cluster # 9890

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Schistosoma mansoni
cluster # 9890 cluster # 9890 Sequences # 12 consensus # 2

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consensus_9890#0 length = 844 sequences # 9

consensus_9890#1 length = 491 sequences # 3

consensusID : consensus_9890#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 844
fasta sequence

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[-] EMBL CD138280             [                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTCAAT GTCCTACTGAGATGCGCCAAGACAGCCAG TGG TGCAGTGCTTAAG TTGCGTC TTCTTGTCCTGG TACCGAAAGATGTTCAAGCGTCTATTGAAAAAAAGCTTAGTCGACTTCTTCTTAGCGCTATTGAACCTTCTGTCATGCTTCACCAATTCCCAAGAGGTAAATATGAAATAGTGACGAACATCCTGGATATACCTTCATATAATTCCAGTGGATTAATAGGAAACTGTCTAGCTGCTGCCATTACATGTGCAGGTTTAGCTCTGCTAAACTCAGGTGTTCAGATGTACGATCTTCTAGTAGGATTAAATTTGGATCTCTCTGCTCTTGGTAATGAAAATGGACACCTTTGTGTTGCTGTTTTAC                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD111931             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACAGCCAGTTGGTTGCAGTGCTTAAGTTTGCGTCTTTCTTGTCCTGGTTACCGAAAGATGTTCAAGCGTCTATTGAAAAAAAGCTTAGCCGACTTCTTCTTAGCGCTATTGAACCTTCTGTCATGCTTCACCAATTCCCAAGAGGGAAATATGAAATAGTGACGAACATCCTGGATATACCTTCATATAATTCCAGTGGATTAATAGGAAACTGTCTAGCTGCTGCCATTACATGTGCAGGCTTAGCTCTGCTAAACTCAGGTGTTCAGATGTACGATCTTCTAGCAGGATTACATTTGGATCTCTCTGCTCTTGGTAATG AAATGGACACCTTGATG TGCTGATTTACta                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD149253             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACAGCCAGTTGGTTGCAGTGCTTAAGTTTGCGTCTTTCTTGTCCTGGTTACCGAAAGATGTTCAAGCGTCTATTGAAAAAAAGCTTAATCGACTTCTTCTTATCGCTATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD132966             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GATGTTCAAGCGTCTATTGAAAAAAAGCTTAGTCGACTTCTTCTTAGCGCTATTGAACCTTCTGTCATGCTTCACCAATTCCCAAGAGGTAAATATGAAATAGTGACGAACATCCTGGATATACCTTCATATAATTCCAGTGGATTAATAGGAAACTGTCTAGCTGCTGCCATTACATGTGCAGGTTTAGCTCTGCTAAACTCAGGTGTTCAGATGTACAATCTTCTAGTAGGATTAAATTTGGATCTCTCTGCTCTTGGTAATGAAAATGGACACCTTTGTGTTGCTGTTTTACCTCGTCTTCGTCAGNTCTCTATGCTTTATGCAGTGGATTCATGCATGCCTAACACTGAGTTTCTCAAAGATNCTNTAACTCACGC                                                                                                       ]
[-] EMBL CD189397             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATGTTCAAGCGTCTATTGAAAAAAAGCTTAGTCGACTTCTTCTTAGCGCTATTGAACCTTCTGTCATGCTTCACCAATTCCCAAGAGGTAAATATGAAATAGTGACGAACATCCTGGATATACCTTCATATAATTCCAGTGGATTAATAGGAAACTGTCTAGCTGCTGCCATTACATGTGCAGGTTTAGCTCTGCTAAACTCAGGTGTTCAGATGTACGATCTTCTAGTAGGATTAAATTTGGATCTCTCTGCTCTTGGTAATGAAAATGGACACCTTTGTGTTGCTGTTTTACCTCGTCTTCGTCAGTTCTCTATGCTTTATGCAGTGGATTCATGCATGCCTAACACTGAGTTTCTCAAAGATTCTT                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD076914             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAAAAGCTTAGTCGACTTCTTCTTAGCGCTATTGAACCTTCTGTCATGCTTCACCAATTCCCAAGAGGTAAATATGAAATAGTGACGAACATCCTGGATATACCTTCATATAATTCCAGTGGATTAATAGGAAACTGTCTAGCTGCTGCCATTACATGTGCAGGTTTAGCTCTGCTAAACTCAGGTGTTCAGATGTACGATCTTCTAGTAGGATTAAATTTGGATCTCTCTGCTCTTGGTAATGAAAATGGACACCTTTGTGTTGCTGTTTTACCTCGTCTTCGTCAGTTCTCTATGCTTTATGCAGTGGATTCATGCATGCCTAACACTGAGTTTCTCAAAGATTCTTTAACTCACGCTATGGACAATTGTATTAAACTTGCAGATGTAATTCGAAGCCATCTCTGTGGACAGCTTAAAACTAAAATAAAGTAAAT                         ]
[-] EMBL CD149187             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GAACTTTCTGTCATGCTTCACCAATTCCCAAGAGGTAAATATGAAATAGTGACGAACATCCTGGATATACCTTCATATAATTCCAGTGGATTAATAGGAAACTGTCTAGCTGCTGCCATTACATGTGCAGGTTTAGCTCTGCTAAACTCAGGTGTTCAGATGTACGATCTTCTAGTAGGATTAAATTTGGATCTCTCTGCTCTTGGTAATGAAAATGGACACCTTTGTGTTGCTGTTTTACCTCGTC                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL AI394974             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ACGATCCCCTAGCGGGACTAAATTTGGATCTCTCTGCTCTTGGTAATGAAAATGGACACCTATGTGATGCTGTTTTACCTCGTCTTCGTCAGTTCTCTATGCTTTATGCAGTGGATTCATGCATGCCTAACACTGAGTTTCTCAAAGATTCTTTAACTCACGCTATGGACAATTGTATTAAACTTGCAGATGTAATTCGAAGCCATCTCTGTGGACAGCTTAAAACTAAAATAAAGTAAATATTTACGGAAAAAAAAAAAAAAAAA]




>consensus_9890#0
CGGATTCCTGAAAGACGAAACTGACAACTCTCTTCATGCTACTCTGCATGCTCTTCTAGT
ACGCAAAATACCCTGCTGACTAGTTGCGAATTGCTACAAAATGCAGACCGGTTGAGCCAA
GCTTGCAGATCCTATTGATTTAAAGTATTTCCTACCAGAGAACAAAGTGGAGAAAGCTGA
AAAATGTCCTCCAGATATATTTTTCAGTTTGGAAACCAATCCTATTACTGATGGCTCCGC
GTACATTGAAGTAGGAGAAATTAAAGTCTCATGTTCTGTCAATGGTCCTACTGAGATGCG
CCAAGACAGCCAGTTGGTTGCAGTGCTTAAGTTTGCGTCTTTCTTGTCCTGGTTACCGAA
AGATGTTCAAGCGTCTATTGAAAAAAAGCTTAGTCGACTTCTTCTTAGCGCTATTGAACC
TTCTGTCATGCTTCACCAATTCCCAAGAGGTAAATATGAAATAGTGACGAACATCCTGGA
TATACCTTCATATAATTCCAGTGGATTAATAGGAAACTGTCTAGCTGCTGCCATTACATG
TGCAGGTTTAGCTCTGCTAAACTCAGGTGTTCAGATGTACGATCTTCTAGTAGGATTAAA
TTTGGATCTCTCTGCTCTTGGTAATGAAAATGGACACCTTTGTGTTGCTGTTTTACCTCG
TCTTCGTCAGTTCTCTATGCTTTATGCAGTGGATTCATGCATGCCTAACACTGAGTTTCT
CAAAGATTCTTTAACTCACGCTATGGACAATTGTATTAAACTTGCAGATGTAATTCGAAG
CCATCTCTGTGGACAGCTTAAAACTAAAATAAAGTAAATATTTACGGAAAAAAAAAAAAA
AAAA

consensusID : consensus_9890#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 491
fasta sequence

                              [TGCGCCAAGACAGCCAGTTGGTTGCAGTGCTTAAGTTTGCGTCTTTCTTGTCCTGGTTACCGAAAGATGTTCAAGCGTCTATTGAAAAAAAAGCTTAGTCGACTTCTTCTTAGCGCTATTGAACCTTCTGTCATGCTTGTAGGTCTAAACCAAAATTATTTGATTTTGTTTGATGGTTCTTCCTTCTTTCATTTTATTACTTTGTACGCAAAAGAATACTTATAGCGTTTATTATACGGTTGTAAATAATCAGCTTATTCGTGTAGTGGTCTGACAAAACCTTGTTATATACTGTCAGACGACTTTATATGTCTGGAAGTAACATACTTCCATGGTTTTCGCATAGTTCTTTTTTACAAACAAGAGAGTTCTCACCTTCCAGTATCATGTAATACAGTCTATCAACCAAACTTTGTCGGCTTACAAAGTTTGGTTTCGCTGTCTTAAACCATCTTATTTACGTCGGTTAACATCAAAACGCCTTCGTACAA]

[+] EMBL CD087170             [TGCGCCAAGACAGCCAGTTGGTTGCAGTGCTTAAGTTTGCGTCTTTCTTGTCCTGGTTACCGAAAGATGTTCAAGCGTCTATTGAAAAAAAAGCTTA TCGACTTTTTTTTAACGCTATGGAACCTTCTGTCATGCTTGTAGGTCTAAACCAAAATTATTTGATTTTGTTTGATGGTTCTTCCTTCTTTCATTTTATTACTTTGTACGCAAAAGAATACTTATAGCGTTTATTATACGGTTGTAAATAATCAGCTTATTCGTGTAGTGGTCTGACAAAACCTTGTTATATACTGTCAGACGACTTTATATGTCTGGAAGTAACATACTTCCATGGTTTTCGCATAGTTCTTTTTTACAAACAAGAGAGTTCTCACCTTCCAGTATCATGTAATACAGTCTATCAACCAAACTTTGTCGGCTTACAAAGTTTGGTTTCGCTGTCTTAAACCATCTTATTTACGTCGGTTAACATCAAAACGCCTTCGTACAA]
[+] EMBL CD087129             [TGCGCCAAGACAGCCAGTTGGTTGCAGTGCTTAAGTTTGCGTCTTTCTTGTCCTGGTTACCGAAAGATGTTCAAGCGTCTATTGAAAAAAAAGCTTAGTCGACTTCTTCTTAGCGCTATTGAACCTTCTGTCATGCTTGTAGGTCTAAACCAAAATTATTTGATTTTGTTTGATGGTTCTTCCTTCTTTCATTTTATTACTTTGTACGCAAAAGAATACTTATAGCGTTTATTATACGGTTGTAAATAATCAGCTTATTCGTGTAGTGGTCTGACAAAACCTTGTTATATACTGTCAGACGACTTTATATGTCTGGAAGTAACATACTTCCATGGTTTTCG                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD087176             [TGCGCCAAGACAGCCAGTTGGTTGCAGTGCTTAAGTTTGCGTCTTTCTTGTCCTGGTTACCGAAAGATGTTCAAGCGTCTATTGAAAAAAAAGCTTAGTCGACTTCTTCTTAGCGCTATTGAACCTTCTGTCATGCTTGTAGGTCTAAACCAAAATTATTTGATTTTGTTTGATGGTTCTTCCTTCTTTCATTTTATTACTTTGTACGCAAAAGAATACTTATAGCGTTTATTATACGGTTGTAAATAATCAGCTTATTCGTGTAGTGGTCTGACAAAACCTTGTTAT                                                                                                                                                                                                           ]




>consensus_9890#1
TGCGCCAAGACAGCCAGTTGGTTGCAGTGCTTAAGTTTGCGTCTTTCTTGTCCTGGTTAC
CGAAAGATGTTCAAGCGTCTATTGAAAAAAAAGCTTAGTCGACTTCTTCTTAGCGCTATT
GAACCTTCTGTCATGCTTGTAGGTCTAAACCAAAATTATTTGATTTTGTTTGATGGTTCT
TCCTTCTTTCATTTTATTACTTTGTACGCAAAAGAATACTTATAGCGTTTATTATACGGT
TGTAAATAATCAGCTTATTCGTGTAGTGGTCTGACAAAACCTTGTTATATACTGTCAGAC
GACTTTATATGTCTGGAAGTAACATACTTCCATGGTTTTCGCATAGTTCTTTTTTACAAA
CAAGAGAGTTCTCACCTTCCAGTATCATGTAATACAGTCTATCAACCAAACTTTGTCGGC
TTACAAAGTTTGGTTTCGCTGTCTTAAACCATCTTATTTACGTCGGTTAACATCAAAACG
CCTTCGTACAA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9890#0      CGGATTCCTGAAAGACGAAACTGACAACTCTCTTCATGCTACTCTGCATGCTCTTCTAGT 60
consensus_9890#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9890#0      ACGCAAAATACCCTGCTGACTAGTTGCGAATTGCTACAAAATGCAGACCGGTTGAGCCAA 120
consensus_9890#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9890#0      GCTTGCAGATCCTATTGATTTAAAGTATTTCCTACCAGAGAACAAAGTGGAGAAAGCTGA 180
consensus_9890#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9890#0      AAAATGTCCTCCAGATATATTTTTCAGTTTGGAAACCAATCCTATTACTGATGGCTCCGC 240
consensus_9890#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9890#0      GTACATTGAAGTAGGAGAAATTAAAGTCTCATGTTCTGTCAATGGTCCTACTGAGATGCG 300
consensus_9890#1      --------------------------------------------------------TGCG 4
                                                                              ****

consensus_9890#0      CCAAGACAGCCAGTTGGTTGCAGTGCTTAAGTTTGCGTCTTTCTTGTCCTGGTTACCGAA 360
consensus_9890#1      CCAAGACAGCCAGTTGGTTGCAGTGCTTAAGTTTGCGTCTTTCTTGTCCTGGTTACCGAA 64
                      ************************************************************

consensus_9890#0      AGATGTTCAAGCGTCTATTGAAAAAAA-GCTTAGTCGACTTCTTCTTAGCGCTATTGAAC 419
consensus_9890#1      AGATGTTCAAGCGTCTATTGAAAAAAAAGCTTAGTCGACTTCTTCTTAGCGCTATTGAAC 124
                      *************************** ********************************

consensus_9890#0      CTTCTGTCATGCTTCACCAATTCCCAAGAGGTAAATATGAAATAGTGACGAACATCCTGG 479
consensus_9890#1      CTTCTGTCATGCTTG---TAGGTCTAAACCAAAATTATTTGATTTTGTTTGA-----TGG 176
                      **************     *   * **     ** ***   **  **    *     ***

consensus_9890#0      ATATACCTTCATATAATTCCAGTGGATTAATAGGAAACTGTCTAGCTGCTGCCATTACAT 539
consensus_9890#1      TTCTTCCTTCTTTCATTTT--ATTACTTTGTACGCAAAAGAATACTTATAGCGTTTAT-T 233
                       * * ***** *  * **    *   **  ** * **  *  **  *   **  ***  *

consensus_9890#0      GTGCAGGTTTAGCTCTGCTAAACTCAGGTGTTCAGATGTACGATCTTCTAGTAGGATTAA 599
consensus_9890#1      ATACGGTTGTAAAT--AATCAGCTTATTCGTGTAG-------------TGGTCTGACAAA 278
                       * * * * **  *    * * ** *   **  **             * **  **  **

consensus_9890#0      ATTTGGATCTCTCTGCTCTTGGTAATGAAAATGGACACCTTTGTGTTGCTGTTTTACCTC 659
consensus_9890#1      ACCTTG--TTATATACTGTCAG--ACGACTTTATATGTCTGGAAGTAACATACTTCCATG 334
                      *  * *   * * * ** *  *  * **   *  *   **    **  *    ** * * 

consensus_9890#0      GTCTTCGT-CAGTTCTCTATGCTTTATGCAGTGGATTCATGCATGCCTAACACTGAGTTT 718
consensus_9890#1      GTTTTCGCATAGTTCTTTTT--TACAAACAAGAGAGTTCTCACCTTCCAGTATCATGTA- 391
                      ** ****   ****** * *  *  *  **   ** *  *      * *  *    **  

consensus_9890#0      CTCAAAGATTCTTTAACTCACGCTATGGACAATTGTATTAAACTTGCAGATGTAATTCGA 778
consensus_9890#1      ---ATACAGTCTATCAACCAAACTTTGTCGGCTTACA--AAGTTTGGTTTCGCTGTCTTA 446
                         * * * *** * *  **  ** **     **  *  **  ***     *   *   *

consensus_9890#0      AGCCATCTCTGTGGACAGCTTAAAACTAAAATAAAGTAAATATTTACGGAAAAAAAAAAA 838
consensus_9890#1      AACCATCT-TATTTACGTC----GGTTAACATCAA---AACGCCTTCGTACAA------- 491
                      * ****** * *  **  *       *** ** **   **    * ** * **       

consensus_9890#0      AAAAAA 844
consensus_9890#1      ------