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Schistosoma mansoni
cluster # 9496 cluster # 9496       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9496#0 length = 1221 sequences # 10  

consensusID : consensus_9496#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1221
fasta sequence
                              [CTTTGTTGCGTTGTAGTGCAGCCCGAAAAACTTTGCGCCGTCAACTTTCGGTTACATTTGATATTTTCTCTTTATCTCACTTGTGTTACTTCTGATCGCTGTCAATTTCTCTCATTATAAGTAGAAGCCATCAGTAATGGGGAAATCTTCACGTGATAAGCGTGATATTTTACTATAGATTAGCTAAAGAAGAGGGTTGGAGAGCACGTAGCGCCTATAAGCTGCTACAGATTGATGATGAGTATGGAATTTTTTCTACTGAAAATACGCCTTTAGAACGAGTGGTTGATTTGTGTGCTG-CACCTGGTAGCTGGTCACAAGTATTATCAAAACGCTTATGGGAATCGAAATCCCCGGAGGACCAAAAATCTGTGAAAATCGTTGCCGTGGATTTACAGGCTATGGCTCCAATACCAGGAGTCATTCAAATTCAAGGCGATATTACTAGTCAGGATACGGCTCAACAGATTATCAAACATTTTGACGGTAAATTAGCTCAACTTGTTGTTTGTGATGGTGCTCCAGATGTGACAGGTCTACATGATTTGGACGAGTATGTTCAGTCGCATCTTATCTTAGCTGCTGTAACTATCTGTTCAAGAGTTCTTGAGCTAGGTGGTACATTTGTTGCCAAGGTTTTTCGTGGGCGAGATTCTGGTTTACTGGGTTCCCAACTTCGATGTTTATTTTCAGGTGAAGTTAGTTTTGCAAAACCAAGAGCTAGTCGGAACTCTAGTTTAGAGTCGTTTGTTATATGTCGTGGATTTATGGGTCCTCGTTTACGGACAGATTTGAAACCATCCACACCTTGTGAGAATCACTCAAGCAACGATAATTTGTTATTATTATGGTACGACAAGGACAACTTTGAAGACGTTAATTCTTCTCAACAAGCTCTATTACCATTCATAGCGTGTGGAGATCTAAGAGGTTTCGACCCAGATGTCACGTATACTTTAGCTCCTGATCATATAGTCAAGCCACCAGTACAAGTTCCTGTGGATCCTGCTTATTCCGAAGTTTGCCGGTTCAGTCGTTTAAATCAATCAAATACTTCGAAATTTCAATCTTTGGAAAAGAACCATGAAATTGATGACAATGATGATATTTCTAGATTTACAAAACTTATGGAAAAGTTGTCTTTCGATTCAAGAGAAGATAATTTATGATGTTTGCTTTTTATAGACAAAACTGTTTTATTCCATAAACAAATAAATATAG]

[+] EMBL CD183608             [CTTTGTTGCGTTGTAGTGCAGCCCGAAAAACTTTGCGCCGTCAACTTTCGGTTACATTTGATATTTTCTCTTTATCTCACTTGTGTTACTTCTGATCGCTGTCAATTTCTCTCATTATAAGTAGAAGCCATCAGTAATGGGGAAATCTTCACGTGATAAGCGTGATATTTTACTATAGATTAGCTAAAGAAGAGGGTTGGAGAGCACGTAGCGCCTATAAGCTGCTACAGATTGATGATGAGTATGGAATTTTTTCTACTGAAAATACGCCTTTAGAACGAGTGGTTGATTTGTGTGCTG CACCTGGTAGCTGGTCACAAGTATTATCAAAACGCTTATGGGAATCGAAATCCCCGGAGGACCAAAAATCTGTGAAAATCGTTGCCGTGGATTTACAGGCTATGGCTCCAATACCAGGAGTCATTCAAATTCAAGGCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL SMAA18504            [                                                  GTTACATTTGATATTTTCTCTTTATCTCACTTTTTTTACTTCTGATCGCTGTCAATTTCTCTCATTATAAGTAGAAGCCATCATGAAGTTTTAAATCTTCACGTGATAAGCGTGATA TTTACTATAGATTAGCTAAAGAAGAGGGTTGGAGAGCACGGAGCGCCTATAAGCGGCTACATATTGATGATGAGTATGGAATTTTTTCTACTGAAAATACTCCTTTAGAACGAGTGGTTGATTTGTGTGCTGNCACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD062762             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCTGTGAAAATCGTTGCCGTGGATTTACAGGCTATGGCTCCAATACCAGGAGTCATTCAAATTCAAGGCGATATTACTAGTCAGGATACGGCTCAACAGATTATCAAACATTTTGACGGTAAATTAGCTCAACTTGTTGTTTGTGATGGTGCTCCAGATGTGACAGGTCTACATGATTTGGACGAGTATGTTCAGTCGCATCTTATCTTAGCTGCTGTAACTATCTGTTCAAGAGTTCTTGAGCTAGGTGGTACATTTGTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD168224             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTCAAGGCGATATTACTAGTCAGGATACGGCTCAACAGATTATCAAACATTTTGACGGTAAATTAGCTCAACTTGTTGTTTGTGATGGTGCTCCAGATGTGACAGGTCTACATGATTTGGACGAGTATGTTCAGTCGCATCTTATCTTAGCTGCTGTAACTATCTGTTCAAGAGTTCTTGAGCTAGGTGGTACATTTGTTGCCAAGGTTTTTCGTGGGCGAGATTCTGGTTTACTGGGTTCCCAACTTCGATGTTTATTTTCAGGTGAAGTTAGTTTTGCAAAACCAAGAGCTAGTCGGAACTCTAGTTTAGAGTCGTTTGTTATATGTCGTGGATTTATGGGTCCTCGTTTACGGACAGATTTGAAACCATCCACACCTTGTGAGAATCACTCAAGCAACGATAATTTGTTATTATTATGGTACGACAAGGACAACTTTGAAGACGTTAATTCTTCTCAACAAGCTCTATTACCATTCATAGCGTGTGGAGATCTAAGAGGTTTCGACCCAGATGTCACGTATACTTTAGCTCCTGATCATATAGTCAAGCCACC                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD067227             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACAGATTATCAAACATTTTGACGGTAAATTAGCTCAACTTGTTGTTTGTGATGGTGCTCCAGATGTGACAGGTCTACATGATTTGGACGAGTATGTTCAGTCGCATCTTATCTTAGCTGCTGTAACTATCTGTTCAAGAGCTCTTGAGCTAGGTGGTACATTTGTTGCCAAGGTTTTTCGTGGGCGAAATTCTGGTTTACTGGGTTCCCAACTTCGATGTTTATTTTCAGGTGAAGTTAGTTTTGCAAAACCAAGAGCTAATCGGAACTCTAGTTTATAGTCGTTCGTTATATGTCGTGGATTTATGGGTCCTCGTTTACGGACAGATTTGAAACCATCCACACCTTGTGAGAATCACTCAAGCAACGATAATTTGTTATTATTATGGTACGACAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD193794             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATCAAACATTTTGACGGTAAATTAGCTCAACTTGTTGTTTGTGATGGTGCTCCAGATGTGACAGGTCTACATGATTTGGACGAGTATGTTCAGTCGCATCTTATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD078323             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATTTTGCCGGTAAATTAGCTCAACTTGTTGTTTGTGATGGTGCTCCAGATGTGACAGGTCTACATGATTTGGACGAGTATGTTCAGTCGCATCTTATCTTAGCTGCTGTAACTATCTGTTCAAGAGTTCTTGAGCTAGGTGGTACATTTGTTGCCAAGGTTTTTCGTGGGCGAGATTCTGGTTTACTGGGTTCCCAACTTCGATGTTTATTTTCAGGTGAAGTTAGTTTTGCAAAACCAAGAGCTAGTCGGAACTCTAGTTTAGAGTCGTTTGTTATATGTCGTGGATTTATGGGTCCTCGTTTACGGACAGATTTGAAACCATCCACACCTTGTGAGAATCACTCAAGCAACGATAATTTGTTATTATTATGGCACGACAAGGACAACTTTGAAGACGTTAATTCTTCTCAACAAGCTCTATTACCATTCATAGCGTGTGGAGATCTAAGAGGTTTCca                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD078243             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATTTTGACGGTAAATTAGCTCAACTTGTTGTTTGTGATGGTGCTCCAGATGTGACAGGTCTACATGATTTGGACGAGTATGTTCAGTCGCATCTTATCTTAGCTGCTGTAACTATCTGTTCAAGAGTTCTTGAGCTAGGTGGTACATTTGTTGCCAAGGTTTTTCGTGGGCGAGATTCTGGTTTACTGGGTTCCCAACTTCGATGTTTATTTTCAGGTGAAGTTAGTTTTGCAAAACCAAGAGCTAGTCGGAACTCTAGTTTAGAGTCGTTTGTTATATGTCGTGGATTTATGGGTCCTCGTTTACGGACAGATTTGAAACCATCCACACCTTGTGAGAATCACTCAAGCAACGATAATTTGTTATTATTATGGTACGACAAGGACAACTTTGAAGACGTTAATTCTTCTCAACAAGCTCTATTACCATTCATAGCGTGTGGAGATCTAAGAGGTTTCGACCCAGATGTCACGTATACTTTAGCTCCTGATCATATAGTCAAGCCACCAGTACAAGTTCCTGTGGATCCTGCTTATTCCGAAGTTTGCCGGTTCAGTCGTTTAAATCAATCAAATACTTCGAAATTTCAATCTTTGGAAAAGAACCATGAAATTGATGACAATG                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD067122             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGGATATATGGGTCATAGTTTACGGACAGATTTGAAACCATCCACACCTTGTGAGAATCACTCAAGCAACGATAATTTGTTATTATTATGGTACGACAAGGACAACTTTGAAGACGTTAATTCTTCTCAACAAGCTCTATTACCATTCATAGCGTGTGGAGATCTAAGAGGTTTCGACCCAGATGTCACGTA                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD072881             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTACCATTCATAGCGTGTGGAGATCTAAGAGGTTTCGACCCAGATGTCACGTATACTTTAGCTCCTGATCATATAGTCAAGCCACCAGTACAAGTTCCTGTGGATCCTGCTTATTCCGAAGTTTGCCGGTTCAGTCGTTTAAATCAATCAAATACTTCGAAATTTCAATCTTTGGAAAAGAACAATGAAATTGATGGCAATGATGATATTTCTAGATTTACAAAACTTATGGAAAAGTTGTCTTTCGATTCAAGAGAAGATAATTTATGATGTTTGCTTTTTATAGACAAAACTGTTTTATTCCATAAACAAATAAATATAG]


>consensus_9496#0 CTTTGTTGCGTTGTAGTGCAGCCCGAAAAACTTTGCGCCGTCAACTTTCGGTTACATTTG ATATTTTCTCTTTATCTCACTTGTGTTACTTCTGATCGCTGTCAATTTCTCTCATTATAA GTAGAAGCCATCAGTAATGGGGAAATCTTCACGTGATAAGCGTGATATTTTACTATAGAT TAGCTAAAGAAGAGGGTTGGAGAGCACGTAGCGCCTATAAGCTGCTACAGATTGATGATG AGTATGGAATTTTTTCTACTGAAAATACGCCTTTAGAACGAGTGGTTGATTTGTGTGCTG CACCTGGTAGCTGGTCACAAGTATTATCAAAACGCTTATGGGAATCGAAATCCCCGGAGG ACCAAAAATCTGTGAAAATCGTTGCCGTGGATTTACAGGCTATGGCTCCAATACCAGGAG TCATTCAAATTCAAGGCGATATTACTAGTCAGGATACGGCTCAACAGATTATCAAACATT TTGACGGTAAATTAGCTCAACTTGTTGTTTGTGATGGTGCTCCAGATGTGACAGGTCTAC ATGATTTGGACGAGTATGTTCAGTCGCATCTTATCTTAGCTGCTGTAACTATCTGTTCAA GAGTTCTTGAGCTAGGTGGTACATTTGTTGCCAAGGTTTTTCGTGGGCGAGATTCTGGTT TACTGGGTTCCCAACTTCGATGTTTATTTTCAGGTGAAGTTAGTTTTGCAAAACCAAGAG CTAGTCGGAACTCTAGTTTAGAGTCGTTTGTTATATGTCGTGGATTTATGGGTCCTCGTT TACGGACAGATTTGAAACCATCCACACCTTGTGAGAATCACTCAAGCAACGATAATTTGT TATTATTATGGTACGACAAGGACAACTTTGAAGACGTTAATTCTTCTCAACAAGCTCTAT TACCATTCATAGCGTGTGGAGATCTAAGAGGTTTCGACCCAGATGTCACGTATACTTTAG CTCCTGATCATATAGTCAAGCCACCAGTACAAGTTCCTGTGGATCCTGCTTATTCCGAAG TTTGCCGGTTCAGTCGTTTAAATCAATCAAATACTTCGAAATTTCAATCTTTGGAAAAGA ACCATGAAATTGATGACAATGATGATATTTCTAGATTTACAAAACTTATGGAAAAGTTGT CTTTCGATTCAAGAGAAGATAATTTATGATGTTTGCTTTTTATAGACAAAACTGTTTTAT TCCATAAACAAATAAATATAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)