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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9746#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 1100 fasta sequence
[GACATAGAGTCACGTTATTTTGGTATCTATAAACATTATTAAAAAAATTTGAATCATCCTCAAATACTTTACATTTTATTGAGATAAATTATAATCTATATATAACACAATTTATTGATTTATTGAATTACATAACATAGCAACAACGAAGTTGTGCCTTATCGATCTCTATAGCTCCCAATGCATCTAATTTAAAAACAAAAACAAACAAACAAAAACAAGTTGTAATATTCAACAATATTATTGGATAGAAATTGGATCCTCTTGTTACCATTATCAATTAATTTGTAAATAAATAAATATAATTGATAAATTGAATCCTGAAAGTCTATTAACAAATTCCTGAAAGATTAATTACAATTGATAAAGTCGATACCTTACCCTTGCTGTTGTCATCGTCACTGTCACTGTCATTGTTGCCGTATTCTTCTTCCAGTGTTGACAGTTTCCTAGTGAATAATCTCTTTTTCACGTTTATTCGTCATTCATTTTGTTTACTGGTTGGAAATTATTTATTAAAACAAGATCAAGAAGAATTAACCGGATCAATCAATTTTATACGTGTGCATGCGTTCTTGTGTAAATAAATAAATAAATAAACATTCACGTAATTGATTGGCTGTGTGCACACACATATACATACTTGTTTACCACTCAGTTAATTCTATCATGC-TTCATAGTGTTGGTCTTAGTGATCCAACTGGAGCAGCGACAGTGGTTTATCCACATTTTACACCATTCCCACCACCCAATTCATCAACATTAAATTCCAATGAAAATTCTAGTCAGTTTCCAATTAATACAACTAATAACAGTAATGGTAATAATAATACTAACAATAATGGTATGTACACATCGAGTACAGCTGCGGCAGCAGCAGCAGCGGTTGCTGCATTGACTGCCGCTGCAGCTGCTTCAGCTGGTCTACCGTCGAATATTAAAGATTCCAGATGGTTAACACTTGAAGTATGCCGACAATATCAACGAAATCAATGTTCAAGAGATGAAAATGAATGTAAATTCGCTCATCCACCAACACATGTCGATGTACAAAGTGGACGTGTTATTTGCTGCTATGATTCAATCAAAGGTAAATGCCA]
[+] EMBL AI975067 [GACATAGAGTCACGTTATTTTGGTATCTATAAACATTATTAAAAAAATTTGAATCATCCTCAAATACTTTACATTTTATTGAGATAAATTATAATCTATATATAACACAATTTATTGATTTATTGAATTACATAACATAGCAACAACGAAGTTGTGCCTTATCGATCTCTATAGCTCCCAATGCATCTAATTTAAAAACAAAAACAAACAAACAAAAACAAGTTGTAATATTCAACAATATTATTGGATAGAAATTGGATCCTCTTGTTACCATTATCAATTAATTTGTAAATAAATAAATATAATTGATAAATTGAATCCTGAAAGTCTATTAACAAATTCCTGAAAGATTAATTACAATTGATAAAGTCGATACCTTACCCTTGCTGTTGTCATCGTCACTGTCACTGTCATTGTTGCCGTATTCTTCTTCCAGTGTTGACAGTTTCCTAGTGAATAATCTCTTTTTCACGTTTATTCGTCATTCATTNTGTTTACTGGTTGGAAATTATTTATTAAAACAAGATCAAGAAGAATTAACCGGATCAATCAA TTTATACGTGTGCATGCGTTCTTGTGTAAAT ]
[-] EMBL CD199693 [ CACTGTCACTGTCATTGTTGCCGTATTCTTCTTCCAGTGTTGACAGTTTCCTAGTGAATAATCTCTTTTTCACGTTCATTCGTCATTCATTTTGTTTACTGGTTGGAAATTATTTATTAAAACAAGATCAAGAAGAATTAACCGGATCAATCAATTTTATACGTGTGCATGCGTTCTTGTGTAAATAAATAAATAAATAAACATTCACGTAATTGATTGGCTGTGTGCACACACATATACATACTTGTTTACCACTCAGTTAATTCTATCATGC TTCATAGTGTTGGTCTTAGTGATCCAACTGGAGCAGCGACAGTGGTTTATCCACATTTTACACCATTCCCACCACCCAATTCATCAACATTAAATTCCAATGAAAATTCTAGTCAGTTTCCAATTAATAC ]
[+] EMBL CD199649 [ CCGTATTCTTCTTCCAGTGTTGACAGTTTCCTAGTGAATAATCTCTTTTTCACGTTTATTCGTCATTCATTTTGTTTACTGGTTGGAAATTATTTATTAAAACAAGATCAAGAAGAATTAACCGGATCAATCAATTTTATACGTGTGCATGCGTTCTTGTGTAAATAAATAAATAAATAAACATTCACGTAATTGATTGGCTGTGTGCACACACATATACATACTTGTTTACCACTCAGTTAATTCTATCATGC TTCATAGTGTTGGTC ]
[+] EMBL CD199664 [ CCGTATTCTTCTTCCAGTGTTGACAGTTTCCTAGTGAATAATCTCTTTTTCACGTTTATTCGTCATTCATTTTGTTTATTGGTTGGAAATTATTTATTAAAACAAGATCAAGAAGAATTAACCGGATCAATCAATTTTATACGTGTGCATGCGTTCTTGTGTAAATAAATAAATAAATAAACATTCACGTAATTGATTGGCTGTGTGCACACACATATACATACTTGTTTACCACTCAGTTAATTCTATCATGC TTCATAGTGTTGGTCTTAGTGATCCAACTGGAGCAGCGACAGTGGTTTATCCACATTTTACACCATTCCCACCACCCAATTCATCAACATTAAATTCCAACGAAAATTCTAGTCAGTTTCCAATTAATA ]
[+] EMBL CD070541 [ CCTAGTGAATAATCTCTTTTTCACGTTTATTCGTCATTCATTTTGTTTACTGGTTGGAAATTATTTATTANAACAAGATCAAGAAGAATTAACCGGATCAATCAATTTTATACGTGTGCATGCGTTCTTGTGTAAATAAATAAATAAATAAACATTCACGTAATTGATTGGCTGTGTGCACACACATATACATACTTGTTTACCACTCAGNTAATTCTATCATGCTTTCATAGTGTTGGTCTTAGTGATCCAACTGGAGCAGCGACAGTGGTTTtat ]
[+] EMBL CD199648 [ TATTTATTAAAACAAGATCAAGAAGAATTAACCGGATCAATCAATTTTATACGTGTGCATGCGTTCTTGTGTAAATAAATAAATAAATAAACATTCACGTAATTGATTGGCTGTGTGCACACACATATACATACTTGTTTACCACTCAGTTAATTCTATCATGC TTCATAGTGTTGGTCTTAGTGATCCAACTGGAGCAGCGACAGTGGTTTATCCACATTTTACACCATTCCCACCACCCAATTCATCAACATTAAATTCCAATGAAAATTCTAGTCAGTTTCCAATTAATA ]
[+] EMBL AI067790 [ TTCATAGTGTTGGTCTTAGTGATCCAACTGGAGCAGCGACAGTGGTTTATCCACATTTTACACCATTCCCACCACCCAATTCATCAACATTAAATTCCAATGAAAATTCTAGTCAGTTTCCAATTAATACAACTAATAACAGTAATGGTAATAATAATACTAACAATAATGGTATGTACACATCGAGTACAGCTGCGGCAGCAGCAGCAGCGGTTGCTGCATTGACTGCCGCTGCAGCTGCTTCAGCTGGTCTACCGTCGAATATTAAAGATTCCAGATGGTTAACACTTGAAGTATGCCGACAATATCAACGAAATCAATGTTCAAGAGATGAAAATGAATGTAAATTCGCTCATCCACCAACACATGTCGATGTACAAAGTGGACGTGTTATTTGCTGCTATGATTCAATCAAAGGTAAATGCCA]
[+] EMBL AI067316 [ GTGTTGGTCTTAGTGATCCAACTGGAGCAGCGACAGTGGTTTATCCACATTTTACACCATTCCCACCACCCAATTCATCAACATTAAATTCCAATGAAAATTCTAGTCAGTTTCCAATTAATACAACTAATAACAGTAATGGTAATAATAATACTAACAATAATGGTATGTACACATCGAGTACAGCTGCGGCAGCAGCAGCAGCGGTTGCTGCATTGACTGCCGCTGCAGCTGCTTCAGCTGGTCTACCGTCGAGTATTAAAGATTCCAGATGGTTAACACTTGAAG ]
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[+] EMBL AI067038 [ GTGTTGGTCTTAGTGATCCAACTGGAGCAGCGACAGTGGTTTATCCACATTTTACACCATTCCCACCACCCAATTCATCAACATTAAATTCCAATGAAAATTCTAGTCAGTTTCCAATTAATACAACTAATAACAGTAATGGTAATAATAATACTAACAATAATGGTATGTACACATCGAGTACAGCTGCGGCAGCAGCAGCAGCGGTTGCTGCATTGACTGCCGCTGCAGCTGCTTCAGCT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||