- a -

• amount : InputNode
• analPts : NodeList
• analysisMode : Simulation
• analysisPt : Plugin , PluginManager
• args : Example
• arr : Tree
• avg : NodeList
• avgFileName : Simulation
• avgPeriod : NodeList

- b -

• banalPts : NodeList
• bdosage : InputNode
• bduration : InputNode
• bits : NodeList
• BITSDIR : Simulation
• bitsFileName : Simulation
• bMutRate : Node
• bstart : InputNode

- c -

• cmd : Simulation
• COLS : GNode , Ttable
• control_inputs : Generator
• create_Extension : PluginWrapper
• current : Node
• cycles : Simulation
• cycleSize : Simulation

- d -

• delay : DelayNode
• destroy_Extension : PluginWrapper
• dosage : InputNode
• dosageRec : NodeList
• DUMP : Simulation , Plugin , PluginManager
• duration : SustainNode , InputNode

- e -

• everyRun : MutatorExtension
• ext : Simulation
• Extension : PluginWrapper
• EXTSDIR : Simulation

- g -

• gnodes : Generator

- h -

• high : InputNode

- i -

• id : GNode
• iid : Input
• in_logicFile : Simulation
• in_patternNodesFile : PatternsExt , Simulation
• in_patternSpecsFile : PatternsExt , Simulation
• in_specsFile : Simulation
• iname : Input
• inFileChange : PluginManager
• init : Node , GNode
• initialLogic : MutatorExtension
• initVal : Ttable
• injectionValue : InputNode
• iNodeList : FileConverter , Simulation
• inOutIndex : NodeList
• inputBits : NodeList
• inputBitsFileName : Simulation
• inputBitStr : InputNode
• inputs : Ttable , GNode , NodeList
• iTables : FileConverter , Simulation

- l -

• labels : Matrix
• lastCalc : PluginManager
• logic : PluginManager , Plugin
• LOGICDIR : Simulation
• low : InputNode

- m -

• manual : InputNode
• mutants : NodeList
• mutation : Mutant , Node
• mutRate : Node
• mutRate_logic : Simulation , MutatorExtension
• mutRate_nodes : MutatorExtension , Simulation
• mutTree : BooleanNode

- n -

• n : Simulation
• name : Node , NodeItem , Plugin , Mutant , GNode , PluginWrapper
• NC_amount : InputNode
• ND2TT : Simulation
• newLogic : MutatorExtension
• noBits : Simulation
• node : NodeItem
• nodeID : Ttable
• nodeLst : Mutator
• nodeName : Ttable
• nodes : NodeList
• NODESAVGDIR : Simulation
• noisy : InputNode
• noisyInputs : NodeList
• noOutFiles : Simulation

- o -

• on : InputNode
• opened : PluginWrapper
• outAvg : Simulation
• outBits : Simulation
• outCalc : NodeList
• outDosage : Simulation
• outFile : PluginManager , Plugin
• outInputBits : Simulation
• outputAll : Simulation , NodeList
• outputFile : Simulation
• outputs : NodeList

- p -

• p : Analysis , PatternsExt , PluginWrapper
• path : BooleanNode
• patternAnal : Simulation
• pipeline : DelayNode
• plugins : PluginManager
• pManager : Simulation
• postPatterns : Simulation
• previous : Node
• progStart : Simulation
• ptime : Simulation

- r -

• rand_init : FileConverter , Simulation
• rand_logicMut : Simulation
• rand_nodeInputs : Simulation
• ROOTDIR : Plugin , PluginManager , Simulation
• ROWS : GNode , Ttable
• run : MutatorExtension
• runDir : Simulation
• RUNDIR : NodeList
• runName : NodeList , Plugin , Simulation
• RunName : PluginManager
• runStart : Simulation
• runTime : NodeList

- s -

• scalar : NodeList
• seed : Simulation
• seedVal : Simulation
• set : InputNode
• sim : FileConverter
• SIMDIR : Simulation , Plugin , PluginManager
• simNumber : NodeList
• source : OutputNode , DelayNode , SustainNode
• sources : BooleanNode
• specs : PluginManager , Plugin
• start : InputNode , SustainNode

- t -

• t : Plugin , PluginManager
• table : GNode , Ttable , BooleanNode
• tables : Mutator
• tablesPath : Generator
• target : BooleanNode
• theMatrix : Matrix
• timeT : Node
• transient : NodeList
• TT2ND : Simulation

- u -

• usePlugins : Simulation

- v -

• version : PluginWrapper
• visMode : Simulation
• visout : Simulation
• visualFile : Simulation

- w -

• window : NodeList

- x -

• x : Example

- y -

• y : Example