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Schistosoma mansoni
cluster # 9962 cluster # 9962       Sequences # 12       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9962#0 length = 544 sequences # 12  
consensusID : consensus_9962#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 544
fasta sequence 
                              [TCTCTGAGACGAAATCGTCGAACCGAGCAACATATTACCAATTCACCAGTATGAACTGCTAAGGAGAACTCAGACTGCCTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTCTTTTTCTTAGAGAATAATCTCGATAGCACTTTTCCAAACTATATTTCAGTAATTACCTATACTGTTATTTGATCAGTTGTTTTTAATTACAGTTTGACAGTTGTGTTAAGCATCCCAACATCACTGGGTCTTACTTTGTAAACGAAGTTGTCGAAGTTTTGGTTATCTGTTCGAAAGATAAAGTTGTTCTAAGAAGTCCCTTCACCAATTGGCGTGTGGATTACTAACGTCGAAGTGTTTTTCTTAAACGTCCGGTCT-GTCAAGTTCCCATTAGTCTTTTTAGTATTAAAAGATTCTCAAATTATCGTAGACCCAGCCGAAAACCAATCGCGATTACATTAAAAAACTTAAAATAAAGAAACAACCCACAATTGATAAATCCTGATGAAAACAAGTTCAAAATCTACTTCCAGGTTTTAAAGTTTGTTTATTGACGAA]

[+] EMBL CD149537             [TCTCTGAGACGAAATCGTCGAACCGAGCAACATATTACCAATTCACCAGTATGAACTGCTAAGGAGAACTCAGACTGCCTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTCTTTTTCTTAGAGAATAATCTCGATAGCACTTTTCCAAACTATATTTCAGTAATTACCTATACTGTTATTTGATCAGTTGTTTTTAATTACAGTTTGACAGTTGTGTTAAGCATCCCAACATCACTGGGTCTTACTTTGTAAACGAAGTTGTCGAAGTTTTGGTTATCTGTTCGAAAGATAAAGTTGTTCTAAGA                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD149477             [caTCTGAGACGAAACCGTCGAACCGAGCAACGGATTACCAATTCACCAGTATGAACTGCTAATGAGAACTCAGACTGCCTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTCTTTTTCTTAGAGAATAATCTCGATAGCACTTTTCCAAACTATATTTCAGTAATTACCTATACTGTTATTTGATCAGTTGTTTTTAATTACAGTTTGACAGTTGTGTTAAGCATCCCAACATCACTGGGTCTTACTTTGT    GAA     CGAAGTTTTGGTTATCTGTTCt                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD149321             [                  CGAACCGAGCAACATATTACCAATTCACCAGTATGAACTGCTAAGGAGAACTCACACTGCCTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTCTTTTTCTTAGAGAATAATCTCGATAGCACTTTTCCAAACTATATTTCAGTAATTACCTATACTGGTATTTGATCAGTTGTTTTTAATTACAGTTTGACAGTTGTGTTAAGCATCCCAACATCACTGGGTCTTACTTTGTAAACGAAGTTGTCGAAGTTTTGGTTATCTGATCGAAAGATAAAGTTGTTCTAAGAAGTCCCTTCACCAATTGGCGTGTGGATTACTAACGTCGAAGTGTTATTCTCATACGTCCGGTCT GTCAAGTTCCCATTAGTCTTTTTAGTATTAAAAGATTCTCANATTATCGTATACCCAGCCGACAACCATTCGCGATTACCTTAAAACACTTATAATCAAGAAACACCCCACANTTGATAAATCCTGATGAAAACAAGTTC AAATCTACTTCCAGGATTTAAAGTTTGTTTATTGACGAc]
[+] EMBL CD149306             [                  CGAACCGAGCAACATATTACCAATTCACCAGTATGAACTGCTAAGGAGAACTCAGACTGCCTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTCTTTTTCTTAGAGAATAATCTCGATAGCACTTTTCCAAACTATATTTCAGTAATTACCTATACTGTTATTTGATCAGTTGTTTTTAATTACAGTTTGACAGTTGTGTTAAGCATCCCAACATCACTGGGTCTTACTTTGTAAACGAAGTTGTCGAAGTTTTGGTTATCTGTTCCAAAGATAAAGTTGTTCTAAGAAGTCCCTTCACCAATTGGCGTGTGGATTACTAACGTCGAAGTGTTTTTCTTAAACGTCCGGTCTCGT AAGTTCCCATTAGTCTTTTTAGTATTAAAAGATCCTCAAATTATCGGAAACCCAGCCGAAAACCAATCGCGATTAC TTAAAAAACTTAAAATAAAGAAACAACCCACATTTGAT AATCCTGATAAAAACAAG TCAAAATCTACTTCCAGGTTTTAAAG TTGGTTATTGACa  ]
[+] EMBL CD149669             [                  CGAACCGAGCAACATATTACCAATTCACCAGTATGAACTGCTAAGGAGAACTCAGACTGCCTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTCTTTTTCTTAGAGAATAATCTCGATAGCACTTTTCCAAACTATATTTCAGTAATTACCTATACTGTTATTTGATCAGTTGTTTTTAATTACAGTTTGACAGTTGTGTTAAGCATCCCAACATCACTGGGTCTTACTTTGT    GAA     CGAAGTTTTGGTTATCTGTTCGAAAGATAAAGTTGTTCTAAGAAGTCCCTTCACCAATTGGCGTGTGGATTACTAACGTCGAAGGGTTTTTCTTAAACGTCCGGTCT GTCAAGTTCCCATTAGTCTTTGTAGTATTAAAAGATTCTCAAATTATCGTAGACCCAGCCGAGAACCAATCGCGATTACATTAAAAAACTTAAAATAAAGAAACAACCCACAATTGATAAATCCTGATG AAACAAGTTCAAAATCTACTTCCAGGTTTTAAAGTTTGGTTATTGACGA ]
[+] EMBL CD149259             [                  CGAACCGAGCAACATATTACCAATTCACCAGTATGAACTGCTAAGGAGAACTCAGACTGCCTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTCTTTTTCTTAGAGAATAATCTCGATAGCACTTTTCCAAACTATATTTCAGTAATTACCTATACTGTTATTTGATCAGTTGTTTTTAATTACAGTTTGACAGTTGTGTTAAGCATCCCAACATCACTGGGTCTTACTTTGTAAACGAAGTTGTCGAAGTTTTGGTTATCTGTTCGAAAGATAAAGTTGTTCTAAGAAGTCCCTTCACCAATTGGCGTGTGGATTACTAACGTCGAAGTGTTTTTCTTAAACGTCCGGTCT GTCAAGTTCCCAT                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD149416             [                  CGAACCGAGCAACATATTACCAATTCACCAGTATGAACTGCTAAGGAGAACTCATACTGCCTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTCTTTTTCTTATAGAATAATCTCGATAGCACTTTTCCAAACTATATTTCAGTAATTACCTATACTGTTATTTGATCAGTTGTTTTTAATTACAGTTTGACAGTTGTGTTAAGCATCCCAACATCACTGGGTCTTACTTTGTAAACGAAGTTGTCGAAGTTTTGGTTATCTGTTCGAAAGATAAAGTTGTT                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD149204             [                  CGAACCGAGCAACATATTACCAATTCACCAGTATGAACTGCTAAGGAGAACTCAGACTGCCTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTCTTTTTCTTATAGAATAATCTCGATAGCACTTTTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD149335             [                   GAACCGAGCAACATATTACCNATTCACCAGTATGAACTGCTAAGGAGAACTCAGACTGCGTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTC TTTTCTTAGAGAATAATCTCGATAGCACTTTTCCAAACTATATTTCAGTAATTACCTATACTGTTATTTGATCAGTTGTTTTTAATTACAGTTTGACAGTTGTGTTGAGCATCCCAACATCACTGGGTCTTACTTTGTAAACGAAGTTGTCGAAGTTTTGGTTATCTGTTCGAAAGATAAAGTTGTTCTAAGAAGTCCCTTCACCAATTGGCGTGTGGATTACTAACGTCGAAGTGTTTTTCTTAAACGTCCGGTCT GTCAAGTTCCCATTAGTCTTTTTAGTATTAAAAGATTCTCAAATTATCGTAGACCCAGCCGAAAACCAATCGCGATTACATTAAAAAACTTAAAATAAAGAAACAACCCACAATTGATAAATCCTGATGAAAACAAGTTCAAAATCTACTTCCAGGTTTTAAAGTTTGTTTATTGACGAA]
[-] EMBL CD149133             [                   GAACCGAGCAACATATTACCAATTCACCAGTATGAACTGNTAAGGAGAACTCAGACTGCCTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTCTTTTTCTTAGAGAATAATCTCGATAGCACTTTTCCAAACTATATTTCAGTAATTACCTATACTGTTATTTGATCAATTGTTTTTAATTACAGTTTGACAGTTGTGTTAAGCATCCCAACATCACTGGGTCTTACTTTGT    GAA     CGAAGTTTTGGTTATCTGTTCGAAGGATAAAGTTGTTCTAAGAAGTCCCTTCACCAATTGGCGTGTGGATTACTAACGTCGAAGGGTTTTTCTTAAACGTCCGGTCT GTCAAGTTCCCATTAGTCTTTTTAGTATTAAAAGATTCTCAAATTATCGTAGACCCAGCCGAAAACCAATCGCGATTACATTAAAAAACTTAAAATAAAGAAACAACCCACAATTGATAAATCCTGATGAAAACAAGTTCAAAATCTACTTCCAGGTTTTAAAGTTTGTTTATTGACGAA]
[-] EMBL CD149227             [                                                                                                                                                                                                                                CATCACTGGGTCTTGCTTTGCAAACGAAGTTGTCGAAGTTTTGGTTATCTGTTCGAAAGATAAAGTTGTTNTAAGAAGTCCCTTCACCAATTGGCGTGTGGATTACTAACGTCGAAGTGTTTTTCTTAAACGTCCGGTCT GTCAAGTTCCCATTAGTCTTTTTAGTATTAAAAGATTCTCAAATTATCGTAGACCCAGCCGAAAACCAATCGCGATTACATTAAAAAACTTAAAATAAAGAAACAACCCACAATTGATAAATCCTGATGAAAACAAGTTCAAAATCTACTTCCAGGTTTTAGAGTTTGTTTATTGACGAA]
[-] EMBL CD149288             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTAAACGTCCGGTCT GTCAAGTTCCCATTAGTCTTTTTAGTATTAAAAGATTCTCAAATTATCGTAGACCCAGCCGAAAACCAATCGCGATTACATTAAAAAACTTAAAATAAAGAAACAACCCACAATTGATAAATCCTGATGAAAACAAGTTCAAAATCTACTTCCAGGTTTTAAAGTTTGTTTATTGACGAA]




>consensus_9962#0
TCTCTGAGACGAAATCGTCGAACCGAGCAACATATTACCAATTCACCAGTATGAACTGCT
AAGGAGAACTCAGACTGCCTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTCTTTTTCTTAGAGAA
TAATCTCGATAGCACTTTTCCAAACTATATTTCAGTAATTACCTATACTGTTATTTGATC
AGTTGTTTTTAATTACAGTTTGACAGTTGTGTTAAGCATCCCAACATCACTGGGTCTTAC
TTTGTAAACGAAGTTGTCGAAGTTTTGGTTATCTGTTCGAAAGATAAAGTTGTTCTAAGA
AGTCCCTTCACCAATTGGCGTGTGGATTACTAACGTCGAAGTGTTTTTCTTAAACGTCCG
GTCTGTCAAGTTCCCATTAGTCTTTTTAGTATTAAAAGATTCTCAAATTATCGTAGACCC
AGCCGAAAACCAATCGCGATTACATTAAAAAACTTAAAATAAAGAAACAACCCACAATTG
ATAAATCCTGATGAAAACAAGTTCAAAATCTACTTCCAGGTTTTAAAGTTTGTTTATTGA
CGAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)