cluster # 9955

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Schistosoma mansoni
cluster # 9955 cluster # 9955 Sequences # 12 consensus # 1
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consensus_9955#0 length = 1176 sequences # 12
consensusID : consensus_9955#0
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Sequences nbr = 12
consensus length = 1176
fasta sequence
                              [AACGATACTTTATTCGTACATCGACACTCAGCAATATTTNCTTCTGACTAAAATATTTATATAAAAGATACAAAAAGATACAATAAACGTGGGTNCA-GCACGTNCCCTAGCACACTAATATAACATGCACGTAAAGTACTGGGGTACGAAAAATAGACTGTCAGTNCTTTTATAATATGATTAATACTGGTAGTAATTGTTTTAAAAATTGTAATATTGTTGTCAATATTATNCTGGTTTCTTCATTATTTTCGAAGAACGTATGAGTACGAATACAGTATTAGATTAAAGCAGATGGAGTGTGTCTGTTGAAAGTTACAAGACACTAGGTGAGTCCAAAAAGGCATACAATGACGATGAAAATAAAG-AAAATAATAATGCG-AGAGGTCATGAAAGAGGTACACATATGAAGACAACTAGACAGCGAGAGAAAAAAAAGAATTAGTCTTCTTAAATTAGTAATCAAAG-TTATTTTGGTTCTTGAACATCTTCCCCCTAATTGTTTAAAATTATCTGGGATACAAAAATGCTACTTTATTTTAAGGAAGTGATATTTAAGAATTAAAAATACTAATACTAATAATCATAGTAATAATCGCTGGACATTTATTATAGTTATTATCACCATTCACACAAGATGATATACACTTGTTAAAATACATGTGTTTATTACCAGTGTAAAGCTGTTTACATAAACGAGTAGTTTTCAGCCTCCTTATTTATTGATTGATTTCATTACTGGATACAAAAAGGCGATCGGTGAATTCACTTCAATTTTCGTAGAAGGTTTTGTATAAATTCATCGATTTGTTCCTGTTTAGCCGGACAGGACTTTAGTTTTTCTTTCAAATTTCGCACTTTCTCATCATNTGTCTTAAGATCACTTATTTCATCCAGATCGATATCACAATCGTAGTCATCGACCTCTGTGCAATAAAGATTACGAAGATGTTCGAAAACAAAATTTTCAAGACGAATCTTTTCGCTAATTTTCTGACGAGTCCTCCTATCGTATTTTGCAGTC-AAATAACG-TTTACG-TTTTGAATGATCTGCAGGGGCATCAGTGGCGAAAACCACCTCCCGGTTTTCTCCTTTTTCAGAAAACCCGTCACTGCTTCCGCTCACTTCC-TGCCTAAATTCATTACTTCAAT-CATTTACGTAGGTATAGCGATAACC]

[+] EMBL SMT14370             [AACGATACTTTATTCGTACATCGACACTCAGCAATATTTNCTTCTGACTAAAATATTTATATAAAAGATACAAAAAGATACAATAAACGTGGGTNCA GCACGTNCCCTAGCACACTAATATAACATGCACGTAAAGTACTGGGGTACGAAAAATAGACTGTCAGTNCTTTTATAATATGATTAATACTGGTAGTAATTGTTTTAAAAATTGTAATATTGTTGTCAATATTATNCTGGTTTCTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD077235             [                                                    ATATTTATATAACAGATACAAAAAGATACAATAAACGTGGGTACACGCACGTACCCTAGCACACTAATATAACATGCACGTAAAGTACTGGGGTACGAAAAATAGACTGTCAGTTCTTTTATAATATGATTAATACTGGTAGTAATTGTTTTAAAAATTGTAATATTGTTGTCAATATTATTCTGGTTTCTTCATTATTTTCGAAGAACGTATGAGTACGAATACAGTATTAGATTAAAACAGATGGAGTGTGTCTGTTGAAAGTTACAAGACACTAGGTGAGTCCAAAAAGGCATACAATGACGATGAAAATAAAG AAAATAATAATGCG AGAGGTCATGAAAGAGGTACACATATGAAGACAACTAGACAGCGAGAGAAAAAAAAGAATTAGTCTTCTTAAATTAGTAATCAAAG TTATTTTGGTTCTTGAACATCTTCCCCCTAATTGTTTAAAATTATCTGGGATACAAAAATGCTACTTTATTTTAAGGAAGTGATATTTAAGAATTAAAAATACTAATACTAATAATCATAGTAATAATCGCTGGACATTTATTATAGTTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD089974             [                                                                                                                                                                                                                                                                          aaTACGAATACAGTATTAGATTAAAGCAGATGGAGTGTGTCTGTTGAAAGTTACAAGACACTAGGTGAGTCCAAAAAGGCATACAATGACGATGAAAATAAAG AAAATAATAATGCG AGAGGTCATGAAAGAGGTACACATATGAAGACAACTAGACAGCGAGAGAAAAAAAAGAATTAGTCTTCTTAAATTAGTAATCAAAG TTATTTTGGTTCTTGAACATCTTCCCCCTAATTGTTTAAAATTATCTGGGATACAAAAATGCTACTTTATTTTAAGGAAGTGATATTTAAGAATTAAAAATACTAATACTAATAATCATAGTAATAATCGCTGGACATTTATTATAGTTATTATCACCATTCACACAAGATGATATACACTTGTTAAAATACATGTGTTTATTACCAGTGTAAAGCTGTTTACATAAACGAGTAGTTTTCAGCCTCCTTATTTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD089951             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTAGATTAAAGCAGATGGAGTGTGTCTGTTGAAAGTTACAAGACACTAGGTGAGTCCAAAAAGGCATACAATGACGGTGAAAATAAAG AAAATAATAATGCG AGAGGTCATGAAAGAGGTACACATATGAAGACAACTAGACAGCGAGAGAAAAAAAAGAATTAGTCTTCTTAAATTAGTAATCAAAG TTATTTTGGTTCTTGAACATCTTCCCCCTAATTGTTTAAAATTATCTGGGATACAAAAATGCTACTTTATTTTAAGGAAGTGATATTTAAGAATTAAAAATACTAATACTAATAATCATAGTAATAATCGCTGGACATTTATTATAGTTATTATCACCATTCACACAAGATGATATACACTTGTTAAAATACATGTGTTTATTACCAGTGTAAAGCTGTTTACATAAACGAGTAGTTTTCAGCCTCCTTATTTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD090081             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTAGATTAAAGCAGATGGAGTGTGTCTGTTGAAAGTTACAAGACACTAGGTGAGTCCAAAAAGGCATACAATGACGATGAAAATAAAG AAAATAATAATGCG AGAGGTCATGAAAGAGGTACACATATGAAGACAACTAGACAGCGAGAGAAAAAAAAGAATTAGTCTTCTTAAATTAGTAATCAAAG TTATTTTGGTTCTTGAACATCTTCCCCCTAATTGTTTAAAATTATCTGGGATACAAAAATGCTACTTTATTTTAAGGAAGTGATATTTAAGAATTAAAAATACTAATACTAATAATCATAGTAATAATCGCTGGACATTTATTATAGTTATTATCACCATTCACACAAGATGATATACACTTGTTAAAATACATGTGTTTATTACCAGTGTAAAGCTGTTTACATAAACGAGTAGTTTTCAGCCTCCTTATTTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL SM0331               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAGAAAAATAATAATGCGAAGAGGTCATGAAAGAGGTACACATATGAAGACAACTAGACAGCGAGAGAAAAAAAAGAATTAGTCTTCTTAAATTAGTAATCAAAGTTTATTTTGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL AA938786             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAGAAAAATAATAATGCGAAGAGGTCATGAAAGAGGTACACATATGAAGACAACTAGACAGCGAGAGAAAAAAAAGAATTAGTCTTCTTAAATTAGTAATCAAAGTTTATTTTGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL AW017360             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGTAAAGCTGTTTACATAAACGAGTAGTTTTCAGCCTCCTTATTTATTGATTGATTTCATTACTGGATACAAAAAGGCGATCGGTGAATTCACTTCAATTTTCGTAGAAGGTTTTGTATAAATTCATCGATTTGTTCCTGTTTAGCCGGACAGGACTTTAGTTTTTCTTTCAAATTTCGCACTTTCTCATCATNTGTCTTAAGATCACTTATTTCATCCAGATCGATATCACAATCGTAGTCATCGACCTCTGTGCAATAAAGATTACGAAGATGTTCGAAAACAAAATTTTCAAGACGAATCTTTTCGCTAATTTTCTGACGAGTCCTCCTATCGTATTTTGCAGTC AAATAACG TTTACG TTTTGAATGATCTGCAGGGGCATCAGTGGCGAAAACCACCTCCCG                                                                                               ]
[-] EMBL CD083949             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GATCGGTGAATTCACTTCAATTTTCGTAGAAGGTTTTGTATAAATTCATCGATTTGTTCCTGTTTAGCCGGACAGGACTTTAGTTTTTCTTTCAAATTTCGCACTTTCTCATCATTTGTCTTAAGATCACTTATTTCATCCAGATCGATATCACAATCGTAGTCATCGACCTCTGTGCAATAAAGATTACGAAGATGTTCGAAAACAAAATTTTCAAGACGAATCTTTTCGCTAATTTTCTGACGAGTCCTCCTATCGTATTTTGCAGTC AAATAACG TTTACG TTTTGAATGATCTGCAGGGGCATCAGTGGCGAAAACCACCTCCCGGTTTTCTCCTTTTTCAGAAAACCCGTCACTGCTTCCGCTCACTTCC TGCCTAAATTCATTACTTCAAT CATTTACGTAGGTATAGCGATAACC]
[-] EMBL SMAA69081            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GATATCACAATCGTAGTCATCGACCTCTGTGCAATAAAGATTACGAAGATGTTCGAAAANAAAATTTTCAAGACGAATCTTTTCGCTAATTTTCTGACGAGTCCTCCTATCGTATTTTGCAGTC AAATAACG TTTACG TTTTGAATGATCTGCAGGGGCATCAGTGGCGAAAACCTCCTCCCGGTTTTCTCCTTTTTCAGAAAACCCGTCACT CTTCCGCTCACTTCCTTGCCTAAATTCATTACTTCAATCCATTTACGT                ]
[-] EMBL CD120873             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATCACAATCGTAGTCATCGACCTCTGTGCAATAAAGATTACGGAGATGTTCGAAAACAAAATTTTCAAGACGAATCTTTTCGCTAATTTTCTGACGAGTCCTCCTATCGTATTTTGCAGTC AAATAACG TTTACG TTTTGAATGATCTGCAGGGGCATCAGTGGCGAAAACCACCTCCCGGTTTTCTCCTTTTTCAGAAAACCCGTCACTGCTTCCGCTCACTTCCTTGCCTAAATTCATTACTTCAATCCATTTACGTAGGTAT          ]
[-] EMBL SMAA8305             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GCANTCAAAATAACGCTTTACGNTTTTGAATGATCTGCAGGGGCATCAGTGGCGAAAACCACCTCCCGGTTTTCTCCTTTTTCAGAAAACCCGTCACTGCTTCCGCTCACTTCCTTGCCTAAATTCATTACTTCAATCCATTTACGTAGGTA           ]




>consensus_9955#0
AACGATACTTTATTCGTACATCGACACTCAGCAATATTTNCTTCTGACTAAAATATTTAT
ATAAAAGATACAAAAAGATACAATAAACGTGGGTNCAGCACGTNCCCTAGCACACTAATA
TAACATGCACGTAAAGTACTGGGGTACGAAAAATAGACTGTCAGTNCTTTTATAATATGA
TTAATACTGGTAGTAATTGTTTTAAAAATTGTAATATTGTTGTCAATATTATNCTGGTTT
CTTCATTATTTTCGAAGAACGTATGAGTACGAATACAGTATTAGATTAAAGCAGATGGAG
TGTGTCTGTTGAAAGTTACAAGACACTAGGTGAGTCCAAAAAGGCATACAATGACGATGA
AAATAAAGAAAATAATAATGCGAGAGGTCATGAAAGAGGTACACATATGAAGACAACTAG
ACAGCGAGAGAAAAAAAAGAATTAGTCTTCTTAAATTAGTAATCAAAGTTATTTTGGTTC
TTGAACATCTTCCCCCTAATTGTTTAAAATTATCTGGGATACAAAAATGCTACTTTATTT
TAAGGAAGTGATATTTAAGAATTAAAAATACTAATACTAATAATCATAGTAATAATCGCT
GGACATTTATTATAGTTATTATCACCATTCACACAAGATGATATACACTTGTTAAAATAC
ATGTGTTTATTACCAGTGTAAAGCTGTTTACATAAACGAGTAGTTTTCAGCCTCCTTATT
TATTGATTGATTTCATTACTGGATACAAAAAGGCGATCGGTGAATTCACTTCAATTTTCG
TAGAAGGTTTTGTATAAATTCATCGATTTGTTCCTGTTTAGCCGGACAGGACTTTAGTTT
TTCTTTCAAATTTCGCACTTTCTCATCATNTGTCTTAAGATCACTTATTTCATCCAGATC
GATATCACAATCGTAGTCATCGACCTCTGTGCAATAAAGATTACGAAGATGTTCGAAAAC
AAAATTTTCAAGACGAATCTTTTCGCTAATTTTCTGACGAGTCCTCCTATCGTATTTTGC
AGTCAAATAACGTTTACGTTTTGAATGATCTGCAGGGGCATCAGTGGCGAAAACCACCTC
CCGGTTTTCTCCTTTTTCAGAAAACCCGTCACTGCTTCCGCTCACTTCCTGCCTAAATTC
ATTACTTCAATCATTTACGTAGGTATAGCGATAACC
clustalw multiple alignements is not computed in this case