cluster # 9952

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Schistosoma mansoni
cluster # 9952 cluster # 9952 Sequences # 12 consensus # 2

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consensus_9952#0 length = 712 sequences # 8

consensus_9952#1 length = 614 sequences # 4

consensusID : consensus_9952#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 712
fasta sequence

                              [CAGATGGATGAACGATAATAGTAATAATAATAAGCCAAGTAAAAAAAATTGAAATAAGAAAAAAGACTTAAAAGAATTAATAGAATAAAATTACTAATTTATTCACTCGGTCAACTAAATAGGATGATCAACAGTCTACAAAAAAAATTACAGAATTATAAATTTACCACATGATTTAAAAGAATTTTTAATAAGTATGATGACTGATGATTGAAGGAATTGGGGGGGGGGGAAATGTCAAACAATACATTCATGTTTTACATGGTTTATGTGAATTAAGAAACTGACTCCAATAAAAAAACAATTTTAATAAATATTACGATGATAAATACAAAACAGGCAATTTATTGCTTTCAGAATAAAATTTAATGAAAGTTATGTAAGCAGAGAGGATAGCTGAAATGAGCATTATAAATGGCAATGATAAAAAATTTAACTTATATTAGTTTAATAAAATAGGAAATGACAAAAAATCCTTATCGAAATTACACTCATCAACATAGACTAAAGAGAAGTTCGATGTTTTTTTGTTGTGGCTTTTACAAACAAGTGCCGAATTCATTCGATAGATTGATACAAAGTATTACCAGAATAATGGATGGCACAAAACACCAACTTC-AAAATTTTTACGATTGAAAT-AAAGGG-AATAAAGAAAAATGAAGAGTTGTTATTGAATCATCAGAGAAACAATTTTTTTTTTAAAACCCACCCC]

[+] EMBL CD196619             [CAGATGGATGAACGATAATAGTAATAATAATAAGCCAAGTAAAAAAAATTGAAATAAGAAAAAAGACTTAAAAGAATTAATAGAATAAAATTACTAATTTATTCACTCGGTCAACTAAATAGGATGATCAACAGTCTACAAAAAAAATTACGGAATTATAAATTTACCACATGATTTAAAAGAATTTTTAATAAGTATGATGACTGATGATTGAAGGAGTT GGGGGGGGGGAAATGTCAAACAATACATTCATGTTTTACATGGTTTATGTGAATTAAGAAACTGACTCCAATAAAAAAACAATTTTAATAAATATTACGATGATAAATACAAAACAGGCAATTTATTGCTTTCAGAATAAAATTTAATGAAAGTTATGTAAGCAGAGAGGATAGCTGAAATGAGCATTATAAATGGCAATGATAAAAAATTTAACTTATATTAGTTTAATAAAATAGGAAAT                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD196680             [CAGATGGATGAACGATAACAGTAATAATAATAAGCCAAGTAAAAAAAATTGAAATAAGAAAAAAGACTTAAAAGAATTAATAGAATAAAATTACTAATTTATTCACTCGGTCAACTAAATAGGATGATCAACAGTCTACAAAAAAAATTACAGAATTATAAATTTACCACATGATTTAAAAGAATTTTTAATAAGTATGATGACTGATGATTGAAGGAATTGGGGGGGGGGGAAATGTCAAACAATACATTCATGTTTTACATGGTTTATGTGAATTAAGAAACTGACTCCAATAAAAAAACAATTTTAATAAATATTACGATGATAAATACAAAACAGGCAATTTATTGCTTTCAGAATAAAATTTAATGAAAGTTATGTAAGCAGAGAGGATAGCTGAAATGAGCATTATAAATGGCAATGATAAAAAATTTAACTTATATTAGTTTAATAAAATAGGAAATG                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD196616             [CAGATGGATGAACGATAATAGTAATAATAATAAGCCAAGTAAAAAAAATTGAAATAAGAAAAAAGACTTAAAAGAATTAATAGAATAAAATTACTAATTTATTCACTCGGTCAACTAAATAGGATGATCAACAGTCTACAAAAAAAATTACAGAATTATAAATTTACCACATGATTTAAAAGAATCTTTAATAAGTATGATGACTGATGATTGAAGGAATTGGGGGGGGGGGAAATGTCAAACAATACATTCATGTCTTACATGGTTTATGTGAATTAAGAAACTGACTCCAATAAAAAAACAATTTTTATTAA ATTAt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD196621             [                                                                                                                                                                                                                                         AATGTCAAACAATACATTCATGTTTTACATGGTTTATGTGAATTAAGAAACTGACTCCAATAAAAAAACAATTTTAATAAATATTACGATGATAAATACAAAACAGGCAATTTATTGCTTTCAGAATAAAATTTAATGAAAGTTATGTAAGCAGAGAGGATAGCTGAAATGAGCATTATAAATGGCAATGATAAAAAATTTAACTTATATTAGTTTAATAAAATAGGAAATGACAAAAAATCCTTATCGAAATTACACTCACCAACATAGACTAAAGAGAAGTTCGATGTTTTTTTGTTGTGGCTTTTACAAACAAGTGCCGAATTCATTCGATAGATTGATACAAAGTATTACCAGAATAATGGATGGCACAAAACACCAACTTC AAAATTTTTACGATTGAAATAAAAGGGAAATAA                                                              ]
[+] EMBL CD200662             [                                                                                                                                                                                                                                         AATGTCAAACAATACATTCATGTTTTACATGGTTTATGTGAATTAAGAAACTGACTCCAATAAAAAAACAATTTTAATAAATATTACGATGATAAATACAAAACAGGCAATTTATTGCTTTCAAAATAAAATTTAATGAAAGTTATGTAAGCAGAGAGGATAGCTGAAATGAGCATTATAAATGGCAATGATAAAAAATTTAACTTATATTAGTTTAATAAAATAGGAAATGACAAAAAATCCTTATCGAAATTACACTCATCAACATAGACTAAAGAGAAGTTCGATGTTTTTTTGTTGTGGCTTTTACAAACAAGTGCCGAATTCATTCGATAGATTGATACAAAGTATTACCAGAATAATGGATGGCACAAAACACCAACTTC AAAATTTTTACGATTGAAAT AAAGGG AATAAAGAAAAATGAAGAGTTGTTATTGAATCATCAGAGAAACAATTTTTTTTTTAAAACCCACCCC]
[-] EMBL CD196577             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTGCTTTCAGAATAAAATTTAATGAAAGTTATGTAAGCAGAGAGGATAGCTGAAATGAGCATTATAAATGGCAATGATAAAAAATTTAACTTATATTAGTTTAATAAAATAGGAAATGACGAAGAATCCTTATCGATATTACACTCATCAACATAGAATAAAGAGAAGTTCGATGTTTTTTTGTTGTGGCTTTTACAAACAAGTGCCGAATTCATTCGATAGATTGATACAAAGTATTACCAGAATAATGGATGGCACAAAACACCAACTTCGAAAATTTTTACGATTGAAAT AAAGGG AATAAAGAAAAATGAAGAGTTGT                                            ]
[+] EMBL CD067176             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTAATGAAAGTTATGTAAGCACAGAGGATAGCTGAAATGAGCATTATAAATGGCAATGATAAAAAATTTAACTTATATTAGTTTAATAAAATACGAAATGACAAAAAATCCTTATCGAAATTACACTCATCAACATAGACTAAAGAGAAGTTCGATGTTTTTTTGTTGTGGCTTTTACAAACAAGTGCCGAATTCATTCGATAGATTGATACAAAGTATTACCAGAATAATGGATGGCACACAACACCAACTTC AAAATTTTTACGATTGAAAT AATGGG AATATAGAAAAATGAAGAGTTGTTATTGAATCATCAGAGAAACAATTTTTTTTTTTAAAa       ]
[-] EMBL CD140447             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tTTTAATAAAATAGGAAATGACAAAAAATCCTTATCGAAATTACACTCATCAACATAGACTAAAGAGAAGTTCGATGTTTTTTTGTTGTGGCTTTTACAAACAAGTGCCGAATTCATTCGATAGATTGATACAAAGTATTACCAGAATAATGGATGGCACAAAACACCAACTTC AAAATTTTTACGATTGAAAT AAAGGG AATAAAGAGAAATGAAGAGTTGTTATTGAATCATCAGAGAAACAATTTTTTT               ]




>consensus_9952#0
CAGATGGATGAACGATAATAGTAATAATAATAAGCCAAGTAAAAAAAATTGAAATAAGAA
AAAAGACTTAAAAGAATTAATAGAATAAAATTACTAATTTATTCACTCGGTCAACTAAAT
AGGATGATCAACAGTCTACAAAAAAAATTACAGAATTATAAATTTACCACATGATTTAAA
AGAATTTTTAATAAGTATGATGACTGATGATTGAAGGAATTGGGGGGGGGGGAAATGTCA
AACAATACATTCATGTTTTACATGGTTTATGTGAATTAAGAAACTGACTCCAATAAAAAA
ACAATTTTAATAAATATTACGATGATAAATACAAAACAGGCAATTTATTGCTTTCAGAAT
AAAATTTAATGAAAGTTATGTAAGCAGAGAGGATAGCTGAAATGAGCATTATAAATGGCA
ATGATAAAAAATTTAACTTATATTAGTTTAATAAAATAGGAAATGACAAAAAATCCTTAT
CGAAATTACACTCATCAACATAGACTAAAGAGAAGTTCGATGTTTTTTTGTTGTGGCTTT
TACAAACAAGTGCCGAATTCATTCGATAGATTGATACAAAGTATTACCAGAATAATGGAT
GGCACAAAACACCAACTTCAAAATTTTTACGATTGAAATAAAGGGAATAAAGAAAAATGA
AGAGTTGTTATTGAATCATCAGAGAAACAATTTTTTTTTTAAAACCCACCCC

consensusID : consensus_9952#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 614
fasta sequence

                              [TNTGTTTTGTTATTTACCAC-TGCATGAAA-TGTGTACAATATTACCTTTTAAAAAGAACGTTGAATACGCTTGAAAAGAGCAACGATGACTAGAATAAGAACAGCAAAATACCACAGAAACATTAACAACAACAGAAAGAACAAATGTTCAATAAAACGCATATATCTTGCTTAACAGTTTTTCTCTTCTTTGTCATCTTTTCTGAACACTGTACAAACGTGTGTGAGTGTGTGTACGTGTTGGTATAAGCTAAATGTAACCAACACAAAGAAGTATGTGAAGACAATTTCTTTGAACAAGATGTAGAAAACAGAAATCAATAAGCAAACATAACACAAGAGAATCGGACACAGATGGATGAACGATAATAGTAATAATAATAAGCCAAGTAAAAAAAATTGAAATAAGAAAAAAGACTTAAAAGAATTAATAGAATAAAATTACTAATTTATTCACTCGGTCAACTAAATAGGATGATCAACAGTCTACAAAAAAAATTACAGAATTATAAATTTACCACATGATTTAAAAGAATTTTTAATAAGTATGATGACTGATGATTG-AAGGAATTGGGGGGGGGGGAAATGTCAAACAATACATTCGCCTCGGACCGA]

[-] EMBL CD083264             [ NTGTTTTGTTATTTACCAC TGCATGAAANTGTGTACAATATTACCTTTTAAAAAGAACGTTGAATACGCTTGAAAAGAGCAACGATGACTAGAATAAGAACAGCAAAATACCACAGAAACATTAACAACAACAGAAAGAACAAATGTTCAATAAAACGCATATATCTTGCTTAACAGTTTTTCTCTTCTTTGTCATCTTTTCTGAACACTGTACAAACGTGTGTGAGTGTGTGTACGTGTTGGTATAAGCTAAATGTAACCAACACAAAGAAGTATGTGAAGACAATTTCTTTGAACAAGATGTAGAAAACAGAAATCAATAAGCAAACATAACACAAGAGAATCGGACACAGATGGATGAACGATAATAGTAATAATAATAAGCCAAGTAAAAAAAATTGAAATAAGAAAAAAGACTTAAAAGAATTAATAGAATAAAATTACTAATTTATTCACTCGGTCAACTAAATAGGATGATCAACAGTCTACAAAAAAAATTACAGAATTATAAATTTACCACATGATTTAAAAGAATTTTTAATAAGTATGATGGCTGATGATTG AAGGAATAAGGGGGGGGGGAAATGTCAAACAATACATTCGCCTCGGACCGA]
[+] EMBL AW017107             [ttTGTTTTGTTATTTACCACTTGCATGAAA TGTGTACAATATTACCTTTTAAAAAGAACGTTGAATACGCTTGAAAAGAGCAACGATGACTAGAATAAGAACAGCAAAATACCACAGAAACATTAACAACAACAGAAAGAACAAATGTTCAATAAAACGCATATATCTTGCTTAACAGTTTTTCTCTTCTTTGTCATCTTTTCTGAACACTGTACAAACGTGTGTGAGTGTGTGTACGTGTTGGTATAAGCTAAATGTAACCAACACAAAGAAGTATGTGAAGACAATTTCTTTGAACAAGATGTAGAAAACAGAAATCAATAAGCAAACATAACACAAGAGAATCGGACACAGATGGATGAACGATAATAGTAATAATAATAAGCCAAGTAAAAAAAATTGAAATAAGAAAAAAGACTTAAAAGAATTAATAGAATAAAATTACTAATTTATTCACTCGGTCAACTAAATAGGATGATCAACAGTCTACAAAAAAAATTACAGAATTATAAATTTACCACATGATTTAAAAGAATTTTTAATAAGTATGATGACTGATGATTG AAGGAATTGGG                                        ]
[+] EMBL CD076834             [                        ATGAAA TGTGTACAATATTACCTTTTAAAAAGAACGTTGAATACGCTTGAAAAGAGCAACGATGACTAGAATAAGAACAGCAAAATACCACAGAAACATTAACAACAACAGAAAGAACAAATGTTCAATAAAACGCATATATCTTGCTTAACAGTTTTTCTCTTCTTTGGCATCTTTTCTGAACACTGTACAAACGTGTGTGAGTGTGTGTACGTGTTGGTATAAGCTAAATGTAACCAACACAAAGAAGTATGTGAAGACAATTTCTTTGAACAAGATGTAGAAAACAGAAATCAATAAGCAAACATAACACAAGAGAATCGGACACAGATGGATGAACGATAATAGTAATAATAATAAGCCAAGTAAAAAAAATTGAAATAAGAAAAAAGACTTAAAAGAATTAATAGAATAAAATTACTAATTTATTCACTCGGTCAACTAAATAGGATGATCAACAGTCTACAAAAAAAATTACAGAATTATAAATTTACCACATGATTTAAAAGAATTTTTAATAAGTATGATGACTGATGATTGAAAGGAATTGGG                                        ]
[+] EMBL CD166933             [                                                                                                                                                                                                                                             CGTGTTGGTATAAGCTAAATGTAACCAACACAAAGAAGTATGTGAAGACAATTTCTTTGAACAAGATGTAGAAAACAGAAATCAATAAGCAAACATAACACAAGAGAATCGGACACAGATGGATGAACGATAATAGTAATAATAATAAGCCAAGTAAAAAAAATTGAAATAAGAAAGAAGACTTAAAAGAATTAATGAAAGAAAATT                                                                                                                                                                             ]




>consensus_9952#1
TNTGTTTTGTTATTTACCACTGCATGAAATGTGTACAATATTACCTTTTAAAAAGAACGT
TGAATACGCTTGAAAAGAGCAACGATGACTAGAATAAGAACAGCAAAATACCACAGAAAC
ATTAACAACAACAGAAAGAACAAATGTTCAATAAAACGCATATATCTTGCTTAACAGTTT
TTCTCTTCTTTGTCATCTTTTCTGAACACTGTACAAACGTGTGTGAGTGTGTGTACGTGT
TGGTATAAGCTAAATGTAACCAACACAAAGAAGTATGTGAAGACAATTTCTTTGAACAAG
ATGTAGAAAACAGAAATCAATAAGCAAACATAACACAAGAGAATCGGACACAGATGGATG
AACGATAATAGTAATAATAATAAGCCAAGTAAAAAAAATTGAAATAAGAAAAAAGACTTA
AAAGAATTAATAGAATAAAATTACTAATTTATTCACTCGGTCAACTAAATAGGATGATCA
ACAGTCTACAAAAAAAATTACAGAATTATAAATTTACCACATGATTTAAAAGAATTTTTA
ATAAGTATGATGACTGATGATTGAAGGAATTGGGGGGGGGGGAAATGTCAAACAATACAT
TCGCCTCGGACCGA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9952#0      CAGATGGATGAACGATAATAGTAATAATAATAAGCCAAGTAAAAAAAATTGAAATAAGAA 60
consensus_9952#1      --------TNTGTTTTGTTATTTACCACTGCATGAAATGTGTACAATATTACCTTTTAAA 52
                              *      *  ** * *  *    * *  * **  * ** ***    *   **

consensus_9952#0      AAAAGACTTAAAAGAATT--AATAGAATAA-AATTACTAATTTATTCACTCGGTCAACTA 117
consensus_9952#1      AAGAACGTTGAATACGCTTGAAAAGAGCAACGATGACTAGAATAAGAAC--AGCAAAATA 110
                      ** *   ** **     *  ** ***  **  ** ****   **   **   *  ** **

consensus_9952#0      A-ATAGGATGATCAACAGTCTACAAAAAAAATTACAGAATTATAAATTTACCACATGATT 176
consensus_9952#1      CCACAGAAACATTAACAA-CAACAGAAAGAACAAATGTTCAATAAAACGCATATATCTTG 169
                        * ** *  ** ****  * *** *** **  *  *    *****      * **  * 

consensus_9952#0      TAAAAGAATTTTTAATAAGTATGATGACTGATGATTGAAGGAATTGGGGGGGGGGGAAAT 236
consensus_9952#1      CTTAACAGTTTTTCTCTTCTTTGTCATCTTTT--CTGAAC--ACTGTACAA-----ACGT 220
                         ** * *****      * **    **  *   ****   * **          *  *

consensus_9952#0      GTCAAACAATACATTCATGTTT-TACATGGTTTATGTGAATTAAGAAACTGACTCCAATA 295
consensus_9952#1      GTGTGAGTGTGTGTACGTGTTGGTATAAGCTAAATGTAACCAACACAAAGAAGTATGTGA 280
                      **   *   *   * * ****  ** * * *  **** *   *   **   * *     *

consensus_9952#0      AAAAAACAATTTTAATAAATATTACGATGATAAATACAAAACAGGCAATTTATTGCTTTC 355
consensus_9952#1      AGACAATTTCTTTGAACAAGATGTAGAAAACAGAAATCAATAAGCAAACATAACACAAG- 339
                      * * **    *** *  ** **   **  * * * *  **  **  **  **   *    

consensus_9952#0      AGAATAAAATTTAATGAAAGTTATGTAAGCAGAGAGGATAGCTGAAATGAGCATTATAAA 415
consensus_9952#1      AGAATCGGACACAGATGGATGAACGATAATAGTAATAATAA-TAAGCCAAGTAAAAAAAA 398
                      *****   *   *     *   * *  *  **  *  ***  * *    ** *  * ***

consensus_9952#0      TGGCAATGATAAAAAATTTAACTTATATTAGTTTAATAAAATAGGA--AATGACAAAAAA 473
consensus_9952#1      TTGAAATAAGAAAAAA---GACTTAAAAGAATT-AATAGAATAAAATTACTAATTTATTC 454
                      * * *** * ******    ***** *  * ** **** ****  *  * * *   *   

consensus_9952#0      TCCTTATCGA--AATTACACTCATCAACATAGACTAAAGAGAAGTTCGATGTTTTTTTGT 531
consensus_9952#1      ACTCGGTCAACTAAATAGGATGATCAACAGTCTACAAAAAAAATTACAGAATTATAAATT 514
                       *    ** *  ** **   * *******      *** * ** * *    ** *    *

consensus_9952#0      TGTGGCTTT-TACAAACAAGTGCCGAATTCATTCGATAGAT--TGATACAAAGTATTACC 588
consensus_9952#1      TACCACATGATTTAAAAGAATTTTTAATAAGTATGATGACTGATGATTGAAGGAATTGGG 574
                      *    * *  *  ***  * *    ***   *  ***   *  ****  ** * ***   

consensus_9952#0      AGAATAATGGATGGCA--CAAAACACCAACTTCAAAATTTTTACGATTGAAATAAAGGGA 646
consensus_9952#1      GGGGGGGGAAATGTCAAACAATACATTCGCCTCGGACCGA-------------------- 614
                       *        *** **  *** ***    * **  *                        

consensus_9952#0      ATAAAGAAAAATGAAGAGTTGTTATTGAATCATCAGAGAAACAATTTTTTTTTTAAAACC 706
consensus_9952#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9952#0      CACCCC 712
consensus_9952#1      ------