cluster # 9881

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Schistosoma mansoni
cluster # 9881 cluster # 9881 Sequences # 12 consensus # 3

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consensus_9881#0 length = 880 sequences # 5

consensus_9881#1 length = 813 sequences # 4
consensus_9881#2 length = 599 sequences # 3

consensusID : consensus_9881#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 880
fasta sequence

                              [TTTGGATATCAGTAAATCATCAGTTGCTGGTGCTGCTCCAGGTCCAGATTGGGCGTATGGGCGCAAATTACATGGTCGACTGNTCAATACAGTCGATGGTAAACTACTTAAAGTAGTTTATCAAACTANAATTAAACAGTTTTTATCTCCAAAAGAATTTCATGACTTAAGTAGATTAGAAACCCTGCCTTTTACGGACAAGTCCGATGATAATGTGTCATCCGTTAATGATTGGCCAGTTTATGTAGAGTTAACAAATGGTGAAATTTATGGATGTGATTTAGTTGTAAGTGCAGTTGGCGTTGAAGCAAATTTAAAACCATTAAACAGACTTTCTAGCAACGTGGATAATACTACTCATAATGATGGTAATACTAATAATATTAATAATAAAGGAACTGAGATCACAGAGTCATCTAACTTAAATGCTTTGTTTCGTTGCGCCCCTATGGAACATGGTGGTGGTCTGTTAGTAAATGAACAAATGGAAACAAGTTGGAAAGATGTGAATGCAGCTGGAGACTGTGCATATGCCAATTGGACATGGTCTCCACATTGGTTTCAAATGAAATTATGGAGTCAAGCTAGACAAATGGGATTTCAAGCTGCCAAGTCTATGTTTTGTCATAGTCAAGGAGACCACAATATCCCGCTGGATTTTTCTTTCGAACTTTTCACTCATGTGACTTACTTTTTTGGATTTAAGATTGTTCTCTTGGGTCGTTTCAACGGTCANGGTATGGATCTATCCGCACCAGATACTTATCTTTTAATGCGTGTTACACGTGGACGAGAATTCATCANATGTATCATGCAATCGGGTCGTATGCAAGGCGCAATATTAATTGGAGAGACTGATTTAGAAGAAACTNTAGAANAT]

[-] EMBL CD146807             [TTTGGATATCAGTAAATCATCAGTTGCTGGTGCTGCTCCAGGTCCAGATTGGGCGTATGGGCGCAAATTACATGGTCGACTGNTCAATACAGTCGATGGTAAACTACTTAAAGTAGTTTATCAAACTANAATTAAACAGTTTTTATCTCCAAAAGAATTTCATGACTTAAGTAGATTAGAAACCCTGCCTTTTACGGACAAGTCCGATGATAATGTGTCATCCGTTAATGATTGGCCAGTTTATGTAGAGTTAACAAATGGTGAAATTTATGGATGTGATTTAGTTGTAAGTGCAGTTGGCGTTGAAGCAAATTTAAAACCATTAAACAGACTTTCTAGCAACGTGGATAATACTACTCATAATGATGGTAATACTAATAATATTAATAATAAAGGAACTGAGATCACAGAGTCATCTAACTTAAATGCTTTGTTTCGTTGCGCCCCTATGGAACATGGTGGTGGTCTGTTAGTAAATGAACAAATGGAAACAAGTTGGAAAGATGTGAATGCAGCTGGAGACTGTGCATATGCCAATTGGACATGGTCTCCACATTGGTTTCAAATGAAATTATGGAGTCAAGCTAGACAAATGGGATTTCAAGCTGCCAAGTCTATGTTTTGTCATAGTCAAGGAGACCA                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD077961             [                                  GCTCCAGGTTCAGATTGGGCGTATGGGCGCAAATTACATGGTCGACTTGTCAATACAGTCGATGGTAAACTACTTAAAGTAGTTTATCAAACTAAAATTAAACAGTTTTTATCTCCAAAAGAATTTCATGACTTAAGTAGATTAGAAACCCTGCCTTTTACGGACAAGTCCGATGATAATGTGTCATCCGTTAATGATTGGCCAGTTTATGTAGAGTTAACAAATGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD080007             [                                                                                                                                                          GAATTTCATGACTTAAGTAGATTAGAAACCCTGCCTTTTACGGACAAGTCCGATGATAATGTGTCATCCGTTAATGATTGGCCAGTTTATGTAGAGTTAACAAATGGTGAAATTTATGGATGTGATTTAGTTGTAAGTGCAGTTGGCGTTGAAGCAAATTTAAAACCATTAAACAGACTTTCTAGCAACGTGGATAATACTACTCATAATGATGGTAATACTAATA  ATTAATAATAAAGGAACTGAGATCACAGAGTCATCTAACTTAAATGCTTTGTTTCGTTGCGCCCCTATGGAACATGGTGGTGGTCTGTTAGTAAATGAACAAATGGAAACAAGTTGGAAAGATGTGTATGCAGCTGGAGACTGTGCATATGCCAATTGGACATGGTCTCCACATTGGTTTCAAATGAAATTATGGAGTCAAGCTAGACAAATGGGATTTCAAGCTGCCAAGTCTATGTTTTGTCATAGTCAAGGAGACCACAATATCCCGCTGGATTTTTCTTTCGAACTTTTCACTCATGTGACTTACTTTTTTGGATTTAAGATTGTTCTCTTGGGTCGTTTCAACGGTCANGGTATGGATCTATCCGCACCAGATACTTATCTTTTAATGCGTGTTACACGTGGACGAGAATTCATCANATGTATCATGCAATCGGGTCGTATGCAAGGCGCAATATTAATTGG                               ]
[-] EMBL CD146817             [                                                                                                                                                                                                          TCCGATGATAATGTGTCATCCGTTAATGATTGGCCAGTTTATGTAGAGTTAACAAATGGTGAAATTTATGGATGTGATTTAGTTGTAAGTGCAGTTGGCGTTGAAGCAAATTTAAAACCATTAAACAGACTTTCTAGCAACGTGGATAATACTACTCATAATGATGGTAATACTAATAATATTAATAATAAAGGAACTGAGATCACAGAGTCATCTAACTTAAATGCTTTGTTTCGTTGCGCCCCTATGGAACATGGTGGTGGTCTGTTAGTAAATGAACAAATGGAAACAAGTTGGAAAGATGTGAATGCAGCTGGAGACTGTGCATATGCCAATTGGACATGGTCTCCACATTGGTTTCAAATGAAATTATGGAGTCAAGCTAGACAAATGGGATTTCAAGCTGCCAAGTCTATGTTTTGTCATAGTCAAGGAGACCA                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD082832             [                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGTAAGTGCAGTTGGCGTTGAAGCAAATTTAAAACCATTAAACAGACTTTCTAGCAACGTGGATAATACTACTCATAATGATGGTAATACTAATAATATTAATAATAAAGGAACTGAGATCACAGAGTCATCTAACTTAAATGCTTTGTTTCGTTGCGCCCCTATGGAACATGGTGGTGGTCTGTTAGTAAATGAACAAATGGAAACAAGTTGGAAAGATGTGTATGCAGCTGGAGACTGTGCATATGCCAATTGGACATGGTCTCCACATTGGTTTCAAATGAAATTATGGAGTCAAGCTAGACAAATGGGATTTCAAGCTGCCAAGTCTATGTTTTGTCATAGTCAAGGAGACCACAATATCCCGCTGGATTTTTCTTTCGAACTTTTCACTCATGTGACTTACTTTTTTGGATTTAAGATTGTTCTCTTGGGTCGTTTCAACGGTCAGGGTATGGATCTATCCGCACCAGATACTTATCTTTTAATGCGTGTTACACGTGGACGAGAATTCATCAAATGTATCATGCAATCGGGTCGTATGCAAGGCGCAATATTAATTGGAGAGACTGATTTAGAAGAAACTNTAGAANAT]




>consensus_9881#0
TTTGGATATCAGTAAATCATCAGTTGCTGGTGCTGCTCCAGGTCCAGATTGGGCGTATGG
GCGCAAATTACATGGTCGACTGNTCAATACAGTCGATGGTAAACTACTTAAAGTAGTTTA
TCAAACTANAATTAAACAGTTTTTATCTCCAAAAGAATTTCATGACTTAAGTAGATTAGA
AACCCTGCCTTTTACGGACAAGTCCGATGATAATGTGTCATCCGTTAATGATTGGCCAGT
TTATGTAGAGTTAACAAATGGTGAAATTTATGGATGTGATTTAGTTGTAAGTGCAGTTGG
CGTTGAAGCAAATTTAAAACCATTAAACAGACTTTCTAGCAACGTGGATAATACTACTCA
TAATGATGGTAATACTAATAATATTAATAATAAAGGAACTGAGATCACAGAGTCATCTAA
CTTAAATGCTTTGTTTCGTTGCGCCCCTATGGAACATGGTGGTGGTCTGTTAGTAAATGA
ACAAATGGAAACAAGTTGGAAAGATGTGAATGCAGCTGGAGACTGTGCATATGCCAATTG
GACATGGTCTCCACATTGGTTTCAAATGAAATTATGGAGTCAAGCTAGACAAATGGGATT
TCAAGCTGCCAAGTCTATGTTTTGTCATAGTCAAGGAGACCACAATATCCCGCTGGATTT
TTCTTTCGAACTTTTCACTCATGTGACTTACTTTTTTGGATTTAAGATTGTTCTCTTGGG
TCGTTTCAACGGTCANGGTATGGATCTATCCGCACCAGATACTTATCTTTTAATGCGTGT
TACACGTGGACGAGAATTCATCANATGTATCATGCAATCGGGTCGTATGCAAGGCGCAAT
ATTAATTGGAGAGACTGATTTAGAAGAAACTNTAGAANAT

consensusID : consensus_9881#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 813
fasta sequence

                              [CCTCCGAGCCAAGAATTGGGCACGAGGACATCACAGAGTCATCTAACTTAAATGCTTTGTTTCGTTGCGCCCCTATGGAACATGGTGGTGGTCTGTTAGTAAATGAACAAATGGAAACAAGTTGGAAAGATGTGTATGCAGCTGGAGACTGTGCATATGCCAATTGGACATGGTCTCCACATTGGTTTCAAATGAAATTATGGAGTCAAGCTAGACAAATGGGATTTCAAGCTGCCAAGTCTATGTTTTGTCATAGTCAAGGAGACCACAATATCCCGCTGGATTTTTCTTTCGAACTTTTCACTCATGTGACTTACTTTTTTGGATTTAAGATTGTTCTCTTGGGTCGTTTCAACGGTCAGGGTATGGATCTATCCGCACCAGATACTTATCTTTTAATGCGTGTTACACGTGGACGAGAATTCATCAAATGTATCATGCAATCGGGTCGTATGCAAGGCGCAATATTAATTGGAGAGACTGATTTAGAAGAAACTTTAGAAAATTTAATTTTAAATCAAATTGATTTGACTAATTTAGAAGATCGTCTTCTTGACCCAGACATTGATTTATCAGATTATTTCGATTAGTAATCTACAATGGGCTCCATTTCTGCTTATATGTATATATATTTATTTTTATGTATGTTACCAATTCGTGTGAATAATTTCTTTGGTTTCCTGTATGCATAAGTATGTGACTATCAGCAGAATAGTAGTTAATTGGTCATGTATATATACACAGAATTAACATCCCATTATGTATGCGTGTGATTAAATAAACTACAAATTGTAATGATTGCTTTAATACAAT]

[+] EMBL CD081368             [CCTCCGAGCCAAGAATTGGGCACGAGGACATCACAGAGTCATCTAACTTAAATGCTTTGTTTCGTTGCGCCCCTATGGAACATGGTGGTGGTCTGTTAGTAAATGAACAAATGGAAACAAGTTGGAAAGATGTGTATGCAGCTGGAGACTGTGCATATGCCAATTGGACATGGTCTCCACATTGGTTTCAAATGAAATTATGGAGTCAAGCTAGACAAATGGGATTTCAAGCTGCCAAGTCTATGTTTTGTCATAGTCAAGGAGACCACAATATCCCGCTGGATTTTTCTTTCGAACTTTTCACTCATGTGACTTACTTTTTTGGATTTAAGATTGTTCTCTTGGGTCGTTTCAACGGTCAGGGTATGGATCTATCCGCACCAGATACTTATCTTTTAATGCGTGTTACACGTGGACGAGAATTCATCAAATGTATCATGCAATCGGGTCGTATGCAAGGCGCAATATTAATTGGAGAGACTGATTTAGAAGAAACTTTAGAAAATTTAATTTTAAATCAAATTGATTTGACTAATTTAGAAGATCGTCTTCTTGACCCAGACATTGATTTATCAGATTATTTCGATTAGTAATCTACAATGGGCTCCATTTCTGCTTATATGTATATATATTTATTTTTATGCATGTTACCAATTCGTGTGAATAATTTCTTTGGTTTCCTGTATGCATAAGTATGTGACTATCAGCAGAATAGTAGTTAATTGGTCATGTATATATACACAGAATTAACATCCCATTATGTATGCGTGTGATTAAATAAc                               ]
[-] EMBL CD075202             [                                                                                                                                  TGTGTATGCAGCTGGAGACTGTGCATATGCCAATTGGACATGGTCTCCACATTGGTTTCAAATGAAATTATGGAGTCAAGCTAGACAAATGGGATTTCAAGCTGCCAAGTCTATGTTTTGTCATAGTCAAGGAGACCACAATATCCCGCTGGATTTTTCTTTCGAACTTTTCACTCATGTGACTTACTTTTTTGGATTTAAGATTGTTCTCTTGGGTCGTTTCAACGGTCAGGGTATGGATCTATCCGCACCAGATACTTATCTTTTAATGCGTGTTACACGTGGACGAGAATTCATCAAATGTATCATGCAATCGGGTCGTATGCAAGGCGCAATATTAATTGGAGAGACTGATTTAGAAGAAACTTTAGAAAATTTAATTTTAAATCAAATTGATTTGACTAATTTAGAAGATCGTCTTCTTGACCCAGACATTGATTTATCAGATTATTTCGATTAGTAATCTACAATGGGCTCCATTTCTGCTTATATGTATATATATTTATTTTTATGTATGTTACCAATTCGTGTGAATAATTTCTTTGGTTTCCTGTATGCATAAGTATGTGACTATCAGCAGAATAGTAGTTAATTGGTCATGTATATATACACAGAATTAACATCACATTATGTATGCGTGTGATTAAATAAACT                             ]
[-] EMBL CD076306             [                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTGGATTTTTCTTTCGAACTTTTCACTCATGTGACTTACTTTTTTGGATTTAAGATTGTTCTCTTGGGTCGTTTCAACGGTCAGGGTATGGATCTATCCGCACCAGATACTTATCTTTTAATGCGTGTTACACGTGGACGAGAATTCATCAAATGTATCATGCAATCGGGTCGTATGCAAGGCGCAATATTAATTGGAGAGACTGATTTAGAAGAAACTTTAGAAAATTTAATTTTAAATCAAATTGATTTGACTAATTTAGAAGATCGTTTTCTTGACCCAGACATTGATTTATCAGATTATTTCGATTAGTAATTTACAATGGGCTCCATTTCTGCTTATATGTATATATATTTATTTTTATGTATGTTACCAATTCGTGTGAATAATTTCTTTGGTTTCCTGTATGCATAAGTATGTGACTATCAGCAGAATAGTAGTTAATTGGTCATGTATATATACACAGAATTAACATCACATTATGTATGCGTGTGATTAAATAAACTACAAATTGTAATGATTGCTTTAATACAAT]
[-] EMBL CD076421             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CATCAAATGTATCATGCAATCGGGTCGTATGCAAAGCGCCATATTAATTGGAGAGACTGATTTAGAAGAAACTTTAGAAAATTTAATTTTAAATCAAATTGATTTGACTAATTTAGAAGATTGTTTTCTTGACCCAGACATTGATTTATCAGATTATTTCGATTAGTAATTTACAATGGGCTCCATTTCTGCTTATATGTATATATATTTATTTTTAAGTATGTTACCAATTCGTGTGAATAATTTCTTTGGTTTCCTGTATGCATAAGTATGTGACTATCAGCAGAATAGTAGTTAATTGGTCATGTATATATACACAGAATTAACATCCCATTATGTATGCGTGTGATTAAATAAACTACAAATTGTAATGATTGCTTTAATACAAT]




>consensus_9881#1
CCTCCGAGCCAAGAATTGGGCACGAGGACATCACAGAGTCATCTAACTTAAATGCTTTGT
TTCGTTGCGCCCCTATGGAACATGGTGGTGGTCTGTTAGTAAATGAACAAATGGAAACAA
GTTGGAAAGATGTGTATGCAGCTGGAGACTGTGCATATGCCAATTGGACATGGTCTCCAC
ATTGGTTTCAAATGAAATTATGGAGTCAAGCTAGACAAATGGGATTTCAAGCTGCCAAGT
CTATGTTTTGTCATAGTCAAGGAGACCACAATATCCCGCTGGATTTTTCTTTCGAACTTT
TCACTCATGTGACTTACTTTTTTGGATTTAAGATTGTTCTCTTGGGTCGTTTCAACGGTC
AGGGTATGGATCTATCCGCACCAGATACTTATCTTTTAATGCGTGTTACACGTGGACGAG
AATTCATCAAATGTATCATGCAATCGGGTCGTATGCAAGGCGCAATATTAATTGGAGAGA
CTGATTTAGAAGAAACTTTAGAAAATTTAATTTTAAATCAAATTGATTTGACTAATTTAG
AAGATCGTCTTCTTGACCCAGACATTGATTTATCAGATTATTTCGATTAGTAATCTACAA
TGGGCTCCATTTCTGCTTATATGTATATATATTTATTTTTATGTATGTTACCAATTCGTG
TGAATAATTTCTTTGGTTTCCTGTATGCATAAGTATGTGACTATCAGCAGAATAGTAGTT
AATTGGTCATGTATATATACACAGAATTAACATCCCATTATGTATGCGTGTGATTAAATA
AACTACAAATTGTAATGATTGCTTTAATACAAT

consensusID : consensus_9881#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 599
fasta sequence

                              [CTCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGTGTAAGTGCAGTTGGCGTTGAAGCAAATTTAAAACCATTAAACAGACTTTCTAGCAGCGTGGATAATACTACTCATAATGATGGTAATACTAATAATATTAATAATAAAGGAACTGAGATCACAGAGTCATCTAACTTAAATGCTTTGTTTCGTTGCGCCCCTATGGAACATGGTGGTGGTCTGTTAGTAAATGAACAAATGGAAACAAGTTGGAAAGATGTGTATGCAGCTGGAGACTGTGCATATGCCAATTGGACATGGTCTCCACATTGGTTTCAAATGAAATTATGGAGTCAAGCTAGACAAATGGGATTTCAAGCTGCC-AGTCTATGTTTTGTCATAGTCAAGGAGACCACAATATCCCGCTGGATTTTTCTTCCGAACTTTTCACTCATGTGACTTACTTTTTTGGATTTAAGATTGTTCTCTTGGGTCGTTTCAACGGTCAGGGTATGGATCTATCCGCACCAGATACTTATCTTTTAATGCGTGTTACACGTGGACGAGAATTCATCANATGTATNCATGCATCGGGTCGTATGCAANGGCGCATATTAATTGGAGAGACTGATT]

[+] EMBL CD082716             [CTCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGTGTAAGTGCAGTTGGCGTTGAAGCAAATTTAAAACCATTAAACAGACTTTCTAGCAGCGTGGATAATACTACTCATAATGATGGTAATACTAATAATATTAATAATAAAGGAACTGAGATCACAGAGTCATCTAACTTAAATGCTTTGTTTCGTTGCGCCCCTATGGAACATGGTGGTGGTCTGTTAGTAAATGAACAAATGGAAACAAGTTGGAAAGATGTGTATGCAGCTGGAGACTGTGCATATGCCAATTGGACATGGTCTCCACATTGGTTTCAAATGAAATTATGGAGTCAAGCTAGACAAATGGGATTTCAAGCTGCCAAGTCTATGTTTTGTCATAGTCAAGGAGACCACAATATCCCGCTGGATTTTTCTTTCGAACTTTTCACTCATGTGACTTACTTTTTTGGATTTAAGATTGTTCTCTTGGGTCGTTTCAACGGTCAGGGTATGGATCTATCCGCACCAGATACTTATCTTTTAATGCGTGTTACACGTGGACGAGAATTCATCANATGTATNCATGCATCGGGTCGTATGCAANGGCGCATATTAATTGGAGAGACTGATT]
[+] EMBL CD149726             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTAGACAAATGGGATTTCAAGCTGCC AGTCTATGTTTTGTCATAGTCAAGGAGACCACAATATCCCGCTGGATTTTTCTTCCGAACTTTTCACTCATGTGACTTACTTTTTTGGATTTAAGATTGTTCTCTTGGGTCGTTTCAACGGTCAGGGTATGGATCTATCCGCACCAGATACTTATCTTTTAAT                                                                                      ]
[+] EMBL CD149704             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTAGACAAATGGGATTTCAAGCTGCC AGTCTATGTTTTGTCATAGTCAAGGAGACCACAATATCCCGCTGGATTTTTCTTCCGAACTTTTCACTCATGTGACTTACTTTTTTGGACTTAAGACTGCTCTCTTGGGTCGATTCAACGGTCAGGGTATGGATCTATCCGCACCAGATACTTATCTTTTAAT                                                                                      ]




>consensus_9881#2
CTCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGTGTAAGTGCAGTTGGCGTTGAAGCAAATTTAAAAC
CATTAAACAGACTTTCTAGCAGCGTGGATAATACTACTCATAATGATGGTAATACTAATA
ATATTAATAATAAAGGAACTGAGATCACAGAGTCATCTAACTTAAATGCTTTGTTTCGTT
GCGCCCCTATGGAACATGGTGGTGGTCTGTTAGTAAATGAACAAATGGAAACAAGTTGGA
AAGATGTGTATGCAGCTGGAGACTGTGCATATGCCAATTGGACATGGTCTCCACATTGGT
TTCAAATGAAATTATGGAGTCAAGCTAGACAAATGGGATTTCAAGCTGCCAGTCTATGTT
TTGTCATAGTCAAGGAGACCACAATATCCCGCTGGATTTTTCTTCCGAACTTTTCACTCA
TGTGACTTACTTTTTTGGATTTAAGATTGTTCTCTTGGGTCGTTTCAACGGTCAGGGTAT
GGATCTATCCGCACCAGATACTTATCTTTTAATGCGTGTTACACGTGGACGAGAATTCAT
CANATGTATNCATGCATCGGGTCGTATGCAANGGCGCATATTAATTGGAGAGACTGATT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9881#0      TTTGGATATCAGTAAATCATCAGTTGCTGGTGCTGCTCCAGGTCCAGATTGGGCGTATGG 60
consensus_9881#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9881#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9881#0      GCGCAAATTACATGGTCGACTGNTCAATACAGTCGATGGTAAACTACTTAAAGTAGTTTA 120
consensus_9881#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9881#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9881#0      TCAAACTANAATTAAACAGTTTTTATCTCCAAAAGAATTTCATGACTTAAGTAGATTAGA 180
consensus_9881#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9881#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9881#0      AACCCTGCCTTTTACGGACAAGTCCGATGATAATGTGTCATCCGTTAATGATTGGCCAGT 240
consensus_9881#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9881#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9881#0      TTATGTAGAGTTAACAAATGGTGAAATTTATGGATGTGATTTAGTTGTAAGTGCAGTTGG 300
consensus_9881#2      --------------------CTCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGTGTAAGTGCAGTTGG 40
consensus_9881#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9881#0      CGTTGAAGCAAATTTAAAACCATTAAACAGACTTTCTAGCAACGTGGATAATACTACTCA 360
consensus_9881#2      CGTTGAAGCAAATTTAAAACCATTAAACAGACTTTCTAGCAGCGTGGATAATACTACTCA 100
consensus_9881#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9881#0      TAATGATGGTAATACTAATAATATTAATAATAAAGGAACTGAGATCACAGAGTCATCTAA 420
consensus_9881#2      TAATGATGGTAATACTAATAATATTAATAATAAAGGAACTGAGATCACAGAGTCATCTAA 160
consensus_9881#1      --------------CCTCCGAGCCAAGAATTGGGCACGAGGACATCACAGAGTCATCTAA 46
                                    *     *    *  * *         ** *****************

consensus_9881#0      CTTAAATGCTTTGTTTCGTTGCGCCCCTATGGAACATGGTGGTGGTCTGTTAGTAAATGA 480
consensus_9881#2      CTTAAATGCTTTGTTTCGTTGCGCCCCTATGGAACATGGTGGTGGTCTGTTAGTAAATGA 220
consensus_9881#1      CTTAAATGCTTTGTTTCGTTGCGCCCCTATGGAACATGGTGGTGGTCTGTTAGTAAATGA 106
                      ************************************************************

consensus_9881#0      ACAAATGGAAACAAGTTGGAAAGATGTGAATGCAGCTGGAGACTGTGCATATGCCAATTG 540
consensus_9881#2      ACAAATGGAAACAAGTTGGAAAGATGTGTATGCAGCTGGAGACTGTGCATATGCCAATTG 280
consensus_9881#1      ACAAATGGAAACAAGTTGGAAAGATGTGTATGCAGCTGGAGACTGTGCATATGCCAATTG 166
                      **************************** *******************************

consensus_9881#0      GACATGGTCTCCACATTGGTTTCAAATGAAATTATGGAGTCAAGCTAGACAAATGGGATT 600
consensus_9881#2      GACATGGTCTCCACATTGGTTTCAAATGAAATTATGGAGTCAAGCTAGACAAATGGGATT 340
consensus_9881#1      GACATGGTCTCCACATTGGTTTCAAATGAAATTATGGAGTCAAGCTAGACAAATGGGATT 226
                      ************************************************************

consensus_9881#0      TCAAGCTGCCAAGTCTATGTTTTGTCATAGTCAAGGAGACCACAATATCCCGCTGGATTT 660
consensus_9881#2      TCAAGCTGCCA-GTCTATGTTTTGTCATAGTCAAGGAGACCACAATATCCCGCTGGATTT 399
consensus_9881#1      TCAAGCTGCCAAGTCTATGTTTTGTCATAGTCAAGGAGACCACAATATCCCGCTGGATTT 286
                      *********** ************************************************

consensus_9881#0      TTCTTTCGAACTTTTCACTCATGTGACTTACTTTTTTGGATTTAAGATTGTTCTCTTGGG 720
consensus_9881#2      TTCTTCCGAACTTTTCACTCATGTGACTTACTTTTTTGGATTTAAGATTGTTCTCTTGGG 459
consensus_9881#1      TTCTTTCGAACTTTTCACTCATGTGACTTACTTTTTTGGATTTAAGATTGTTCTCTTGGG 346
                      ***** ******************************************************

consensus_9881#0      TCGTTTCAACGGTCANGGTATGGATCTATCCGCACCAGATACTTATCTTTTAATGCGTGT 780
consensus_9881#2      TCGTTTCAACGGTCAGGGTATGGATCTATCCGCACCAGATACTTATCTTTTAATGCGTGT 519
consensus_9881#1      TCGTTTCAACGGTCAGGGTATGGATCTATCCGCACCAGATACTTATCTTTTAATGCGTGT 406
                      *************** ********************************************

consensus_9881#0      TACACGTGGACGAGAATTCATCANATGTATC-ATGCAATCGGGTCGTATGCAAGGCGCAA 839
consensus_9881#2      TACACGTGGACGAGAATTCATCANATGTATNCATGCA-TCGGGTCGTATGCAANGGCGCA 578
consensus_9881#1      TACACGTGGACGAGAATTCATCAAATGTATC-ATGCAATCGGGTCGTATGCAAGGCGCAA 465
                      *********************** ******  ***** *************** *    *

consensus_9881#0      TATTAATTGGAGAGACTGATTTAGAAGAAACTNTAGAANAT------------------- 880
consensus_9881#2      TATTAATTGGAGAGACTGATT--------------------------------------- 599
consensus_9881#1      TATTAATTGGAGAGACTGATTTAGAAGAAACTTTAGAAAATTTAATTTTAAATCAAATTG 525
                      *********************                                       

consensus_9881#0      ------------------------------------------------------------
consensus_9881#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9881#1      ATTTGACTAATTTAGAAGATCGTCTTCTTGACCCAGACATTGATTTATCAGATTATTTCG 585
                                                                                  

consensus_9881#0      ------------------------------------------------------------
consensus_9881#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9881#1      ATTAGTAATCTACAATGGGCTCCATTTCTGCTTATATGTATATATATTTATTTTTATGTA 645
                                                                                  

consensus_9881#0      ------------------------------------------------------------
consensus_9881#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9881#1      TGTTACCAATTCGTGTGAATAATTTCTTTGGTTTCCTGTATGCATAAGTATGTGACTATC 705
                                                                                  

consensus_9881#0      ------------------------------------------------------------
consensus_9881#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9881#1      AGCAGAATAGTAGTTAATTGGTCATGTATATATACACAGAATTAACATCCCATTATGTAT 765
                                                                                  

consensus_9881#0      ------------------------------------------------
consensus_9881#2      ------------------------------------------------
consensus_9881#1      GCGTGTGATTAAATAAACTACAAATTGTAATGATTGCTTTAATACAAT 813