These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9642#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1354 fasta sequence [TGTAATCAATATGGAGATTAAAATGAGTTATCCATTTAGTAGTAATGACTGAAACTACTAGAAAAATTGTTGTTGTTGGCGATGGAATGGTTGGGAAAACTGCTTTATTGTCAGCGTTTGTAAATGGTGCATTTCAGGACTGCTATATTCCAACAGTATTTGAAACATCAGCTAAAGAAGTTGATCTGCCAGATGGTCGTCATTTAACTTTGGGTTTGTGGGATACAGGGGGTCAAGAGGAATTCGATCAAATTCGGCAACTTGCATATCCTGGTGCAAGTTTAATTCTGCTTTGTTACGCAGTTGATTGTCCAACTAGTTTGGAAAATATTGTGCACACATGGCTAGATGAAGTAAAATGCTACTGTCCACAAATACCACTCATACTGGTC-GGATGT-AAAGCTGATAAACGTGTGGTCATTGCACCAGGAAAGTCTAATAACTTAACTATGAATGCATCGCAG-ACAGC-TTTGATCGATCCAAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATTCTATAACATACTTCCAA-TCCATAGAAAGAAATCAATTTCAAATGGTGCAGTAACTGGGACCTCACTTATTACACGTCGAAGCTCTGGACTGAAACGACGTATTTCCAGTTCAAACTATTTTTGTTTTTTAAGAAGACGGTGAGTTATTTCATGCAAGGTATGATGAGTAAATAACAAAATCGAGGAATAATATGCTATTGAATGTTCCGAAGTCTTTCCCTCTTCTTATTTCAAAATATGGATACATAATAATGCTTTCATAAAGCTCAAAATAATTCCGTTTTTCTTAAATGAACAGCCAATGTCTTTCATATGTTGATATTATAGGAGATTATATGCATATTACAAATAATGATATCGATAATGATAACATACTTTCATTTGAGTCAATCTATTGATTGTTGGAACTATATTGTGTAAATACAAGAGTTCAATGTACATCAGTATGTCAGAGGAACTGTGATCATGATGATTCAATTCCATATGTGCACTCTATTATGAATACTACATTTGTTGACCAAATATGCACAAAAATAATGTATAAATGGATGGTATTCTTTTAATTGTATGAAATGTTGATAATAATAATATTCAAATTGATGGATTTAGGTATGCTTAAACCTATTCATGCTCCACTAATAACTATGTACCCGTGAAATTAATAATTCTGAACTTATGAAATGAAACTGATTACTCTACCATAAATAAATAAATTTTTAACTG] [+] EMBL AY158215 [TGTAATCAATATGGAGATTAAAATGAGTTATCCATTTAGTAGTAATGACTGAAACTACTAGAAAAATTGTTGTTGTTGGCGATGGAATGGTTGGGAAAACTGCTTTATTGTCAGCGTTTGTAAATGGTGCATTTCAGGACTGCTATATTCCAACAGTATTTGAAACATCAGCTAAAGAAGTTGATCTGCCAGATGGTCGTCATTTAACTTTGGGTTTGTGGGATACAGGGGGTCAAGAGGAATTCGATCAAATTCGGCAACTTGCATATCCTGGTGCAAGTTTAATTCTGCTTTGTTACGCAGTTGATTGTCCAACTAGTTTGGAAAATATTGTGCACACATGGCTAGATGAAGTAAAATGCTACTGTCCACAAATACCACTCATACTGGTC GGATGT AAAGCTGATAAACGTGTGGTCATTGCACCAGGAAAGTCTAATAACTTAACTATGAATGCATCGCAG ACAGC TTTGATCGATCCAAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATTCTATAACATACTTCCAA TCCATAGAAAGAAATCAATTTCAAATGGTGCAGTAACTGGGACCTCACTTATTACACGTCGAAGCTCTGGACTGAAACGACGTATTTCCAGTTCAAACTATTTTTGTTTTTTAAGAAGACGGTGAGTTATTTCATGCAAGGTATGATGAGTAAATAACAAAATCGAGGAATAATATGCTATTGAATGTTCCGAAGTCTTTCCCTCTTCTTATTTCAAAATATGGATACATAATAATGCTTTCATAAAGCTCAAAATAATTCCGTTTTTCTTAAATGAACAGCCAATGTCTTTCATATGTTGATATTATAGGAGATTATATGCATATTACAAATAATGATATCGATAATGATAACATACTTTCATTTGAGTCAATCTATTGATTGTTGGAACTATATTGTGTAAATACAAGAGTTCAATGTACATCAGCATGTCAGAGGAACTGTGATCATGATGATTCAATTCCATATGTGCACTCTATTATGAATACTACATTTGTTGACCAAATATGCACAAAAATAATGTATAAATGGATGGTATTCTTTTAATTGTATGAAATGTTGATAATAATAATATTCAAATTGATGGATTTAGGTATGCTTAAACCTATTCATGCTCCACTAATAACTATGTACCCGTGAAATTAATAATTCTGAACTTATGAAATGAAACTGATTACTCTACCATAAATAAATAAATTTTTAACTG] [+] EMBL AW017008 [TGTAATCAATATGGAGATTAAAATGAGTTATCCATTTAGTAGTAATGACTGAAACTACTAGAAAAATTGTTGTTGTTGGCGATGGAATGGTTGGGAAAACTGCTTTATTGTCAGCGTTTGTAAATGGTGCATTTCAGGACTGCTATATTCCAACAGTATTTGAAACATCAGCTAAAGAAGTTGATCTGCCAGATGGTCGTCATTTAACTTTGGGTTTGTGGGATACAGGGGGTCAAGAGGAATTCGATCAAATTCGGCAACTTGCATATCCTGGTGCAAGTTTAATTCTGCTTTGTTACGCAGTTGATTGTCCAACTAGTTTGGAAAATATTGTGCACACATGGCTAGATGAAGTAAAATGCTACTGTCCACAA ] [+] EMBL AW017183 [ CCAACAGTATTTGAAACATCAGCTAAAGAAGTTGATCTGCCAGATGGTCGTCATTTAACTTTGGGTTTGTGGGATACAGGGGGTCAAGAGGAATTCGATCAAATTCGGCAACTTGCATATCCTGGTGCAAGTTTAATTCTGCTTTGTTACGCAGTTGATTGTCCAACTAGTTTGGAAAATATTGTGCACACATGGCTAGATGAAGTAAAATGCTACTGTCCACAAATACCACTCATACTGGTC GGATGT AAAGCTGATAAACGTGTGGTCATTGCACCAGGAAAGTCTAATAACTTAACTATGAATGCATCGCAG ACAGC TTTGATCGATCCAAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATTCTATAACATACTTCCAA TCCATAGAAAGAAATCAATTTCAAATGGTGCAGTAACTGGGACCTCACTTATTACACGTCGAAGCTCTGGACTGAAACGACGTATTTCCAGTTCAAACTATTTTTGGTTTTTAAGAAAACGGTGAGTTATTTCATGCAAGGTATGATGAGTAAATAACAAAATCGAGGAATAATATGCTATTGAATGTTTCGAAGTCTTTCCCTCTTC ] [+] EMBL AI067299 [ CAACTTGCATATCCTGGTGCAAGTTTAATTCTGCTTTGTTACGCAGTTGATTGTCCAACTAGTTTGGAAAATATTGTGCACACATGGCTAGATGAAGTAAAATGCTACTGTCCACAAATACCACTCATACTGGTC GGATGT AAAGCTGATAAACGTGTGGTCATTGCACCAGGAAAGTCTAATAACTTAACTATGAATGCATCGCAG ACAGC TTTGATCGATCCAAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATT ] [-] EMBL CD070825 [ CTGTCCACAAATACCACTCATACT GTCGGGATGT AAAGCTGATAAACGTGTGGTCATTGCACCAGGAAAGTCTAATAACTTAACTATGAATGCATCGCAG ACAGC TCTGATCGATCCGAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATTCTATAACATACTTCCAA TCCATAGAAAGAAATCAATTTCAAATG ] [+] EMBL SM58082 [ CTCATACTGGTC GGATGT 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TCGATCCGAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATTCTATAACATACTTCCAA TCCATAGAAAGAAATCAATTTCAAATGGTGCAGTAACTGGGACCTCACTTATTACACGTCGAAGCTCTGGACTGAAACGACGTATTTCCAGTTCAAACTATTTTTGTTTTTTAAGAAGACGGTGAGTTATTGCATGCAAGGTATGATGAGTAAATAACAAAATCGAGGAATAATATGCTATTGAATGTTCCGAAGTCTTTCCCTCTTCTTATTTCAAAATATGGATACATAATAATGCTTTCATAAAGCTCAAAATAATTCCGTTTTTCTTAAATGAACAGCCAATGTCTTTCATATGTTGATATTATAGGAGATTATATGCATATTACAAATAATGATATCGATAATGATAACATACTTTCATTTGAGTCAATCTATTGATTGTTGGAACTATATTGTGTANATACAAGAGTTCAATGTACATCAGTATGTC ] [-] EMBL CD073109 [ AAGGTATGATGAGTAAATAACAAAATCGAGGAATAATATGCTATTGAATGTTCCGAAGTCTTTCCCTCTTCTTATTTCAAAATATGGATACATAATAATGCTTTCATAAAGCTCAAAATAATTCCGTTTTTCTTAAATGAACAGCCAATGTCTTTCATATGTTGATATTATAGGAGATTATATGCATATTACAAATAATGATATCGATAATGATAACATACTTTCATTTGAGTCAATCTATTGATTGTTGGAACTATATTGTGTAAATACAAGAGTTCAATGTACATCAGTATGTCAGAGGAACTGTGATCATGATGATTCAATTCCATATGTGCACTCTATTATGAATACTACATTTGTTGACCAAATATGCACAAAAATAATGTATAAATGGATGGTATTCTTTTAATTGTATGAAATGTTGATAATAATAATATTCAAATTGATGGATTTAGGTATGCTTAAACCTATTCATGCTCCACTAATAACTATGTACCCGTGAAATTAATAATTCTGAACTTATGAAATGAAACTGATTACTCTACCATAAATAAATAAATTTT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||