Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9802 cluster # 9802       Sequences # 11       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9802#0 length = 508 sequences # 11  
consensusID : consensus_9802#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 508
fasta sequence 
                              [ACAGTTTAACAGGCTGACATTTTGCTTCAATCATACAGTCAGTTATCTGCGATCAGTAGTACCAAAAGTTAGTAGAACTGACAACAGAACATATCATGTTCCGATTTTGTCTGATTTTTATTATTTCTTGTATTCGTGATATTTTAAACCAAGTTGGTGAGAACCAGCAACATCCAGCTACGTAGTGCATTATGCTAGACCTCAATCTTTCCTAAGTAGCTTTTCTTGGTTAAGTATACATCACTAAGGCTAAGATACTCGTCTAATTCACCAGCCTGTTCATATAGTGACTGAA-ATTGTCAAATGATAGCTGTATGATACTACTACTACTATTAAAAATA-CATTCATTCCACCGTGACTTTATTAGTTGTTCATAATAGCTTAAGCTACTGACCACTACTTTACTGAGTTTGTAACAAAAAATTGTTGAAAGTTGATTTTCATTTTAACGCTCGTATTCACTGCAGACTTTATGTTTTATCGTTGATCATTACATATGCCATAGTCT]

[+] EMBL CD088011             [ACAGTTTAACAGGCTGACATTTTGCTTCAATCATACAGTCAGTTATCTGCGATCAGTAGTACCAAAAGTTAGTAGAACTGACAACAGAACATATCATGTTCCGATTTTGTCTGATTTTTATTATTTCTTGTATTCGTGATATTTTAAACCAAGTTGGTGAGAACCAGCAACATCCAGCTACGTAGTGCATTATGCTAGACCTCAATCTTTCCTAAGTAGCTTTTCTTGGTTGAGTATACATCACTAAGGCTAAGATACTCGTCTAATTCACCAGCCTGTTCATATAGTGACTGAA ATTGTCAAATGATAGCTGTATGATACTACTACTACTATTATAAATA CATTCATTCCACCGTGACTTTATTAGTTGTTCATAATAGCTTAAGCTACTGACCACTACTTTACTGAGTTTGTAACAAAAAATTGTTGAAAGTTGATTTTCATTTTAACGCTCGTATTCACTGCAGACTTTATGTTTTATCGTTGATCATTACATATGCCATAGTCT]
[+] EMBL CD088025             [ACAGTTTAACAGGCTGACATTTTGCTTCAATCATACAGTCAGTTATCTGCGATCAGTAGTACCAAAAGTTAGTAGAACTGACAACAGAACATATCATGTTCCGATTTTGTCTGATTTTTATTATTTCTTGTATTCGTGATATTTTAAACCAAGTTGGTGAGAACCAGCAACATCCAGCTACGTAGTGCATTATGCTAGACCTCAATCTTTCCTAAGTAGCTTTTCTTGGTTAAGTATACATCACTAAGGCTAAGATACTCGTCTAATTCACCAGCCTGTTCATATAGTGACTGAA ATTGTCAAATGATAGCTGTATGATACTACTACTACTATTAAAAATA CATTCATTCCACCGTGACTTTATTAGTTGTTCATAATAGCTTAAGCTACTGACCACTACTTTACTGAGTTTGTAACAAAAAATTGTTGAAAGTTGATTTTCATTTTAACGCTCGTATTCACTGCAGACTTTATGTTTTATCGTTGATCATTACA             ]
[+] EMBL CD088024             [ACAGTTTAACAGGCTGACATTTTGCTTCAATCATACAGTCGGTTATCTGCGATCAGTAGTACCAAAAGTTAGTAGAACTGACAACAGAACATATCATGTTCCGATTTTGTCTGATTTTTATTATTTCTTGTATTCGTGATATTTTAAACCAAGTTGGTGAGAACCAGCAACATCCAGCTACGTAGTGCATTATGCTAGACCTCAATCTTTCCTAAGTAGCTTTTCTTGGTTAAGTATACATCACTAAGGCTAAGATACTCGTCTAATTCACCAGCCTGTTCATATAGTGACTGAA ATTGTCAAATGATAGCTGTATGATACTACTACTACTATTAAAAATA CATTCATTCCACCGTGACTTTATTAGTTGTTCATAATAGCTTAAGCTACTGACCACTACTTTACTGAGTTTGTAACAAAAAATTGTTGAAAGTCGATTTTCATTTTAACGCTCGTATTCACTGCAGACTTTA                                   ]
[+] EMBL CD088012             [ACAGTTTAACAGGCTGACATTTTGCTTCAATCATACAGTCAGTTATCTGCGATCAGTAGTACCAAAAGTTAGTAGAACTGACAACAGAACATATCATGTTCCGATTTTGTCTGATTTTTATTATTTCTTGTATTCGTGATATTTTAAACCAAGTTGGTGAGAACCAGCAACATCCAGCTACGTAGTGCATTATGCTAGACCTCAATCTTTCCTAAGTAGCTTTTCTTGGTTAAGTATACATCACTAAGGCTAAGATACTCGTCTAATTCACCAGCCTGTTCATATAGTGACTGAA ATTGTCAAATGATAGCTGTATGATACTACTACTACTATTAAAAATA CATTCATCCCACCGTGACTTTATTAGTTGTTCATAATAGCTTAAGCTACTGACCACTACTTTACTGAGTTTGTAACAAAAAATTGTTGAAAGTTGATTTTCATTTTAACGCTCGTA TCACTGCAGAC                                       ]
[+] EMBL CD087990             [ACAGTTTAACAGGCTGACATTTTGCTTCAATCATACAGTCAGTTATCTGCGATCAGTAGTACCAAAAGTTAGTAGAACTGACAACAGAACATATCATGTTCCGATTTTGTCTGATTTTTATTATTTCTTGTATTCGTGATATTTTAAACCAAGTTGGTGAGAACCAGCAACATCCAGCTACGTAGTGCATTATGCTAGACCTCAATCTTTCCTAAGTAGCTTTTCTTGGTTAAGTATACATCACTAAGGCTAAGATACTCGTCTAATTCACCAGCCTGTTCATATAGTGACTGAA ATTGTCAAATGATAGCTGTATGATACTACTACTACTATTAAAAATA CATTCATTCCACCGTGACTTTATTAGTTGTTCATAATAGCTTAAGCTACTGACCACTACTTTACTGAGTTTGTAACAAAAAATTGTTGAAAGTTGATTTTCATTTTAACGCTCG                                                     ]
[+] EMBL CD088007             [ACAGTTTAACAGGCTGACATTTTGCTTCAATCATACAGTCAGTTATCTGCGATCAGTAGTACCAAAAGTTAGTAGAACTGACAACAGAACATATCATGTTCCGATTTTGTCTGATTTTTATTATTTCTTGTATTCGTGATATTTTAAACCAAGTTGGTGAGAACCAGCAACATCCAGCTACGTAGTGCATTATGCTAGACCTCAATCTTTCCTAAGTAGCTTTTCTTGGTTAAGTATACATCACTAAGGCTAAGATACTCGTCTAATTCACCAGCCTGTTCATATAGTGACTGAA ATTGTCAAATGATAGCTGTATGATACTACTACTACTATTAAAAATA CATTCATTCCACCGTGACTTTATTAGTTGTTCATAATAGCTTAAGCTACTGACCACTACTTTACTGAGTTTGTAACAAAAAATTGTTGACAGTCGATTTTCATTTTA                                                            ]
[+] EMBL CD087992             [ACAGTTTAACAGGCTGACGTTTTGCTTCAATCATACAGTCAGTTATCTGCGATCAGTAGTACCAAAAGTTAGTAGAACTGACAACAGAACATATCATGTTCCGATTTTGTCTGATTTTTATTATTTCTTGTATTCGTGATATTTTAAACCAAGTTGGTGAGAACCAGCAACATCCAGCTACGTAGTGCATTATGCTAGACCTCAATCTTTCCTAAGTAGCTTTTCTTGGTTAAGTATACATCACTAAGGCTAAGATACTCGTCTAATTCACCAGCCTGTTCATATAGTGACTGAA ATTGTCAAATGATAGCTGTATGATACTACTACTACTATTAAAAATA CATTCATTCCACCGTGACTTTATTAGTTGTTCATAATAGCTTAAGCTACTGACCACTACTTTACTGAGTTTGTGACAAAAAATTGTTGACCGTTGATTTTCATT                                                               ]
[+] EMBL CD087995             [ACAGTTTAACAGGCTGACATTTTGCTTCAATCATACAGTCAGTTATCTGCGATCAGTAGTACCAAAAGTTAGTAGAACTGACAACAGAACATATCATGTTCCGATTTTGTCTGATTTTTATTATTTCTTGTATTCGTGATATTTTAAACCAAGTTGGTGAGAACCAGCAACATCCAGCTACGTAGTGCATTATGCTAGACCTCAATCTTTCCTAAGTAGCTTTTCTTGGTTAAGTATACATCACTAAGGCTAAGATACTCGTCTAATTCACCAGCCTGTTCATATAGTGACTGAA ATTGTCAAATGATAGCTGTATGATACTACTACTACTATTAAAATTA CATTCATTCCACCGTGACTTTATTAGTTGTTCATAATAGCTTAAGCTACTGACCACTACTTTACTGAGTTTGTAACAAAAAATTGTTGAAAGTTGATTTT                                                                   ]
[+] EMBL CD088017             [ACAGTTTAACAGGCTGACATTTTGCTTCAATCATACAGTCAGTTATCTGCGATCAGTAGTACCAAAAGTTAGTAGAACTGACAACAGAACATATCATGTTCCGATTTTGTCTGATTTTTATTATTTCTTGTATTCGTGATATTTTAAACCAAGTTGGTGAGAACCAGCAACATCCAGCTACGTAGTGCATTATGCTAGACCTCAATCTTTCCTAAGTAGCTTTTCTTGGTTAAGTATACATCACTAAGGCTAAGATACTCGTCTAATTCACCAGCCTGTTCATATAGTGACTGAA ATTGTCAAATGATAGCTGTATGATACTACTACTACTATTAAAAATA CATTCATTCCACCGTGACTTTATTAGTTGTTCATAATAGCTTAAGCTACTGACCACTACTTTACTGAGTTTGTAACAAAAAATTGTTG                                                                               ]
[+] EMBL CD088005             [ACAGTTTAACAGGCTGACATTTTGCTTCAATCATACAGTCAGTTATCTGCGATCAGTAGTACCAAAAGTTAGTAGAACTGACAACAGAACATATCATGTTCCGATTTTGTCTGATTTTTATTATTTCTTGTATTCGTGATATTTTAAACCAAGTTGGTGAGAACCAGCAACATCCAGCTACGTAGTGCATTATGCTAGACCTCAATCTTTCCTAAGTAGCTTTTCTTGGTTCAGTATACATCACTAAGGCTAAGATACTCGTCTAATTCACCAGCCTGTCCATATAGTGACTGAA ATTGTCAAATGATAGCTGTATGATACTACTACTACTATTAAAAATACCTTTCATTCCACCGTGACTTCATTAGTTGTTCATAATAGCTTAAGCTACTGACCACTGCTTTACTGAGTTTGTAACAAAAA                                                                                      ]
[+] EMBL CD088030             [ACAGTTTAACAGGCTGACATTTTGCTTCAATCATACAGTCAGTTATCTGCGATCAGTAGTACCAAAAGTTAGTAGAACTGACAACAGAACATATCATGTTCCGATTTTGTCTGATTTTTATTACTTCTTGTATTCGTGATATTTTAAACCAAGTTGGTGAGAACCAGCAACATCCAGCTACGTAGTGCATTATGCTAGACCTCAATCTTTCCTAAGTAGCTTTTCTTGGTTAAGTATACATCACTAAGGCTAAGATACTCGTCTAATTCACCAGCCTGTTCATATACTGACTGAACATTGTCAAATGATAGCTGTATGATACTACTACTACTATTAAAAATA CATTCATTCC                                                                                                                                                             ]




>consensus_9802#0
ACAGTTTAACAGGCTGACATTTTGCTTCAATCATACAGTCAGTTATCTGCGATCAGTAGT
ACCAAAAGTTAGTAGAACTGACAACAGAACATATCATGTTCCGATTTTGTCTGATTTTTA
TTATTTCTTGTATTCGTGATATTTTAAACCAAGTTGGTGAGAACCAGCAACATCCAGCTA
CGTAGTGCATTATGCTAGACCTCAATCTTTCCTAAGTAGCTTTTCTTGGTTAAGTATACA
TCACTAAGGCTAAGATACTCGTCTAATTCACCAGCCTGTTCATATAGTGACTGAAATTGT
CAAATGATAGCTGTATGATACTACTACTACTATTAAAAATACATTCATTCCACCGTGACT
TTATTAGTTGTTCATAATAGCTTAAGCTACTGACCACTACTTTACTGAGTTTGTAACAAA
AAATTGTTGAAAGTTGATTTTCATTTTAACGCTCGTATTCACTGCAGACTTTATGTTTTA
TCGTTGATCATTACATATGCCATAGTCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)