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Takifugu rubripes
cluster # 2400 cluster # 2400       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2400#0 length = 916 sequences # 6  

consensusID : consensus_2400#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 916
fasta sequence
                              [GGCGAAAGCCTCCACTGACCCAGATTTACCAACGCACAAGTTCTTCAACCAACCCCAACAGACGTAGATGCTCGGCAGACTTCAATTTTCTTACTGATAGTGGAGATCTTTTGCACATAGCTGAGGCAGCTTAGGAGACTACCTGGACCCTGCAGAGACAAGCACACAGCAGCTCCTGTCCCCAAAGAAAAACCAAGGCCGGGCAGCACCGAACCAGCTCTGAGAAGGATTCTCATCTTCTTCCATGTAGCAGTTCTGTGTACAGGAGCTCACCTGTTAGCATTTGAAGCTTTTCTCTCGCCGTTTGAAAAGGGAGCCACTTGAAGCTAATGTTACAGAGGGGGAGGGTTGTGGTTTGTTTTATTTCGTCTCTAAACTGTGCC-TTTTTTTTCCCCTTCGGGTCACGTCGTCTGGTTTTGTCTGTGTCGACTCCTGAGTTCTGGGTGTGAGAAGCCACCTCACAACGACGTAGCGCTTACTTTATGCACACGTGTCTTAAAGGCTTGAGACACAGAAAACTCAAATGTTTCATATCTTCGTTTGCACATTACAACCAGAATGCTGATCAGAGAGGGAGCGAGAGCTGCTGCTGCTAGCTGAGGAAGCTGTCGTGTTCGTAGTTCTGCTTGACAACTGTGTCCTGCTCATACAGTCTTCCGATCGCCTCGCCATTCACGTAACGGCG--GC-CTGCAGCCGATTGTTGAAACTGAACATTCCATTTTAATATTGCCGTGTTGCAGTTTGAAGATATTTAAATTTTGTTTGTATATTTCGAGTCATGTTCTAGTTTTAATGTATATTAAAGAGGACAAAAAGAGTATGCTTAAATATGTATATGTAACTATTCATGTTAAATGTACTGTAAATTGTAATTTGAAGATTTATGTGACCATGTTTGGTTTGCAATAAAAGGTGA]

[+] EMBL CA845127             [GGCGAAAGCCTCCACTGACCCAGATTTACCAACGCACAAGTTCTTCAACCAACCCCAACAGACGTAGATGCTCGGCAGACTTCAATTTTCTTACTGATAGTGGAGATCTTTTGCACATAGCTGAGGCAGCTTAGGAGACTACCTGGACCCTGCAGAGACAAGCACACAGCAGCTCCTGTCCCCAAAGAAAAACCAAGGCCGGGCAGCACCGAACCAGCTCTGAGAAGGATTCTCATCTTCTTCCATGTAGCAGTTCTGTGTACAGGAGCTCACCTGTTAGCATTTGAAGCTTTTCTCTCGCCGTTTGAAAAGGGAGCCACTTGAAGCTAATGTTACAGAGGGGGAGGGTTGTGGTTTGTTTTATTTCGTCTCTAAACTGTGCC TTTTTTTTCCCCTTCGGGTCACGTCGTCTGGTTTTGTCTGTGTCGACTCCTGAGTTCTGGGTGTGAGAAGCCACCTCACAACGACGTAGCGCTTACTTTATGCACACGTGTCTTAAAGGCTTGAGACACAGAAAACTCAAATGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CA331762             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGTGGTTTGTTTTATTTCGTCTCTAAACTGTGCCTTTTTTTTTCCCCTTCGGGTCACGTCGTCTGGTTTTGTCTGTGTCGACTCCTGAGTTCTGGGTGTGAGAAGCCACCTCACAACGACGTAGCGCTTACTTTATGCACACGTGTCTTAAAGGCTTGAGACACAGAAAACTCAAATGTTTCATATCTTCGTTTGCACATTACAACCAGAATGCTGATCAGAGAGGGAGCGAGAGCTGCTGCTGCTAGCTGAGGAAGCTGTCGTGTTCGTAGTTCTGCTTGACAACTGTGTCCTGCTCATACAGTCTTCCGATCGCCTCGCCATTCACGTAACGGCG  GC CTGCAGCCGATTGTTGAAACTGAACATTCCATTTTAATATTGCCGTGTTGCAGTTTGAAGATATCTAAATTTTGTTTGTATATTTCGAGTCATGTTCTAGTTTTAATGTATATTAAAGAGGACAAAAAGAGTATGCTAAAATATGTATATGTAACTATTCATGTTAAATGTACTGTAAATTGTAATTTGAAGATTTATGTGACCATGTTTGGTTTGCAATAAAAGGTG ]
[-] EMBL CA329194             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGTGGTTTGTTTTATTTCGTCTCTAAACTGTGCC TTTTTTTTCCCCTTCGGGTCACGTCGTCTGGTTTTGTCTGTGTCGACTCCTGAGTTCTGGGTGTGAGAAGCCACCTCACAACGACGTAGCGCTTACTTTATGCACACGTGTCTTAAAGGCTTGAGACACAGAAAACTCAAATGTTTCATATCTTCGTTTGCACATTACAACCAGAATGCTGATCAGAGAGGGAGCGAGAGCTGCTGCTGCTAGCTGAGGAAGCTGTCGTGTTCGTAGTTCTGCTTGACAACTGTGTCCTGCTCATACAGTCTTCCGATCGCCTCGCCATTCACGTAACGGCG  GC CTGCAGCCGATTGTTGAAACTGAACATTCCATTTTAATATTGCCGTGTTGCAGTTTGAAGATATTTAAATTTTGTTTGTATATTTCGAGTCATGTTCTAGTTTTAATGTATATTAAAGAGGACAAAAAGAGTATGCTTAAATATGTATATGTAACTATTCATGTTAAATGTACTGTAAATTGTAATTTGAAGATTTATGTG                            ]
[-] EMBL CA332438             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACTCCTGAGTTCTGGGTGTGAGAAGCCACCTCACAACGACGTAGCGCTTACTTTATGCACACGTGTCTTAAAGGCTTGAGACACAGAAAACTCAAATGTTTCATATCTTCGTTTGCACATTACAACCAGAATGCTGATCAGAGAGGGAGCGAGAGCTGCTGCTGCTAGCTGAGGAAGCTGTCGTGTTCGTAGTTCTGCTTGACAACTGTGTCCTGCTCATACAGTCTTCCGATCGCCTCGCCATTCACGTAACGGCG  GC CTGCAGCCGATTGTTGAAACTGAACATTCCATTTTAATATTGCCGTGTTGCAGTTTGAAGATATTTAAATTTTGTTTGTATATTTCGAGTCATGTTCTAGTTTTAATGTATATTAAAGAGGACAAAAAGAGTATGCTTAAATATGTATATGTAACTATTCATGTTAAATGTACTGTAAATTGTAATTTGAAGATTTATGTGACCATGTTTGGTTTGCAATAAAAGGTGA]
[-] EMBL CA332462             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTTTATGCACACGTGTCTTAAAGGCTTGAGACACAGAAAACTCAAATGTTTCATATCTTCGTTTGCACATTACAACCAGAATGCTGATCAGAGAGGGAGCGAGAGCTGCTGCTGCTAGCTGAGGAAGCTGTCGTGTTCGTAGTTCTGCTTGACAACTGTGTCCTGCTCATACAGTCTTCCGATCGCCTCGCCATTCACGTAACGGCG  ACAATACAGCCGATTGTTGAAACTGAACATTCCATTTTAATATTGCCGTGTTGCAGTTTGAAGATATTTAAATTTTGTTTGTATATTTCGAGTCATGTTCTAGTTTTAATGTATATTAAAGAGGACAAAAAGAGTATGCTTAAATATGTATATGTAACTATTCATGTTAAATGTACTGTAAATTGTAATTTGAAGATTTATGTGACCATGTTTGGTTTGCAATAA       ]
[-] EMBL CA332227             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GCTGATCAGAGAGGGAGCGAGAGCTGCTGCTGCTAGCTGAGGAAGCTGTCGTGTTCGTAGTTCTGCTTGACAACTGTGTCCTGCTCATACAGTCTTCCGATCGCCTCGCCATTCACGTAACGGCGAAAC ATACAACCGATTGTTGAAACTGAACATTCCATTTTAATATTGCCGTGTTGCAGTTTGAAGATATTTAAATTTTGTTTGTATATTTCGAGTCATGTTCTAGTTTTAATGTATATTAAAGAGGACAAAAAGAGTATGCTTAAATATGTATATGTAACTATTCATGTTAAATGTACTGTAAATTGTAATTTGAAGATTTATGTGGCCGGGTAAGGTTTGCAATAAAAGGTGA]


>consensus_2400#0 GGCGAAAGCCTCCACTGACCCAGATTTACCAACGCACAAGTTCTTCAACCAACCCCAACA GACGTAGATGCTCGGCAGACTTCAATTTTCTTACTGATAGTGGAGATCTTTTGCACATAG CTGAGGCAGCTTAGGAGACTACCTGGACCCTGCAGAGACAAGCACACAGCAGCTCCTGTC CCCAAAGAAAAACCAAGGCCGGGCAGCACCGAACCAGCTCTGAGAAGGATTCTCATCTTC TTCCATGTAGCAGTTCTGTGTACAGGAGCTCACCTGTTAGCATTTGAAGCTTTTCTCTCG CCGTTTGAAAAGGGAGCCACTTGAAGCTAATGTTACAGAGGGGGAGGGTTGTGGTTTGTT TTATTTCGTCTCTAAACTGTGCCTTTTTTTTCCCCTTCGGGTCACGTCGTCTGGTTTTGT CTGTGTCGACTCCTGAGTTCTGGGTGTGAGAAGCCACCTCACAACGACGTAGCGCTTACT TTATGCACACGTGTCTTAAAGGCTTGAGACACAGAAAACTCAAATGTTTCATATCTTCGT TTGCACATTACAACCAGAATGCTGATCAGAGAGGGAGCGAGAGCTGCTGCTGCTAGCTGA GGAAGCTGTCGTGTTCGTAGTTCTGCTTGACAACTGTGTCCTGCTCATACAGTCTTCCGA TCGCCTCGCCATTCACGTAACGGCGGCCTGCAGCCGATTGTTGAAACTGAACATTCCATT TTAATATTGCCGTGTTGCAGTTTGAAGATATTTAAATTTTGTTTGTATATTTCGAGTCAT GTTCTAGTTTTAATGTATATTAAAGAGGACAAAAAGAGTATGCTTAAATATGTATATGTA ACTATTCATGTTAAATGTACTGTAAATTGTAATTTGAAGATTTATGTGACCATGTTTGGT TTGCAATAAAAGGTGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)