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Schistosoma mansoni
cluster # 9751 cluster # 9751       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9751#0 length = 875 sequences # 11  

consensusID : consensus_9751#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 875
fasta sequence
                              [GATGAGATAGAGTTTTTAAAAACACTAACTCGACCTGGTGCCAACATTGAACAAGAAGTCAGTGCAGACGAAGAGCAAAAACGAAAAGCTACTGACAGACGTGAAGCCCTCCAGGAAGCGAAACGCTCTCTCCCGATCTATAAATTTCGGGATGCTCTTTTACAAGCTATTGCTGATCATCAGGTTTTAATCATAGAAGGTGAAACAGGTTCTGGTAAAACAACTCAAATTCCTCAGTATTTGTACGAAGCGGGTTATTGTAATGGAGGAAAACGTATTGGGTGTACACAACCACGTCGTGTTGCTG-CCATGTCAGTAGCTGCTCGAGTTTCACAAGAAATGTCTGTTAGACTTGGATCTGAAGTGGGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTACTTCAGAACATACAGTAATAAAGTACATGACAGATGGTATGCTTTTGCGTGAATTTCTCACAGAACCAGATTTGGGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGTAAAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAAAAATTTGCTACATTTTTTGATGATGCTCCTGTATTCCGAATCCCAGGTCGTCGTTATCCAGTTGATATCTACTATACAAAAGCTCCAGAAGCTGATTATATTGAAGCTGCTATCATATCTATTCTTCAAATACATGTAACTCAACCCC-CAGGTGATATTCTAGTCTTTTTAACTGGTCAAGAAGAAATTGAAACCGCTAATGAATTATTAATGGAGCGTACAAGAAAACTTGGGAGTAAAATTCGTGAATTAATAATTCTACCTAT]

[+] EMBL CD094022             [GATGAGATAGAGTTTTTAAAAACACTAACTCGACCTGGTGCCAACATTGAACAAGAAGTCAGTGCAGACGAAGAGCAAAAACGAAAAGCTACTGACAGACGTGAAGCCCTCCAGGAAGCGAAACGCTCTCTCCCGATCTATAAATTTCGGGATGCTCTTTTACAAGCTATTGCTGATCATCAGGTTTTAATCATAGAAGGTGAAACAGGTTCTGGTAAAACAACTCAAATTCCTCAGTATTTGTACGAAGCGGGTTATTGTAATGGAGGAAAACGTATTGGGTGTACACAACCACGTCGTGTTGCTG CCATGTCAGTAGCTGCTCGAGTTTCACAAGAAATGTCTGTTAGACTTGGATCTGAAGTGGGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTACTTCAGAACATACAGTAATAAAGTACATGACAGATGGTATGCTTTTGCGTGAATTTCTCACAGAGCCAGATTTGGGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGT AAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAAC TCTAATTAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD065711             [          AGTTTTTAAAAACACTAACTCGACCTGGTGCCAACATTGAACAAGAAGTCAGTGCAGACGAAGAGCAAAAACGAAAAGCTACTGACAGACGTGAAGCCCTCCAGGAAGCGAAACGCTCTCTCCCGATCTATAAATTTCGGGATGCTCTTTTACAAGCTATTGCTGATCATCAGGTTTTAATCATAGAAGGTGAAACAGGTTCTGGTAAAACAACTCAAATTCCTCAGTATTTGTACGAAGCGGGTTATTGTAATGGAGGAAAACGTATTGGGTGTACACAACCACGTCATGTTGCTG CCATGTCAGTAGCTGCTCGAGTTTCAC AGAAATGTCTGTGAGACTTGGATCTGAAGT GGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTAC TCAGAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD183411             [                                          AACATTGAACAAGAAGTCAGTGCAGACGAAGAGCAAAAACGAAAAGCTACTGACAGACGTGAAGCCCTCCAGGAAGCGAAACGCTCTCTCCCGATCTATAAATTTCGGGATGCTCTTTTACAAGCTATTGCTGATCATCAGGTTTTAATCATAGAAGGTAAAACAGGTTCTGGTAAAACAACTCAAATTCCTCAGTATTTGTACGAAGCGGGTTATTGTAATGGAGGAAAACGTATTGGGTGTACACAACCACGTCGTGTTGCTG CCATGTCAGTAGCTGCTCGAGTTTCACAAGAAATGTCTGTTAGACTTGGATCTGAAGTGGGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTACTTCAGAACATACAGTAATAAAGTACATGACAGATGGTATGCTTTTGCGTGAATTTCTCACAGAACCAGATTTGNGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGTAAAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD155007             [                                                                                                               CAGGAAGCGAAACGCTCTCTCCCGATCTATAAATTTCGGGATGCTCTTTTACAAGCTATTGCTGATCATCAGGTTTTAATCATAGAAGGTGAAACAGGTTCTGGTAAAACAACTCAAATTCCTCAGTATTTGTACGAGGCGGGTTATTGTAATGGAGGAAAACGTATTGGGTGTACACAACCACGTCGTGTTGCTG CCATGTCAGTAGCTGCTCGAGTTCCACAAGAAATGTCTGTTAGACTTGGATCTGAAGTGGGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTACTTCAGAACATACAGTAATAAAGTACATGACAGATGGTATGCTTTTGCGTGAATTTCTCACAGAACCAGATTTGGGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGTAAAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAANAATTTGCTACATTTTTTGATGAT                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD181138             [                                                                                                                           CGCTCTCTCCCGATCTATAAATTTCGGGATGCTCTTTTACAAGCTATTGCTGATCATCAGGTTTTAATCATAGAAGGTGAAACAGGTTCTGGTAAAACAACTCAAATTCCTCAGTATTTGTACGAAGCGGGTTATTGTAATGGAGGAAAACGTATTGGGTGTACACAACCACGTCGTGTTGCTG CCATGTCAGTAGCTGCTCGAGTTTCACAAGAAATGTCTGTTAGACTTGGATCTGAAGTGGGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTACTTCAGAACATACAGTAATAAAGTACATGACAGATGGTATGCTTTTGCGTGAATTTCTCACAGAACCAGATTTGGGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGTAAAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAAAAATTTGCTACATTTTTTGATGATGCTCCTGTATTCCGAATCCCAGGTCGTCGTTATCCAGTTGATATCTACTATACAAAAGCTCCAGAAGCTGATTATATTGAAGCTGCTATCATATCTATTCTTC AATACATGTAACTCAACCCCNCA GTGATATTCT                                                                                                         ]
[-] EMBL CD155046             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CACGTCGTG TGCTGCCCATGTCAGTAGCTGCTCGAGTTTCACAAGAAATGTCTGTTAGACTTGGATCTGAAGTGGGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTACTTCAGAACATACAGTAATAAAGTACATGACAGATGGTATGCTTTTGCGTGAATTTCTCACAGAACCAGATTTGGGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGTAAAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAAAAATTTGCTACATTTTTTGATGATGCTCCTGTATTCCGAATCCCAGGTCGTCGTTATCCAGTTGATATCTACTATACAAAAGCTCCAGAAGCTGATTATATTGAAGCTGCTATCATATCTATTCTTCAAATACATGTAACTCAACCCC CAGGTGATATTCTAGTCTTTTTAACTGGTCAAGAAGAAATTGAAACCGCTAATGAATTATTAATGGAGCGT                                               ]
[+] EMBL CD188381             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGCTGCTCGAGTTTCACAAGAAATGTCTGTTAGACTTGGATCTGAAGTGGGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTACTTCAGAACATACAGTAATAAAGTACATGACAGATGGTATGCTTTTGCGTGAATTTCTCACAGAACCAGATTTGGGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGTAAAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAAAAATTTGCTACATTTTTTGATGATGTTCCTGTATTCCGAATCCCAGGTCGTCGTTATCCAGTTGATATCTACTATACAAAAGCTCCAGAAGCTGATTATATTGAAGCTGCTATCATATCTATTCTTCAAATACATG                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD154899             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GGGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTACTTCAGAACATACAGTAATAAAGTACATGACAGATGGTATGCTTTTGCGTGAATTTCTCACAGAACCAGATTTGGGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGTAAAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAAAAATTTGCTACATTTTTTGATGATGCTCCTGTATTCCGAATCCCAGGTCGTCGTTATCCAGTTGATATCTACTATACAAAAGCTCCAGAAGCTGATTATATTGAAGCTGCTATCATATCTATTCTTCAAATACATGTAACTCAACCCC CAGGTGATATTCTAGTCTTTTTAACTGGTCAAGAAGAAATTGAAACCGCTAATGAATTATTAATGGAGCGT                                               ]
[-] EMBL CD154981             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGAT GTATGC TTTGCGTG ATTTCTCACAGAACCAGATNTGGGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGTAAAGAATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTAAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAAAAATTTGCTACATTTTTTGATGATGCTCCCGTATTCCGAATCCCAGGTCGTCGTTATCCAGTTGATATCTACTATACAAAAGCTCCAGAAGCTGATTATATTGAAGCTGCTATCATATCTATTCTTCAAATACATGTAACTCAACCCC CAGGTGATATTCTAGTCTTTTTAACTGGTCAAGAAGAAATTGAAACCGCTAATGAATTATTAATGGAGCGT                                               ]
[+] EMBL CD120675             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATACTATTCGGTTTAGTAAAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAAAAATTTGCTACATTTTTTGATGATGCTCCTGTATTCCGAATCCCAGGTCGTCGTTATCCAGTTGATATCTACTATACAAAAGCTCCAGAAGCTG                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD179135             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAAAAATTTGCTACATTTTTTGATGATGCTCCTGTATTCCGAATCCTAGGTCGTCGTTATCCAGTTGATATCTACTATACAAAAGCTCCAGAAGCTGATTATATTGAAGCTGCTATCATATCTATTCTTCAAATACATGTAACTCAACCCC CAGGTGATATTCTAGTCTTTTTAACTGGTCAAGAAGAAATTGAAACCGCTAATGAATTATTAATGGAGCGTACAAGAAAACTTGGGAGTAAAATTCGTGAATTAATAATTCTACCTAT]


>consensus_9751#0 GATGAGATAGAGTTTTTAAAAACACTAACTCGACCTGGTGCCAACATTGAACAAGAAGTC AGTGCAGACGAAGAGCAAAAACGAAAAGCTACTGACAGACGTGAAGCCCTCCAGGAAGCG AAACGCTCTCTCCCGATCTATAAATTTCGGGATGCTCTTTTACAAGCTATTGCTGATCAT CAGGTTTTAATCATAGAAGGTGAAACAGGTTCTGGTAAAACAACTCAAATTCCTCAGTAT TTGTACGAAGCGGGTTATTGTAATGGAGGAAAACGTATTGGGTGTACACAACCACGTCGT GTTGCTGCCATGTCAGTAGCTGCTCGAGTTTCACAAGAAATGTCTGTTAGACTTGGATCT GAAGTGGGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTACTTCAGAACATACAGTAATAAAGTAC ATGACAGATGGTATGCTTTTGCGTGAATTTCTCACAGAACCAGATTTGGGCAGTTATTCA GTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTA GTAAAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTA GATGCAGAAAAATTTGCTACATTTTTTGATGATGCTCCTGTATTCCGAATCCCAGGTCGT CGTTATCCAGTTGATATCTACTATACAAAAGCTCCAGAAGCTGATTATATTGAAGCTGCT ATCATATCTATTCTTCAAATACATGTAACTCAACCCCCAGGTGATATTCTAGTCTTTTTA ACTGGTCAAGAAGAAATTGAAACCGCTAATGAATTATTAATGGAGCGTACAAGAAAACTT GGGAGTAAAATTCGTGAATTAATAATTCTACCTAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)