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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9877#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 667 fasta sequence
[CCAGCCAANATTTGGCACGAGGCCATTGACTAATTGTTATCCAGTATAAATATATATATCACTTAAAGCCTTCATATCTCTTTCAATATAGATTTCCATGCTTCTGATACTGTT-ATTGTTGTTGATTAGG-TTTTTTTTCTTTTACTGTAC-AGCTGCTTTCTTCATAAGCATATTGAATTTCAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCTTTGTGTTTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTAAATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAATCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAATACCACAAAATATTTATCCGTAAATTCTTTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA-TAAAAGGAGAT--AATCTCTCAAAG-ACTTTGAAAGGGCTTATTCAGTNNNCTGACTGTAAAGAATAACCCAATATCTATTTATATAGATNNGTATATGTATCAATTTTTTAAACAANTATTAACCATTGAAAATT]
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[-] EMBL CD073918 [ gATTGACTAATTGTTATCCAGTATAAATATATATATCACTTAAAGCCTTCATATCTCTTTCAATATAGATTTCCATGCTTCTGATACTGTT ATTGTTGTTGATTAGG TTTTTTTTCTTTTACTGTAC AGCTGCTTTCTTCATAAGCATATTGAATTTCAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCTTTGTGTTTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTAAATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAATCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAATACCACAAAATATTTATCCGTAAATTCTTTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA TAAAAGGAGAT AATCTCTCAAAG ACTTTGAAA GGC TATTCAGT CTGACTGTAAAG ATAA CAATATCTA TATATAGAT GTATATGTATC ATTTTTTAAACAA TATTAACCATTGAAAt ]
[-] EMBL CD136832 [ TATAGATTTCCATGCTTCTGATACTGTT ATTGTTGTTGATTAGG TTTTTTTTCTTTTACTGTAC AGCTGCTTTCTTCATAAGCATATTGAATTTCAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCTTTGTGTTTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTAAATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAATCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAATACCACAAAATATTTATCCGTAAATTCTTTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA TAAAAGGAGAT AATCTCTCAAAG ACTATGAAGGG ]
[-] EMBL CD137030 [ TATAGATTTCCATGCTTCTGATACTGTT ATTGTTGTTGATTAGG TTTTTTTTCTTTTACTGTAC AGCTGCTTTCCTCATAAGCATATTGAATTTCAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCTTTGTGTTTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTAAATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAATCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAATACCACAAAATATTTATCCGTAAATTCTTTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA TAAAAGGAGAT AATCT ]
[-] EMBL CD136970 [ TATAGATTTCCATGCTTCTGATACTGTT ATTGTTGTTGATTAGG TTTTTTTTCTTTTACTGTAC AGCTGCTTTCTTCATAAGCATATTGAATTTCAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCTTTGTGTTTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTAAATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAATCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAATACCACAAAATATTTATCCGTAAATTCTTTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA TAAAAGGAGAT AATCT ]
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[-] EMBL CD136849 [ TATAGATTTCCATGCTTCTGATACTGTT ATTGTTGTTGATTAGG TTTTATTCTTTTACTGTAC AGCTGCTTTCTTCATAAGCATATTGAATTTCAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCTTTGTGTTTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTAAATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAATCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAATACCACAAAATATTTATCCGTAAATTCTTTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA TAAAAGGAGAT AATCT ]
[-] EMBL CD136973 [ ATAGATTTCCATGCTTCTGATACTGTT ATTGTTGTTGATTAGG TTTTTTTTCTTTTACTGTAC AGCTGCTTTCTTCATAAGCATATTGAATTTCAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCTTTGTGTTTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTAAATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAATCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAATACCACAAAATATTTATCCGTAAATTCTTTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA TAAAAGGAGAT AATCT ]
[-] EMBL CD136661 [ atTAGATTTCCACGCTTCTGA ACTGTTAATTGTTGTTGAATAGG TTTTTTTTCTTTTACTG ACAAGCTGCTTTCTTCATAAGCATATTGAATTTCAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCCTTGTGTTTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTAAATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAATCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAATACCACAAAATATTTATCCGTAAATTCTTTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA TAAAAGGAGAT AATCT ]
[-] EMBL CD136657 [ AGATTTCCATGCTTCTGATCCTGTT ATTGTTGTTGATTAGGTTTTTTTTTCTTTTACTGTAC AGCTGCTTTCTTCATAAGCATATTGAATTTCAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCTTTGTGTTTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTAAATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAATCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAATACCACAAAATATTTATCCGTAAATTCTTTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA TAAAAGGAGAT AATCT ]
[+] EMBL CD136749 [ AATTTCAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCTTTGTGTCTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTAAATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAATCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAATACCACAAAATATTTATCCGTAAATTC TTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA TAAAAGGAGAT AATC ]
[-] EMBL CD136733 [ TTCTTAACCCCTA TTC TCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA TAAAAGGAGAT AATCT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||