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Schistosoma mansoni
cluster # 9859 cluster # 9859       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9859#0 length = 907 sequences # 11  

consensusID : consensus_9859#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 907
fasta sequence
                              [CAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGGAGTGTATGAGAGTGTGGTATATAATTCGCATTGTTACGCTTATCTATTGGATTAGTGAAGCTGTCGTCTGTGACATGTGTTAACATG-AAGGAAATCAGAGGAGTATTGAATGCGTGTTGATTGTTTTGACGTTGGAGTTAATCAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGATGATTGATTTTGTAGTTCAGGTATTTGACTTACCTATTGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATGAGGATAATAAACGAGATTGTTGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTATTCCGAATGAACATCTACTGTGTATAGTTGGAGTGTATGAGAGTGTGGTATAGAATTCGCATTGTTACGCTTAGCTATTGGATTAGTGAAGCTGTCGTCTGTGACATGTGTTAACATGAAGGAAATCAGAGGAGTATTGAATGCGTGTTGATTGTTTTGACGTTGGAGTTAATCAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGATGATTGATTTTGTAGTTC]

[+] EMBL CD115846             [CAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGGAGTGTATGAGAGTGTGGTATATAATTCGCATTGTTACGCTTATCTATTGGATTAGTGAAGCTGTCGTCTGTGACATGTGTTAACATG AAGGAAATCAGAGGAGTATTGAATGCGTGTTGATTGTTTTGACGTTGGAGTTAATCAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGATGATTGATTTTGTAGTTCAGGTATTTGACTGACCTATCGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATGAGGATAATAAACGAGATTGTCGATTGACAGAGAATGCAC AAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGATTAACTGATATTTGAGATATATGCCTCCATGACTGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATATTGGAGAATGTATTTTGTCAAGTATTCCGAATGAACATCTACTGCGTATAGCTGGAGTGTTTGAccatg                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD194886             [                                                                                                                                            gTAACAGGAAAGGAAATCAGAGGAGTATTGAATGCGTGTTGATTGTTTTGACGTTGGAGTTAATCAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGATGATTGATTTTGTAGTTCAGGTATTTGACTTACCTATTGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATGAGGATAATAAACGAGATTGTTGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTATTCCGAATGAACATCTACTGTGTATAGTTGGAGTGTATGAGAGTGTGGTATAGAATTCGCATTGTTACGCTTAGCTATTGGATTAGTGAAGCTGTCGT                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD164643             [                                                                                                                                                                               GTGTTGATTGTTTTGACGTTGGAGTTAATCAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGATGATTGATTTTGTAGTTCAGGTATTTGACTTACCTATTGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATGAGGATAATAAACGAGATTGTTGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD164747             [                                                                                                                                                                               GTGTTGATTGTTTTGACGTTGGAGTTAATCAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGATGATTGATTTTGTAGTTCAGGTATTTGACTTACCTATTGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATGAGGATAATAAACGAGATTGTTGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD164693             [                                                                                                                                                                               GTGTTGATTGTTTTGACGTTGGAGTTAATCAAACCGATAATGGATGACATGTAAGATGGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGCAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGGGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTAAGATGATTGATTTTGTAGTTCAGGTATTTGACTTACCTATTGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATGAGGATAATAAACGAGATTGTTGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD153924             [                                                                                                                                                                                                            CAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGATGATTGATTTTGTAGTTCAGGTATTTGACTTACCTATTGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATGAGGATAATAAACGAGATTGTTGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTATTCCGAATGAACATCTACTGTGTATAGTTGGAGTGTATGAGAGTGTGGTATAGAATTCGCATTGTTACGCTTAGCTATTGGATTAGTGAAGCTGTCGTCTGTGACATGTGTTAACATGAAGGAAATCAGAGGAGTAT                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD154129             [                                                                                                                                                                                                            CAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGATGATTGATTTTGTAGTTCAGGTATTTGACTTACCTATTGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATGAGGATAATAAACGAGATTGTTGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTATTCCGAATGAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD154069             [                                                                                                                                                                                                            CAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGATGATTGATTTTGTAGTTCAGGTATTTGACTTACCTATTGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATGAGGATAATAAACGAGATTGTTGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTATTCCGAATGAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD085587             [                                                                                                                                                                                                                                                                              TGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGACGATTGATTTTGTAGTTCAGGTATTTGACTTACCTATTGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATGAGGATAATAAACGAGATTGTTGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTATTCCGAATGAACATCTACTGTGTATAGTTGGAGTGTATGAGAGTGTGGTATAGAATTCGCATTGTTACGCTTAGCTATTGGATTAGTGAAGCTGTCGTCTGTGACATGTGTTAACAT                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD116837             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTTGACTTACCTATTGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATGAGGATAATAAACGAGATTGTTGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTATTCCGAATGAACATCTACTGTGTATAGTTGGAGTGTATGAGAGTGTGGCATAGAATTCGCATTGTTACGCTTAGCTATTGGATTAGTGAAGCTGTCGTCTGTGACATGTGTTAACATGAAGGAAATCAGAGGAGTATTGAATGCGTGTTGATTGTTTTGACGTTGGAGTTAATCAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGATGATTGATTTTGTAGTTC]
[+] EMBL CD152131             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGGAT ATAAACGAGATTGTCGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTATTCCGAATGAACATCTACTGTGTACAGTTGGAGTGTATGAGAGTGTGGTATAGAATTCGCATTGTTACGCTTAGCTATTGGATTAGTGAAGCTGTCGTCTGTGACATGTGTTAACATGAAGGAAATCAGAGGAGTATTGAATGCGTGTTGATTGTTTTGACGTTGGAGTTAATCAAACCG                                                                                                                                                    ]


>consensus_9859#0 CAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATG GAGTGTATGAGAGTGTGGTATATAATTCGCATTGTTACGCTTATCTATTGGATTAGTGAA GCTGTCGTCTGTGACATGTGTTAACATGAAGGAAATCAGAGGAGTATTGAATGCGTGTTG ATTGTTTTGACGTTGGAGTTAATCAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTAT GGACGACATGATGAAAGTAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGT ATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGATGATTGATTTTGTAGTTCAG GTATTTGACTTACCTATTGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATG AGGATAATAAACGAGATTGTTGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGG GAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATG GAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTATTCCGAATGAACATCTACTGT GTATAGTTGGAGTGTATGAGAGTGTGGTATAGAATTCGCATTGTTACGCTTAGCTATTGG ATTAGTGAAGCTGTCGTCTGTGACATGTGTTAACATGAAGGAAATCAGAGGAGTATTGAA TGCGTGTTGATTGTTTTGACGTTGGAGTTAATCAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAA TGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATT GTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGATGATTGATTTT GTAGTTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)