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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9516#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 819 fasta sequence
[TCTGAAGCAGAGTTATTAACATATGTAGACTGTATAGCAGCACCATATGCTGAATCAACAGTTAAATCATTACTTTCTGTTTTATCGATT-ATTTGTGAAACACTGTC-TTTATGATCACTATTATCGA-TTGAGGTATCGGCAAAGTAGTTGAGATTATTTGTAGATTCATCTAATTGTTCCATAGATGAAGAGCAACTAGATAAAGGAAGATCCATATTCATTGAATTTATGGAGGACAGTGGGAAAACTGAAGGTATACTTTTAGGTATAGCTGAATAGTTCGGTTGTGGTTGGGAGACTGATGATGATAATGGTTGGGGTGATGGAACAGAATTCGGCATCATAACAGAATCAGGACTGGTATTGAAACTT-TTATGCTCAGGAGCCATAATTGAATAACATGATGTTGTTGGATGGTCACAATTAGGTATAATTATTCCAGAATCTGTAATAGGTGTGGTCGATGAATCAATGTTCAGATTATGCAAACGTAATTTCTCGCCCAATAAGAGGTAAGTAGCTGTCAGATGATCGTAAGCACAACGTAGAAGTGACTTGAGAATTTGAGTGCGACACATTCCATAAGACTCCATAATCATAATAACTAATTCGTTTAGTTTACCAACTTTCATTTCAGCCGCTAAATTAGGACCAGGACTTTGTAGATCGTCTTTACTCCATGAGAATTTTGAAGAGCAATCACAAGAACAATGTTTCAAAATAAACGTGGGTTGAACTAAATCATAGTCCGTAGATTTATTTAGAATATTTGTATTAGCACCACAGGGTGACAACGTTTGTTGTAATGTTGTTTGCGTA]
[-] EMBL CD072792 [TCTGAAGCAGAGTTATTAACATATGTAGACTGTATAGCAGCACCATATGCTGAATCAACAGTTAAATCATTACTTTCTGTTTTATCGATT ATTTGTGAAACACTGTC TTTATGATCACTATTATCGA TTGAGGTATCGGCAAAGTAGTTGAGATTATTTGTAGATTCATCTAATTGTTCCATAGATGAAGAGCAACTAGATAAAGGAAGATCCATATTCATTGAATTTATGGAGGACAGTGGGAAAACTGAAGGTATACTTTTAGGTATAGCTGAATAGTTCGGTTGTGGTTGGGAGACTGATGATGATAATGGTT ]
[-] EMBL CD098130 [ AGACTGTAAAGCAACACCATATGCTGAATCAACAGTTAAATCATTACTTTCTGTTTTATCGATT ATTTGTGAAACACTGTC TTTATGATCACTATTATCGA TTGAGGTATCGGCAAAGTAGTTGAGATTATTTGTAGATTCATCTAATTGTTCCATAGATGAAGAGCAACTAGATAAAGGAAGATCCATATTCATTGAATTTATGGAGGACAGTGGGAAAACTGAAGGTATACTTTCAGGTATAGCTGAATAGTTCGGTTGTGGTTGGGAGACTGATGATGATAATGGTTGGGGTGATGGAACAGAATTCGGCATCATAACAGAATCAGGACTGGTATTGAAACTTCTTATGCTCAGGAGCCATAATTGAATAACATGATGTTGTTGGATGGTCACAATTAGGTATAATTATTCCAGAATCTGTAATAGGTGTGGTCGATGAATCAATGTTCAGATTATGCAAACGTAA ]
[-] EMBL CD061370 [ gtATTAATTTGTGAAACACTGTCGTTTATGATCACTATTATCGAGTTGAGGTATCGGCAAAGTAGTTGAGATTATTTGTAGATTCATCTAATTGTTCCATAGATGAAGAGCAACTAGATAAAGGAAGAT ]
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[+] EMBL CD097697 [ CTTTTAGGTATAGCTGAATAGTTCGGTTGTGGTTGGGAGACTGATGATGATAATGGTTGGGGTGATGGAACAGAATTCGGCATCATAACAGAATCAGGACTGGTATTGAAACTT TTATGCTCAGGAGCCATAATTGAATAACATGATGTTGTTGGATGGTCACAATTAGGTATAATTATTCCAGAATCTGTAATAGGTGTGGTCGATGAATCAATGTTCAGATTATGCAAACGTAATTTCTCGCCCAATAAGAGGTAAGTAGCTGTCAGATGATCGTAAGCACAACGTAGAAGTGACTTGAGAATTTGAGTGCGACACATTCCATAAGACTCCATAATCATAATAACTAATTCGTTTAGTTTACCAACTTTCATTTCAGCCGCTAAATTAGGACCAGGACTTTGTAGATCGTCTTTACTCCATGAGAATTTTGAAGAGCAATCACAAGAACAATGTTTCAAAATAAACGTGGGTTGAACTAAATCATAGTCCGTAGATTTATTTAGAATATTTGTATTAGCACCACAGGGTGACAACGTTTGTTGTAATGTTGTTTGCGTA]
[+] EMBL CD097654 [ CTTTTAGGTATAGCTGAATAGTTCGGTTGTGGTTGGGAGACTGATGATGATAATGGTTGGGGTGATGGAACAGAATTCGGCATCATAACAGAATCAGGACTGGTATTGAAACTT TTATGCTCAGGAGCCATAATTGAATAACATGATGTTGTTGGATGGTCACAATTAGGTATAATTATTCCAGAATCTGTAATAGGTGTGGTCGATGAATCAATGTTCAGATTATGCAAACGTAATTTCTCGCCCAATAAGAGGTAAGTAGCTGTCAGATGATCGTAAGCACAACGTAGAAGTGACTTGAGAATTTGAGTGCGACACATTCCATAAGACTCCATAATCATAATAACTAATTCGTTTAGTTTACCAACTTTCATTTCAGCCGCTAAATTAGGACCAGGACTTTGTAGATCGTCTTTACTCCATGAGAATTTTGAAGAGCAATCACAAGAATAATGTTTCAAAATAAACGTGGGTTGAACTAAATCATAGTCCGTAGATTTATTTAGAATATTTGTATTAGCACCACAGGGTGACAACGTTTGTTG ]
[+] EMBL CD097723 [ CTTTTAGGTATAGCTGAATAGTTCGGTTGTGGTTGGGAGACTGATGATGATAATGGTTGGGGTGATGGAACAGAATTCGGCATCATAACAGAATCAGGACTGGTATTGAAACTT TTATGCTCAGGAGCCATAATTGAATAACATGATGTTGTTGGATGGTCACAATTAGGTATAATTATTCCAGAATCTGTAATAGGTGTGGTCGATGAATCAATGTTCAGATTATGCAAACGTAATTTCTCGCCCAATAAGAGGTAAGTAGCTGTCAGATGATCGTAAGCACAACGTAGAAGTGACTTGAGAATTTGAGTGCGACACATTCCATAAGACTCCATAATCATAATAACTAATTCGTTTAGTTTACCAACTTTCATTTCAGCCGCTAAATTAGGACCAGGACTTTGTAGATCGTCTTTACTCCATGAGAATTTTGAAGAGCAATCACAAGAACAATGTTTCAAAATAAACGTGGGTTGAACTAAATCATAGTCCGTGGATTTATTTAGAATATTTGTATTAGCACCACAGGGTGACAACGTTTGTTGT ]
[+] EMBL CD097704 [ CTTTTAGGTATAGCTGAATAGTTCGGTTGTGGTTGGGAGACTGATGATGATAATGGTTGGGGTGATGGAACAGAATTCGGCATCATAACAGAATCAGGACTGGTATTGAAACTT TTATGCTCAGGAGCCATAATTGAATAACATGATGTTGTTGGATGGTCACAATTAGGTATAATTATTCCAGAATCTGTAATAGGTGTGGTCGATGAATCAATGTTCAGATTATGCAAACGTAATTTCTCGCCCAATAAGAGGTAAGTAGCTGTCAGATGATCGTAAGCACAACGTAGAAGTGACTTGAGAATTTGAGTGCGACACATTCCATAAGACTCCATAATCATAATAACTAATTCGTTTAGTTTACCAACTTTCATTTCAGCCGCTAAATTAGGACCAGGACTTTGTAGATCGTCTTTACTCCATGAGAATTTTGAAGAGCAATCACAAGAATAATGTTTCAAAATAAACGTGGGTTGAACTAAATCATAGTCCGTAGATTTATTTAGAATATTTGTATTAGCACCACAGGGTGACAACGTTTGTTGTA ]
[+] EMBL CD189427 [ gggtattTTGGGTGACTGATGATGATAATGGTTGGGGTGATGGAACAGAATTCGGCATCATAACAGAATCAGGACTGGTATTGAAACTT TTATGCTCAGGAGCCATAATTGAATAACATGATGTTGTTGGATGGTCACAATTAGGTATAATTATTCCAGAATCTGTAATAGGTGTGGTCGATGAATCAATGTTCAGATTACGCAAACGTAATTTCTCGCCCAATAAGAGGTAAGTAGCTGTCAGATGATCGTAAGCACAACGTAGAAGTGACTTGAGAATTTGAGTGCGACACATTCCATAAGACTCCATAATCATAATAACTAATTCGTTTAGTTTACCAACTTTCATTTCAGCCGC ]
[-] EMBL CD138099 [ AATGGTTGGGGTGATGGAACAGAATTCGGCATCATAACAGAATCAGGACTGGTATTGAAACTT CTATGCTCAGGAGCCATAATTGAATAACATGATGTTGTTGGATGGTCACAATTAGGTATAATTATTCCAGAATCTGTAATAGGTGTGGTCGATGAATCAATGTTCAGATTATGCAAACGTAATTTCTCGCCCAATAAGAGGTAAGTAGCTGTCAGATGATCGTAAGCTCAACGTAGAAGTGACTTGAGAATTTGAGTGCGACACATTCCATAAGACTCCATAATCATAATAACTAATTCGTTTAGTTTACCAACTTTCATTTCAGCCGCTAAATTAGGACCAGGACT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||