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Schistosoma mansoni
cluster # 9646 cluster # 9646       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9646#0 length = 986 sequences # 10  

consensusID : consensus_9646#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 986
fasta sequence
                              [AGTTTTTGCGCAACATGGGACTTGTTCGTCCTATTCGTATGATTCTTTGTTTTGTTTGTTTCTTGTTTCTCGTGAACTCTCAAAATGCACAGAAAGAACCCAGTTGCGGCCGTGCAAAAAGTTGTAGTGAATGCATGGGGATACGCCCTGCCTGTTCGTGGTGTAGTGCTGATGAATTTGATGATACGAAAGAAGGTCCAGGGTTTCGTTGTGCTCCATCTTCAGTCTTATTGGCCCGTGGATGTCCACAAAGTAGTATCGAGGATGTGGAGTCTGTGTTATTAGATCATGGAGTTCCTCTTGATCAAGCCAGTTTAACCGAAGATATACAACTTACTCCACGATCACAATCAGTAAAGGTCAGACCCGGAGGGACTATGATGGTCAATTTCACATTCCAGTCTATTTCGGATTACCCCGTTGACCTTTATTTCTTAACAGATCTCAGTTATACAATGATTGATGATTTGGAAACAGTTTCTCGTTTGACTAACGATATTGTATTAACTATGCGTAATGTAACAAAAAAGTTACAAATGGGATTCGGTGCCTTTGTAGACAAACCAGTGTTTCCCTTTGTTGTGCCAACTCCAGAATATCTTCGAAATCCATGTTTAAATGTTGGTACTAAAAATCTCCATTGCGATCCTCCATTCTTGTACAAACACATTTTGTCACTTACCGATAATTTTGAGGAGTTCAGAGAAAAAACCAAAGTAGCACGTCCTTCAGGTAATCTAGATAGTCCAGAGGGTGGTATGGACGCATTACTTCAGGTTGCCCGATGCAGTGAAGCTATTGGATGGCGTGCTGGTG-CCCGTAAAATCGTACTATTTGCTTCTGACGGTGGATTCCATTTGGCTGGTGATGGTCGAATCGCTGGATTAATACTGCCTCCTCCAACTACTTGTCAATTAACATATCAAGCTGATCGATTCAATTCTTCACTTAAGTACCTCGGCTGGCATAATTCTGATCAAACTGAT]

[+] EMBL CD178551             [AGTTTTTGCGCAACATGGGACTTGTTCGTCCTATTCGTATGATTCTTTGTTTTGTTTGTTTCTTGTTTCTCGTGAACTCTCAAAATGCACAGAAAGAACCCAGTTGCGGCCGTGCAAAAAGTTGTAGTGAATGCATGGGGATACGCCCTGCCTGTTCGTGGTGTAGTGCTGATGAATTTGATGATACGAAAGAAGGTCCAGGGTTTCGTTGTGCTCCATCTTCAGTCTTATTGGCCCGTGGATGTCCACAAAGTAGTATCGAGGATGTGGAGTCTGTGTTATTAGATCATGGAGTTCCTCTTGATCAAGCCAGTTTAACCGAAGATATACAACTTACTCCACGATCACAATCAGTAAAGGTCAGACCCGGAGGGACTATGATGGTCAATTTCACATTCCAGTCTATTTCGGATTACCCCGTTGACCTTTATTTCTTAACAGATCTCAGTTATACAATGATTGATGATTTGGAAACAGTTTCTCGTTTGACTAACGATATTGTATTAACTATGCGTAATGTAACAAAAAAGTTACAAATGGGATACGGTGCCTTTGTAGACAAACCAGTGTTTCCCTTTGTTGTGCCAACTTCAGAATATCTTCGAAATCCATGTTTAAATGTTGGTACTAAAAATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD120909             [   TTTTGCGCAACATGGGACTTGTTCGTCCTATTCGTATGATTCTTTGTTTTGTTTGTTTCTTGTTTCTCGTGAACTCTCAAAATGCACAGAAAGAACCCAGTTGCGGCCGTGCAAAAAGTTGTAGTGAATGCATGGGGATACGCCCTGCCTGTTCGTGGTGTAGTGCTGATGAATTTGATGATACGAAAGAAGGTCCAGGGTTTCGTTGTGCTCCATCTTCAGTCTTATTGGCCCGTGGATGTCCACAAAGTAGTATCGAGGATGTGGAGTCTGTGTTATTAGATCATGGAGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD186858             [                                                                                                                                  ATGCATGGGGATACGCCCTGCCTGTTCGTGGTGTAGTGCTGATGAATTTGATGATACGAAAGAAGGTCCAGGGTTTCGTTGTGCTCCATCTTCAGTCTTATTGGCCCGTGGATGTCCACAAAGTAGTATCGAGGATGTGGAGTCTGTGTTATTAGATCATGGAGTTCCTCTTGATCAAGCCAGTTTAACCGAAGATATACAACTTACTCCACGATCACAATCAGTAAAGGTCAGACCCGGAGGGACTATGATGGCCAATTTCACATTCCAGTCTATTTCGGATTACCCCGTTGACCTTTATTTCTTAACAGATCTCAGTTATACAATGATTGATGATTTGGAAACAGTTTCTCGTTTGACTAACGATATTGTATTAACTATGCGTAATGTAACGAAAAAGTTACAAATGGGATTCGGTGCCTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD164417             [                                                                                                                                                            CGTGG GCACTGCTGATGAATTTGATGATACGAAAGAAGGTCCAGGGTTTCGTTGTGCTCCATCTTCAGTCTTATTGGCCCGTGGATGTCCACAAAGTAGTATCGAGGATGTGGAGTCTGTGTTATTAGATCATGGAGTTCCTCTTGATCAAGCCAGTTTAACCGAAGATATACAACTTACTCCACGATCACAATCAGTAAAGGTCAGACCCGGAGGGACTATGATGGTCAATTTCACATTCCAGTCTATTTCGGATTACCCCGTTGACCTTTATTTCTTAACAGATCTCAGTTATACAATGATTGATGATTTGGAAACAGTTTCTCGTTTGACTAACGATATTGTATTAACTATGCGTAATGTAACAAAAAAGTTACAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD164415             [                                                                                                                                                                               ATTTGATGGTACGAAAGAAGGTCCAGGGTTTCGTTGTGCTCCATCTTCAGTCTTATTGGCCCGTGGATGTCCACAAAGTAGTATCGAGGATGTGGAGTCTGTGTTATTAGATCATGGAGTTCCTCTTGATCAAGCCAGTTTAACCGAAGATATACAACTTACTCCACGATCACAATCAGTAAAGGTCAGACCCGGAGGGACTATGATGGTCAATTTCACATTCCAGTCTATTTCGGATTACCCCGTTGACCTTTATTTCTTAACAGATCTCAGTTATACAATGTTTGATGATTTGGAAACAGTTTCTCGTTTGACTAACGATATTGTATTAACTATGCGTAATGTAACAAAAAAGTTACAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD180983             [                                                                                                                                                                                                                                                 ATGTCCACAAAGTAGTATCGAGGATGTGGAGTCTGTGTTATTAGATCATGGAGTTCCTCTTGATCAAGCCAGTTTAACCGAAGATATACAACTTACTCCACGATCACAATCAGTAAAGGTCAGACCCGGAGGGACTATGATGGTCAATTTCACATTCCAGTCTATTTCGGATTACCCCGTTGACCTTTATTTCTTAACAGATCTCAGTTATACAATGATTGATGATTTGGAAACAGTTTCTCGTTTGACTAACGATATTGTATTAACTATGCGTAATGTAACAAAAAAGTTACAAATGGGATTCGGTGCCTTTGTAGACAAACCAGTGTTTCCCTTTGTTGTGCCAACTCCAGAATATCTTCGAAATCCATGTTTAAATGTTGGTACTACAAATCTCCATTGCGATCCTCCATTCTTGTACAAACACca                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD146541             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATACAACTTACTCCACGATCACAATCAGTAAAGGTCAGACCCGGAGGGACTATGATGGTCAATTTCACATTCCAGTCTATTTCGGATTACCCCGTTGACCTTTATTTCTTAACAGATCTCAGTTATACAATGATTGATGATTTGGAAACAGTTTCTCGTTTGACTAACGATATTGTATTAACTATGCGTAATGTAACAAAAAAGTTACAAATGGGATTCGGTGCCTTTGTAGACAAACCAGTGTTTCCCTTTGTTGTGCCAACTCCAGAATATCTTCGAAATCCATGTTTAAATGTTGGTACTAAAAATCTCCATTGCGATCCTCCATTCTTGTACAAACACGTTTTGTCACTTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD182584             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATCCATGTTTAAATGTTGGTACTAAAAATCTCCATTGCGATCCTCCATTCTTGTACAAACACATTTTGTCACTTACCGATAATTTTGAGGAGTTCAGAGAAAAAACCAAAGTAGCACGTCCTTCAGGTAATCTAGATAGTCCAGAGGGTGGTATGGACGCACTACTTCAGGTTGCCCGATGCAGTGAAGCTATTGGATGGCGTGCTGGTG CCCGTAAAATCGTACTATTTGCTTCTGACGGTGGATTCCATTTGGCTGGTGATGGTCGAATCGCTGGAT                                                                                                     ]
[-] EMBL CD163641             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GCGATCCTCCATTCTTGTACAAACACATTTTGTCACTTACCGATAATTTTGAGGAGTTCAGAGAAAAAACCAAAGTAGCACGTCCTTCAGGTAATCTAGATAGTCCAGAGGGTGGTATGGACGCATTACTTCAGGTTGCCCGATGCAGTGAAGCTATTGGATGGCGTGCTGGTG CCCGTAAAATCGTACTATTTGCTTCTGACGGTGGATTCCATTTGGCTGGTGATGGTCGAATCGCTGGATTAATACTGCCTCCTCCAACTACTTGTCAATTAACATATCAAGCTGATCGATTCAATTCTTCACTTAAGTACCTCGGCTGGCATAATTCTGATCAAACTGAT]
[+] EMBL CD200334             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AACCAAAGTAGCACGTCCTTCAGGTAATCTAGATAGTCCAGAGNGTGGTATGGACGCATTACTTCAGGTTGCCCGATGCAGTGAAGCTATTGGATGGCGTGCTGGTGCCCCGT AAATCGTACTATTT                                                                                                                                                      ]


>consensus_9646#0 AGTTTTTGCGCAACATGGGACTTGTTCGTCCTATTCGTATGATTCTTTGTTTTGTTTGTT TCTTGTTTCTCGTGAACTCTCAAAATGCACAGAAAGAACCCAGTTGCGGCCGTGCAAAAA GTTGTAGTGAATGCATGGGGATACGCCCTGCCTGTTCGTGGTGTAGTGCTGATGAATTTG ATGATACGAAAGAAGGTCCAGGGTTTCGTTGTGCTCCATCTTCAGTCTTATTGGCCCGTG GATGTCCACAAAGTAGTATCGAGGATGTGGAGTCTGTGTTATTAGATCATGGAGTTCCTC TTGATCAAGCCAGTTTAACCGAAGATATACAACTTACTCCACGATCACAATCAGTAAAGG TCAGACCCGGAGGGACTATGATGGTCAATTTCACATTCCAGTCTATTTCGGATTACCCCG TTGACCTTTATTTCTTAACAGATCTCAGTTATACAATGATTGATGATTTGGAAACAGTTT CTCGTTTGACTAACGATATTGTATTAACTATGCGTAATGTAACAAAAAAGTTACAAATGG GATTCGGTGCCTTTGTAGACAAACCAGTGTTTCCCTTTGTTGTGCCAACTCCAGAATATC TTCGAAATCCATGTTTAAATGTTGGTACTAAAAATCTCCATTGCGATCCTCCATTCTTGT ACAAACACATTTTGTCACTTACCGATAATTTTGAGGAGTTCAGAGAAAAAACCAAAGTAG CACGTCCTTCAGGTAATCTAGATAGTCCAGAGGGTGGTATGGACGCATTACTTCAGGTTG CCCGATGCAGTGAAGCTATTGGATGGCGTGCTGGTGCCCGTAAAATCGTACTATTTGCTT CTGACGGTGGATTCCATTTGGCTGGTGATGGTCGAATCGCTGGATTAATACTGCCTCCTC CAACTACTTGTCAATTAACATATCAAGCTGATCGATTCAATTCTTCACTTAAGTACCTCG GCTGGCATAATTCTGATCAAACTGAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)