Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Takifugu rubripes
cluster # 1169 cluster # 1169       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1169#0 length = 670 sequences # 2  
consensusID : consensus_1169#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 670
fasta sequence 
                              [GCTAACTGATGTGCTGATATGAAGCCCTTGGCTTGTTTAGGCTGTCATTGTATACTGTCATTCGCCTTAGCCTATGTTTATTTCCACTGACTAAAAAAAGAACTCCTTCAGGGCGCATGCTCTGTTTTGCTAGACGTTTCTAGCATGAATCCTTGGGCCTTTTTCCTTCCTAAAGCCCTTTTTGAGGTTGATGTAGGAGGATGTTGTTGCTCTGTTAGCCTCAATCCTTCAGGAAATACAAGCCTTAAATGTCAGTAGTTGGAAATGATAGCTGTGTTAAAGGACAAGTATACAGGCAAGGAAATCTCTTTTCTGTATTTTGGAATTGCAGTAAATCGTAGGGTAATAATGCTACTCATACCTGTTGATAAATCAAATATTGTCTCAAATGTCACCTATCTAAGTTCCGGAATGATTTTAAGTTTAATATATGAATGGTGTTTGACAGGATATGTATTTAGAACAGGGTCGTAGCAGATATTTGAACAGTGTTTGAGTTTGAAGCCCTTGTGTTGTTAGCTTTTCTGACCTCTGCATCCAGAAGCCATAGGTGTTTTGACATTAGGTGCCATAGTTGGTAGTTGCAGACATTGTGCTTAAATTTTTCAGAGCACTGACCTTTTCTCCTCCTCTCTCCTTTTTTTTTTCTTAATCTTCAGGGCAAAAGGGA]

[+] EMBL CA846295             [GTTCTTTGATGTGCTGATATGAAGCCCTTGGCTTGTTTAGGCTGTCTTTGTATACTGTCATTCGCCTTAGCCTATGTTTATTTCCACTGACTAAAAAAAGAACTCCTTCAGGGCGCATGCTCTGTTTTGCTAGACGTTTCTAGCATGAATCCTTGGGCCTTTTTCCTTCCTAAAGCCCTTTTTGAGGTTGATGTAGGAGGATGTTGTTGCTCTGTTAGCCTCAATCCTTCAGGAAATACAAGCCTTAAATGTCAGTAGTTGGAAATGATAGCTGTGTTAAAGGACAAGTATACAGGCAAGGAAATCTCTTTTCTGTATTTTGGAATTGCAGTAAATCGTAGGGTAATAATGCTACTCATACCTGTTGATAAATCAAATATTGTCTCAAATGTCACCTATCTAAGTTCCGGAATGATTTTAAGTTTAATATATGAATGGTGTTTGACAGGATATGTATT                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CA845882             [ CTAACTGATGTGCTGATATGAAGCCCTTGGCTTGTTTAGGCTGTTATTGTATACTGTCATTCGCCTTAGCCTATGTTTATTTCCACTGACTAAAAAAAGAACTCCTTCAGGGCGCATGCTCTGTTTTGCTAGACGTTTCTAGCATGAATCCTTGGGCCTTTTTCCTTCCTAAAGCCCTTTTTGAGGTTGATGTAGGAGGATGTTGTTGCTCTGTTAGCCTCAATCCTTCAGGAAATACAAGCCTTAAATGTCAGTAGTTGGAAATGATAGCTGTGTTAAAGGACAAGTATACAGGCAAGGAAATCTCTTTTCTGTATTTTGGAATTGCAGTAAATCGTAGGGTAATAATGCTACTCATACCTGTTGATAAATCAAATATTGTCTCAAATGTCACCTATCTAAGTTCCGGAATGATTTTAAGTTTAATATATGAATGGTGTTTGACAGGATATGTATTTAGAACAGGGTCGTAGCAGATATTTGAACAGTGTTTGAGTTTGAAGCCCTTGTGTTGTTAGCTTTTCTGACCTCTGCATCCAGAAGCCATAGGTGTTTTGACATTAGGTGCCATAGTTGGTAGTTGCAGACATTGTGCTTAAATTTTTCAGAGCACTGACCTTTTCTCCTCCTCTCTCCTTTTTTTTTTCTTAATCTTCAGGGCAAAAGGGA]




>consensus_1169#0
GCTAACTGATGTGCTGATATGAAGCCCTTGGCTTGTTTAGGCTGTCATTGTATACTGTCA
TTCGCCTTAGCCTATGTTTATTTCCACTGACTAAAAAAAGAACTCCTTCAGGGCGCATGC
TCTGTTTTGCTAGACGTTTCTAGCATGAATCCTTGGGCCTTTTTCCTTCCTAAAGCCCTT
TTTGAGGTTGATGTAGGAGGATGTTGTTGCTCTGTTAGCCTCAATCCTTCAGGAAATACA
AGCCTTAAATGTCAGTAGTTGGAAATGATAGCTGTGTTAAAGGACAAGTATACAGGCAAG
GAAATCTCTTTTCTGTATTTTGGAATTGCAGTAAATCGTAGGGTAATAATGCTACTCATA
CCTGTTGATAAATCAAATATTGTCTCAAATGTCACCTATCTAAGTTCCGGAATGATTTTA
AGTTTAATATATGAATGGTGTTTGACAGGATATGTATTTAGAACAGGGTCGTAGCAGATA
TTTGAACAGTGTTTGAGTTTGAAGCCCTTGTGTTGTTAGCTTTTCTGACCTCTGCATCCA
GAAGCCATAGGTGTTTTGACATTAGGTGCCATAGTTGGTAGTTGCAGACATTGTGCTTAA
ATTTTTCAGAGCACTGACCTTTTCTCCTCCTCTCTCCTTTTTTTTTTCTTAATCTTCAGG
GCAAAAGGGA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)