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Schistosoma mansoni
cluster # 9475 cluster # 9475       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9475#0 length = 1388 sequences # 9  

consensusID : consensus_9475#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1388
fasta sequence
                              [GGCACGAGGGAAGAATATACTAGAGCTATGGAACAAGAACATCATACTGGTCATTTTGCATGTCATAGTTGTGATGTATCATTAACAGGACAACGTTATATATTACGTGATGATGAACCACATTGTTTAGCTTGTTATGAAGCAAAGTTTGCTAATACATGTGAACAATGTAAAGAAAAAATTGGTTGTGATTCAAAAGATCTTTCATTTAAAGAAAGACATTGGCATGAGAAATGTTTTAAATGTTCTGCTTGTACTACTTCATTAGCTGATCGACCATTTGCTACAAAAGAAGAACAATTATATTGTTCTGATTGTTATGATGAACGTTTTGCTGCAAGATGTGATGGTTGTCAAGGTGTATTCAAAGCTGGAATGCGTAAATATGAATATCGTGGACAACAATGGCATGAAGAATGTTTTTTATGTGTTGAATGTAAACAACCAATTGGTGCAAAAAGTTTTATTCCACGTGAAAATCAAGTTGTATGTGTACCATGTTATGAAGCGAAATATGCTCAACGTTGTACGAAATGTTCAGAAGTTATACGTCGTGGTGGAGTTACATACAAAGGAAATCCATGGCATAAAGAATGTTTCACTTGTACTAGTTGTTCTAAACAATTAGCCGGTTTAAAA-TTCACATCTAAAGATGAACAACCTGATTGTGCTGATTGTTATGGTGAATTATTTGCTAAAAAATGCACAAAATGTACCAAACCAATTACGGGATTTGGTGGTTGT-AATTCATTTCATTCGAAGATCGTCATTGGCATTCAGAATGTTTTCTATGTGGAAAATGTAATTCTAATCTGGTTGGTAGAGGTTTTCTTACTAGTGATGATATGATTATGTGTTCTGAATGTGGTCGTTAACTTTGACAAGCACAATCAGTATACAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAAGCAGCAGATATATCTAGTCAAAAGTGCGTGATTCAATGATTCGTTCATTCATTCGTTCTTTCTTTCTTTGTTTAATCAGCTTTATGATATCCATTTATTTGTTTTCGTTTTGTTATGTTTGGTTACTAGTTAAATCTCCTTATAACTATGTTCATTCTAATGTTCATAATGCATTTATATAGACCAACAACAACAAAAAAAGTTTTGAACCATGACTTGAAAAGGCCAGACCTTAAATGTTCATTGTTGCTCATTCACTATGGAAATTCTATTCTAGTCCTTATTCTTCTTCTTCTTCTTACCCTTCGAATATATTGATTTATTATGTTTTTTTGTACTGTTTTTTTCTCTGTCTCTTCGATTGTCTGTTTTAATGATGATGATGTCCAAAACTGTCTTCCTTTTTCATAGACATTCAAATGAATGAATGAACATATATATATATATATATATATATACTATTA]

[+] EMBL CD079328             [GGCACGAGGGAAGAATATACTAGAGCTATGGAACAAGAACATCATACTGGTCATTTTGCATGTCATAGTTGTGATGTATCATTAACAGGACAACGTTATATATTACGTGATGATGAACCACATTGTTTAGCTTGTTATGAAGCAAAGTTTGCTAATACATGTGAACAATGTAAAGAAAAAATTGGTTGTGATTCAAAAGATCTTTCATTTAAAGAAAGACATTGGCATGAGAAATGTTa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AI067185             [                                     AACATCATACTGGTCATTTTGCATGTCATAGTTGTGATGTATCATTAACAGGACAACGTTATATATTACGTGATGATGAACCACATTGTTTAGCTTGTTATGAAGCAAAGTTTGCTAATACATGTGAACAATGTAAAGAAAAAATTGGTTGTGATTCAAAAGATCTTTCATTTAAAGAAAGACATTGGCATGAGAAATGTTTTAAATGTTCTGCTTGTACTACTTCATTAGCTGATCGACCATTTGCTACAAAAGAAGAACAATTATATTGTTCTGATTGTTATGATGAACGTTTTGCTGCAAGATGTGATGGTTGTCAAGGTGTATTCAAAGCTGGAATGCGTAAATATGAATATCGTGGACAACAATGGCATGAAGAATGTTTTTTATGTGTTGAATGTAAACAACCAATTGGTGCAAAAAGTTTTATTCCACGTGAAAATCAAGTTGTATGTGTACCATGTTATGAAGCGAAATATGCTCAACGTTGTACGAAATGTTCAGAAGTTATACGTCGTGGTGGAGTTACATACAAAGGAAATCCATGGCATAAAGAATGTTTCACTTGTACTAGTTGTTCTAAACAATTAGCCGGTTTAAAA TTCACATCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AI067120             [                                     AACATCATACTGGTCATTTTGCATGTCATAGTTGTGATGTATCATTAACAGGACAACGTTATATATTACGTGATGATGAACCACATTGTTTAGCTTGTTATGAAGCAAAGTTTGCTAATACATGTGAACAATGTAAAGAAAAAATTGGTTGTGATTCAAAAGATCTTTCATTTAAAGAAAGACATTGGCATGAGAAATGTTTTAAATGTTCTGCTTGTACTACTTCATTAGCTGATCGACCATTTGCTACAAAAGAAGAACAATTATATTGTTCTGATTGTTATGATGAACGTTTTGCTGCAAGATGTGATGGTTGTCAAGGTGTATTCAAAGCTGGAATGCGTAAATATGAATATCGTGGACAACAATGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AI068302             [                                     AACATCATACTGGTCATTTTGCATGTCATAGTTGTGATGTATCATTAACAGGACAACGTTATATATTACGTGATGATGAACCACATTGTTTAGCTTGTTATGAAGCAAAGTTTGCTAATACATGTGAACAATGTAAAGAAAAAATTGGTTGTGATTCAAAAGATCTTTCATTTAAAGAAAGACATTGGCATGAGAAATGTTTTAAATGTTCTGCTTGTACTACTTCATTAGCTGATCGACCATTTGCTACAAAAGAAGAACAATTATATTGTTCTGATTGTTATGATGAACGTTTTGCTGCAAGATGTGATGGTTGTCAAGGTGTATTCAAAGCTGGAATGCGTAAATATGAATATCGTGGACAACAATGGCATGAAGAATGTNTTTTATGTGTTGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AI068171             [                                         TCATACTGGTCATTTTGCATGTCATAGTTGTGATGTATCATTAACAGGACAACGTTATATATTACGTGATGATGAACCACATTGTTTAGCTTGTTATGAAGCAAAGTTTGCTAATACATGTGAACAATGTAAAGAAAAAATTGGTTGTGATTCAAAAGATCTTTCATTTAAAGAAAGACATTGGCATGAGAAATGTTTTAAATGTTCTGCTTGTACTACTTCATTAGCTGATCGACCATTTGCTACAAAAGAAGAACAATTATATTGTTCTGATTGTTATGATGAACGTTTTGCTGCAAGATGTGATGGTTGTCAAGGTGTATTCAAAGCTGGAATGCGTAAATATGAATATCGTGGACAACAATGGCATGAAGAATGTTTTTTATGTGTTGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD131302             [                                                                                                                                                                                       GGTTGTGATTCAAAAGATCTTTCATTTAAAGAAAGACATTGGCATGAGAAATGTTTTAAATGTTCTGCTTGTACTACTTCATTAGCTGATCGACCATTTGCTACAAAAGAAGAACAATTATATTGTTCTGATTGTTATGATGAACGTTTTGCTGCAAGATGTGATGGTTGTCAAGGTGTATTCAAAGCTGGAATGCGTAAATATGAATATCGTGGACAACAATGGCATGAAGAATGTTTTTTATGTGTTGAATGTAAACAACCAATTGGTGCAAAAAGTTTTATTCCACGTGAAAATCAAGTTGTATGTGTACCATGTTATGAAGCGAAATATGCTCAACGTTGTACGAAATGTTCAGAAGTTATACGTCGTGGTGGAGTTACATACAAAGGAAATCCATGGCATAAAGAATGTTTCACTTGTACTAGTTGTTCTAAACAATTAGCCGGTTTAAAA TTCACATCTAAAGATGAACAACCTGATTGTGCTGATTGTTATGGTGAATTATTTGCTAAAAAATGCACAAAATGTACCAAACCAATTACGGGATTTGGTGGTTGT AATTCATTTCATTCGAAGATCGTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD073605             [                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACAAAAGAAGAACAATTATATTGTTCTGATTGTTATGATGAACGTTTTGCTGCAAGATGTGATGGTTGTCAAGGTGTATTCAAAGCTGGAATGCGTAAATATGAATATCGTGGACAACAATGGCATGAAGAATGTTTTTTATGTGTTGAATGTAAACAACCAATTGGTGCAAAAAGTTTTATTCCACGTGAAAATCAAGTTGTATGTGTACCATGTTATGAAGCGAAATATGCTCAACGTTGTACGAAATGTTCAGAAGTTATACGTCGTGGTGGAGTTACATACAAAGGAAATCCATGGCATAAAGAATGTTTCACTTGTACTAGTTGTTCTAAACAATTAGCCGGTTTAAAATTTCACATCTAAAGATGAACACCCTTATTGTGCTGATTGTTATGGTGAATTATTTGCTAAAAAATGCACAAAATGTACCAAACCAATTACGGGATTTGGTGGTTGTAAATTCATTTCATTCGAAGATCGTCATTGGCATTCAGAATGTTTTCTATGTGGAAAATGTAATTCTAATCTGGTTGGTAGAGGTTTTCTTACTAGTGATGATATGATTATGTGTTCTGAATGTGGTCGTTAACTTTGACAAGCACAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD064462             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CATTGGCATTCAGAATGTTTTCTATGTGGAAAATGTAATTCTAATCTGGTTGGTAGAGGTTTTCTTACTAGTGATGATATGATTATGTGTTCTGAATGTGGTCGTTAACTTTGACAAGCACAATCAGTATACAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAAGCAGCAGATATATCTAGTCAAAAGTGCGTGATTCAATGATTCGTTCATTCATTCGTTCTTTCTTTCTTTGTTTAATCAGCTTTATGATATCCATTTATTTGTTTTCGTTTTGTTATGTTTGGTTACTAGTTAAATCTCCTTATAACTATGTTCATTCTAATGTTCATAATGCATTTATATAGACCAACAACAACAAAAAAAGTTTTGAACCATGACTTGAAAAGGCCAGACCTTAAATGTTCATTGTTGCTCATTCACTATGGAAATTCTATTCTAGTCCTTATTCTTCTTCTTCTTCTTACCCTTCGAATATATTGATTTATTATGTTTTTTTGTACTGTTTTTTTCTCTGTCTCTTCGATTGT                                                                                                   ]
[+] EMBL AI976196             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TAACTTTGACAAGCACAATCAGTATACAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAAGCAGCAGATATATCTAGTCAAAAGTGCGTGATTCAATGATTCGTTCATTCATTCGTTCTTTCTTTCTTTGTTTAATCAGCTTTATGATATCCATTTATTTGTTTTCGTTTTGTTATGTTTGGTTACTAGTTAAATCTCCTTATAACTATGTTCATTCTAATGTTCATAATGCATTTATATAGACCAACAACAACAAAAAAAGTTTTGAACCATGACTTGAAAAGGCCAGACCTTAAATGTTCATTGTTGCTCATTCACTATGGAAATTCTATTCTAGTCCTTATTCTTCTTCTTCTTCTTACCCTTCGAATATATTGATTTATTATGTTTTTTTGTACTGGTTTTTTCTCTGGCTCTTCGATTGTCTGTTTTAATGATGATGATGTCCAAAACTGTCTTCCTTTTTCATAGACATTCAAATGAATGAATGAACATATATATATATATATATATATATACTATTA]


>consensus_9475#0 GGCACGAGGGAAGAATATACTAGAGCTATGGAACAAGAACATCATACTGGTCATTTTGCA TGTCATAGTTGTGATGTATCATTAACAGGACAACGTTATATATTACGTGATGATGAACCA CATTGTTTAGCTTGTTATGAAGCAAAGTTTGCTAATACATGTGAACAATGTAAAGAAAAA ATTGGTTGTGATTCAAAAGATCTTTCATTTAAAGAAAGACATTGGCATGAGAAATGTTTT AAATGTTCTGCTTGTACTACTTCATTAGCTGATCGACCATTTGCTACAAAAGAAGAACAA TTATATTGTTCTGATTGTTATGATGAACGTTTTGCTGCAAGATGTGATGGTTGTCAAGGT GTATTCAAAGCTGGAATGCGTAAATATGAATATCGTGGACAACAATGGCATGAAGAATGT TTTTTATGTGTTGAATGTAAACAACCAATTGGTGCAAAAAGTTTTATTCCACGTGAAAAT CAAGTTGTATGTGTACCATGTTATGAAGCGAAATATGCTCAACGTTGTACGAAATGTTCA GAAGTTATACGTCGTGGTGGAGTTACATACAAAGGAAATCCATGGCATAAAGAATGTTTC ACTTGTACTAGTTGTTCTAAACAATTAGCCGGTTTAAAATTCACATCTAAAGATGAACAA CCTGATTGTGCTGATTGTTATGGTGAATTATTTGCTAAAAAATGCACAAAATGTACCAAA CCAATTACGGGATTTGGTGGTTGTAATTCATTTCATTCGAAGATCGTCATTGGCATTCAG AATGTTTTCTATGTGGAAAATGTAATTCTAATCTGGTTGGTAGAGGTTTTCTTACTAGTG ATGATATGATTATGTGTTCTGAATGTGGTCGTTAACTTTGACAAGCACAATCAGTATACA AAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAAGCAGCAGATATATCTAGTCAAAAGTGCGTGATTCAA TGATTCGTTCATTCATTCGTTCTTTCTTTCTTTGTTTAATCAGCTTTATGATATCCATTT ATTTGTTTTCGTTTTGTTATGTTTGGTTACTAGTTAAATCTCCTTATAACTATGTTCATT CTAATGTTCATAATGCATTTATATAGACCAACAACAACAAAAAAAGTTTTGAACCATGAC TTGAAAAGGCCAGACCTTAAATGTTCATTGTTGCTCATTCACTATGGAAATTCTATTCTA GTCCTTATTCTTCTTCTTCTTCTTACCCTTCGAATATATTGATTTATTATGTTTTTTTGT ACTGTTTTTTTCTCTGTCTCTTCGATTGTCTGTTTTAATGATGATGATGTCCAAAACTGT CTTCCTTTTTCATAGACATTCAAATGAATGAATGAACATATATATATATATATATATATA TACTATTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)