These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9952#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 712 fasta sequence [CAGATGGATGAACGATAATAGTAATAATAATAAGCCAAGTAAAAAAAATTGAAATAAGAAAAAAGACTTAAAAGAATTAATAGAATAAAATTACTAATTTATTCACTCGGTCAACTAAATAGGATGATCAACAGTCTACAAAAAAAATTACAGAATTATAAATTTACCACATGATTTAAAAGAATTTTTAATAAGTATGATGACTGATGATTGAAGGAATTGGGGGGGGGGGAAATGTCAAACAATACATTCATGTTTTACATGGTTTATGTGAATTAAGAAACTGACTCCAATAAAAAAACAATTTTAATAAATATTACGATGATAAATACAAAACAGGCAATTTATTGCTTTCAGAATAAAATTTAATGAAAGTTATGTAAGCAGAGAGGATAGCTGAAATGAGCATTATAAATGGCAATGATAAAAAATTTAACTTATATTAGTTTAATAAAATAGGAAATGACAAAAAATCCTTATCGAAATTACACTCATCAACATAGACTAAAGAGAAGTTCGATGTTTTTTTGTTGTGGCTTTTACAAACAAGTGCCGAATTCATTCGATAGATTGATACAAAGTATTACCAGAATAATGGATGGCACAAAACACCAACTTC-AAAATTTTTACGATTGAAAT-AAAGGG-AATAAAGAAAAATGAAGAGTTGTTATTGAATCATCAGAGAAACAATTTTTTTTTTAAAACCCACCCC] [+] EMBL CD196619 [CAGATGGATGAACGATAATAGTAATAATAATAAGCCAAGTAAAAAAAATTGAAATAAGAAAAAAGACTTAAAAGAATTAATAGAATAAAATTACTAATTTATTCACTCGGTCAACTAAATAGGATGATCAACAGTCTACAAAAAAAATTACGGAATTATAAATTTACCACATGATTTAAAAGAATTTTTAATAAGTATGATGACTGATGATTGAAGGAGTT GGGGGGGGGGAAATGTCAAACAATACATTCATGTTTTACATGGTTTATGTGAATTAAGAAACTGACTCCAATAAAAAAACAATTTTAATAAATATTACGATGATAAATACAAAACAGGCAATTTATTGCTTTCAGAATAAAATTTAATGAAAGTTATGTAAGCAGAGAGGATAGCTGAAATGAGCATTATAAATGGCAATGATAAAAAATTTAACTTATATTAGTTTAATAAAATAGGAAAT ] [+] EMBL CD196680 [CAGATGGATGAACGATAACAGTAATAATAATAAGCCAAGTAAAAAAAATTGAAATAAGAAAAAAGACTTAAAAGAATTAATAGAATAAAATTACTAATTTATTCACTCGGTCAACTAAATAGGATGATCAACAGTCTACAAAAAAAATTACAGAATTATAAATTTACCACATGATTTAAAAGAATTTTTAATAAGTATGATGACTGATGATTGAAGGAATTGGGGGGGGGGGAAATGTCAAACAATACATTCATGTTTTACATGGTTTATGTGAATTAAGAAACTGACTCCAATAAAAAAACAATTTTAATAAATATTACGATGATAAATACAAAACAGGCAATTTATTGCTTTCAGAATAAAATTTAATGAAAGTTATGTAAGCAGAGAGGATAGCTGAAATGAGCATTATAAATGGCAATGATAAAAAATTTAACTTATATTAGTTTAATAAAATAGGAAATG ] [+] EMBL CD196616 [CAGATGGATGAACGATAATAGTAATAATAATAAGCCAAGTAAAAAAAATTGAAATAAGAAAAAAGACTTAAAAGAATTAATAGAATAAAATTACTAATTTATTCACTCGGTCAACTAAATAGGATGATCAACAGTCTACAAAAAAAATTACAGAATTATAAATTTACCACATGATTTAAAAGAATCTTTAATAAGTATGATGACTGATGATTGAAGGAATTGGGGGGGGGGGAAATGTCAAACAATACATTCATGTCTTACATGGTTTATGTGAATTAAGAAACTGACTCCAATAAAAAAACAATTTTTATTAA ATTAt ] [-] EMBL CD196621 [ AATGTCAAACAATACATTCATGTTTTACATGGTTTATGTGAATTAAGAAACTGACTCCAATAAAAAAACAATTTTAATAAATATTACGATGATAAATACAAAACAGGCAATTTATTGCTTTCAGAATAAAATTTAATGAAAGTTATGTAAGCAGAGAGGATAGCTGAAATGAGCATTATAAATGGCAATGATAAAAAATTTAACTTATATTAGTTTAATAAAATAGGAAATGACAAAAAATCCTTATCGAAATTACACTCACCAACATAGACTAAAGAGAAGTTCGATGTTTTTTTGTTGTGGCTTTTACAAACAAGTGCCGAATTCATTCGATAGATTGATACAAAGTATTACCAGAATAATGGATGGCACAAAACACCAACTTC AAAATTTTTACGATTGAAATAAAAGGGAAATAA ] [+] EMBL CD200662 [ AATGTCAAACAATACATTCATGTTTTACATGGTTTATGTGAATTAAGAAACTGACTCCAATAAAAAAACAATTTTAATAAATATTACGATGATAAATACAAAACAGGCAATTTATTGCTTTCAAAATAAAATTTAATGAAAGTTATGTAAGCAGAGAGGATAGCTGAAATGAGCATTATAAATGGCAATGATAAAAAATTTAACTTATATTAGTTTAATAAAATAGGAAATGACAAAAAATCCTTATCGAAATTACACTCATCAACATAGACTAAAGAGAAGTTCGATGTTTTTTTGTTGTGGCTTTTACAAACAAGTGCCGAATTCATTCGATAGATTGATACAAAGTATTACCAGAATAATGGATGGCACAAAACACCAACTTC AAAATTTTTACGATTGAAAT AAAGGG AATAAAGAAAAATGAAGAGTTGTTATTGAATCATCAGAGAAACAATTTTTTTTTTAAAACCCACCCC] [-] EMBL CD196577 [ ATTGCTTTCAGAATAAAATTTAATGAAAGTTATGTAAGCAGAGAGGATAGCTGAAATGAGCATTATAAATGGCAATGATAAAAAATTTAACTTATATTAGTTTAATAAAATAGGAAATGACGAAGAATCCTTATCGATATTACACTCATCAACATAGAATAAAGAGAAGTTCGATGTTTTTTTGTTGTGGCTTTTACAAACAAGTGCCGAATTCATTCGATAGATTGATACAAAGTATTACCAGAATAATGGATGGCACAAAACACCAACTTCGAAAATTTTTACGATTGAAAT AAAGGG AATAAAGAAAAATGAAGAGTTGT ] [+] EMBL CD067176 [ TTAATGAAAGTTATGTAAGCACAGAGGATAGCTGAAATGAGCATTATAAATGGCAATGATAAAAAATTTAACTTATATTAGTTTAATAAAATACGAAATGACAAAAAATCCTTATCGAAATTACACTCATCAACATAGACTAAAGAGAAGTTCGATGTTTTTTTGTTGTGGCTTTTACAAACAAGTGCCGAATTCATTCGATAGATTGATACAAAGTATTACCAGAATAATGGATGGCACACAACACCAACTTC AAAATTTTTACGATTGAAAT AATGGG AATATAGAAAAATGAAGAGTTGTTATTGAATCATCAGAGAAACAATTTTTTTTTTTAAAa ] [-] EMBL CD140447 [ tTTTAATAAAATAGGAAATGACAAAAAATCCTTATCGAAATTACACTCATCAACATAGACTAAAGAGAAGTTCGATGTTTTTTTGTTGTGGCTTTTACAAACAAGTGCCGAATTCATTCGATAGATTGATACAAAGTATTACCAGAATAATGGATGGCACAAAACACCAACTTC AAAATTTTTACGATTGAAAT AAAGGG AATAAAGAGAAATGAAGAGTTGTTATTGAATCATCAGAGAAACAATTTTTTT ] consensusID : consensus_9952#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! 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Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||