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Schistosoma mansoni
cluster # 9840 cluster # 9840       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9840#0 length = 867 sequences # 11  

consensusID : consensus_9840#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 867
fasta sequence
                              [ACGCAAAAGTTCGGACTGTAACTACTCCATTCGGAAATCCATCAGGTGTTCTTACTGAAGGTTTTGTTAAAGGTGTCCCGTGTGTTGTGCTTCCCAGGCATGGAAAGGAACATTTACTGCTGCCAAGCGAGATCAATTATCGGGCCAACATTTGGGCGTTAAAAGAACTTGGGTG-TACTCACATATTAGCCACTAACGCTTGTGGTAGTCTGCAGAAAGACAAAAAACCTGGTGATTTCGTTGTTCTTAACCAGTTTTACGATAATACTCAAAATCGAGAGCTTACGTTTTATGGAAGTGGGCCTGGCTCACTGAAAGGAGTCTTACATATGCCGATGGCAGACCCATTTTGTGAAGAAACACGTCAGGTTTTAATCAAAGCAGCTAAAAATCTATCACTAACTATTCGTGATAAAACGTGTAGTTCAGATACAATTAGCAATCATCCGTGTGTGCATACTGAAGGTTCTGTAATTACTATTAATGGTCCACGTTTCTCAACTCGTTGCGAATCATTGTTATTTCAAAAATGGGGTTTCGATT-TGATCAATATGACATTAGTTCCTGAGGTTTCATTGGCTCGCGAAGCT-GGTTTAAGTTATGCTTCTATAGCAATTGTTACAGATTTCGATTGTTGGAAAGCAGATGAGGAACATGTCTGTGTTGATATGGGTTTTGGAACAGTTTCGTAAAAGTGTTGGTCAAGTTAGGGAAATCTTATTAGAAGCTGTGAGATTGATTGGTGCTTGTGACTGGACAAAAACTATTGAAGCAAATAAGGCGCTAGTGTTGAGCTCACGTCAAGACTTACTTCATCAAGGAAGTAATGACAAATAAATATGAGGTTAATTGGAATTTATTATCTGT]

[-] EMBL CD196969             [ACGCAAAAGTTCGGACTGTAACTACTCCATTCGGAAATCCATCAGGTGTTCTTACTGAAGGTTTTGTTAAAGGTGTCCCGTGTGTTGTGCTTCCCAGGCATGGAAAGGAACATTTACTGCTGCCAAGCGAGATCAATTATCGGGCCAACATTTGGGCGTTAAAAGAACTTGGGTG TACTCACATATTAGCCACTAACGCTTGTGGTAGTCTGCAGAAAGACAAAAAACCTGGTGATTTCGTTGTTCTTAACCAGTTTTACGATAATACTCAAAATTGAGAGCTTACGTTTTATGGAAGTGGGCCTGGCTCACTGAAAGGAGTCTTACATATGTCGATGGCAGACCCATTTTGTGAAGAAACACGTCAGGTTTTAATCAAAGCAGCTAAAAATCTATCACTAACTATTCGTGATAAAACGTGTAGTTCAGATACAATTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD171140             [                                                    TACTGGAGTTTTTGTTAAAGGTGTCCCGTGTGTTGTGCTTCCCAGGCATGGAAAGGAGCATTTACTGCTGCCAAGCGAGATCAATTATCGGGCCAACATTTGGGCGTTAAAAGAACTTGGGTGTTACTCACATATTAGCCACTAACGCTTGTGGTAGTCTGCAGAAAGACAAAAAACCTGGTGATTTCGTTGTTCTTAACCAGTTTTACGATAATACTCAAAATCGAGAGCTTACGTTTTATGGAAGTGGGCCTGGCTCACTGAAAGGAGTCTTACATATGCCGATGGCAGACCCATTTTGTGAAGAAACACGTCAGGTTTTAATCAAAGCAGCTAAAAATCTATCACTAACTATTCGTGATAAAACGTGTAGTTCAGATACAATTAGCAATCATCCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD121555             [                                                       TGAAGGTTTTGTTAAAGGTGTCCCGTGTGTTGTGCTTCCCAGGCATGGAAAGGAACATTTACTGCTGCCAAGCGAGATCAATTATCGGGCCAACATTTGGGCGTTAAAAGAACTTGGGTG TACTCACATATTAGCCACTAACGCTTGTGGTAGTCTGCAGAAAGACAAAAAACCTGGTGATTTCGTTGTTCTTAACCAGTTTTACGATAATACTCAAAATCGAGAGCTTACGTTTTATGGAAGTGGGCCTGGCTCACTGAAAGGAGTCTTACATATGCCGATGGCAGACCCATTTTGTGAAGAAACACGTCAGGTTTTTATCAAAGCAGCTAAAAATCTATCACTAACTATTCGTGATAAAACGTGTAGTTCAGATACAATTAGCAATCATCCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD121566             [                                                       TGAAGGTTTTGTTAAAGGTGTCCCGTGTGTTGTGCTTCCCAGGCATGGAAAGGAACATTTACTGCTGCCAAGCGAGATCAATTATCGGGCCAACATTTGGGCGTTAAAAGAACTTGGGTG TACTCACATATTAGCCACTAACGCTTGTGGTAGTCTGCAGAAAGACAAAAAACCTGGTGATTTCGTTGTTCTTAACCAGTTTTACGATAATACTCAAAATCGAGAGCTTACGTTTTATGGAAGTGGGCCTGGCTCACTGAAAGGAGTCTTACATATGCCGATGGCAGACCCATTTTGTGAAGAAACACGTCAGGTTTTAATCAAAGCAGCTAAAAATCTATCACTAACTACTCGTGATAAAACGTGTAGTTCAGATACAATTAGCAATCATCCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD171141             [                                                       TGAAGGTTTTGTTAAAGGTGTCCCGTGTGTTGTGCTTCCCAGGCATGGAAAGGAACATTTACTGCTGCCAAGCGAGATCAATTATCGGGCCAACATTTGGGCGTTAAAAGAACTTGGGTG TACTCACATATTAGCCACTAACGCTTGTGGTAGTCTGCAGAAAGACAAAAAACCTGGTGATTTCGTTGTTCTTAACCAGTTTTTCGATAATACTCAAAATCGAGAGCTTACGTTTTATGGAAGTGGGCCTGGCTCACTGAAAGGAGTCTTACATATGCCGATGGCAGACCCATTTTGTGAAGAAACACGTCAGGTTTTAATCAAAGCAGCTAAAAATCTATCACTAACTATTCGTGATAAAACGTGTAGTTCAGATACAATTAGCAATCATCCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD121499             [                                                       TGAAGGTTTTGTTAAAGGTGTCCCGTGTGTTGTGCTTCCCAGGCATGGAAAGGAACATTTACTGCTGCCAAGCGAGATCAATTATCGGGCCAACATTTGGGCGTTAAAAGAACTTGGGTG TACTCACATATTAGCCACTAACGCTTGTGGTAGTCTGCAGAAAGACAAAAAACCTGGTGATTTCGTTGTTCTTAACCAGTTTTACGATAATACTCAAAATCGAGAGCTTACGTTTTATGGAAGTGGGCCTGGCTCACTGAAAGGAGTCTTACATATGCCGATGGCAGACCCATTTTGTGAAGAAACACGTCAGGTTTTAATCAAAGCAGCTAAAAATCTATCACTAACTATTCGTGATAAAACGTGTAGTTCAGATACAATTAGCAATCATCCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD171170             [                                                       TGAAGGTTTTGTTAAAGGTGTCCCGTGTGTTGTGCTTCCCAGGCATGGAAAGGAACATTTACTGCTGCCAAGCGAGATCAATTATCGGGCCAACATTTGGGCGTTAAAAGAACTTGGGTG TACTCACATATTAGCCACTAACGCTTGTGGTAGTCTGCAGAAAGACAAAAAACCTGGTGATTTCGTTGTTCTTAACCAGTTTTACGATAATACTCAAAATCGAGAGCTTACGTTTTATGGAAGTGGGCCTGGCTCACTGAAAGGAGTCTTACATATGCCGATGGCAGACCCATTTTGTGAAGAAACACGTCAGGTTTTAATCAAAGCAGCTAAAAATCTATCACTAACTATTCGTGACAAAACGTGTAGTTCAGATACAATTAGCAATCATCCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD084101             [                                                                                                                                                                                         gaggGCCACTAACGCTTGTGGTAGTCTGCAGAAAGACAAAAAACCTGGTGATTTCGTTGTTCTTAACCAGTTTTACGATAATACTCAAAATCGAGAGCTTACGTTTTATGGAAGTGGGCCTGGCTCACTGAAAGGAGTCTTACATATGCCGATGGCAGACCCATTTTGTGAAGAAACACGTCAGGTTTTAATCAAAGCAGCTAAAAATCTATCACTAACTATTCGTGATAAAACGTGTAGTTCAGATACAATTAGCAATCATCCGTGTGTGCATACTGAAGGTTCTGTAATTACTATTAATGGTCCACGTTTCTCAACTCGTTGCGAATCATTGTTATTTCAAAAATGGGGTTTCGATT TGATCAATATGACATTAGTTCCTGAGGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD139587             [                                                                                                                                                                                                                                       GGTGATTTCGTTGTTCTTAACCAGTTTTACGATAATACTCAAAATCGAGAGCTTACGTTTTATGGAAGTGGGCCTGGCTCACTGAAAGGAGTCTTACATATGCCGATGGCAGACCCATTTTGTGAAGAAACACGTCAGGTTTTAATCAAAGCAGCTAAAAATCTATCACTAACTATTCGTGATANAACGTGTAGTTCAGATACAATTAGCAATCATCCGTGTGTGCATACTGAAGGTTCTGTAATTACTATTAATGGTCCACGTTTCTCAACTCGTTGCGAATCATTGTCATTTC AAAATGGGGGTTCGATTNNGATC ATATGACATTAGNTCCTGAGGGTTCATTGGCTCGCGAAGCTGGGTTAAAAGTATGC TCTATAGCAATTGGTACNGA                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD083732             [                                                                                                                                                                                                                                                     gCTT ACCAGTTTTACGATAATACTCAAAATCGAGAGCTTACGTTTTATGGAAGTGGGCCTGGCTCACTGAAAGGAGTCTTACATATGCCGATGGCAGACCCATTTTGTGAAGAAACACGTCAGGTTTTAATCAAAGCAGCTAAAAATCTATCACTAACTATTCGTGATAAAACGTGTAGTTCAGATACAATTAGCAATCATCCGTGTGTGCATACTGAAGGTTCTGTAATTACTATTAATGGTCCACGTTTTTCAACTCGTTGCGAATCATTGTTATTTCAAAAATGGGGTTTCGATT TGATCAATATGACATTAGTTCCTGAGGTTTCATTGGCTCGCGAAGCT GGTTTAAGTTATGCTTCTATAGCAATTGTTACAGATTTCGATTGTTGGAAAGCAGATGAGGAACATGTCTGTGTTGATATGGGTTTTGGAACAGTTTCGTAAAAGTGTTGGTCAAGTTAGGGAAATCTTATTAGAA                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD083892             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cataggCCGTGTGTGCATACTGAAGGTTCTGTAATTACTATTAATGGTCCACGTTTCTCAACTCGTTGCGAATCATTGTTATTTCAAAAATGGGGTTTCGATT TGATCAATATGACATTAGTTCCTGAGGTTTCATTGGCTCGCGAAGCT GGTTTAAGTTATGCTTCTATAGCAATTGTTACAGATTTCGATTGTTGGAAAGCAGATGAGGAACATGTCTGTGTTGATAT GGTTTTGGAACAGTTTCGTAAAAGTGTTGGTCAAGTTAGGGAAATCTTATTAGAAGCTGTGAGATTGATTGGTGCTTGTGACTGGACAAAAACTATTGAAGCAAATAAGGCGCTAGTGTTGAGCTCACGTCAAGACTTACTTCATCAAGGAAGTAATGACAAATAAATATGAGGTTAATTGGAATTTATTATCTGT]


>consensus_9840#0 ACGCAAAAGTTCGGACTGTAACTACTCCATTCGGAAATCCATCAGGTGTTCTTACTGAAG GTTTTGTTAAAGGTGTCCCGTGTGTTGTGCTTCCCAGGCATGGAAAGGAACATTTACTGC TGCCAAGCGAGATCAATTATCGGGCCAACATTTGGGCGTTAAAAGAACTTGGGTGTACTC ACATATTAGCCACTAACGCTTGTGGTAGTCTGCAGAAAGACAAAAAACCTGGTGATTTCG TTGTTCTTAACCAGTTTTACGATAATACTCAAAATCGAGAGCTTACGTTTTATGGAAGTG GGCCTGGCTCACTGAAAGGAGTCTTACATATGCCGATGGCAGACCCATTTTGTGAAGAAA CACGTCAGGTTTTAATCAAAGCAGCTAAAAATCTATCACTAACTATTCGTGATAAAACGT GTAGTTCAGATACAATTAGCAATCATCCGTGTGTGCATACTGAAGGTTCTGTAATTACTA TTAATGGTCCACGTTTCTCAACTCGTTGCGAATCATTGTTATTTCAAAAATGGGGTTTCG ATTTGATCAATATGACATTAGTTCCTGAGGTTTCATTGGCTCGCGAAGCTGGTTTAAGTT ATGCTTCTATAGCAATTGTTACAGATTTCGATTGTTGGAAAGCAGATGAGGAACATGTCT GTGTTGATATGGGTTTTGGAACAGTTTCGTAAAAGTGTTGGTCAAGTTAGGGAAATCTTA TTAGAAGCTGTGAGATTGATTGGTGCTTGTGACTGGACAAAAACTATTGAAGCAAATAAG GCGCTAGTGTTGAGCTCACGTCAAGACTTACTTCATCAAGGAAGTAATGACAAATAAATA TGAGGTTAATTGGAATTTATTATCTGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)