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Schistosoma mansoni
cluster # 9914 cluster # 9914       Sequences # 12       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9914#0 length = 1477 sequences # 12  

consensusID : consensus_9914#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 1477
fasta sequence
                              [TAATACATATTCTTATCAGGACATTTACAGTTAGAGAATCAGAAAGAGATTTTTCAATTTTTGCCTGAGCAATAATGTGCTTACTTTTCTTGACGGTAAAAAAAACTGAATTCCAGATCATTTCAAAAAAGTAATGATGGACAAGAAATATCTGTCCGTTTGTTTGCAGTTAAGCGGTGATCAAGAGTGTGAAGGAATAATAATGCTTGGAAAAAAACAAATTATAATCATAATCCTAATAATAAATAAGCGACGAACATTAGCGTTCTTATACATTATACACTGATGAGGTAAGTCAATAATCAGGTATTTTGGGTGGGTTTTTTTAAAAATAATACCTTTTTTTCTTCCTCAAAATTAGGGGGACAGACTTCAATGTGTACGATTGTTCAATGGTCATCATATAACCCGTCCTTATCACACACAGATACTGCCTACATACAGATGCCAGCATATTAAG-AGAATTGCAAT-GAGTGAGACTAG-AGAGAGGGAGAGAAGATAGATATAAATAAATAATATGGTAATGAAGATACACGAAAACATGAATTACATACTACTATTAACATAATATAGGTAGTAGTAGTAGTAGTATGGTAAATTTTACAAAACCAGTAAGTGGAGAATGTAAGCGATACAAAAAGTACTTTCTTGGAAAGCGGGACACACATAGACACGGGGACAAGAGAGAAGTTAATAACCAGAAAGAGAATATCGGAGATTTCTGTCATAATGGTGTAAAGCTACAAAATGGTTTCACGTAATGTATAACAGACCACTTTGTTATATGACTTCTGCATTGTGATTTCAATGATGTAGAAGTATGATTGAAGAGGAAAAAGTTCAACAACATAATTGAGTACCGGAGATCTTCATAAATACAAATATATCAGTTACTAGATATATATATAATTTGGATAGAAAATGTTTGATCATGTTTCGGTTATCCATTGATAAAGGAACGATATTCTACGAGGGGTTGGTCGCTGCTAGTACTATTGTCCAAGAGTTAATTATGTCTAGCGTAAAGCTGAGTCCATTCACGTGCTTTAGCAAGGGCTTCTGATTCATTTTGTTTCCAATGTGATGCAACTTCACCGTCCAGTGGATCTTCAGGATTTGGTGCACTTAACAATGCTTGAATAGACAGTAAAACAGTGCGTATTTGAAGAGCAGGACTCCATTTATCTTTAAGAATATCAAGACAAATTCTGCCAAGACGATCAATATTTGGATGATATAATTTGGTTGTAAATCTGACCTTAGGTGCAGTCATAGGGTATTCTTCCGGAAGGAATAATTCTAAGTCGAAAATACCTCCTTCGTATGCGCTATCTTTCGGTCCATCTATGGATACCAGAAAGT-TCTTGCGTTGTTCTCAAAGAGTACCGCTTTTATGCCATCACATGGATCCTGGATAAGTTTTTGAGTTTCTTTGATTATCCTCTTTGGAAGTGATGACATTAGGCAGTCAGCAAGA]

[+] EMBL AI976188             [TAATACATATTCTTATCAGGACATTTACAGTTAGAGAATCAGAAAGAGATTTTTCAATTTTTGCCTGAGCAATAATGTGCTTACTTTTCTTGACGGTAAAAAAAACTGAATTCCAGATCATTTCAAAAAAGTAATGATGGACAAGAAATATCTGTCCGTTTGTTTGCAGTTAAGCGGTGATCAAGAGTGTGAAGGAATAATAATGCTTGGAAAAAAACAAATTATAATCATAATCCTAATAATAAATAAGCGACGAACATTAGCGTTCTTATACATTATACACTGATGAGGTAAGTCAATAATCAGGTATTTTGGGTGGGTTTTTTTAAAAATAATACCTTTTTTTCTTCCTCAAAATTAGGGGGACAGACTTCAATGTGTACGATTGTTCAATGGTCATCATATAACCCGTCCTTATCACACACAGATACTGCCTACATACAGATGCCAGCATATTAAG AGAATTGCAAT GAGTGAGACTAG AGAGAGGGAGAGAAGATAGATATAAATAAATAATATGGTAATGAAGATACACGAAAACATGAATTACATACTACTATTAACATAATATAGGTAGTAGTAGTAGTAGTATGGTAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AI976158             [TAATACATATTCTTATCAGGACATTTACAGTTAGAGAATCAGAAAGAGATTTTTCAATTTTTGCCTGAGCAATAATGTGCTTACTTTTCTTGACGGTAAAAAAAACTGAATTCCAGATCATTTCAAAAAAGTAATGATGGACAAGAAATATCTGTCCGTTTGTTTGCAGTTAAGCGGTGATCAAGAGTGTGAAGGAATAATAATGCTTGGAAAAAAACAAATTATAATCATAATCCTAATAATAAATAAGCGACGAACATTAGCGTTCTTATACATTATACACTGATGAGGTAAGTCAATAATCAGGTATTTTGGGTGGGTTTTTTTAAAAATAATACCTTTTTTTCTTCCTCAAAATTAGGGGGACAGACTTCAATGTGTACGATTGTTCAATGGTCATCATATAACCCGTCCTTATCACACACAGATACTGCCTACATACAGATGCCAGCATATTAAG AGAATTGCAAT GAGTGAGACTAG AGAGAGGGAGAGAAGATAGATATAAATAAATAATATGGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AI975213             [TAATACATATTCTTATCAGGACATTTACAGTTAGAGAATCAGAAAGAGATTTTTCAATTTTTGCCTGAGCAATAATGTGCTTACTTTTCTTGACGGTAAAAAAAACTGAATTCCAGATCATTTCAAAAAAGTAATGATGGACAAGAAATATCTGTCCGTTTGTTTGCAGTTAAGCGGTGATCAAGAGTGTGAAGGAATAATAATGCTTGGAAAAAAACAAATTATAATCATAATCCTAATAATAAATAAGCGACGAACATTAGCGTTCTTATACATTATACACTGATGAGGTAAGTCAATAATCAGGTATTTTGGGTGGGTTTTTTTAAAAATAATACCTTTTTTTCTTCCTCAAAATTAGGGGGACAGACTTCAATGTGTACGATTGTTCAATGGTCATCATATAACCCGTCCTTATCACACACAGATACTGCCTACATACAGATGCCAGCATATTAAG AGAATTGCAAT GAGTGAGACTAG AGAGAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BF936298             [TAATACATATTCTTATCAGGACATTTACAGTTAGAGAATCAGAAAGAGATTTTTCAATTTTTGCCTGAGCAATAATGTGCTTACTTTTCTTGACGGTGAAAAAAACTGAATTCCAGATCATTTCAAAAAAGTAATGATGGACAAGAAATATCTGTCCGTTTGTTTGCAGTTAAGCGGTGATCAAGAGTGTGAAGGAATAATAATGCTTGGAAAAAAACAAATTATAATCATAATCCTAATAATAAATAAGCGACGAACATTAGCGTTCTTATACATTATACACTGATGAGGTAAGTCAATAATCAGGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD137032             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATTAAGTAGAATTGCAATGGAGTGAGACTAGCAGAGAGGGAGAGAAGATAGATATAAATAAATAATATGGTAATGAAGATACACGAAAACATGAATTACATACTACTATTAACATAATATAGGTAGTAGTAGTACTAGTATGGTAAATGTTACAAAACCAGTAAGTGGAGAATGTAAGCGATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD147684             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tGAGAGAGGGAAGATAGATATAAATAAATAATATGGTAATGAAGATACACGAAAACATGAATTACATACCCCTATTAACATAATATAGGTAGTAGTAGTAGTAGTATGGTAAATTTTACAAAACCAGTAAGTGGAGAATGTAAGCGATACAAAAAGTACTTTCTTGGAAAGCGGGACACACATAGACACGGGGACAAGAGAGAAGTTAATAACCAGAAAGAGAATATCGGAGATTTCTGTCATAATGGTGTAAAGCTACAAAATGGTTTCACGTAATGTATAACAGACCACTTTGTTATATGACTTCTGCATTGTGATTTCAATGATGTAGAAGTATGATTGAAGAGGAAAAAGTTCAACAACATAATTGAGTACCGGAGATCTTCATAAATACAAATATATCAGTTACTAGATATATATATAATTTGGATAGAAAATGTTTGATCATGTTTCGGTTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD196352             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACATGAATTACATACTACTATTAACATAATATAG   GTAGTAGTAGTAGTATGGTAAATTTTACAAAACCAGTAAGTGGAGAATGTAAGCGATACAAAAAGTACTTTCTTGGAAAGCGGGACACACATAGACACGGGGACAAGAGAGAAGTTAATAACCAAAAAGAGAATATCGGAAATTTTTGTCATAATGGTGTAAAGCTACAAAATGGTTTCACGTAATGTATAACAGACCACTTTGTTATATGACTTCTGCATTGTGATTTCAATGATGTAGAAGTATGATTGAAGAGGAAAAAGTTCAACAACATAATTGAGTACCGGAGATCTTCATAAATACAAATATATCAGTTACTAGATATATATATAATTTGAATAGAAAATGTTTGATCATGTTTCGGTTATCCATTGATAAAGGAACGATATTCTACGAGGGGTTGGTCGCTGCTAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD196527             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAACAACATAATTGAGTACCGGAGATCTTCATAAATACAAATATATCAGTTACTAGATATATATATAATTTGGATAGAAAATGTTTGATCATGTTCCGGTTATCCATTGATAAAGGAACGATATTCTACGAGGGGTTGGTCGCTGCTAGTACTATTGTCCAAGAGTTAATTATGTCTAGCGTAAAGCTGAGTCCATTCACGTGCTTTAGCAAGGGCTTCTGATTCATTTTGTTTCCAATGTGATGCAACTTCACCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD149659             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAGAGTTAATTATGTCTAGCGTAAAGCTGAGTCCATTCACGTGCTTTAGCAAGGGCTTCTGATTCATTTTGTTTCCAATGTGATGCAACTTCACCGTCCAGTGGATCTTCAGGATTTGGTGCACTTAACAATGCTTGAATAGACAGTAAAACAGTGCGTATGTGAAGAGCAGGACTCCATTTATCTTTAAGAATATCAAGACAAATTCTGCCAAGACGATCAATATTTGGATGATATAATTTGGTTGTAAATCTGACCTTAGGTGCAGTCATAGGGTATTCTTCCGGAAGGAATAATTCTAAGTCGAAAATACCTCCTTCGTATGCGCTATCTTTCGGTCCATCTATGGATACCAGAAAGT TCTTGCGTTGTTCTCAAAGA                                                                                               ]
[+] EMBL CD068383             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTAGCGTAAAGCTGAGTCCATTCACGTGCTTTAGCAAGGGCTTCTGATTCA TTTGTTTCCAATGTGATGCAACTTCACCGTCCAGTGGATCTTCAGGATTTGGTGCACTTAACAATGCTTGAATAGACAGTAAAACAGTGCGTATTTGAAGAGCAGGACTCCATTTATCTTTAAGAATATCAAGACAAATTCTGCCAAGACGATCAATATTTGGATGATATAATTTGGTTGTAAATCTGACCCTAGGTGCAGTCATAGGGTATTCTTCCGGAAGGAATAATTCTAAGTCGAAAATACCTCCTTCGTATGCGCTATCTTTCGGTCCATCTATGGATACCAGAAAGTATCTTGCGTTGTTTTCATCTGGTACCGCTTTTATGCCATCACATGGATCCTGGATAAGTTTTTGAGTTTCTTTGATTATCCTCTTTGGAAGTGATGACATTAGGCAGTCAGCAAGA]
[-] EMBL CD149163             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATTCACGTGCTTTAGCAAGGGCTTATGATTCATTTTGTTTCCAATGTGATGCAACTTCACCGTCCAGTGGATCTTCAGGATTTGGTGCACTTAACAATGCTTGAATAGACAGTAAAACAGTGCGTATTTGAAGAGCAGGACTCCATTTATCTTTAAGAATATCAAGACAAATTCTGCCAAGACGATCAATATTTGGATGATATAATTTGGTTGTAAATCTGACCTTAGGTGCAGTCATAGGGTATTCTTCCGGAAGGAATAATTCTAAGTCGAAAATACCTCCTTCGTATGCGCTATCTTTCGGTCCATCTATGGATACCAGAAAGTatc                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD149413             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTTTCCAATGTGATGCAACTTCACCGTCCAGTGGATCTTCAGGATTTGGTGCACTTAACAATGCTTGAATAGACAGTAAAACAGTGCGTATTTGAAGAGCAGGACTCCATTTATCTTTAAGAATATCAAGACAAATTCTGCCAAGACGATCAATATTTGGATGATATAATTTGGTTGTAAATCTGACCTTAGGTGCAGTCATAGGGTATTCTTCCGGAAGGAATAATTCTAAGTCGAAAATACCTCCT                                                                                                                                                               ]


>consensus_9914#0 TAATACATATTCTTATCAGGACATTTACAGTTAGAGAATCAGAAAGAGATTTTTCAATTT TTGCCTGAGCAATAATGTGCTTACTTTTCTTGACGGTAAAAAAAACTGAATTCCAGATCA TTTCAAAAAAGTAATGATGGACAAGAAATATCTGTCCGTTTGTTTGCAGTTAAGCGGTGA TCAAGAGTGTGAAGGAATAATAATGCTTGGAAAAAAACAAATTATAATCATAATCCTAAT AATAAATAAGCGACGAACATTAGCGTTCTTATACATTATACACTGATGAGGTAAGTCAAT AATCAGGTATTTTGGGTGGGTTTTTTTAAAAATAATACCTTTTTTTCTTCCTCAAAATTA GGGGGACAGACTTCAATGTGTACGATTGTTCAATGGTCATCATATAACCCGTCCTTATCA CACACAGATACTGCCTACATACAGATGCCAGCATATTAAGAGAATTGCAATGAGTGAGAC TAGAGAGAGGGAGAGAAGATAGATATAAATAAATAATATGGTAATGAAGATACACGAAAA CATGAATTACATACTACTATTAACATAATATAGGTAGTAGTAGTAGTAGTATGGTAAATT TTACAAAACCAGTAAGTGGAGAATGTAAGCGATACAAAAAGTACTTTCTTGGAAAGCGGG ACACACATAGACACGGGGACAAGAGAGAAGTTAATAACCAGAAAGAGAATATCGGAGATT TCTGTCATAATGGTGTAAAGCTACAAAATGGTTTCACGTAATGTATAACAGACCACTTTG TTATATGACTTCTGCATTGTGATTTCAATGATGTAGAAGTATGATTGAAGAGGAAAAAGT TCAACAACATAATTGAGTACCGGAGATCTTCATAAATACAAATATATCAGTTACTAGATA TATATATAATTTGGATAGAAAATGTTTGATCATGTTTCGGTTATCCATTGATAAAGGAAC GATATTCTACGAGGGGTTGGTCGCTGCTAGTACTATTGTCCAAGAGTTAATTATGTCTAG CGTAAAGCTGAGTCCATTCACGTGCTTTAGCAAGGGCTTCTGATTCATTTTGTTTCCAAT GTGATGCAACTTCACCGTCCAGTGGATCTTCAGGATTTGGTGCACTTAACAATGCTTGAA TAGACAGTAAAACAGTGCGTATTTGAAGAGCAGGACTCCATTTATCTTTAAGAATATCAA GACAAATTCTGCCAAGACGATCAATATTTGGATGATATAATTTGGTTGTAAATCTGACCT TAGGTGCAGTCATAGGGTATTCTTCCGGAAGGAATAATTCTAAGTCGAAAATACCTCCTT CGTATGCGCTATCTTTCGGTCCATCTATGGATACCAGAAAGTTCTTGCGTTGTTCTCAAA GAGTACCGCTTTTATGCCATCACATGGATCCTGGATAAGTTTTTGAGTTTCTTTGATTAT CCTCTTTGGAAGTGATGACATTAGGCAGTCAGCAAGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)