These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9751#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 875 fasta sequence [GATGAGATAGAGTTTTTAAAAACACTAACTCGACCTGGTGCCAACATTGAACAAGAAGTCAGTGCAGACGAAGAGCAAAAACGAAAAGCTACTGACAGACGTGAAGCCCTCCAGGAAGCGAAACGCTCTCTCCCGATCTATAAATTTCGGGATGCTCTTTTACAAGCTATTGCTGATCATCAGGTTTTAATCATAGAAGGTGAAACAGGTTCTGGTAAAACAACTCAAATTCCTCAGTATTTGTACGAAGCGGGTTATTGTAATGGAGGAAAACGTATTGGGTGTACACAACCACGTCGTGTTGCTG-CCATGTCAGTAGCTGCTCGAGTTTCACAAGAAATGTCTGTTAGACTTGGATCTGAAGTGGGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTACTTCAGAACATACAGTAATAAAGTACATGACAGATGGTATGCTTTTGCGTGAATTTCTCACAGAACCAGATTTGGGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGTAAAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAAAAATTTGCTACATTTTTTGATGATGCTCCTGTATTCCGAATCCCAGGTCGTCGTTATCCAGTTGATATCTACTATACAAAAGCTCCAGAAGCTGATTATATTGAAGCTGCTATCATATCTATTCTTCAAATACATGTAACTCAACCCC-CAGGTGATATTCTAGTCTTTTTAACTGGTCAAGAAGAAATTGAAACCGCTAATGAATTATTAATGGAGCGTACAAGAAAACTTGGGAGTAAAATTCGTGAATTAATAATTCTACCTAT] [+] EMBL CD094022 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TCAGAACA ] [+] EMBL CD183411 [ AACATTGAACAAGAAGTCAGTGCAGACGAAGAGCAAAAACGAAAAGCTACTGACAGACGTGAAGCCCTCCAGGAAGCGAAACGCTCTCTCCCGATCTATAAATTTCGGGATGCTCTTTTACAAGCTATTGCTGATCATCAGGTTTTAATCATAGAAGGTAAAACAGGTTCTGGTAAAACAACTCAAATTCCTCAGTATTTGTACGAAGCGGGTTATTGTAATGGAGGAAAACGTATTGGGTGTACACAACCACGTCGTGTTGCTG CCATGTCAGTAGCTGCTCGAGTTTCACAAGAAATGTCTGTTAGACTTGGATCTGAAGTGGGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTACTTCAGAACATACAGTAATAAAGTACATGACAGATGGTATGCTTTTGCGTGAATTTCTCACAGAACCAGATTTGNGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGTAAAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTG ] [+] EMBL CD155007 [ CAGGAAGCGAAACGCTCTCTCCCGATCTATAAATTTCGGGATGCTCTTTTACAAGCTATTGCTGATCATCAGGTTTTAATCATAGAAGGTGAAACAGGTTCTGGTAAAACAACTCAAATTCCTCAGTATTTGTACGAGGCGGGTTATTGTAATGGAGGAAAACGTATTGGGTGTACACAACCACGTCGTGTTGCTG CCATGTCAGTAGCTGCTCGAGTTCCACAAGAAATGTCTGTTAGACTTGGATCTGAAGTGGGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTACTTCAGAACATACAGTAATAAAGTACATGACAGATGGTATGCTTTTGCGTGAATTTCTCACAGAACCAGATTTGGGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGTAAAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAANAATTTGCTACATTTTTTGATGAT ] [+] EMBL CD181138 [ CGCTCTCTCCCGATCTATAAATTTCGGGATGCTCTTTTACAAGCTATTGCTGATCATCAGGTTTTAATCATAGAAGGTGAAACAGGTTCTGGTAAAACAACTCAAATTCCTCAGTATTTGTACGAAGCGGGTTATTGTAATGGAGGAAAACGTATTGGGTGTACACAACCACGTCGTGTTGCTG CCATGTCAGTAGCTGCTCGAGTTTCACAAGAAATGTCTGTTAGACTTGGATCTGAAGTGGGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTACTTCAGAACATACAGTAATAAAGTACATGACAGATGGTATGCTTTTGCGTGAATTTCTCACAGAACCAGATTTGGGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGTAAAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAAAAATTTGCTACATTTTTTGATGATGCTCCTGTATTCCGAATCCCAGGTCGTCGTTATCCAGTTGATATCTACTATACAAAAGCTCCAGAAGCTGATTATATTGAAGCTGCTATCATATCTATTCTTC AATACATGTAACTCAACCCCNCA GTGATATTCT ] 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ATTTCTCACAGAACCAGATNTGGGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGTAAAGAATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTAAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAAAAATTTGCTACATTTTTTGATGATGCTCCCGTATTCCGAATCCCAGGTCGTCGTTATCCAGTTGATATCTACTATACAAAAGCTCCAGAAGCTGATTATATTGAAGCTGCTATCATATCTATTCTTCAAATACATGTAACTCAACCCC CAGGTGATATTCTAGTCTTTTTAACTGGTCAAGAAGAAATTGAAACCGCTAATGAATTATTAATGGAGCGT ] [+] EMBL CD120675 [ TATACTATTCGGTTTAGTAAAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAAAAATTTGCTACATTTTTTGATGATGCTCCTGTATTCCGAATCCCAGGTCGTCGTTATCCAGTTGATATCTACTATACAAAAGCTCCAGAAGCTG ] [-] EMBL CD179135 [ CGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAAAAATTTGCTACATTTTTTGATGATGCTCCTGTATTCCGAATCCTAGGTCGTCGTTATCCAGTTGATATCTACTATACAAAAGCTCCAGAAGCTGATTATATTGAAGCTGCTATCATATCTATTCTTCAAATACATGTAACTCAACCCC CAGGTGATATTCTAGTCTTTTTAACTGGTCAAGAAGAAATTGAAACCGCTAATGAATTATTAATGGAGCGTACAAGAAAACTTGGGAGTAAAATTCGTGAATTAATAATTCTACCTAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||