These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9491#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1040 fasta sequence [TTTTAGTTCGTCACGTTTCTTATACACTGTGGACCAAGAAGTTATATTCTCACTTTCCAAGAACGTATCCAAATGGATCTAT-AAAAAAAACAAATAATGGTAATGAAATTTATCACACACTTTCTTGCTCAAATCGGACCGCAGTCTGAATATACTTGGACTCGTCTAATTTACAGTACACTTAAGGCTCCTACATATCATTTGTACTTTGAATTGCTACTAATTATTGGTATTATATGGTTATTGTTTAAACGCAGTTATCGTATTAATGACGTGATTAATCTAAGTGTGGAAGAAAAAAACCAACTGATTAGTGAATGGAAACCCGATAGTTTGGTTCCGAAAGATTGGGAACCATCAAAATATCTATTAAAACAATTCCACAGATGTGCATATGGTCCTCTTGGCAAATATGTCAATTTCAACTTGGAAGTGGAAGAGTTTGAAGCTACTGAAATGAATGTTAGTAAGAACCATCTCAATTTCGCGACATTAAATTTCTTAAACTTTGTTGGGGATTCGGATTTGTCTAATGTTGCTACTGAGCAGATGAAAAAATATGGTGTTGGATCATGTGGACCAAGAGGATTTTATGGTACTTTTGATGTTCATCTTGAATTGGAAAATAAATTAGCTGAATTCCTTGGTGTTGAAAAAGCAGTAATCTATTCTTATGGAGCAGCTACATTTTCTAGTGCTATTCCATCCTATTCCAAACGAACTGATGTAATATTTGCAGATGAACGTATCAGCCATGCTACGTATCTAGGATTAGTGGCATCTAGAAGTCATGTTCGATTTTTCCGTCATAATGATATGGAGCATTTGGAACAGTTACTGATAGCACAGGCGAAAAAAGACAAAGAAGATCCTAAACGTGCATTACTAACCCGCCGATTTTTTGTTGTTGAAGGTATTTATTTCAATTCTGGAGAAATATGTCCCTTATCTGAGCTTATTGCTTTAAAGTATAAATACAAAGTTCGCATTTTGTTAGATGAGACCATTTCTTTTGGAGTATTAGGTAAAACTGGTAGGGG] [+] EMBL CD081276 [TTTTAGTTCGTCACGTTTCTTATACACTGTGGACCAAGAAGTTATATTCTCACTTTCCAAGAACGTATCCAAATGGATCTAT AAAAAAAACAAATAATGGTAATGAAATTTATCACACACTTTCTTGCTCAAATCGGACCGCAG TGAATATACTTGGACTCGTCTAATTTACAGTACACTTAAGGCTCCTACATATCATTTGTACTTTGAATTGCTACTAATTATTGGTATTATATGGTTATTGTTTAAACGCAGTTATCGTATTAATGACGTGATTAATCTAAGTGTGGAAGAAAAAAACCAACTGATTAGTGAATGGAAACCCGATAGTTTGGTTCCGAAAGATTGGGAACCATCAAAATATCTATTAAAACAATTCCACAGATGTGCATATGGTCCTCTTGGCAAATATGTCAATTTCAACTTGGAAGTGGAAGAGTTTGAAGCTACTGAAATGAATGTTAGTAAGAACCATCTCAATTTCGCGACATTAAATTTCTTAAACTTTGTTGGGGATTCGGATTTGTCTAATGTTGCTACTGAGCAGATGAAAAAATATGGTGTTGGATCATGTGGACCAAGAGGATTTTATGGTACTTTTGATGTTCATCTTGAATTGGAAAATAAATTAGCTGAATTCCTTGGTGTTGAAAAAGCAGNTATCTATTCTTATGGAGCAGC ] [+] EMBL CD195723 [ CAAATGGATCTAT AAAAAAAACAAATAATGGTAATGAAATTTATCACACACTTTCTTGCTCAAATCGGACCGCAGTCTGAATATACTTG ] [+] EMBL CD068414 [ GATCTATAAAAAAAAACAAATAATGGTAATGAAATTTATCACACACTTTCTTGCTCAAATCGGACCGCAGTCTGAATATACTTGGACTCGTCTAATTTACAGTACACTTAAGGCTCCTACATATCATTTGTACTTTGAATTGCTACTAATTATTGGTATTATATGGTTATTGTTTAAACGCAGTTATCGTATTAATGACGTGATTAATCTAAGTGTGGAAGAAAAAAACCAACTGATTAGTGAATGGAAACCCGATAGTTTGGTTCCGAAAGATGGGGAACCA ] [-] EMBL CD163378 [ ACACACTTTCTTGCTCAAATCGGACCGCAGTCTGAATATACTTGGACTCGTCTAATTTACAGTACACTTAAGGCTCCTACATATCATTTGTACTTTGAATCGCTACTAATTATTGGTATTATATGGTTATTGTTTAAACGCAGTTATCGTATTAATGACGTGATTAATCTAAGTGTGGAAGAAAAAAACCAACTGATTAGTGAATGGAAACCCGATAGTTTGGTTCCGAAAGATTGGGAACCATCAAAATATCTATTAAAACAATTCCACAGATGTGCATATGGTCCTCTTGGCAAATATGTCAATTTCAACTTGGAAGTGGAAGAGTTTGAAGCTACTGAAATGAATGTTAGTAAGAACCATCTCAATTTCGCGACATTAAATTTCTTAAACTTTGTTGGGGATTCGGATTTGTCTAAT ] [+] EMBL CD117318 [ AGATGAAAAAATATGGTGTTGGATCATGTGGACCAAGAGGATTTTATGGTACTTTTGATGTTCATCTTGAATTGGAAAATAAATTAGCTGAATTCCTTGGTGTTGAAAAAGCAGTAATCTATTCTTATGGAGCAGCTACATTTTCTAGTGCTATTCCATCCTATTCCAAACGAACTGATGTAATATTTGCAGATGAACGTATCAGCCATGCTACGTATCTAGGATTAGTGGCATCTAGAAGTCATGTTCGATTTTTCCGTCATAATGATATGGAGCATTTGGAACAGTTACTGATAGCACAGGCGAAAAAAGACAAAGAAGATCCTAAACGTGCATTACTAACCCGCCGATTTTTTGTTGTTGAAGGTATTTATTTCAATTCTGGAGAAATATGTCCCTTATCTGAGCTTATTGCTTTAAAGTATAAATACAAAGTTCGCATTTTGTTAGATAAGACCATT ] [+] EMBL CD139736 [ GGTGTTGGATCATGTGGACCAAGAGGATTTTATGGTACTTTTGATGTTCATCTTGAATTGGAAAATAAATTAGCTGAATTCCTTGGTGTTGAAAAAGCAGTAATCTATTCTTATGGAGCAGCTACATTTTCTAGTGCTATTCCATCCTATTCCAAACGAACTGATGTAATATTTGCAGATGAACGTATCAGCCATGCTACGTATCTAGGATTAGTGGCATCTAGAAGTCATGTTCGATTTTTCCGTCATAATGATATGGAGCATTTGGAACAGTT ] [-] EMBL CD121244 [ cTTATGGTACTTTTGATGTTCATCTTGAATTGGAAAATAAATTAGCTGAATTCCTTGGTGTTGAAAAAGCAGTAATCTATTCTTATAGAGCAGCTACATTTTCTAGTGCTATTCCATCCTATTCCAAACGAACTGATGTAATATTTGCAGATGAACGTATCAGCCATGCTACGTATCTAGGATTAGTGGCATCTAGAAGTCATGTTCGATTTTTCCGTCATAATGATATGGAGCATTTGGAACAGTTACTGATAGCACAGGCGAAAAGAGACAAAGAAGATCCTAAACGTGCATTACTAACCCGCCGATTTTTTGTTGTTGAAGGTATTTATTTCAATTCTGGGGAAATATGTCCCTTATCTGAGCTTATTGCTTTAAAGTATAAATACAAAGTTCGCATTTTGTTAGATGAGACCATTTCTTTTGGAGTATTAGGTAAAACTG ] [-] EMBL CD121222 [ cTTATGGTACTTTTGATGTTCATCTTGAATTGGAAAATAAATTAGCTGAATTCCTTGGTGTTGAAAAAGCAGTAATCTATTCTTATAGAGCAGCTACATTTTCTAGTGCTATTCCATCCTATTCCAAACGAACTGATGTAATATTTGCAGATGAACGTATCAGCCATGCTACGTATCTAGGATTAGTGGCATCTAGAAGTCATGTTCGATTTTTCCGTCATAATGATATGGAGCATTTGGAACAGTTACTGATAGCACAGGCGAAAAGAGACAAAGAAGATCCTAAACGTGCATTACTAACCCGCCGATTTTTTGTTGTTGAAGGTATTTATTTCAATTCTGGGGAAATATGTCCCTTATCTGAGCTTATTGCTTTAAAGTATAAATACAAAGTTCGCATTTTGTTAGATGAGACCATTTCTTTTGGAGTATTAGGTAAAACTG ] [+] EMBL CD139773 [ AGCTGAATTCCTTGGTGTTGAAAAAGCAGTAATCTATTCTTATGGAGCAGCTACATTTTCTAGTGCTATTCCATCCTATTCCAAACGAACTGATGTAATATTTGCAGATGAACGTATCAGCCATGCTACGTATCTAGGATTAGTGGCATCTAGAAGTCATGTTCGATTTTTCCGTCATAATGATATGGAGCATTTGGAACAGT ] [+] EMBL CD139598 [ AACGTATCAGCCATGCTACGTATCTAGGATTAGTGGCATCTAGAAGTCATGTTCGATTTTTCCGTCATAATGATATGGAGCATTTGGAACAGTTACTGATAGCACAGGCGAAAAAAGACAAAGAAGATCCTAAACGTGCATTACTAACCCGCCGATTTTTTGTTGTTGAAGGTATTTATTTCAATTCTGGAGAAATATGTCCCTTATCTGAGCTTATTGCTTTAAAGTATAAATACAAAGTCCGCATTTTGTTAGATGAGACCATTTCTTTTGGAGTATTAGGTAAAACTGGTAGGGG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||