cluster # 9574

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9574 cluster # 9574 Sequences # 10 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9574#0 length = 745 sequences # 10
consensusID : consensus_9574#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 745
fasta sequence
                              [TGCATCATTCATGTATTTTAGTGTGTACTGTTTCTAGGTTTTTCTTTGTAATTAAAATTTTTTTATTTAACCTTATTTTTCAAAAATACATATTTTTTGTGTTAGATATACTACTGAATAAGACTATTTTTTCAAAATAATGAAAGTGTGTTTAAAGACAAAAAAAACTCAGCAACATTTCCATCTTTATTTCGTTAACTCTTTAATTTTTTTCAACTTTAAACTCAGTCTTCACTACTTTGCCTTTGTATTCATCTGCTCACTTAATCACTCACTCAATCTTATCTCTGTAAGCTTACTATCACATCACTATCATCTTTCAGAAATAAAAAATCCTCTTTTTTGTCATAAACAAATCAGATGTATGTTTGTCAGTTTATAAGATTATTATACTTTTTAACTAGTACTATTATCGTCAATTATAATT-CTACTATGTACAGTTTATAGTGTGAAAATTGTCTTGTGTTTTCTCTCTCCCAGCGTTTTT-CCCCTGTTCTCTTTGAAAAACATGACAAGATTGTAACTGTGGCAATGAATAATGAGAGATGGCGGAAAAAAGGGAAAAGAATTTCTTCTTTTTATTAGGATTT-TTTAATGAGTCGTTCTTTTGTATGAAAATAAATTTATTCGTTTGCTTTTTATTATCGGACTAATTGTTTGTTGTTGTGGTGGTGATGGCTGTACTATTTCTAGTGGATATTTTTAATGAAAANACTTCTAGGTTTATGCTTCAATTATTCCCTCC]

[+] EMBL CD083436             [TGCATCATTCATGTATTTTAGTGTGTACTGTTTCTAGGTTTTTCTTTGTAATTAAAATTTTTTTATTTAACCTTATTTTTCAAAAATACATATTTTTTGTGTTAGATATACTACTGAATAAGACTATTTTTTCAAAATAATGAAAGTGTGTTTAAAGACAAAAAAAACTCAGCAACATTTCCATCTTTATTTCGTTAACTCTTTAATTTTTTTCAACTTTAAACTCAGTCTTCACTACTTTGCCTTTGTATTCATCTGCTCACTTAATCACTCACTCAATCTTATCTCTGTAAGCTTACTATCACATCACTATCATCTTTCAGAAATAAAAAATCCTCTTTTTTGTCATAAACAAATCAGATGTATGTTTGTCAGTTTATAAGATTATTATACTTTTTAACTAGTACTATTATCGTCAATTATAATT CTACTATGTACAGTTTATAGTGTGAAAATTGTCTTGTGTTTGCTCTCTCCCAGCGTTTTTCCCCCTGT                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD091921             [                                                                                                                                                              aAAAAAAAACTCACCAACATTTCCATCTTTATTTCGTTAACTCTTTAATTTTTTCCAACTTTAAACTCAGTCTTCACTACTTTGCCTTTGTATTCATCTGCTCACTTAATCACTCACTCAATCTTATCTCTGTAAGCTTACTATCACATCACTATCATCTTTCAGAAATAAAAAATCCTCTTTTTTGTCATAAACAAATCAGATGTATGTTTGTCAGTTTATAAGATTATTATACTTTTTAACTAGTACTATTATCGTCAATTATAATT CTACTATGTACAGTTTATAGTGTGAAAATTGTCTTGTGTTTTCTCTCTCCCAGCGTTTTT CCCCTGTTCTCTTTGAAAAACATGACAAGATTGTAACTGTGGCAATGAATAATGAGAGATGGCGGAAAAAAGGGAAAAGAATTTCTTCTTTTTATTAGGATTT TTTAATGAGTCGTTCTTTTGTATGAAAATAAATTTATTCGTTTGCTTTTTATTATCGGACTAATTGTTTGTTGTTGTGGTGGTGATGGCTGTACTATTTCTAGTGGATATTTTTAATGAAAAN                                ]
[-] EMBL CD091968             [                                                                                                                                                               AAAAAAAACTCAGCAACATTTCCATCTTTATTTCGTTAACTCTTTAATTTTTTTCAACTTTAAACTCAGTCTTCACTACTTTGCCTTTGTATTCATCTGCTCACTTAATCACTCACTCAATCTTATCTCTGTAAGCTTACTATCACATCACTATCATCTTTCAGAAATAAAAAACCCTCTTTTTTGTCATAAACAAATCAGATGTATGTTTGTCAGTTTATAAGATTATTATACTTTTTAACTAGTACTATTATCGTCAATTATAATT CTACTATGTACAGTTTATAGTGTGAAAATTGTCTTGTGTTTTCTCTCTCCCAGCGTTTTT CCCCTGTTCTCTTTGAAAAACATGACAAGATTGTAACTGTGGCAATGAATAATGAGAGATGGCGGAAAAAAGGGAAAAGAATTTCTTCTTTTTATTAGGATTT TTTAATGAGTCGTTCTTTTGTATGAAAATAAATTTATTCGTTTGCTTTTTATTATCGGACTAATCGTTTGTTGTTGTGGTGGTGATGGCTGTACTATTTCTAGTGGATATTTTTAATG                                     ]
[-] EMBL CD091976             [                                                                                                                                                               AAAAAAAACTCAGCAACATTTCCATCTTTATTTCGTTAACTCTTTAATTTTTTTCAACTTTAAACTCAGTCTTCACTACTTTGCCTTTGTATTCATCTGCTCACTTAATCACTCACTCAATCTTATCTCTGTAAGCTTACTATCACATCACTATCATCTTTCAGAAATAAAAAATCCTCTTTTTTGTCATAAACAAATCAGATGTATGTTTGTCAGTTTATAAGATTATTATACTTTTTAACTAGTACTATTATCGTCAATTATAATT CTACTATGTACAGTTTATAGTGTGAAAATTGTCTTGTGTTTTCTCTCTCCCAGCGTTTTT CCCCTGTTCTCTTTGAAAAACATGACAAGATTGTAACTGTGGCAATGAATAATGAGAGATGGCGGAAAAAAGGGAAAAGAATTTCTTCTTTTTATTAGGATTT TTTAATGAGTCGTTCTTTTGTATGAAAATAAATTTATTCGTTTGCTTTTTATTATCGGACTAATTGTTTGTTGTTGTGGTGGTGATGGCTGTACTATTTCTAGTGGATATTTTTAATG                                     ]
[-] EMBL CD091933             [                                                                                                                                                                    AAACTCAGCCACATTTCCATCTGTATTTCGTTAACTCTTTAATTTTTTTCAACTTTAAACTCAGTCTTCACTACTTTGCCTTTGTATTCATCTGCTCACTTAATCACTCACTCAATCTTATCTCTGTAAGCTTACTATCACATCACTATCATCTTTCAGACATACAAAATCCTCTTCTTTGTCATAAACAAATCAGATGTATGTTTGTCAGTTTATAAGATTATTATACTTTTTAACTAGTCCTACTATCGTCAATTATAATTCCTCCTATGTACAGTTTATAGTGTCAAAATTGTCTTGTGTTTTCTCTCTCCCAGCGTTTTT CCCCTGTTCTCTTTGAAAAACATGACAAGATTGTAACTGTGGCAATGAATAATGAGAGATGGCGGAAAAAAGGGAAAACAATTTCTTCTTTTTATTAGGATTTCTTTAATGAGTCGTTCTTTTGTATGACAATAAATTTATTCGTTTGCTTTTTATTATCGGACTAATTGTTTGTTGTTGTGGTGGTGATGGCTGTACTATTTCTAGTGGATATTTTTAATG                                     ]
[-] EMBL AI068210             [                                                                                                                                                                          AGCAACATTTCCATCTTTATTTCGTTAACTCTTTAATTTTTTTCAACTTTAAACTCAGTCTTCACTACTTTGCCTTTGTATTCATCTGCTCACTTAATCACTCACTCAATCTTATCTCTGTAAGCTTACTATCACATCACTATCATCTTTCAGAAATAAAAAATCCTCTTTTTTGTCATAAACAAATCAGATGTATGTTTGTCAGTTTATAAGATTATTATACTTTTTAACTAGTACTATTATCGTCAATTATAATT CTACTATGTACAGTTTATAGTGTGAAAATTGTCTTGTGTTTTCTCTCTCCCAGCGTTTTT CCCCTGTTCTCTTTGAAAAACATGACAAGATTGTAACTGTGGCAATGAATAATGAGAGATGGCGGAAAAAAG                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL AI068199             [                                                                                                                                                                                     CATCTTTATNTCGTTAACTCTTTAATTTTTTTCAACTTTAAACTCAGTCTTCACTACTTTGCCTTTGTATTCATCTGCTCACTTAATCACTCACTCAATCTTATCTCTGTAAGCTTACTATCACATCACTATCATCTTTCAGAAATAAAAAATCCTCTTTTTTGTCATAAACAAATCAGATGTATGTTTGTCAGTTTATAAGATTATTATACTTTTTAACTAGTACTATTATCGTCAATTATAATT CTACTATGTACAGTTTATAGTGTGAAAATTGTCTTGTGTTTTCTCTCTCCCAGCGTTTTT CCCCTGTTCTCTTTGAAAAACATGACAAGATTGTAACTGTGGCAATGAATAATGAGAGATGGCGGAAAAAAG                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL AI067201             [                                                                                                                                                                                                                                                TGCCTTTGTATTCATCTGCTCACTTAATCACTCACTCAATCTTATCTCTGTAAGCTTACTATCACATCACTATCATCTTTCAGAAATAAAAAATCCTCTTTTTTGTCATAAACAAATCAGATGTATGTTTGTCAGTTTATAAGATTATTATACTTTTTAACTAGTACTATTATCGTCAATTATAATT CTACTATGTACAGTTTATAGTGTGAAAATTGTCTTGTGTTTTCTCTCTCCCAGCGTTTTT CCCCTGTTCTCTTTGAAAAACATGACAAGATTGTAACTGTGGCAATGAATAATGAGAGATGGCGGAAAAAAG                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL AI067379             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATGTTTGTCAGTTTATAAGATTATTATACTTTTTAACTAGTACTATTATCGTCAATTATAATT CTACTATGTACAGTTTATAGTGTGAAAATTGTCTTGTGTTTTCTCTCTCCCAGCGTTTTT CCCCTGTTCTCTTTGAAAAACATGACAAGATTGTAACTGTGGCAATGAATAATGAGAGATGGCGGAAAAAAG                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL AI067793             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTTATAAGATTATTATACTTTTTAACTAGTACTATTATCGTCAATTATAATT CTACTATGTACAGTTTATAGTGTGAAAATTGTCTTGTGTTTTCTCTCTCCCAGCGTTTTT CCCCTGTTCTCTTTGAAAAACATGACAAGATTGTAACTGTGGCAATGAGTAATGAGAGATGGCGGAAAAAAGGGAAAAGAATTTCTTCTTTGTATTAGGATTT TTTAATGAGTCGTTCTGGTGTATGAAAATAAATTTATTCGTCTGCTTTTTATTATCGGACTAATTGTTTG TGTTGTGGTGGTGATGGCTGTACTATTTGTAGTGGATATTGTTAATGAAAACACTTCTAGGTTTATGCTTCAATTATTCCCTCC]




>consensus_9574#0
TGCATCATTCATGTATTTTAGTGTGTACTGTTTCTAGGTTTTTCTTTGTAATTAAAATTT
TTTTATTTAACCTTATTTTTCAAAAATACATATTTTTTGTGTTAGATATACTACTGAATA
AGACTATTTTTTCAAAATAATGAAAGTGTGTTTAAAGACAAAAAAAACTCAGCAACATTT
CCATCTTTATTTCGTTAACTCTTTAATTTTTTTCAACTTTAAACTCAGTCTTCACTACTT
TGCCTTTGTATTCATCTGCTCACTTAATCACTCACTCAATCTTATCTCTGTAAGCTTACT
ATCACATCACTATCATCTTTCAGAAATAAAAAATCCTCTTTTTTGTCATAAACAAATCAG
ATGTATGTTTGTCAGTTTATAAGATTATTATACTTTTTAACTAGTACTATTATCGTCAAT
TATAATTCTACTATGTACAGTTTATAGTGTGAAAATTGTCTTGTGTTTTCTCTCTCCCAG
CGTTTTTCCCCTGTTCTCTTTGAAAAACATGACAAGATTGTAACTGTGGCAATGAATAAT
GAGAGATGGCGGAAAAAAGGGAAAAGAATTTCTTCTTTTTATTAGGATTTTTTAATGAGT
CGTTCTTTTGTATGAAAATAAATTTATTCGTTTGCTTTTTATTATCGGACTAATTGTTTG
TTGTTGTGGTGGTGATGGCTGTACTATTTCTAGTGGATATTTTTAATGAAAANACTTCTA
GGTTTATGCTTCAATTATTCCCTCC
clustalw multiple alignements is not computed in this case