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Schistosoma mansoni
cluster # 9516 cluster # 9516       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9516#0 length = 819 sequences # 10  

consensusID : consensus_9516#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 819
fasta sequence
                              [TCTGAAGCAGAGTTATTAACATATGTAGACTGTATAGCAGCACCATATGCTGAATCAACAGTTAAATCATTACTTTCTGTTTTATCGATT-ATTTGTGAAACACTGTC-TTTATGATCACTATTATCGA-TTGAGGTATCGGCAAAGTAGTTGAGATTATTTGTAGATTCATCTAATTGTTCCATAGATGAAGAGCAACTAGATAAAGGAAGATCCATATTCATTGAATTTATGGAGGACAGTGGGAAAACTGAAGGTATACTTTTAGGTATAGCTGAATAGTTCGGTTGTGGTTGGGAGACTGATGATGATAATGGTTGGGGTGATGGAACAGAATTCGGCATCATAACAGAATCAGGACTGGTATTGAAACTT-TTATGCTCAGGAGCCATAATTGAATAACATGATGTTGTTGGATGGTCACAATTAGGTATAATTATTCCAGAATCTGTAATAGGTGTGGTCGATGAATCAATGTTCAGATTATGCAAACGTAATTTCTCGCCCAATAAGAGGTAAGTAGCTGTCAGATGATCGTAAGCACAACGTAGAAGTGACTTGAGAATTTGAGTGCGACACATTCCATAAGACTCCATAATCATAATAACTAATTCGTTTAGTTTACCAACTTTCATTTCAGCCGCTAAATTAGGACCAGGACTTTGTAGATCGTCTTTACTCCATGAGAATTTTGAAGAGCAATCACAAGAACAATGTTTCAAAATAAACGTGGGTTGAACTAAATCATAGTCCGTAGATTTATTTAGAATATTTGTATTAGCACCACAGGGTGACAACGTTTGTTGTAATGTTGTTTGCGTA]

[-] EMBL CD072792             [TCTGAAGCAGAGTTATTAACATATGTAGACTGTATAGCAGCACCATATGCTGAATCAACAGTTAAATCATTACTTTCTGTTTTATCGATT ATTTGTGAAACACTGTC TTTATGATCACTATTATCGA TTGAGGTATCGGCAAAGTAGTTGAGATTATTTGTAGATTCATCTAATTGTTCCATAGATGAAGAGCAACTAGATAAAGGAAGATCCATATTCATTGAATTTATGGAGGACAGTGGGAAAACTGAAGGTATACTTTTAGGTATAGCTGAATAGTTCGGTTGTGGTTGGGAGACTGATGATGATAATGGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD098130             [                          AGACTGTAAAGCAACACCATATGCTGAATCAACAGTTAAATCATTACTTTCTGTTTTATCGATT ATTTGTGAAACACTGTC TTTATGATCACTATTATCGA TTGAGGTATCGGCAAAGTAGTTGAGATTATTTGTAGATTCATCTAATTGTTCCATAGATGAAGAGCAACTAGATAAAGGAAGATCCATATTCATTGAATTTATGGAGGACAGTGGGAAAACTGAAGGTATACTTTCAGGTATAGCTGAATAGTTCGGTTGTGGTTGGGAGACTGATGATGATAATGGTTGGGGTGATGGAACAGAATTCGGCATCATAACAGAATCAGGACTGGTATTGAAACTTCTTATGCTCAGGAGCCATAATTGAATAACATGATGTTGTTGGATGGTCACAATTAGGTATAATTATTCCAGAATCTGTAATAGGTGTGGTCGATGAATCAATGTTCAGATTATGCAAACGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD061370             [                                                                                     gtATTAATTTGTGAAACACTGTCGTTTATGATCACTATTATCGAGTTGAGGTATCGGCAAAGTAGTTGAGATTATTTGTAGATTCATCTAATTGTTCCATAGATGAAGAGCAACTAGATAAAGGAAGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL AI976247             [                                                                                                                                                                                                                GAAGATCCATATTCATTGAATTTATGGAGGACAGTGGGAAAACTGAAGGTATACTGTTAGGTATAGCTGAATAGTTCGGCTGTGGTCGGGAGACTGATGATGATAATGGTTGGGGTAATGGAACAGAATTCGGCATCATAACAGAATCAGGACTGGTATTGAAACTT TTATGCTCAGGAGCCATAATTGAATAACATGATGTTGTTGGATGGTCACAATTAGGTATAATTATTCCAGAATCTGTAATAGGTGTGGTCGATGAATCAATGTTCAGATTATGCAAACGTAATATCTCGCCCAATAAGAGGTAAGTAGCTGTCAGATGATCGTAAGCACATCGTAGAAGTGTCTTGAGAATGTGAGTGCGACACATTCCATAAGACTCCATAATCATAATAACTAATTCGTTTAGTTCACCAACTTTCATGTCAGCCGCTAAATTAGG                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD097697             [                                                                                                                                                                                                                                                                     CTTTTAGGTATAGCTGAATAGTTCGGTTGTGGTTGGGAGACTGATGATGATAATGGTTGGGGTGATGGAACAGAATTCGGCATCATAACAGAATCAGGACTGGTATTGAAACTT TTATGCTCAGGAGCCATAATTGAATAACATGATGTTGTTGGATGGTCACAATTAGGTATAATTATTCCAGAATCTGTAATAGGTGTGGTCGATGAATCAATGTTCAGATTATGCAAACGTAATTTCTCGCCCAATAAGAGGTAAGTAGCTGTCAGATGATCGTAAGCACAACGTAGAAGTGACTTGAGAATTTGAGTGCGACACATTCCATAAGACTCCATAATCATAATAACTAATTCGTTTAGTTTACCAACTTTCATTTCAGCCGCTAAATTAGGACCAGGACTTTGTAGATCGTCTTTACTCCATGAGAATTTTGAAGAGCAATCACAAGAACAATGTTTCAAAATAAACGTGGGTTGAACTAAATCATAGTCCGTAGATTTATTTAGAATATTTGTATTAGCACCACAGGGTGACAACGTTTGTTGTAATGTTGTTTGCGTA]
[+] EMBL CD097654             [                                                                                                                                                                                                                                                                     CTTTTAGGTATAGCTGAATAGTTCGGTTGTGGTTGGGAGACTGATGATGATAATGGTTGGGGTGATGGAACAGAATTCGGCATCATAACAGAATCAGGACTGGTATTGAAACTT TTATGCTCAGGAGCCATAATTGAATAACATGATGTTGTTGGATGGTCACAATTAGGTATAATTATTCCAGAATCTGTAATAGGTGTGGTCGATGAATCAATGTTCAGATTATGCAAACGTAATTTCTCGCCCAATAAGAGGTAAGTAGCTGTCAGATGATCGTAAGCACAACGTAGAAGTGACTTGAGAATTTGAGTGCGACACATTCCATAAGACTCCATAATCATAATAACTAATTCGTTTAGTTTACCAACTTTCATTTCAGCCGCTAAATTAGGACCAGGACTTTGTAGATCGTCTTTACTCCATGAGAATTTTGAAGAGCAATCACAAGAATAATGTTTCAAAATAAACGTGGGTTGAACTAAATCATAGTCCGTAGATTTATTTAGAATATTTGTATTAGCACCACAGGGTGACAACGTTTGTTG                ]
[+] EMBL CD097723             [                                                                                                                                                                                                                                                                     CTTTTAGGTATAGCTGAATAGTTCGGTTGTGGTTGGGAGACTGATGATGATAATGGTTGGGGTGATGGAACAGAATTCGGCATCATAACAGAATCAGGACTGGTATTGAAACTT TTATGCTCAGGAGCCATAATTGAATAACATGATGTTGTTGGATGGTCACAATTAGGTATAATTATTCCAGAATCTGTAATAGGTGTGGTCGATGAATCAATGTTCAGATTATGCAAACGTAATTTCTCGCCCAATAAGAGGTAAGTAGCTGTCAGATGATCGTAAGCACAACGTAGAAGTGACTTGAGAATTTGAGTGCGACACATTCCATAAGACTCCATAATCATAATAACTAATTCGTTTAGTTTACCAACTTTCATTTCAGCCGCTAAATTAGGACCAGGACTTTGTAGATCGTCTTTACTCCATGAGAATTTTGAAGAGCAATCACAAGAACAATGTTTCAAAATAAACGTGGGTTGAACTAAATCATAGTCCGTGGATTTATTTAGAATATTTGTATTAGCACCACAGGGTGACAACGTTTGTTGT               ]
[+] EMBL CD097704             [                                                                                                                                                                                                                                                                     CTTTTAGGTATAGCTGAATAGTTCGGTTGTGGTTGGGAGACTGATGATGATAATGGTTGGGGTGATGGAACAGAATTCGGCATCATAACAGAATCAGGACTGGTATTGAAACTT TTATGCTCAGGAGCCATAATTGAATAACATGATGTTGTTGGATGGTCACAATTAGGTATAATTATTCCAGAATCTGTAATAGGTGTGGTCGATGAATCAATGTTCAGATTATGCAAACGTAATTTCTCGCCCAATAAGAGGTAAGTAGCTGTCAGATGATCGTAAGCACAACGTAGAAGTGACTTGAGAATTTGAGTGCGACACATTCCATAAGACTCCATAATCATAATAACTAATTCGTTTAGTTTACCAACTTTCATTTCAGCCGCTAAATTAGGACCAGGACTTTGTAGATCGTCTTTACTCCATGAGAATTTTGAAGAGCAATCACAAGAATAATGTTTCAAAATAAACGTGGGTTGAACTAAATCATAGTCCGTAGATTTATTTAGAATATTTGTATTAGCACCACAGGGTGACAACGTTTGTTGTA              ]
[+] EMBL CD189427             [                                                                                                                                                                                                                                                                                              gggtattTTGGGTGACTGATGATGATAATGGTTGGGGTGATGGAACAGAATTCGGCATCATAACAGAATCAGGACTGGTATTGAAACTT TTATGCTCAGGAGCCATAATTGAATAACATGATGTTGTTGGATGGTCACAATTAGGTATAATTATTCCAGAATCTGTAATAGGTGTGGTCGATGAATCAATGTTCAGATTACGCAAACGTAATTTCTCGCCCAATAAGAGGTAAGTAGCTGTCAGATGATCGTAAGCACAACGTAGAAGTGACTTGAGAATTTGAGTGCGACACATTCCATAAGACTCCATAATCATAATAACTAATTCGTTTAGTTTACCAACTTTCATTTCAGCCGC                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD138099             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATGGTTGGGGTGATGGAACAGAATTCGGCATCATAACAGAATCAGGACTGGTATTGAAACTT CTATGCTCAGGAGCCATAATTGAATAACATGATGTTGTTGGATGGTCACAATTAGGTATAATTATTCCAGAATCTGTAATAGGTGTGGTCGATGAATCAATGTTCAGATTATGCAAACGTAATTTCTCGCCCAATAAGAGGTAAGTAGCTGTCAGATGATCGTAAGCTCAACGTAGAAGTGACTTGAGAATTTGAGTGCGACACATTCCATAAGACTCCATAATCATAATAACTAATTCGTTTAGTTTACCAACTTTCATTTCAGCCGCTAAATTAGGACCAGGACT                                                                                                                                                                ]


>consensus_9516#0 TCTGAAGCAGAGTTATTAACATATGTAGACTGTATAGCAGCACCATATGCTGAATCAACA GTTAAATCATTACTTTCTGTTTTATCGATTATTTGTGAAACACTGTCTTTATGATCACTA TTATCGATTGAGGTATCGGCAAAGTAGTTGAGATTATTTGTAGATTCATCTAATTGTTCC ATAGATGAAGAGCAACTAGATAAAGGAAGATCCATATTCATTGAATTTATGGAGGACAGT GGGAAAACTGAAGGTATACTTTTAGGTATAGCTGAATAGTTCGGTTGTGGTTGGGAGACT GATGATGATAATGGTTGGGGTGATGGAACAGAATTCGGCATCATAACAGAATCAGGACTG GTATTGAAACTTTTATGCTCAGGAGCCATAATTGAATAACATGATGTTGTTGGATGGTCA CAATTAGGTATAATTATTCCAGAATCTGTAATAGGTGTGGTCGATGAATCAATGTTCAGA TTATGCAAACGTAATTTCTCGCCCAATAAGAGGTAAGTAGCTGTCAGATGATCGTAAGCA CAACGTAGAAGTGACTTGAGAATTTGAGTGCGACACATTCCATAAGACTCCATAATCATA ATAACTAATTCGTTTAGTTTACCAACTTTCATTTCAGCCGCTAAATTAGGACCAGGACTT TGTAGATCGTCTTTACTCCATGAGAATTTTGAAGAGCAATCACAAGAACAATGTTTCAAA ATAAACGTGGGTTGAACTAAATCATAGTCCGTAGATTTATTTAGAATATTTGTATTAGCA CCACAGGGTGACAACGTTTGTTGTAATGTTGTTTGCGTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)