAAATTCTGGGACGTGTTACAACATAGAAACTAAAACCATTATACTTTTATATAGGTTCGTGTTTATTTATTTATACAAATAAAAGATTTTATACATAATGTGTTAATTTAAAGATAAAAATAAACAGGAAAACATCTTCGGTTTCTGTTAAATGTTAGGATCCATCACCTTTACCGATATAAGTCTGCGTAAATGTCATGGGAAGCTTGNAT                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD088846             [ATAGCGAAGCGAAACGAAATGACGCGCGATAGAGAAAGCAAGTGAATCAACTTAATTCATTCAGACATGAATCGACATTTA TAGACAAACAAAAAGGTCAGGAATAATAAGCGAATAAGTGATAAGGTAAAAATGTGGCTTAAGAAGAATGAATAGATTGGTCTGTCCAGATGCTAGAATAACCCATATAGACTTGACATAATACCAGCCCCTACACTTTGTTCAATGCTTCAGATTACGTGAATCTCGATTACTGGATAAAAAAGTGGGAAATGATTTTAACATTTATGATTTTGCCGCTAACATTATTTCCCATGTAACAATAAATATAACAGTTTACCTATTCAAAAAATTCTGGGACGTGTTACAACATAGAAACTAAAACCATTATACTTTTATATAGGTTCGTGTTTATTTATTTATACAAATAAAAGATTTTATACATAATGTGTTAATTTAAAGATAAAAATAAACAGGAAAACATCTTCAGTTTCTGTTAAATGGTAGGATCCATCACCTTTACCGATATAGGTCTGCGTANATGTC                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD088787             [ATAGCGAAGCGAAACGAAATGACGCGCGATAGAGAAAGCAAGTGAATCAACTTAATTCATTCAGACATGAATCGACATTTA TAGACAAACAAAAAGGTCAGGAATAATAAGCGAATAAGTGATAAGGTAAAAATGTGGCTTAAGAAGAATGAATAGATTGGTCTGTCCAGATGCTAGAATAACCCATATAGACTTGACATAATACCAGCCCCTACACTTTGTTCAATGCTTCAGATTACGTGAATCTCGATTACTGGATAAAAAAGTGGGAAATGATTTTAACATTTATGATTTTGCCGCTAACATTATTTCCCATGTAACAATAAATATAACAGTTTACCTATTCAAAAAATTCTGGGACGTGTTACAACATAGAAACTAAAACCATTATACTTTTATATAGGTTCGTGTTTATTTATTTATACAAATAAAAGATTTTATACATAATGTGTCAATTTAAAGATAAAAATAAACAGGAAAACATCTTCAGTTTCTGTTAAATGTTAGGATCCATCACCTTTACCGATATAGGTCTGCGTCAATGTC                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD088809             [ATAGCGAAGCGAAACGAAATGACGCGCGATAGAGAAAGCAAGTGAATCAACTTAATTCATTCAGACATGAATCGACATTTACTAGACAAACAAAAAGGTCAGGAATACTAAGCGAATAAGTGATAAGGTAAAAATGTGGCTTAAGAAGAATGAATAGATTGGTCTGTCCAGATGCTAGAATAACCCATATAGACTTGACATAATACCAGCCCCTACACTTTGTTCAATGCTTCAGATTACGTGAATCTCGATTACTGCTTAAAAAAGTGGGAAATGATTTTAACATTTATGATTTTGCCGCTAACATTATTTCCCATGTAACAATAAATATAACAGTTTACCTATTCAAAAAATTCTGGGACGTGTTACAACATAGAAACTAAAACCATTATACTTTTATATAGGTTCGTGTTTATTTATTTATACAAATAAAAGATTTTATACATAATGTGTTAATTTACAGATAAAAATAAACAGGAAAACATCTTCAGTTTC                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD088848             [ATAGCGAAGCGAAACGAAATGACGCGCGATAGAGAAAGCAAGTGAATCAACTTAATTCATTCAGACATGAATCGACATTTA TAGACAAACAAAAAGGTCAGGAATAATAAGCGAGTAAGTGATAAGGTAAAAATGTGGCTTAAGAAGAATGAATAGATTGGTCTGTCCAGATGCTAGAATAACCCATATAGACTTGACATAATACCAGCCCCTACACTTTGTTCAATGCTTCAGATTACGTGAATCTCGATTACTGGATAAAAAAGCGGGAAATGATTTTAACATTTATGATTTTGCCGCTAACATTATTTCCCATGTAACAATAAATATCACAGTTTACCTATTCAAAAAATTCTGGGACGTGTTACAACATAGAAACTAAAACCATTATACTTTTATATAGGTTCGCGTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD088849             [                                                                                                                                                                                                  cTGACATAATGCCAGCCCCTACACTTTGTGCAATGCTTCAGATTACGTGAATCTCGATTACTGGATAAAAAAGTGGGAAATGATTTTAACATTTATGATTTTGCCGCTAACATTATTTCCCATGTAACAATAAATATAACAGTTTACCTATTCAAAAAATTCTGGGACGTGTTACAACATAGAAACTAAAACCATTATACTTTTATATAGGTTCGTGTTTATTTATTTATACAAATAAAAGATTTTATACATAATGTGTTAATTTAAAGATAAAAATAAACAGGAAAACATCTTCAGTTTCTGTTAAATGTTAGGATCCATCACCTTTACCGATATAAGTCTGCGTAAATGTCATGGGAAGCTTGGATAAGAATACTCATGTAAGTTCGGCTGACATAAACAAAACTGATTTAGAATAGATTGCTTATGGTTATATATCAGCCTATCTCGGACCTATCAACAGGATGCACATGCATGTCAGTGTTGATGCTCAACATTGAGACTTGAACCTAGTA]


>consensus_9450#0 ATAGCGAAGCGAAACGAAATGACGCGCGATAGAGAAAGCAAGTGAATCAACTTAATTCAT TCAGACATGAATCGACATTTATAGACAAACAAAAAGGTCAGGAATAATAAGCGAATAAGT GATAAGGTAAAAATGTGGCTTAAGAAGAATGAATAGATTGGTCTGTCCAGATGCTAGAAT AACCCATATAGACTTGACATAATACCAGCCCCTACACTTTGTTCAATGCTTCAGATTACG TGAATCTCGATTACTGGATAAAAAAGTGGGAAATGATTTTAACATTTATGATTTTGCCGC TAACATTATTTCCCATGTAACAATAAATATAACAGTTTACCTATTCAAAAAATTCTGGGA CGTGTTACAACATAGAAACTAAAACCATTATACTTTTATATAGGTTCGTGTTTATTTATT TATACAAATAAAAGATTTTATACATAATGTGTTAATTTAAAGATAAAAATAAACAGGAAA ACATCTTCAGTTTCTGTTAAATGTTAGGATCCATCACCTTTACCGATATAGGTCTGCGTA AATGTCATGGGAAGCTTGGATAAGATACTCATGTAAGTTCGGCTGACATAAACAAAACTG ATTTAGAATAGATTGCTTATGGNTATATATCAGCCTATCTCGGACCTATCNACAGGATGC ACATGCATGTCAGTGTTGATGCTCNACATTGAGACTTGACCTAGTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)