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Schistosoma mansoni
cluster # 9692 cluster # 9692       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9692#0 length = 776 sequences # 11  

consensusID : consensus_9692#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 776
fasta sequence
                              [ACTAACTAGTTGCGGAGGATCGACCAATGTTAATCGGCCAAGACATTCTGAGACTAGATTTCGTGTACCTTCTTCCGATAAACCAGAACATGCTAATAAAAGGGACCACATTGAATCTAGATGATGTTTCAAAGATTGATTAGGATCCAGACCAGCAAGATTAACAAGAACCTCTCTAAGAGCTTGAATTAAATAATATAATTGATGTTGACTTGTGTTATTTTTACTACCTATGCCAGCACCGCCACTGCCACTACTGCTGCTGCTAGTAAGAGATCCTGAGGTGTTTGTCAGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG-AAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGATGTAGAAGGATCCTTGACAGATATTAACAACTGATCAACCACATTGTTTACACTACTCAGTAAACTGTCGGCATGAGGTGATAATAATGACGGTGAATTCGATGAAGTCATTGGTAGTTCAGCTAATAGAGCAGCTATACATTGAGCTAAACTAGGCA]

[+] EMBL CD153338             [ACTAACTAGTTGCGGAGGATCGACCAATGTTAATCGGCCAAGACATTCTGAGACTAGATTTCGTGTACCTTCTTCCGATAAACCAGAACATGCTAATAAAAGGGACCACATTGAATCTAGATGATGTTTCAAAGATTGATTAGGATCCAGACCAGCAAGATTAACAAGAACCTCTCTAAGAGCTTGAATTAAATAATATAATTGATGTTGACTTGTGTTATTTTTACTACCTATGCCAGCACCGCCACTGCCACTACTGCTGCTGCTAGTAAGAGATCCTGAGGTGTTTGTCAGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG AAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGncacagcga                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD069744             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CAGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG AAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGAT                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD069748             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CAGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG AAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGAT                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD069719             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CAGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG AAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGTGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGAT                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD069740             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CAGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG AGATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGAT                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD069785             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CAGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG AAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGAGCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGAT                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD069751             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTGAAAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGATG                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD069734             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG AAACGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGATG                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD069752             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG AAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGATG                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD069743             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGTTGCATATGTTGTTTTACAACTTGTG AAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGATG                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD148158             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGACGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCGCCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGATGTAGAAGGATCCTTGACAGATATTAACAACTGATCAACCACATTGTTTACACTACTCAGTAAACTGTCGGCATGAGGTGATAATAATGACGGTGAATTCGATGAAGTCATTGGTAGTTCAGCTAATAGAGCAGCTATACATTGAGCTAAACTAGGCA]


>consensus_9692#0 ACTAACTAGTTGCGGAGGATCGACCAATGTTAATCGGCCAAGACATTCTGAGACTAGATT TCGTGTACCTTCTTCCGATAAACCAGAACATGCTAATAAAAGGGACCACATTGAATCTAG ATGATGTTTCAAAGATTGATTAGGATCCAGACCAGCAAGATTAACAAGAACCTCTCTAAG AGCTTGAATTAAATAATATAATTGATGTTGACTTGTGTTATTTTTACTACCTATGCCAGC ACCGCCACTGCCACTACTGCTGCTGCTAGTAAGAGATCCTGAGGTGTTTGTCAGTTGCAT ATGTTGTTTTACAGCTTGTGAAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTT ACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCAT GAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTG CTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAG ATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAG ATATAATTGTGTTGGAGATGTAGAAGGATCCTTGACAGATATTAACAACTGATCAACCAC ATTGTTTACACTACTCAGTAAACTGTCGGCATGAGGTGATAATAATGACGGTGAATTCGA TGAAGTCATTGGTAGTTCAGCTAATAGAGCAGCTATACATTGAGCTAAACTAGGCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)