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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9496#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1221 fasta sequence
[CTTTGTTGCGTTGTAGTGCAGCCCGAAAAACTTTGCGCCGTCAACTTTCGGTTACATTTGATATTTTCTCTTTATCTCACTTGTGTTACTTCTGATCGCTGTCAATTTCTCTCATTATAAGTAGAAGCCATCAGTAATGGGGAAATCTTCACGTGATAAGCGTGATATTTTACTATAGATTAGCTAAAGAAGAGGGTTGGAGAGCACGTAGCGCCTATAAGCTGCTACAGATTGATGATGAGTATGGAATTTTTTCTACTGAAAATACGCCTTTAGAACGAGTGGTTGATTTGTGTGCTG-CACCTGGTAGCTGGTCACAAGTATTATCAAAACGCTTATGGGAATCGAAATCCCCGGAGGACCAAAAATCTGTGAAAATCGTTGCCGTGGATTTACAGGCTATGGCTCCAATACCAGGAGTCATTCAAATTCAAGGCGATATTACTAGTCAGGATACGGCTCAACAGATTATCAAACATTTTGACGGTAAATTAGCTCAACTTGTTGTTTGTGATGGTGCTCCAGATGTGACAGGTCTACATGATTTGGACGAGTATGTTCAGTCGCATCTTATCTTAGCTGCTGTAACTATCTGTTCAAGAGTTCTTGAGCTAGGTGGTACATTTGTTGCCAAGGTTTTTCGTGGGCGAGATTCTGGTTTACTGGGTTCCCAACTTCGATGTTTATTTTCAGGTGAAGTTAGTTTTGCAAAACCAAGAGCTAGTCGGAACTCTAGTTTAGAGTCGTTTGTTATATGTCGTGGATTTATGGGTCCTCGTTTACGGACAGATTTGAAACCATCCACACCTTGTGAGAATCACTCAAGCAACGATAATTTGTTATTATTATGGTACGACAAGGACAACTTTGAAGACGTTAATTCTTCTCAACAAGCTCTATTACCATTCATAGCGTGTGGAGATCTAAGAGGTTTCGACCCAGATGTCACGTATACTTTAGCTCCTGATCATATAGTCAAGCCACCAGTACAAGTTCCTGTGGATCCTGCTTATTCCGAAGTTTGCCGGTTCAGTCGTTTAAATCAATCAAATACTTCGAAATTTCAATCTTTGGAAAAGAACCATGAAATTGATGACAATGATGATATTTCTAGATTTACAAAACTTATGGAAAAGTTGTCTTTCGATTCAAGAGAAGATAATTTATGATGTTTGCTTTTTATAGACAAAACTGTTTTATTCCATAAACAAATAAATATAG]
[+] EMBL CD183608 [CTTTGTTGCGTTGTAGTGCAGCCCGAAAAACTTTGCGCCGTCAACTTTCGGTTACATTTGATATTTTCTCTTTATCTCACTTGTGTTACTTCTGATCGCTGTCAATTTCTCTCATTATAAGTAGAAGCCATCAGTAATGGGGAAATCTTCACGTGATAAGCGTGATATTTTACTATAGATTAGCTAAAGAAGAGGGTTGGAGAGCACGTAGCGCCTATAAGCTGCTACAGATTGATGATGAGTATGGAATTTTTTCTACTGAAAATACGCCTTTAGAACGAGTGGTTGATTTGTGTGCTG CACCTGGTAGCTGGTCACAAGTATTATCAAAACGCTTATGGGAATCGAAATCCCCGGAGGACCAAAAATCTGTGAAAATCGTTGCCGTGGATTTACAGGCTATGGCTCCAATACCAGGAGTCATTCAAATTCAAGGCG ]
[+] EMBL SMAA18504 [ GTTACATTTGATATTTTCTCTTTATCTCACTTTTTTTACTTCTGATCGCTGTCAATTTCTCTCATTATAAGTAGAAGCCATCATGAAGTTTTAAATCTTCACGTGATAAGCGTGATA TTTACTATAGATTAGCTAAAGAAGAGGGTTGGAGAGCACGGAGCGCCTATAAGCGGCTACATATTGATGATGAGTATGGAATTTTTTCTACTGAAAATACTCCTTTAGAACGAGTGGTTGATTTGTGTGCTGNCACC ]
[-] EMBL CD062762 [ TCTGTGAAAATCGTTGCCGTGGATTTACAGGCTATGGCTCCAATACCAGGAGTCATTCAAATTCAAGGCGATATTACTAGTCAGGATACGGCTCAACAGATTATCAAACATTTTGACGGTAAATTAGCTCAACTTGTTGTTTGTGATGGTGCTCCAGATGTGACAGGTCTACATGATTTGGACGAGTATGTTCAGTCGCATCTTATCTTAGCTGCTGTAACTATCTGTTCAAGAGTTCTTGAGCTAGGTGGTACATTTGTTG ]
[-] EMBL CD168224 [ TTCAAGGCGATATTACTAGTCAGGATACGGCTCAACAGATTATCAAACATTTTGACGGTAAATTAGCTCAACTTGTTGTTTGTGATGGTGCTCCAGATGTGACAGGTCTACATGATTTGGACGAGTATGTTCAGTCGCATCTTATCTTAGCTGCTGTAACTATCTGTTCAAGAGTTCTTGAGCTAGGTGGTACATTTGTTGCCAAGGTTTTTCGTGGGCGAGATTCTGGTTTACTGGGTTCCCAACTTCGATGTTTATTTTCAGGTGAAGTTAGTTTTGCAAAACCAAGAGCTAGTCGGAACTCTAGTTTAGAGTCGTTTGTTATATGTCGTGGATTTATGGGTCCTCGTTTACGGACAGATTTGAAACCATCCACACCTTGTGAGAATCACTCAAGCAACGATAATTTGTTATTATTATGGTACGACAAGGACAACTTTGAAGACGTTAATTCTTCTCAACAAGCTCTATTACCATTCATAGCGTGTGGAGATCTAAGAGGTTTCGACCCAGATGTCACGTATACTTTAGCTCCTGATCATATAGTCAAGCCACC ]
[+] EMBL CD067227 [ ACAGATTATCAAACATTTTGACGGTAAATTAGCTCAACTTGTTGTTTGTGATGGTGCTCCAGATGTGACAGGTCTACATGATTTGGACGAGTATGTTCAGTCGCATCTTATCTTAGCTGCTGTAACTATCTGTTCAAGAGCTCTTGAGCTAGGTGGTACATTTGTTGCCAAGGTTTTTCGTGGGCGAAATTCTGGTTTACTGGGTTCCCAACTTCGATGTTTATTTTCAGGTGAAGTTAGTTTTGCAAAACCAAGAGCTAATCGGAACTCTAGTTTATAGTCGTTCGTTATATGTCGTGGATTTATGGGTCCTCGTTTACGGACAGATTTGAAACCATCCACACCTTGTGAGAATCACTCAAGCAACGATAATTTGTTATTATTATGGTACGACAAG ]
[+] EMBL CD193794 [ ATCAAACATTTTGACGGTAAATTAGCTCAACTTGTTGTTTGTGATGGTGCTCCAGATGTGACAGGTCTACATGATTTGGACGAGTATGTTCAGTCGCATCTTATCT ]
[+] EMBL CD078323 [ ATTTTGCCGGTAAATTAGCTCAACTTGTTGTTTGTGATGGTGCTCCAGATGTGACAGGTCTACATGATTTGGACGAGTATGTTCAGTCGCATCTTATCTTAGCTGCTGTAACTATCTGTTCAAGAGTTCTTGAGCTAGGTGGTACATTTGTTGCCAAGGTTTTTCGTGGGCGAGATTCTGGTTTACTGGGTTCCCAACTTCGATGTTTATTTTCAGGTGAAGTTAGTTTTGCAAAACCAAGAGCTAGTCGGAACTCTAGTTTAGAGTCGTTTGTTATATGTCGTGGATTTATGGGTCCTCGTTTACGGACAGATTTGAAACCATCCACACCTTGTGAGAATCACTCAAGCAACGATAATTTGTTATTATTATGGCACGACAAGGACAACTTTGAAGACGTTAATTCTTCTCAACAAGCTCTATTACCATTCATAGCGTGTGGAGATCTAAGAGGTTTCca ]
[+] EMBL CD078243 [ ATTTTGACGGTAAATTAGCTCAACTTGTTGTTTGTGATGGTGCTCCAGATGTGACAGGTCTACATGATTTGGACGAGTATGTTCAGTCGCATCTTATCTTAGCTGCTGTAACTATCTGTTCAAGAGTTCTTGAGCTAGGTGGTACATTTGTTGCCAAGGTTTTTCGTGGGCGAGATTCTGGTTTACTGGGTTCCCAACTTCGATGTTTATTTTCAGGTGAAGTTAGTTTTGCAAAACCAAGAGCTAGTCGGAACTCTAGTTTAGAGTCGTTTGTTATATGTCGTGGATTTATGGGTCCTCGTTTACGGACAGATTTGAAACCATCCACACCTTGTGAGAATCACTCAAGCAACGATAATTTGTTATTATTATGGTACGACAAGGACAACTTTGAAGACGTTAATTCTTCTCAACAAGCTCTATTACCATTCATAGCGTGTGGAGATCTAAGAGGTTTCGACCCAGATGTCACGTATACTTTAGCTCCTGATCATATAGTCAAGCCACCAGTACAAGTTCCTGTGGATCCTGCTTATTCCGAAGTTTGCCGGTTCAGTCGTTTAAATCAATCAAATACTTCGAAATTTCAATCTTTGGAAAAGAACCATGAAATTGATGACAATG ]
[-] EMBL CD067122 [ TGGATATATGGGTCATAGTTTACGGACAGATTTGAAACCATCCACACCTTGTGAGAATCACTCAAGCAACGATAATTTGTTATTATTATGGTACGACAAGGACAACTTTGAAGACGTTAATTCTTCTCAACAAGCTCTATTACCATTCATAGCGTGTGGAGATCTAAGAGGTTTCGACCCAGATGTCACGTA ]
[-] EMBL CD072881 [ TTACCATTCATAGCGTGTGGAGATCTAAGAGGTTTCGACCCAGATGTCACGTATACTTTAGCTCCTGATCATATAGTCAAGCCACCAGTACAAGTTCCTGTGGATCCTGCTTATTCCGAAGTTTGCCGGTTCAGTCGTTTAAATCAATCAAATACTTCGAAATTTCAATCTTTGGAAAAGAACAATGAAATTGATGGCAATGATGATATTTCTAGATTTACAAAACTTATGGAAAAGTTGTCTTTCGATTCAAGAGAAGATAATTTATGATGTTTGCTTTTTATAGACAAAACTGTTTTATTCCATAAACAAATAAATATAG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||