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Schistosoma mansoni
cluster # 9642 cluster # 9642       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9642#0 length = 1354 sequences # 10  

consensusID : consensus_9642#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1354
fasta sequence
                              [TGTAATCAATATGGAGATTAAAATGAGTTATCCATTTAGTAGTAATGACTGAAACTACTAGAAAAATTGTTGTTGTTGGCGATGGAATGGTTGGGAAAACTGCTTTATTGTCAGCGTTTGTAAATGGTGCATTTCAGGACTGCTATATTCCAACAGTATTTGAAACATCAGCTAAAGAAGTTGATCTGCCAGATGGTCGTCATTTAACTTTGGGTTTGTGGGATACAGGGGGTCAAGAGGAATTCGATCAAATTCGGCAACTTGCATATCCTGGTGCAAGTTTAATTCTGCTTTGTTACGCAGTTGATTGTCCAACTAGTTTGGAAAATATTGTGCACACATGGCTAGATGAAGTAAAATGCTACTGTCCACAAATACCACTCATACTGGTC-GGATGT-AAAGCTGATAAACGTGTGGTCATTGCACCAGGAAAGTCTAATAACTTAACTATGAATGCATCGCAG-ACAGC-TTTGATCGATCCAAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATTCTATAACATACTTCCAA-TCCATAGAAAGAAATCAATTTCAAATGGTGCAGTAACTGGGACCTCACTTATTACACGTCGAAGCTCTGGACTGAAACGACGTATTTCCAGTTCAAACTATTTTTGTTTTTTAAGAAGACGGTGAGTTATTTCATGCAAGGTATGATGAGTAAATAACAAAATCGAGGAATAATATGCTATTGAATGTTCCGAAGTCTTTCCCTCTTCTTATTTCAAAATATGGATACATAATAATGCTTTCATAAAGCTCAAAATAATTCCGTTTTTCTTAAATGAACAGCCAATGTCTTTCATATGTTGATATTATAGGAGATTATATGCATATTACAAATAATGATATCGATAATGATAACATACTTTCATTTGAGTCAATCTATTGATTGTTGGAACTATATTGTGTAAATACAAGAGTTCAATGTACATCAGTATGTCAGAGGAACTGTGATCATGATGATTCAATTCCATATGTGCACTCTATTATGAATACTACATTTGTTGACCAAATATGCACAAAAATAATGTATAAATGGATGGTATTCTTTTAATTGTATGAAATGTTGATAATAATAATATTCAAATTGATGGATTTAGGTATGCTTAAACCTATTCATGCTCCACTAATAACTATGTACCCGTGAAATTAATAATTCTGAACTTATGAAATGAAACTGATTACTCTACCATAAATAAATAAATTTTTAACTG]

[+] EMBL AY158215             [TGTAATCAATATGGAGATTAAAATGAGTTATCCATTTAGTAGTAATGACTGAAACTACTAGAAAAATTGTTGTTGTTGGCGATGGAATGGTTGGGAAAACTGCTTTATTGTCAGCGTTTGTAAATGGTGCATTTCAGGACTGCTATATTCCAACAGTATTTGAAACATCAGCTAAAGAAGTTGATCTGCCAGATGGTCGTCATTTAACTTTGGGTTTGTGGGATACAGGGGGTCAAGAGGAATTCGATCAAATTCGGCAACTTGCATATCCTGGTGCAAGTTTAATTCTGCTTTGTTACGCAGTTGATTGTCCAACTAGTTTGGAAAATATTGTGCACACATGGCTAGATGAAGTAAAATGCTACTGTCCACAAATACCACTCATACTGGTC GGATGT AAAGCTGATAAACGTGTGGTCATTGCACCAGGAAAGTCTAATAACTTAACTATGAATGCATCGCAG ACAGC TTTGATCGATCCAAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATTCTATAACATACTTCCAA TCCATAGAAAGAAATCAATTTCAAATGGTGCAGTAACTGGGACCTCACTTATTACACGTCGAAGCTCTGGACTGAAACGACGTATTTCCAGTTCAAACTATTTTTGTTTTTTAAGAAGACGGTGAGTTATTTCATGCAAGGTATGATGAGTAAATAACAAAATCGAGGAATAATATGCTATTGAATGTTCCGAAGTCTTTCCCTCTTCTTATTTCAAAATATGGATACATAATAATGCTTTCATAAAGCTCAAAATAATTCCGTTTTTCTTAAATGAACAGCCAATGTCTTTCATATGTTGATATTATAGGAGATTATATGCATATTACAAATAATGATATCGATAATGATAACATACTTTCATTTGAGTCAATCTATTGATTGTTGGAACTATATTGTGTAAATACAAGAGTTCAATGTACATCAGCATGTCAGAGGAACTGTGATCATGATGATTCAATTCCATATGTGCACTCTATTATGAATACTACATTTGTTGACCAAATATGCACAAAAATAATGTATAAATGGATGGTATTCTTTTAATTGTATGAAATGTTGATAATAATAATATTCAAATTGATGGATTTAGGTATGCTTAAACCTATTCATGCTCCACTAATAACTATGTACCCGTGAAATTAATAATTCTGAACTTATGAAATGAAACTGATTACTCTACCATAAATAAATAAATTTTTAACTG]
[+] EMBL AW017008             [TGTAATCAATATGGAGATTAAAATGAGTTATCCATTTAGTAGTAATGACTGAAACTACTAGAAAAATTGTTGTTGTTGGCGATGGAATGGTTGGGAAAACTGCTTTATTGTCAGCGTTTGTAAATGGTGCATTTCAGGACTGCTATATTCCAACAGTATTTGAAACATCAGCTAAAGAAGTTGATCTGCCAGATGGTCGTCATTTAACTTTGGGTTTGTGGGATACAGGGGGTCAAGAGGAATTCGATCAAATTCGGCAACTTGCATATCCTGGTGCAAGTTTAATTCTGCTTTGTTACGCAGTTGATTGTCCAACTAGTTTGGAAAATATTGTGCACACATGGCTAGATGAAGTAAAATGCTACTGTCCACAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL AW017183             [                                                                                                                                                     CCAACAGTATTTGAAACATCAGCTAAAGAAGTTGATCTGCCAGATGGTCGTCATTTAACTTTGGGTTTGTGGGATACAGGGGGTCAAGAGGAATTCGATCAAATTCGGCAACTTGCATATCCTGGTGCAAGTTTAATTCTGCTTTGTTACGCAGTTGATTGTCCAACTAGTTTGGAAAATATTGTGCACACATGGCTAGATGAAGTAAAATGCTACTGTCCACAAATACCACTCATACTGGTC GGATGT AAAGCTGATAAACGTGTGGTCATTGCACCAGGAAAGTCTAATAACTTAACTATGAATGCATCGCAG ACAGC TTTGATCGATCCAAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATTCTATAACATACTTCCAA TCCATAGAAAGAAATCAATTTCAAATGGTGCAGTAACTGGGACCTCACTTATTACACGTCGAAGCTCTGGACTGAAACGACGTATTTCCAGTTCAAACTATTTTTGGTTTTTAAGAAAACGGTGAGTTATTTCATGCAAGGTATGATGAGTAAATAACAAAATCGAGGAATAATATGCTATTGAATGTTTCGAAGTCTTTCCCTCTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AI067299             [                                                                                                                                                                                                                                                                 CAACTTGCATATCCTGGTGCAAGTTTAATTCTGCTTTGTTACGCAGTTGATTGTCCAACTAGTTTGGAAAATATTGTGCACACATGGCTAGATGAAGTAAAATGCTACTGTCCACAAATACCACTCATACTGGTC GGATGT AAAGCTGATAAACGTGTGGTCATTGCACCAGGAAAGTCTAATAACTTAACTATGAATGCATCGCAG ACAGC TTTGATCGATCCAAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD070825             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTGTCCACAAATACCACTCATACT GTCGGGATGT AAAGCTGATAAACGTGTGGTCATTGCACCAGGAAAGTCTAATAACTTAACTATGAATGCATCGCAG ACAGC TCTGATCGATCCGAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATTCTATAACATACTTCCAA TCCATAGAAAGAAATCAATTTCAAATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL SM58082              [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTCATACTGGTC GGATGT AAAGCTGATAAACGTGTGGTCATTGCACCAGGAAAGTCTAATAACTTAACTATGAATGCATCGCAGAACAGCTTTTGATCGATCCAAATGATGTAGAAAAGGTTGGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAGAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATTCTATAACATACTTCCAACTCCATAGAAAG AATCATTTTC AATGGTGCAGTAACTGGGACCTCACTTATTACACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD070781             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tGTC GGATGTAAAAGCTGATAAACGTGTGGTCATTGCACCAGGANAGTCTAATAACTTANCTATGAATGCATCGCAG ACAGC TTTGATCGATCCGAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATTCTATAACATACTTCCAA TCCATAGAAAGAAATCAATTTCAAATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD070864             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CAG ACAGC TTTGATCGTTCCGAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATACTATTACATACTTCCAA T CGGAAAAAG AATCAATTTCAAATGGTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD078645             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCGATCCGAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATTCTATAACATACTTCCAA TCCATAGAAAGAAATCAATTTCAAATGGTGCAGTAACTGGGACCTCACTTATTACACGTCGAAGCTCTGGACTGAAACGACGTATTTCCAGTTCAAACTATTTTTGTTTTTTAAGAAGACGGTGAGTTATTGCATGCAAGGTATGATGAGTAAATAACAAAATCGAGGAATAATATGCTATTGAATGTTCCGAAGTCTTTCCCTCTTCTTATTTCAAAATATGGATACATAATAATGCTTTCATAAAGCTCAAAATAATTCCGTTTTTCTTAAATGAACAGCCAATGTCTTTCATATGTTGATATTATAGGAGATTATATGCATATTACAAATAATGATATCGATAATGATAACATACTTTCATTTGAGTCAATCTATTGATTGTTGGAACTATATTGTGTANATACAAGAGTTCAATGTACATCAGTATGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD073109             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AAGGTATGATGAGTAAATAACAAAATCGAGGAATAATATGCTATTGAATGTTCCGAAGTCTTTCCCTCTTCTTATTTCAAAATATGGATACATAATAATGCTTTCATAAAGCTCAAAATAATTCCGTTTTTCTTAAATGAACAGCCAATGTCTTTCATATGTTGATATTATAGGAGATTATATGCATATTACAAATAATGATATCGATAATGATAACATACTTTCATTTGAGTCAATCTATTGATTGTTGGAACTATATTGTGTAAATACAAGAGTTCAATGTACATCAGTATGTCAGAGGAACTGTGATCATGATGATTCAATTCCATATGTGCACTCTATTATGAATACTACATTTGTTGACCAAATATGCACAAAAATAATGTATAAATGGATGGTATTCTTTTAATTGTATGAAATGTTGATAATAATAATATTCAAATTGATGGATTTAGGTATGCTTAAACCTATTCATGCTCCACTAATAACTATGTACCCGTGAAATTAATAATTCTGAACTTATGAAATGAAACTGATTACTCTACCATAAATAAATAAATTTT      ]


>consensus_9642#0 TGTAATCAATATGGAGATTAAAATGAGTTATCCATTTAGTAGTAATGACTGAAACTACTA GAAAAATTGTTGTTGTTGGCGATGGAATGGTTGGGAAAACTGCTTTATTGTCAGCGTTTG TAAATGGTGCATTTCAGGACTGCTATATTCCAACAGTATTTGAAACATCAGCTAAAGAAG TTGATCTGCCAGATGGTCGTCATTTAACTTTGGGTTTGTGGGATACAGGGGGTCAAGAGG AATTCGATCAAATTCGGCAACTTGCATATCCTGGTGCAAGTTTAATTCTGCTTTGTTACG CAGTTGATTGTCCAACTAGTTTGGAAAATATTGTGCACACATGGCTAGATGAAGTAAAAT GCTACTGTCCACAAATACCACTCATACTGGTCGGATGTAAAGCTGATAAACGTGTGGTCA TTGCACCAGGAAAGTCTAATAACTTAACTATGAATGCATCGCAGACAGCTTTGATCGATC CAAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTG CTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATG TAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATTCTATAACATACTTCCAATCCATAGAAAGA AATCAATTTCAAATGGTGCAGTAACTGGGACCTCACTTATTACACGTCGAAGCTCTGGAC TGAAACGACGTATTTCCAGTTCAAACTATTTTTGTTTTTTAAGAAGACGGTGAGTTATTT CATGCAAGGTATGATGAGTAAATAACAAAATCGAGGAATAATATGCTATTGAATGTTCCG AAGTCTTTCCCTCTTCTTATTTCAAAATATGGATACATAATAATGCTTTCATAAAGCTCA AAATAATTCCGTTTTTCTTAAATGAACAGCCAATGTCTTTCATATGTTGATATTATAGGA GATTATATGCATATTACAAATAATGATATCGATAATGATAACATACTTTCATTTGAGTCA ATCTATTGATTGTTGGAACTATATTGTGTAAATACAAGAGTTCAATGTACATCAGTATGT CAGAGGAACTGTGATCATGATGATTCAATTCCATATGTGCACTCTATTATGAATACTACA TTTGTTGACCAAATATGCACAAAAATAATGTATAAATGGATGGTATTCTTTTAATTGTAT GAAATGTTGATAATAATAATATTCAAATTGATGGATTTAGGTATGCTTAAACCTATTCAT GCTCCACTAATAACTATGTACCCGTGAAATTAATAATTCTGAACTTATGAAATGAAACTG ATTACTCTACCATAAATAAATAAATTTTTAACTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)