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Schistosoma mansoni
cluster # 9755 cluster # 9755       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9755#0 length = 826 sequences # 11  

consensusID : consensus_9755#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 826
fasta sequence
                              [ACAATTCAATCATTATATAGAATGCTACTTATTTATTTTTACAATAACACACACACATATGAGGAATAGTATTAATAATAACAATCGTGATATTTACACTTCGATAGAAAACAAAAAAAAAGGGATCAAAATAAGTCAGTAAGGTTATGATCATGTCGAAATTGTTTTGTATATGATTTTTCCTTCTTTTCACGTAATCTTTCCTCGTTGGCTTTCATTTTTCGACGTTGAATTGCTTCCAAAGTTTCAGGACTTGGTTCGGGTTTATTTAATGAATCAACACATTCCCTGATTATACGACGAATTCGTTCTAAACAATCAGCTTGATTTAATATTTGTTTCCTAGTATGATCTGATGTAATAATAAAGTAATTTTCTTTATTAATTCGATTAGCCTCCTTTTCCATAAATAGTTGTTTAACTTGATCTGGTATCCATGACGCTGATGGAACATGGAAACGTATCTCCACTTTTGTTTTATTTTTATTCACATGTTGTCCTCCTGGACCACTCGAATATGCATAAGATATTTGAAGTTCATCGATAGGGATATATCCGCTGAAAACATTTTGACTAATACTTGGTTCTGTAGGTTTCTTAAAAACAGCATTAGAATCAGAATTTGGATAAAGATTGACTGGATTTTGTGCACTTTCAAAAGAACTCAAACATCGTATTGATGGGCGGGAGATGTAAAATGATAGAAATTTTCCAACACGAATCATTAGCTACGAAACCACCCAGGTTACCGTCTAATATCGTCTACGCACGGTAAAAAAAAGTCGGGGCCTTTCAAAGCCACCCGCCGCTTCGTTTTAACGACCTT]

[-] EMBL CD066960             [ACAATTCAATCATTATATAGAATGCTACTTATTTATTTTTACAATAACACACACACATATGAGGAATAGTATTAATAATAACAATCGTGATATTTACACTTGGATAGACAAC AAAAAAAAGGGATCAAAATAAGTCAGTAAGGTTATGATCATGTCGAAATTGTTTTGTATATGATTTTTCCTTCTTTTCACGTAATCTTTCCTCGTTGGCTTTCATTTTTAGACGTTGAATTGCTTCCAAAGTTTCAGGACTTGGTTCGGGTTTATTTAATGAATCAACACATTCCCTGATTATACGCAGAATTCGTTATAATCAATCAGCTTGATTTAATATTTGTTTCATAGTATGGTTTGATGTAATAATAAAGTAATTTTGTTTATTAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD198823             [                                                                          ATAATAACAATCGTGATATTTACACTTCGATAGAAAACAAAAAAGAAGGGATCAAAATAAGTCAGTAAGGTTATGATCATGTCGAAATTGTTTTGTATATGATTTTTCCTTCTTTTCACGTAATCTTTCCTCGTTGGCTTTCATTTTTCGACGTTGAATTGCTTCCAAAGTTTCAGGACTTGGTTCGGGTTTATTTAATGAATCAACACATTCCCTGATTATACGACGAATTCGTTCTANACAATCAGCTTGATTTAATATTTGTTTCCTAGTATGATCTGATGTAATAAATAAGTAATTTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD143319             [                                                                           TAATAACAATCGTGATATTTACACTTCGATAGAAAACAAAAAAAAAGGGATCAAAATAAGTCAGTAAGGTTATGATCATGTCGAAATTGTTTTGTATATGATTTTTCCTTCTTTTCACGTAATCTTTCCTCGTTGGCTTTCATTTTTCGACGTTGAATTGCTTCCAAAGTTTCAGGACTTGGTTCGGGTTTATTTAATGAATCAACACATTCCCTGATTATACGACGAATTCGTTCTAAACAATCAGCTTGATTTAATATTTGTTTCCTAGTATGATCTGATGTAATAATAAAGTAATTTTCTTTATTAATTCGATTAGCCTCCTTTTCCATAAAAAGTTGTTTAACTTGATCTGGTATCCATGACGCTGATGGAACATGGAAACGTATCTCCACTTTTGTTTTATTTTTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD143330             [                                                                           TAATAACAATCGTGATATTTACACTTCGATAGAAAACAAAAAAAAAGGGATCAAAATAAGTCAGTAAGGTTATGATCATGTCGAAATTGTTTTGTATATGATTTTTCCTTCTTTTCACGTAATCTTTCCTCGTTGGCTTTCATTTTTCGACGTTGAATTGCTTCCAAAGTTTCAGGACTTGGTTCGGGTTTATTTAATGAATCAACACATTCCCTGATTATACGACGAATTCGTTCTAAACAATCAGCTTGATTTAATATTTGTTTCCTAGTATGATCTGATGTAATAATAAAGTAATTTTCTTTATTAATTCGATTAGCCTCCTTTTCCATAAATAGTTGTTTAACTTGATCTGGTATCCATGACGCTGATGGAACATGGAAACGTATCTCCACTTTTGTTTTATTTTTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD143404             [                                                                           TAATAACAATCGTGATATTTACACTTCGATAGAAAACAAAAAAAAAGGGATCAAAATAAGTCAGTAAGGTTATGATCATGTCGAAATTGTTTTGTATATGATTTTTCCTTCTTTTCACGTAATCTTTCCTCGTTGGCTTTCATTTTTCGACGTTGAATTGCTTCCAAAGTTTCAGGACTTGGTTCGGGTTTATTTAATGAATCAACACATTCCCTGATTATACGACGAATTCGTTCTAAACAATCAGCTTGATTTAATATTTGTTTCCTAGTATGATCTGATGTAATAATAAAGTAATTTTCTTTATTAATTCGATTAGCCTCCTTTTCCATAAATAGTTGTTTAACTTGATCTGGTATCCATGACGCTGATGGAACATGGAAACGTATCTCCACTTTTGTTTTATTTTTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD143324             [                                                                           TAATAACAATCGTGATATTTACACTTCGATAGAAAACAAAAAAAAAGGGATCGAAATAAGTCAGTAAGGTTATGATCATGTCGAAATTGTTTTGTATATGATTTTTCCTTCTTTTCACGTAATCTTTCCTCGTTGGCTTTCATTTTTCGACGTTGAATTGCTTCCAAAGTTTCAGGACTTGGTTCGGGTTTATTTAATGAATCAACACATTCCCTGATTATACGACGAATTCGTTCTAAACAATCAGCTTGATTTAATATTTGTTTCCTAGTATGATCTGATGTAATAATAAAGTAATTTTCTTTATTAATTCGATTAGCCTCCTTTTCCATAAATAGTTGTTTAACTTGATCTGGTATCCATGACGCTGATGGAACATGGAAACGTATCTCCACTTTTGTTTTATTTTTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD143307             [                                                                           TAATAACAATCGTGATATTTACACTTCGATAGAAAACAAAAAAAAAGGGATCAAAATAAGTCAGTAAGGTTATGATCATGTCGAAATTGTTTTGTATATGATTTTTCCTTCTTTTCACGTAATCTTTCCTCGTTGGCTTTCATTTTTCGACGTTGAATTGCTTCCAAAGTTTCAGGACTTGGTTCGGGTTTATTTAATGAATCAACACATTCCCTGATTATACGACGAATTCGTTCTAAACAATCAGCTTGATTTAATATTTGTTTCCTAGTATGATCTGATGTAATAATAAAGTAATTTTCTTTATTAATTCGATTAGCCTCCTTTTCCATAAATAGTTGTTTAACTTGATCTGGTATCCATGACGCTGATGGAACATGGAAACGTATCTCCACTTTTGTTTTATTTTTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD189459             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATGTAATAATAAAGTAATTTTCTTTATTAATTCGATTAGCCTCCTTTTCCATAAATAGTTGTTTAACTTGATCTGGTATCCATGACGCTGATGGAACATGGAAACGTATCTCCACTTTTGTTTTATTTTTATTCACATGTTGTCCTCCTGGACCACTCGAATATGCATAAGATATTTGAAGTTCATCGATAGGGATATATCCGCTGAAAACATTTCGACTAATACTTGGTTCTGTAGGTTTCTTAAAAACAGCATTAGAATCAGAATTTGGATAAAGATTGACTGGATTTTGTGCACTTTCAAAAGAACTCAAACATCGTATTGATGGGCGGGAGATGTAAAATGATAGAAATTTTCCAACACGAATCATTAGCTACGAAACCACCCAGGTTACCGTCTAATATCGTCTACGCACGGTAAAAAAAAGTCGGGGCCTTTCAAAGCCACCCGCCGCTTCGTTTTAACGA    ]
[-] EMBL CD191590             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTGTTTAACTTGATCTGGTATCCATGACGCTGATGGAACATGGAAACGTATCTCCACTTTTGTTTTATTTTTATTCACATGTTGTCCTCCTGGACCACTCGAATATGCATAAGATATTTGAAGTTCATCGATAGGGATATATCCGCTGAAAACATTTTGACTAATACTTGGTTCTGTAGGTTTCTTAAAAACAGCATTAGAATCAGAATTTGGATAAAGATTGACTGGATTTTGTGCACTTTCAAAAGAACTCAAACATCGTATTGATGGGCGGGAGATGTAAAATGATAGAAATTTTCCAACACGAATCATTAGCTACGAAACCACCCAGGTTACCGTCTAATATTGTCTta                                                            ]
[-] EMBL CD191603             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTGTTTAACTTGATCTGGTATCCATGACGCTGATGGAACATGGAAACGTATCTCCACTTTTGTTTTATTTTTATTCACATGTTGTCCTCCTGGACCACTCGAATATGCATAAGATATTTGAAGTTCATCGATAGGGATATATCCGCTGAAAACATTTTGACTAATACTTGGTTCTGTAGGTTTCTTAAAAACAGCATTAGAATCAGAATTTGGATAAAGATTGACTGGATTTTGTGCACTTTCAAAAGAACTCAAACATCGTATTGATGGGCGGGAGATGTAAAATGATAGAAATTTTCCAACACGAATCATTAGCTACGAAACCACCCAGGTTACCGTCTAATAT GTCTA                                                             ]
[+] EMBL CD190155             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATATGCATAAGATATTTGAAGTTCATCGATAGGGATATATCCGCTGAAAACATTTTGACTAATACTTGGTTCTGTAGGTTTCTTAAAAACAGCATTAGAATCAGAATTTGGATAAAGATTGACTGGATTTTGTGCACTTTCAAAAGAACTCAAACATCGTATTGATGGGCGGGAGATGTAAAATGATAGAAATTTTCCAACACGAATCATTAGCTACGAAACCACCCAAGTTACCGTCTAATATCGTCTACGCACGGTAAAAAAAAGTCGGGGCCTTTCAAAGCCACCCGCCGCTTCGTTTTAACGACCTT]


>consensus_9755#0 ACAATTCAATCATTATATAGAATGCTACTTATTTATTTTTACAATAACACACACACATAT GAGGAATAGTATTAATAATAACAATCGTGATATTTACACTTCGATAGAAAACAAAAAAAA AGGGATCAAAATAAGTCAGTAAGGTTATGATCATGTCGAAATTGTTTTGTATATGATTTT TCCTTCTTTTCACGTAATCTTTCCTCGTTGGCTTTCATTTTTCGACGTTGAATTGCTTCC AAAGTTTCAGGACTTGGTTCGGGTTTATTTAATGAATCAACACATTCCCTGATTATACGA CGAATTCGTTCTAAACAATCAGCTTGATTTAATATTTGTTTCCTAGTATGATCTGATGTA ATAATAAAGTAATTTTCTTTATTAATTCGATTAGCCTCCTTTTCCATAAATAGTTGTTTA ACTTGATCTGGTATCCATGACGCTGATGGAACATGGAAACGTATCTCCACTTTTGTTTTA TTTTTATTCACATGTTGTCCTCCTGGACCACTCGAATATGCATAAGATATTTGAAGTTCA TCGATAGGGATATATCCGCTGAAAACATTTTGACTAATACTTGGTTCTGTAGGTTTCTTA AAAACAGCATTAGAATCAGAATTTGGATAAAGATTGACTGGATTTTGTGCACTTTCAAAA GAACTCAAACATCGTATTGATGGGCGGGAGATGTAAAATGATAGAAATTTTCCAACACGA ATCATTAGCTACGAAACCACCCAGGTTACCGTCTAATATCGTCTACGCACGGTAAAAAAA AGTCGGGGCCTTTCAAAGCCACCCGCCGCTTCGTTTTAACGACCTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)