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consensusID : consensus_9796#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1104 fasta sequence
[CTACGAGCCAATATTCGGCACGAGGGGCGTTCGGGCGTCAGAATATTGTCCCTCACCCAGTCAATCAAGGAAAAGGTACGAATGTGTTCCAGAACCTATGAAGAGAACTCCAGATTACATCAACAAAAGAATTCGCAACAGAAGTGCCGTTAAACGGTTTCGTGAAAAATCAAAAACGAAAGCCAAGAGACAAGAAGACGTAAAGGCTAATTTAATTTTATTAACAAGATTTTATGATAATGAATTAATTCGAATAAAACACTCAAAGCAGCAACTAGAACTGCTATTATATCAA-CATGCTGCTCATAA-AAACATTATTAGTCAACTTA-ATGAAATTTTAAGTCTAGAAGCCCAAGCCCGATTAAAGTTTCAAACTCAACTTGCTAGTGTTCCGGAGTGGTCTACTTCATCTGTAGAGCATTTGATCGACTAGTTATAACAAATATTGTATTAGTAATTTATGTTCAAATTTTCTGTATATTTCTAGACCAGATCATTTTCATTTCTATTTATTTCAGCATATTTTGTCTTGTATATCTGTATTGACACATGTATATGGAGTTTATAGCTATATGAATAATTTGTTTACGTAGTTGTAAGTTTATATTATTGGATATG-TGTAACAGTTTTTAGCCAGGACAATACCTAATTCCGGATAAAGTACTCACATTATTTTGGCTTTCTTGCGATGTCCCTTAATTCTTTTAACCAGCCATAAACCACTACTCATGTTTGTCCGTACAACTACGCTCTTTGTGTATTGGCCAGTGTTTTGAAATTTGACATTATTTGTTGCACCCTTATGCTGGTACAATTTATTTATTTTCCTGACAATTTTTAAAACTATAGCATCCCAATCCTATGTCCAGAAAAAAAACTGTGCATTTTCGTCTTGTCTTCTTCCCAGTGTCGTATTAATTCGATAAATAACTGCACAAAATTGTTCTGACCTTCGTTTGCACTACGTGACTTCGTTGTATTATTTCTTGTGACTGTGCATAGTTGTGCTTTGTAATCAACTAATAATTATTACATTTTCATGTTTTGTTCGCTACTTTTTT-GAACTTTATATTCGCTATTTGTAGTGTATTTCATTCGATTATA]
[+] EMBL CD083212 [CTACGAGCCAATATTCGGCACGAGGGGCGTTCGGGCGTCAGAATATTGTCCCTCACCCAGTCAATCAAGGAAAAGGTACGAATGTGTTCCAGAACCTATGAAGAGAACTCCAGATTACATCAACAAAAGAATTCGCAACAGAAGTGCCGTTAAACGGTTTCGTGAAAAATCAAAAACGAAAGCCAAGAGACAAGAAGACGTAAAGGCTAATTTAATTTTATTAACAAGATTTTATGATAATGAATTAATTCGAATAAAACACTCAAAGCAGCAACTAGAACTGCTATTATATCAA CATGCTGCTCATAA AAACATTATTAGTCAACTTA ATGAAATTTTAAGTCTAGAAGCCCAAGCCCGATTAAAGTTTCAAACTCAACTTGCTAGTGTTCCGGAGTGGTCTACTTCATCTGTAGAGCATTTGATCGACTAGTTATAACAAATATTGTATTAGTAATTTATGTTCAAATTTTCTGTATATTTCTAGACCAGATCATTTTCATTTCTATTTATTTCAGCATATTTTGTCTTGTATAACTGTATTGACACATGTATATGGAGTTTATAGCTATATGAATAATTTGTTTACGTAGTTGTAAGTTTATATTATTGGATATGNTGT ACAGTTTTT ]
[+] EMBL CD068573 [ GCCAAGAGACAAGAAGACGTAGAGGCTAATTTAATTTTATTAACAAGATTTTATGATAATGAATTAATTCGAATAAAACACTCAAAGCAGCAACTAGAACTGCTATTATATCAATCATGCTGCTCATAAGAAACATTATTAGTCAACTTAGATGAAATTTTAAGTCTAGAAGCCCAAGCCCGATTAAAGTTTCAAACTCAACTTGCTAGTGTTCCGGAGTGGTCTACTTCATCTGTAGAGCATTTGATCGACTAGTTATAACAAATATTGTATTAGTAATTTATGTTCAAATTTTCTGTATATTTCTAGACCAGATCATTTTCATTTCTATTTATTTCAGCATATTTTGTCTTGTATATCTGTATTGACACATGTATATGGAGTTTATAGCT ]
[+] EMBL CD196630 [ CGTAAAGGCTAATTTAATTTTATTAACAAGATTTTATGATAATGAATTAATTCGAATAAAACACTCAAAGCAGCAACTAGAACTGCTATTATATCAA CATGCTGCTCATAA AAACATTATTAGTCAACTTA ATGAAATTTTAAGTCTAGAAGCCCAAGCCCGATTAAAGTTTCAAACTCAACTTGCTAGTGTTCCGGAGTGGTCTACTTCATCTGTAGAGCATTTGATCGACTAGTTATAACAAATATTGTATTAGTAATTTATGTTCAAATTTTCTGTATATTTCTAGACCAGATCATTTTCATTTCTATTTATTTCAGCATATTTTGTCTTGTATATCTGTATTGACACATGTATATGGAGTTTATAGCTATATGAATAATTTGTTTACGTAGTTGTAAGTTCATATTATTGGATATG TGTAACAGTTTTTAGCCAGGACAATACCTAATTCCGGATAAAGT ]
[-] EMBL CD133405 [ GAACTGCTATTATATCAA CATGCTGCTCATAA AAACATTATTAGTCAACTTA ATGAAATTTTGAGTCTAGAAGCCCAAGCCCGATTAAAGTTTCAAACTCAACTTGCTAGTGTTCCGGAGTGGTCTACTTCATCTGTAGAGCATTTGATCGACTAGTTATAACAAATATTGTATTAGTAATTTATGTTCAAATTTTCTGTATATTTCTAGACCAGATCATTTTCATTTCTATTTATTTCAGCATATTTTGTCTTGTATATCTGTATTGACACATGTATATGGAGTTTATAGCTATATGAATAATTTGTTTACGTAGTTGTAAGTTTATATTATTGGATATG TGTAAC ]
[+] EMBL CD072105 [ GATCATTTTCATTTCTATTTATTTCAGCATATTTTGTCTTGTATATCTGTATCGACACATGTATATGGAGTTTATAGCTATATGAATAATTTGTTTACGTAGTTGTAAGTTTATATTATTGGATATG TGTAACAGTTTTTAGCCAGGACAATACCTAATTCCGGATAAAGTACTCACATTATTTTGGCTTTCTTGCGATGTCCCTT ]
[-] EMBL CD076785 [ TGTATTGACACATGTATATGGAGTTTATAGCTATATGAATAATTTGTTTACGTAGTTGTAAGTTTATATTATTGGATATG TGTAACAGTTTTTAGCCAGGACAATACCTAATTCCGGATAAAGTACTCACATTATTTTGGCTTTCTTGCGATGTCCCTTAATTCTTTTAACCAGCCATAAACCACTACTCATGTTTGTCCGTACAACTACGCTCTTTGTGTATTGGCCAGTGTTTTGAAATTTGACATTATTTGTTGCACCCTTATGCTGGTACAATTTATTTATTTTCCTGCCAATTTTTAAAACTATAGCATCCCAATCCTATGTCCAGAAAAAAAACTGTGCATTTTCGTCTTGTCTTCTTCCCAGTGTCGTATTAATTCGATAAATAACTGCACAAAATTGTTCTGACCTTCGTTTGCACTACGTGACTTCGTTGTATTATTTCTTGTGACTGTGCATAGTTGTGCTTTGTAATCAACTAATAATTATTACATTTTCATGTTTTGTTCGCTACTTTTTT GAACTTTATATTCGCTATTTGTAGTGTATTTCATTCGATTATA]
[-] EMBL CD073075 [ TGAATAATTTGTTTACGTAGTTGTAAGTTTATATTATTGGATATG TGTAACAGTTTTTAGCCAGGACAATACCTAATTCCGGATAAAGTACTCACATTATTTTGGCTTTCTTGCGATGTCCCTTAATTCTTTTAACCAGCCATAAACCACTACTCATGTTTGTCCGTACAACTACGCTCTTTGTGTATTGGCCAGTGTTTTGAAATTTGACATTATTTGTTGCACCCTTATGCTGGTACAATTTATTTATTTTCCTGACAATTTTTAAAACTATAGCATCCCAATCCTATGTCCAGAAAAAAAACTGGGCATTTTCGTCTTGTCTTCTTCCCAGTGTCGTATTAATTCGATAAATAACTGCACAAAATTGTTTTGACCTTCGTTTGCACTACGTGACTTCGTTGTATTATTTCTTGTGACTGTGCATAGTTGTGCTTTGTAATCAACTAATAATTATTACATTTTCATGTTTTGTTCGCTACTTTTTT GAACTTTATATTCGCTATTTGTAGTGTATTTCATTCGATTATA]
[+] EMBL AI977263 [ TTGTTGCAGCCTTATGCTGGTACAATTTATTTATTTTCCTGACAATTTTTAAAACTATAGCATCCCAATCCTATGTCCAGAAAAAAAACTGTGCATTTTCGTCTTGTCTTCTTCCCAGTGTCGTATTAATTCGATAAATAACTGCACAAAATTGTTCTGACCTTCGTTTGCACTACGTGACTTCGTTGTATTATTTCTTGTGACTGTGCATAGTTGTGCTTTGTAATCAACTAATAATTATTACAT ]
[+] EMBL SM7671 [ gnATCCCAATCCTATGTCCAGAAAAAAAA TGTGCATTTTCGTCTTGTCTTCTTCCCAGTGTCGTATTAATTCGATAAATAACTGCACAAAATTGTTCTGACCTTCGTTTGCACTACGTGACTTCGTTGTATTATTTCTTGTGACTGTGCATAGTTGTGCTTTGTAATCAACTAATAATTATTACATTTTCATGTTTTGTTCGCTACTTTTTTGGAACTTTATATTCGCTATTTG GTATTTCATTCGATTA ]
consensusID : consensus_9796#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 366 fasta sequence
[GGAGAACTTTGAAAGATCATAGTCCCATCAACACATCTCCTAGTTCTACTGGCGTTCGGGCGTCAGAATATTGTCCCTCACCCAGTCAATCAAGGAAAAGGTACGAATGTGTTCCAGAACCTATGAAGAGAACTCCAGATTACATCAACAAAAGAATTCGCAACAGAAGTGCCGTTAAACGGTTTCGTGAAAAATCAAAAACGAAAGCCAAGAGACAAGAAGACGTAAAGGCTAATTTAATTTTATTAACAAGATTTTATGATAATGAATTAATTCGAATAAAACACTCAAAGCAGCAACTAGAACTGCTATTATATCAACATGCTGCTCATAAAAACATTATTAGTCAACTTAATGAAATTTTAA]
[-] EMBL CD200900 [GGAGAACTTTGAAAGATCATAGTCCCATCAACACATCTCCTAGTTCTACTGGCGTTCGGGCGTCAGAATATTGTCCCTCACCCAGTCAATCAAGGAAAAGGTACGAATGTGTTCCAGAACCTATGAAGAGAACTCCAGATTACATCAACAAAAGAATTCGCAACAGAAGTGCCGTTAAACGGTTTCGTGAAAAATCAAAAACGAAAGCCAAGAGACAAGAAGACGTAAAGGCTAATTTAATTTTATTAACAAGATTTTATGATAATGAATTAATTCGAATAAAACACTCAAAGCAGCAACTAGAACTGCTATTATATCAACATGCTGCTCATAAAAACATTATTAGTCAACTTAATGAAATTTTAA]
[+] EMBL CD071583 [ AATATTGTCCCTCACCCAGTCAATCAAGGAAAAGGTACGAATGTGTTCCAGAACCTATGAAGAGAACTCCAGATTACATCAACAAAAGAATTCGCAACAGAAGTGCCGTTAAACGGTTTCGTGAAAAATCAAAAACGAAAGCCAAGAGACAAGAAGACGTAAAGGCTAATTTAATTTTATTAACAAGATTTTATGATAATGAATTAATTCGAATAAAACACTCAAAGCAGCAACTAGAACTGCTATTATATCAACATGCTGCTCATAAAAACATTATTAGTCAACTTAATGAAATTTTA ]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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consensus_9796#1 CGTCAGAATATTGTCCCTCACCCAGTCAATCAAGGAAAAGGTACGAATGTGTTCCAGAAC 120
************************************************************
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************************************************************
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************************************************************
consensus_9796#0 TTTTATTAACAAGATTTTATGATAATGAATTAATTCGAATAAAACACTCAAAGCAGCAAC 275
consensus_9796#1 TTTTATTAACAAGATTTTATGATAATGAATTAATTCGAATAAAACACTCAAAGCAGCAAC 300
************************************************************
consensus_9796#0 TAGAACTGCTATTATATCAACATGCTGCTCATAAAAACATTATTAGTCAACTTAATGAAA 335
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************************************************************
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******
consensus_9796#0 AGTGGTCTACTTCATCTGTAGAGCATTTGATCGACTAGTTATAACAAATATTGTATTAGT 455
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consensus_9796#0 CAGCATATTTTGTCTTGTATATCTGTATTGACACATGTATATGGAGTTTATAGCTATATG 575
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consensus_9796#0 AATAATTTGTTTACGTAGTTGTAAGTTTATATTATTGGATATGTGTAACAGTTTTTAGCC 635
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||