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Schistosoma mansoni
cluster # 9596 cluster # 9596       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9596#0 length = 1304 sequences # 10  

consensusID : consensus_9596#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1304
fasta sequence
                              [AGTTAGACAATAGTGAACCATTGTATGAATGTGTTATTTGTCAAATATCTGGTCGACCATCAGTAGATGACATGGTTCTTTTAGACATGATATGTGAATCGAATCTTATGCTTCAGCTTCGTGAAACTGCTGTGATACCAACATTATATGGACGAGATCTTAGCCACTCATCAGGTTATCCTCCAGTTCTTTCTGAGACTGACGACTTATCGTGGTTGTCACCGGAACGACCACCTGTTAGTGGCCCATTATTTCAAAATTCTCCGTTGAGTAATTCGACAAACTCTGATAATCCTTCTCCAGTTAGTGGTAGTAGTCAAGCTCCAGCAGGAATTGTTGGTCTACCGATTCATCCAATTACAACAAATTCTTCTATAAAATCACATACAGAACGTTCATCATCACCCAAACCTGAAACACTTTCTGGTAATAAACAATCAAAGCATCACTCATGCTATACTGAACATCGTCAATGGTGGAGTAATGCGATACCTTCTCTGATATCTAAAACATTACCACTACTACATTCTGGAATTTTATTACAAACTTGCGGTCATGTTGTTCATCGAGAATGTTTTCAGCGTTATCGTACACATGGAGGTAATCGTTCTGCTGCAACACGTCATCGTTCTTGGATTGTATGCCCTTTGTGTAGAAGAGATATTCATCATCTTTTACCATTAGTTCCATTGCCTAAATCTGGTACATTTGGCAATAAACAACAACTATTCCCTTCTGTAGAATATGGTCAACAGAATATTGCAATGCTTTTGAGTAGACTAAATTCATTATCTGACACTGGTTCAACATTTTGGAATGATTTAAATTGTTCCGAGGATGAGTTAAATGTTCAGCGTCGAATTCTGATGTCTCAACTAATTGGAAGTAATTATGAGGCTACCATACTATTAAGATGTCAACTAGAATGTGAACTTAGTGTTCTGATGAGTTATCCATCACAATATTCCATGGTATCTCGTCGGTGTTATTGGCGTGAATTTATTTGTTATCTCCGACAATATGTTTCCAGTGTTTGCTTTACTTCAGGATCCAGCCGATATTCTGCTCGGGCTACTACCTCACATATGGCCCCACGAAGGTATTTTTCATACTGTTTTGGCATCGACATTTTGTTTGGCTTATATACGTGCTCTTATCAGTGTTACATTTAATCGTTCCACTTCATCAACATGTTTTAATTTAGTCAAACAGATCAATAGGACAAAATATTTATTGGGTAAAATTTCTGGTGTTCTCAGGAAGCATTTAGAGAATTTACTTAATTATTTAAGTGAATTAAACAC]

[-] EMBL CD180394             [AGTTAGACAATAGTGAACCATTGTATGAATGTGTTATTTGTCAAATATCTGGTCGACCATCAGTAGATGACATGGTTCTTTTAGACATGATATGTGAATCGAATCTTATGCTTCAGCTTCGTGAAACTGCTGTGATACCAACATTATATGGACGAGATCTTAGCCACTCATCAGGTTATCCTCCAGTTCTTTCTGAGACTGACGACTTATCGTGGTTGTCACCGGAACGACCACCTGTTAGTGGCCCATTATTTCAAAATTCTCCGTTGAGTAATTCGACAAACTCTGATAATCCTTCTCCAGTTAGTGGTAGTAGTCAAGCTCCAGCAGGAATTGTTGGTCTACCGATTCATCCAATTACAACTAATTCTTCTATAAAATCACTTACAGAACGTTCATCATCACCCAAACCTGAAACACTTTCTGGTAATAAACAATCAAAGCATCACTCATGCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD065821             [                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTCTGATAATCCTTCTCCAGTTAGTGGTAGTAGTCAAGCTCCAGCAGGAATTGTTGGTCTACCGATTCATCCAATTACAACAAATTCTTCTATAAAATCACATACAGAACGTTCATCATCACCCAAACCTGAAACACTTTCTGGTAATAAACAATCAAAGCATCACTCATGCTATACTGAACATCGTCAATGGTGGAGTAATGCGATACCTTCTCTGATATCTAAAACATTACCACTACTACATTCTGGAATTTTATTACAAACTTGCGGTCATGTTGTTCATCGAGAATGTTTTCAGCGTTATCGTACACATGGAGGTAATCGTTCTGCTGCAACACGTCATCGTTCTTGGATTGTATGCCCTTTGTGTAGAAGAGATATTCATCATCTTTTACCATTAGCTCCATTGCCTAAATCTGGTACATTTGGCAATAAACAACAACTATTCCCTTCTGTAGAATATGGTCCACAGAATATTGCAATGCTTTTGAGTAGACTAAATTCATTATCTGACACTGGTTCAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD065828             [                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTCTGATAATCC TCTCCAGTTAGTGGTAGTAGTCCAGCTCCAGCAGGAATTGTTGGTCTACCGATTCATCCAATTACAACAAATTCTTCTATAAAATCACATACAGAACGTTCATCATCACCCAAACCTGAAACACTTTCTGGTAATAAACAATCAAAGCATCACTCATGCTATACTGAACATCGTCAATGGTGGAGTAATGCGATACCTTCTCTGATATCTAAAACATTACCACTACTACATTCTGGAATTTTATTACAAACTTGCGGTCATGTTGTTCATCGAGAATGTTTTCAGCGTTATCGTACACATGGAGGTAATCGTTCTGCTGCAACACGTCATCGTTCTTGGATTGTATGCCCTTTGTGTAGAAGAGATATTCATCATCTTTTACCATTAGTTCCATTGCCTAAATCTGGTACATTTGGCAATAAACAACAACTATTCCCTTCTGTAGAATATGGTCAACAGAATATTGCAATGCTTTTGAGTAGACTAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD119252             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCAAAGCATCACTCATGCTATACTGAACATCGTCAATGGTGGAGTAATGCGATACCTTCTCTGATATCTAAAACATTACCACTACTACATTCTGGAATTTTATTACAAACTTGCGGTCATGTTGTTCATCGAGAATGTTTTCAGCGTTATCGTACACATGGAGGTAATCGTTCTGCTGCAACACGTCATCGTTCTTGGATTGTATGCCCTTTGTGTAGAAGAGATATTCATCATCTTTTACCATTAGTTCCATTGCCTAAATCTGGTACATTTGGCAATAAACAACAACTATTCCCTTCTGTAGAATATGGTCAACGGAATATTGCAATGCTTTTGAGTAGACTAAATTCATTATCTGACACTGGTTCAACATTTTGGAATGATTTAAATTGTTCCGAGGATGAGTTAAATGTTCAGCGTCGAATTCTGATGTCTCAACTAATTGGAAGTAATTATGAGGCTACCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD065861             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GCTATACTGAACATCGTCAATGGTGGAGTAATGCGATACCTTCTCTGATATCTAAAACATTACCACTACTACATTCTGGAATTTTATTACAAACTTGCGGTCATGTTGTTCATCGAGAATGTTTTCAGCGTTATCGTACACATGGAGGTAATCGTTCTGCTGCAACACGTCATCGTTCTTGGATTGTATGCCCTTTGTGTAGAAGAGATATTCATCATCTTTTACCATTAGTTCCATTGCCTAAATCTGGTACATTTGGCAATAAACAACAACCAGTACGTTCTGTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD119029             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACCTTCTCTGATATCTAAAACATTACCACTACTACATTCTGGAATTTTATTACAAACTTGCGGTCATGTTGTTCATCGAGAATGTTTTCAGCATTATCGTACACATGGAGGTAATCGTTCTGCTGCAACACGTCATCGTTCTTGGATTGTATGCCCTTTGTGTAGAAGAGATATTCATCATCTTTTACCATTAGTTCCATTGCCTAAATCTGGTACATTTGGCAATAAACAACAACTATTCCCTTCTGTAGAATATGGTCAACGGAATATTGCAATGCTTTTGAGTAGACTAAATTCATTATCTGACACTGGTTCAACATTTTGGAATGATTTAAATTGTTCCGAGGATGAGTTAAATGTTCAGCGTCGAATTCTGATGTCTCAACTAATTGGAAGTAATTATGAGGCTACCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD119007             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCTCTGATATCTAAAACATTACCACTACTACATTCTGGAATTTTATTACAAACTTGCGGTCATGTTGTTCATCGAGAATGTTTTCAGCGTTATCGTACACATGGAGGTAATCGTTCTGCTGCAACACGTCATCGTTCTTGGATTGTATGCCCTTTGTGTAGAAGAGATATTCATCATCTTTTACCATTAGTTCCATTGCCTAAATCTGGTACATTTGGCAATAAACAACAACTATTCCCTTCTGTAGAATATGGTCAACGGAATATTGCAATGCTTTTGAGTAGACTAAATTCATTATCTGACACTGATTCAACATTTTGGAATGATTTAAATTGTTCCGAGGATGAGTTAAATGTTCAGCGTCGAATTCTGATGTCTCAACTAATTGGAAGTAATTATGAGGCTACCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD148190             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACTACATTCTGGAATTTTATTACAAACTTGCGGTCATGTTGTTCATCGAGAATGTTTTCAGCATTATCGTACACATGGAGGTAATCGTTCTGCTGCAACACGTCATCGTTCTTGGATTGTATGCCCTTTGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD065859             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TATTACAAACTTGCGGTCATGTTGTTCATCGAGAATGTTTTCAGCGTTATCGTACACATGGAGGTAATCGTTCTGCTGCAACACGTCATCGTTCTTGGATTGTATGCCCTTTGTGTAGAAGAGATATTCATCATCTTTTACCATTAGTTCCATTGCCTAAATCTGGTACATTTGGCAATAAACAACAACTATTCCCTTCTGTAGAATATGGTCAACAGAATATTGCAATGCTTTTGAGTAGACTAAATTCATTATCTGACACTGGTTCAACATTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD178500             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATGGTCAACAGAATATTGCAATGCTTTTGAGTAGACTAAATTCATTATCTGACACTGGTTCAACATTTTGGAATGATTTAAATTGTTCCGAGGATGAGTTAAATGTTCAGCGTCGAATTCTGATGTCTCAACTAATTGGAAGTAATTATGAGGCTACCATACTATTAAGATGTCAACTAGAATGTGAACTTAGTGTTCTGATGAGTTATCCATCACAATATTCCATGGTATCTCGTCGGTGTTATTGGCGTGAATTTATTTGTTATCTCCGACAATATGTTTCCAGTGTTTGCTTTACTTCAGGATCCAGCCGATATTCTGCTCGGGCTACTACCTCACATATGGCCCCACGAAGGTATTTTTCATACTGTTTTGGCATCGACATTTTGTTTGGCTTATATACGTGCTCTTATCAGTGTTACATTTAATCGTTCCACTTCATCAACATGTTTTAATTTAGTCAAACAGATCAATAGGACAAAATATTTATTGGGTAAAATTTCTGGTGTTCTCAGGAAGCATTTAGAGAATTTACTTAATTATTTAAGTGAATTAAACAC]


>consensus_9596#0 AGTTAGACAATAGTGAACCATTGTATGAATGTGTTATTTGTCAAATATCTGGTCGACCAT CAGTAGATGACATGGTTCTTTTAGACATGATATGTGAATCGAATCTTATGCTTCAGCTTC GTGAAACTGCTGTGATACCAACATTATATGGACGAGATCTTAGCCACTCATCAGGTTATC CTCCAGTTCTTTCTGAGACTGACGACTTATCGTGGTTGTCACCGGAACGACCACCTGTTA GTGGCCCATTATTTCAAAATTCTCCGTTGAGTAATTCGACAAACTCTGATAATCCTTCTC CAGTTAGTGGTAGTAGTCAAGCTCCAGCAGGAATTGTTGGTCTACCGATTCATCCAATTA CAACAAATTCTTCTATAAAATCACATACAGAACGTTCATCATCACCCAAACCTGAAACAC TTTCTGGTAATAAACAATCAAAGCATCACTCATGCTATACTGAACATCGTCAATGGTGGA GTAATGCGATACCTTCTCTGATATCTAAAACATTACCACTACTACATTCTGGAATTTTAT TACAAACTTGCGGTCATGTTGTTCATCGAGAATGTTTTCAGCGTTATCGTACACATGGAG GTAATCGTTCTGCTGCAACACGTCATCGTTCTTGGATTGTATGCCCTTTGTGTAGAAGAG ATATTCATCATCTTTTACCATTAGTTCCATTGCCTAAATCTGGTACATTTGGCAATAAAC AACAACTATTCCCTTCTGTAGAATATGGTCAACAGAATATTGCAATGCTTTTGAGTAGAC TAAATTCATTATCTGACACTGGTTCAACATTTTGGAATGATTTAAATTGTTCCGAGGATG AGTTAAATGTTCAGCGTCGAATTCTGATGTCTCAACTAATTGGAAGTAATTATGAGGCTA CCATACTATTAAGATGTCAACTAGAATGTGAACTTAGTGTTCTGATGAGTTATCCATCAC AATATTCCATGGTATCTCGTCGGTGTTATTGGCGTGAATTTATTTGTTATCTCCGACAAT ATGTTTCCAGTGTTTGCTTTACTTCAGGATCCAGCCGATATTCTGCTCGGGCTACTACCT CACATATGGCCCCACGAAGGTATTTTTCATACTGTTTTGGCATCGACATTTTGTTTGGCT TATATACGTGCTCTTATCAGTGTTACATTTAATCGTTCCACTTCATCAACATGTTTTAAT TTAGTCAAACAGATCAATAGGACAAAATATTTATTGGGTAAAATTTCTGGTGTTCTCAGG AAGCATTTAGAGAATTTACTTAATTATTTAAGTGAATTAAACAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)